MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	GA	3	6	2784	2789	50 %	0 %	50 %	0 %	16119814
2	NC_003065	TG	3	6	2818	2823	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
3	NC_003065	TG	3	6	2974	2979	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
4	NC_003065	AG	3	6	3870	3875	50 %	0 %	50 %	0 %	159161953
5	NC_003065	GC	3	6	4586	4591	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
6	NC_003065	GC	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
7	NC_003065	GC	3	6	6369	6374	0 %	0 %	50 %	50 %	16119816
8	NC_003065	AG	3	6	8925	8930	50 %	0 %	50 %	0 %	16119818
9	NC_003065	TC	3	6	10817	10822	0 %	50 %	0 %	50 %	16119819
10	NC_003065	AC	3	6	11172	11177	50 %	0 %	0 %	50 %	16119819
11	NC_003065	CA	3	6	13542	13547	50 %	0 %	0 %	50 %	16119821
12	NC_003065	CA	3	6	13777	13782	50 %	0 %	0 %	50 %	16119821
13	NC_003065	CA	3	6	15491	15496	50 %	0 %	0 %	50 %	16119822
14	NC_003065	AT	3	6	17164	17169	50 %	50 %	0 %	0 %	16119823
15	NC_003065	AG	3	6	17592	17597	50 %	0 %	50 %	0 %	16119823
16	NC_003065	GT	3	6	17825	17830	0 %	50 %	50 %	0 %	16119823
17	NC_003065	GT	3	6	22472	22477	0 %	50 %	50 %	0 %	159162008
18	NC_003065	AG	3	6	23569	23574	50 %	0 %	50 %	0 %	16119827
19	NC_003065	TC	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	16119827
20	NC_003065	CT	3	6	27627	27632	0 %	50 %	0 %	50 %	41223318
21	NC_003065	CG	4	8	28459	28466	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
22	NC_003065	TC	3	6	28728	28733	0 %	50 %	0 %	50 %	16119831
23	NC_003065	GC	3	6	28866	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
24	NC_003065	AT	3	6	29189	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	16119831
25	NC_003065	GC	3	6	29618	29623	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
26	NC_003065	CG	3	6	30236	30241	0 %	0 %	50 %	50 %	16119833
27	NC_003065	AC	3	6	30659	30664	50 %	0 %	0 %	50 %	16119833
28	NC_003065	CG	3	6	32225	32230	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
29	NC_003065	GC	3	6	32457	32462	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
30	NC_003065	TC	3	6	33201	33206	0 %	50 %	0 %	50 %	16119834
31	NC_003065	TC	3	6	33612	33617	0 %	50 %	0 %	50 %	16119834
32	NC_003065	CG	3	6	34416	34421	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
33	NC_003065	CG	3	6	35121	35126	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
34	NC_003065	CG	4	8	35351	35358	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
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37	NC_003065	GA	3	6	37329	37334	50 %	0 %	50 %	0 %	16119837
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40	NC_003065	CG	3	6	39653	39658	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
41	NC_003065	CT	3	6	40890	40895	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
42	NC_003065	GC	3	6	41398	41403	0 %	0 %	50 %	50 %	16119842
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44	NC_003065	TC	3	6	42580	42585	0 %	50 %	0 %	50 %	16119843
45	NC_003065	GC	3	6	42922	42927	0 %	0 %	50 %	50 %	41223322
46	NC_003065	CG	3	6	43749	43754	0 %	0 %	50 %	50 %	41223323
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48	NC_003065	GC	3	6	44133	44138	0 %	0 %	50 %	50 %	41223323
49	NC_003065	AT	3	6	44569	44574	50 %	50 %	0 %	0 %	16119846
50	NC_003065	GC	3	6	44638	44643	0 %	0 %	50 %	50 %	16119846
51	NC_003065	CG	3	6	44648	44653	0 %	0 %	50 %	50 %	16119846
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53	NC_003065	CG	3	6	47093	47098	0 %	0 %	50 %	50 %	16119849
54	NC_003065	CG	3	6	47841	47846	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
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59	NC_003065	CT	3	6	51565	51570	0 %	50 %	0 %	50 %	16119854
60	NC_003065	CG	3	6	51792	51797	0 %	0 %	50 %	50 %	16119854
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62	NC_003065	CG	3	6	52927	52932	0 %	0 %	50 %	50 %	159161958
63	NC_003065	TG	3	6	53044	53049	0 %	50 %	50 %	0 %	159161958
64	NC_003065	GA	3	6	53347	53352	50 %	0 %	50 %	0 %	159161958
65	NC_003065	GC	3	6	54060	54065	0 %	0 %	50 %	50 %	16119856
66	NC_003065	GA	3	6	54081	54086	50 %	0 %	50 %	0 %	16119856
67	NC_003065	CT	3	6	54185	54190	0 %	50 %	0 %	50 %	16119856
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69	NC_003065	GA	3	6	54589	54594	50 %	0 %	50 %	0 %	16119856
70	NC_003065	CG	3	6	55339	55344	0 %	0 %	50 %	50 %	16119857
71	NC_003065	AG	3	6	55468	55473	50 %	0 %	50 %	0 %	16119857
72	NC_003065	CG	3	6	56331	56336	0 %	0 %	50 %	50 %	159161959
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111	NC_003065	CG	3	6	78710	78715	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
112	NC_003065	CG	3	6	78811	78816	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
113	NC_003065	CG	3	6	78872	78877	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.