MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	A	7	7	1666	1672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	T	6	6	1955	1960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003065	T	7	7	3475	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	T	6	6	3669	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	159161953
5	NC_003065	T	7	7	5254	5260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	T	7	7	7120	7126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003065	A	7	7	7363	7369	100 %	0 %	0 %	0 %	159162007
8	NC_003065	A	7	7	7714	7720	100 %	0 %	0 %	0 %	16119817
9	NC_003065	A	7	7	8205	8211	100 %	0 %	0 %	0 %	16119817
10	NC_003065	A	6	6	8937	8942	100 %	0 %	0 %	0 %	16119818
11	NC_003065	A	6	6	9998	10003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003065	T	6	6	11320	11325	0 %	100 %	0 %	0 %	16119819
13	NC_003065	G	6	6	12782	12787	0 %	0 %	100 %	0 %	16119820
14	NC_003065	A	7	7	12881	12887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003065	T	6	6	15121	15126	0 %	100 %	0 %	0 %	16119822
16	NC_003065	A	6	6	15713	15718	100 %	0 %	0 %	0 %	16119822
17	NC_003065	T	7	7	15869	15875	0 %	100 %	0 %	0 %	16119822
18	NC_003065	A	6	6	16248	16253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003065	T	6	6	17020	17025	0 %	100 %	0 %	0 %	16119823
20	NC_003065	A	6	6	18244	18249	100 %	0 %	0 %	0 %	16119823
21	NC_003065	A	6	6	18730	18735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003065	A	6	6	18879	18884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003065	A	6	6	19328	19333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003065	T	6	6	20353	20358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003065	A	6	6	20667	20672	100 %	0 %	0 %	0 %	16119825
26	NC_003065	A	6	6	21483	21488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003065	G	6	6	22716	22721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003065	T	8	8	23984	23991	0 %	100 %	0 %	0 %	16119827
29	NC_003065	G	6	6	35180	35185	0 %	0 %	100 %	0 %	16119835
30	NC_003065	C	6	6	38264	38269	0 %	0 %	0 %	100 %	16119838
31	NC_003065	C	7	7	38518	38524	0 %	0 %	0 %	100 %	41223319
32	NC_003065	C	6	6	42721	42726	0 %	0 %	0 %	100 %	16119843
33	NC_003065	G	6	6	49180	49185	0 %	0 %	100 %	0 %	16119850
34	NC_003065	G	6	6	53156	53161	0 %	0 %	100 %	0 %	159161958
35	NC_003065	A	6	6	54501	54506	100 %	0 %	0 %	0 %	16119856
36	NC_003065	A	7	7	55386	55392	100 %	0 %	0 %	0 %	16119857
37	NC_003065	A	7	7	55720	55726	100 %	0 %	0 %	0 %	16119857
38	NC_003065	T	6	6	56458	56463	0 %	100 %	0 %	0 %	159161959
39	NC_003065	C	6	6	61067	61072	0 %	0 %	0 %	100 %	16119860
40	NC_003065	C	6	6	61264	61269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_003065	T	6	6	61359	61364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003065	T	6	6	69315	69320	0 %	100 %	0 %	0 %	159161960
43	NC_003065	C	6	6	69725	69730	0 %	0 %	0 %	100 %	16119872
44	NC_003065	A	9	9	70521	70529	100 %	0 %	0 %	0 %	16119873
45	NC_003065	G	6	6	74183	74188	0 %	0 %	100 %	0 %	16119876
46	NC_003065	G	6	6	74676	74681	0 %	0 %	100 %	0 %	16119876
47	NC_003065	A	6	6	79376	79381	100 %	0 %	0 %	0 %	16119880
48	NC_003065	C	6	6	85715	85720	0 %	0 %	0 %	100 %	16119886
49	NC_003065	C	6	6	91254	91259	0 %	0 %	0 %	100 %	159161965
50	NC_003065	T	6	6	93270	93275	0 %	100 %	0 %	0 %	159161966
51	NC_003065	C	6	6	93467	93472	0 %	0 %	0 %	100 %	16119892
52	NC_003065	C	6	6	96785	96790	0 %	0 %	0 %	100 %	159161967
53	NC_003065	C	6	6	98263	98268	0 %	0 %	0 %	100 %	159161969
54	NC_003065	T	6	6	109174	109179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003065	A	6	6	109354	109359	100 %	0 %	0 %	0 %	16119905
56	NC_003065	C	6	6	128528	128533	0 %	0 %	0 %	100 %	41223336
57	NC_003065	T	6	6	131116	131121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003065	T	6	6	143376	143381	0 %	100 %	0 %	0 %	16119943
59	NC_003065	A	6	6	146391	146396	100 %	0 %	0 %	0 %	159161979
60	NC_003065	A	6	6	150198	150203	100 %	0 %	0 %	0 %	16119949
61	NC_003065	T	6	6	152614	152619	0 %	100 %	0 %	0 %	16119951
62	NC_003065	A	6	6	154112	154117	100 %	0 %	0 %	0 %	41223344
63	NC_003065	T	6	6	158510	158515	0 %	100 %	0 %	0 %	16119957
64	NC_003065	C	6	6	159518	159523	0 %	0 %	0 %	100 %	16119957
65	NC_003065	G	7	7	162600	162606	0 %	0 %	100 %	0 %	16119960
66	NC_003065	A	7	7	162788	162794	100 %	0 %	0 %	0 %	16119960
67	NC_003065	T	6	6	171586	171591	0 %	100 %	0 %	0 %	159161990
68	NC_003065	A	6	6	173180	173185	100 %	0 %	0 %	0 %	16119971
69	NC_003065	A	6	6	173837	173842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003065	A	6	6	176319	176324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003065	G	6	6	181745	181750	0 %	0 %	100 %	0 %	16119781
72	NC_003065	T	6	6	182949	182954	0 %	100 %	0 %	0 %	16119781
73	NC_003065	C	6	6	184407	184412	0 %	0 %	0 %	100 %	41223307
74	NC_003065	G	6	6	184475	184480	0 %	0 %	100 %	0 %	41223307
75	NC_003065	T	7	7	185199	185205	0 %	100 %	0 %	0 %	16119784
76	NC_003065	A	7	7	187905	187911	100 %	0 %	0 %	0 %	16119787
77	NC_003065	A	7	7	189349	189355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003065	A	6	6	190247	190252	100 %	0 %	0 %	0 %	16119791
79	NC_003065	A	7	7	192685	192691	100 %	0 %	0 %	0 %	41223310
80	NC_003065	G	8	8	196845	196852	0 %	0 %	100 %	0 %	16119798
81	NC_003065	A	7	7	198155	198161	100 %	0 %	0 %	0 %	159162000
82	NC_003065	A	6	6	199431	199436	100 %	0 %	0 %	0 %	159162000
83	NC_003065	A	6	6	202608	202613	100 %	0 %	0 %	0 %	16119801
84	NC_003065	C	6	6	207858	207863	0 %	0 %	0 %	100 %	16119805
85	NC_003065	A	6	6	208926	208931	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
86	NC_003065	A	6	6	208937	208942	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
87	NC_003065	A	7	7	209386	209392	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
88	NC_003065	C	7	7	210350	210356	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_003065	T	6	6	212223	212228	0 %	100 %	0 %	0 %	159162003

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.