MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	T	6	6	3669	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	159161953
2	NC_003065	A	7	7	7363	7369	100 %	0 %	0 %	0 %	159162007
3	NC_003065	A	7	7	7714	7720	100 %	0 %	0 %	0 %	16119817
4	NC_003065	A	7	7	8205	8211	100 %	0 %	0 %	0 %	16119817
5	NC_003065	A	6	6	8937	8942	100 %	0 %	0 %	0 %	16119818
6	NC_003065	T	6	6	11320	11325	0 %	100 %	0 %	0 %	16119819
7	NC_003065	G	6	6	12782	12787	0 %	0 %	100 %	0 %	16119820
8	NC_003065	T	6	6	15121	15126	0 %	100 %	0 %	0 %	16119822
9	NC_003065	A	6	6	15713	15718	100 %	0 %	0 %	0 %	16119822
10	NC_003065	T	7	7	15869	15875	0 %	100 %	0 %	0 %	16119822
11	NC_003065	T	6	6	17020	17025	0 %	100 %	0 %	0 %	16119823
12	NC_003065	A	6	6	18244	18249	100 %	0 %	0 %	0 %	16119823
13	NC_003065	A	6	6	20667	20672	100 %	0 %	0 %	0 %	16119825
14	NC_003065	T	8	8	23984	23991	0 %	100 %	0 %	0 %	16119827
15	NC_003065	G	6	6	35180	35185	0 %	0 %	100 %	0 %	16119835
16	NC_003065	C	6	6	38264	38269	0 %	0 %	0 %	100 %	16119838
17	NC_003065	C	7	7	38518	38524	0 %	0 %	0 %	100 %	41223319
18	NC_003065	C	6	6	42721	42726	0 %	0 %	0 %	100 %	16119843
19	NC_003065	G	6	6	49180	49185	0 %	0 %	100 %	0 %	16119850
20	NC_003065	G	6	6	53156	53161	0 %	0 %	100 %	0 %	159161958
21	NC_003065	A	6	6	54501	54506	100 %	0 %	0 %	0 %	16119856
22	NC_003065	A	7	7	55386	55392	100 %	0 %	0 %	0 %	16119857
23	NC_003065	A	7	7	55720	55726	100 %	0 %	0 %	0 %	16119857
24	NC_003065	T	6	6	56458	56463	0 %	100 %	0 %	0 %	159161959
25	NC_003065	C	6	6	61067	61072	0 %	0 %	0 %	100 %	16119860
26	NC_003065	T	6	6	69315	69320	0 %	100 %	0 %	0 %	159161960
27	NC_003065	C	6	6	69725	69730	0 %	0 %	0 %	100 %	16119872
28	NC_003065	A	9	9	70521	70529	100 %	0 %	0 %	0 %	16119873
29	NC_003065	G	6	6	74183	74188	0 %	0 %	100 %	0 %	16119876
30	NC_003065	G	6	6	74676	74681	0 %	0 %	100 %	0 %	16119876
31	NC_003065	A	6	6	79376	79381	100 %	0 %	0 %	0 %	16119880
32	NC_003065	C	6	6	85715	85720	0 %	0 %	0 %	100 %	16119886
33	NC_003065	C	6	6	91254	91259	0 %	0 %	0 %	100 %	159161965
34	NC_003065	T	6	6	93270	93275	0 %	100 %	0 %	0 %	159161966
35	NC_003065	C	6	6	93467	93472	0 %	0 %	0 %	100 %	16119892
36	NC_003065	C	6	6	96785	96790	0 %	0 %	0 %	100 %	159161967
37	NC_003065	C	6	6	98263	98268	0 %	0 %	0 %	100 %	159161969
38	NC_003065	A	6	6	109354	109359	100 %	0 %	0 %	0 %	16119905
39	NC_003065	C	6	6	128528	128533	0 %	0 %	0 %	100 %	41223336
40	NC_003065	T	6	6	143376	143381	0 %	100 %	0 %	0 %	16119943
41	NC_003065	A	6	6	146391	146396	100 %	0 %	0 %	0 %	159161979
42	NC_003065	A	6	6	150198	150203	100 %	0 %	0 %	0 %	16119949
43	NC_003065	T	6	6	152614	152619	0 %	100 %	0 %	0 %	16119951
44	NC_003065	A	6	6	154112	154117	100 %	0 %	0 %	0 %	41223344
45	NC_003065	T	6	6	158510	158515	0 %	100 %	0 %	0 %	16119957
46	NC_003065	C	6	6	159518	159523	0 %	0 %	0 %	100 %	16119957
47	NC_003065	G	7	7	162600	162606	0 %	0 %	100 %	0 %	16119960
48	NC_003065	A	7	7	162788	162794	100 %	0 %	0 %	0 %	16119960
49	NC_003065	T	6	6	171586	171591	0 %	100 %	0 %	0 %	159161990
50	NC_003065	A	6	6	173180	173185	100 %	0 %	0 %	0 %	16119971
51	NC_003065	G	6	6	181745	181750	0 %	0 %	100 %	0 %	16119781
52	NC_003065	T	6	6	182949	182954	0 %	100 %	0 %	0 %	16119781
53	NC_003065	C	6	6	184407	184412	0 %	0 %	0 %	100 %	41223307
54	NC_003065	G	6	6	184475	184480	0 %	0 %	100 %	0 %	41223307
55	NC_003065	T	7	7	185199	185205	0 %	100 %	0 %	0 %	16119784
56	NC_003065	A	7	7	187905	187911	100 %	0 %	0 %	0 %	16119787
57	NC_003065	A	6	6	190247	190252	100 %	0 %	0 %	0 %	16119791
58	NC_003065	A	7	7	192685	192691	100 %	0 %	0 %	0 %	41223310
59	NC_003065	G	8	8	196845	196852	0 %	0 %	100 %	0 %	16119798
60	NC_003065	A	7	7	198155	198161	100 %	0 %	0 %	0 %	159162000
61	NC_003065	A	6	6	199431	199436	100 %	0 %	0 %	0 %	159162000
62	NC_003065	A	6	6	202608	202613	100 %	0 %	0 %	0 %	16119801
63	NC_003065	C	6	6	207858	207863	0 %	0 %	0 %	100 %	16119805
64	NC_003065	A	6	6	208926	208931	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
65	NC_003065	A	6	6	208937	208942	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
66	NC_003065	A	7	7	209386	209392	100 %	0 %	0 %	0 %	16119806
67	NC_003065	T	6	6	212223	212228	0 %	100 %	0 %	0 %	159162003

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.