MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 6494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003064	TGT	2	6	95	100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119233
2	NC_003064	GGC	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119233
3	NC_003064	GCA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119233
4	NC_003064	CCG	2	6	274	279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119233
5	NC_003064	GAC	2	6	721	726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119233
6	NC_003064	ATT	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119233
7	NC_003064	CGC	2	6	827	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119233
8	NC_003064	TCT	2	6	866	871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119233
9	NC_003064	TGA	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119233
10	NC_003064	ACG	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119233
11	NC_003064	GTT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119233
12	NC_003064	GAT	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119233
13	NC_003064	CGG	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119233
14	NC_003064	TCA	2	6	1349	1354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119233
15	NC_003064	CTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186453
16	NC_003064	CGG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186453
17	NC_003064	CAA	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186453
18	NC_003064	GCG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186453
19	NC_003064	CGA	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186453
20	NC_003064	CGC	2	6	1920	1925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186453
21	NC_003064	GGC	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186453
22	NC_003064	ATC	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186453
23	NC_003064	ATG	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186453
24	NC_003064	GCA	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186453
25	NC_003064	CGG	2	6	2231	2236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186453
26	NC_003064	GAA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186453
27	NC_003064	TGG	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186453
28	NC_003064	GAC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186454
29	NC_003064	GCG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186454
30	NC_003064	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186454
31	NC_003064	ATC	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186454
32	NC_003064	CAG	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186454
33	NC_003064	AGA	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186454
34	NC_003064	TCG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186454
35	NC_003064	GAT	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186454
36	NC_003064	TTC	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186454
37	NC_003064	ACC	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186454
38	NC_003064	ATG	2	6	3348	3353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186454
39	NC_003064	CCG	3	9	3570	3578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186454
40	NC_003064	AGG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186454
41	NC_003064	TGC	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186454
42	NC_003064	CCA	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186455
43	NC_003064	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186455
44	NC_003064	CAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186455
45	NC_003064	TCG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186455
46	NC_003064	GCC	2	6	4478	4483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186455
47	NC_003064	GAT	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186455
48	NC_003064	ACC	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186455
49	NC_003064	CCG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186455
50	NC_003064	TGA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186455
51	NC_003064	GAT	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186455
52	NC_003064	GGC	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186456
53	NC_003064	CCG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186456
54	NC_003064	TCG	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186456
55	NC_003064	TCG	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186456
56	NC_003064	GCT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186456
57	NC_003064	AGC	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186456
58	NC_003064	AAC	2	6	5789	5794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186456
59	NC_003064	CCG	3	9	5809	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186456
60	NC_003064	GTC	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186456
61	NC_003064	ATA	2	6	5859	5864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159186456
62	NC_003064	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186456
63	NC_003064	TGG	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186456
64	NC_003064	CGC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186456
65	NC_003064	GAT	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186456
66	NC_003064	GGC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186456
67	NC_003064	GGC	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186456
68	NC_003064	CCA	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119238
69	NC_003064	GAC	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
70	NC_003064	CGG	2	6	6473	6478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119238
71	NC_003064	ACG	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
72	NC_003064	TGC	2	6	6650	6655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119238
73	NC_003064	TCT	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119238
74	NC_003064	CGG	2	6	6842	6847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119238
75	NC_003064	CGC	2	6	6900	6905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119238
76	NC_003064	GCA	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
77	NC_003064	GAT	2	6	6970	6975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119238
78	NC_003064	TCC	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119238
79	NC_003064	TGA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119238
80	NC_003064	GCT	2	6	7155	7160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119238
81	NC_003064	GAC	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
82	NC_003064	AGC	3	9	7241	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
83	NC_003064	CAC	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119238
84	NC_003064	GCA	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
85	NC_003064	ACG	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
86	NC_003064	AGG	2	6	7613	7618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119238
87	NC_003064	ATG	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119238
88	NC_003064	CAT	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119238
89	NC_003064	TTC	2	6	7769	7774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119238
90	NC_003064	GCA	2	6	7797	7802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119238
91	NC_003064	GCG	2	6	7834	7839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119238
92	NC_003064	TCA	2	6	7857	7862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119238
93	NC_003064	GCC	2	6	7940	7945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186457
94	NC_003064	CTT	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186457
95	NC_003064	AGT	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186457
96	NC_003064	GCC	2	6	8141	8146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186457
97	NC_003064	GTT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186457
98	NC_003064	TTC	2	6	8243	8248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186457
99	NC_003064	ACG	2	6	8279	8284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186457
100	NC_003064	CGT	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186457
101	NC_003064	ACC	2	6	8486	8491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186457
102	NC_003064	CTT	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186457
103	NC_003064	TGG	3	9	8616	8624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186457
104	NC_003064	GGC	2	6	9073	9078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186458
105	NC_003064	GCA	2	6	9161	9166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186458
106	NC_003064	GAC	2	6	9168	9173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186458
107	NC_003064	CTT	2	6	9222	9227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186458
108	NC_003064	TCA	2	6	9287	9292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186458
109	NC_003064	CGG	3	9	9308	9316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186458
110	NC_003064	GGC	2	6	9321	9326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186458
111	NC_003064	CGA	2	6	9483	9488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186458
112	NC_003064	CCG	2	6	9497	9502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186458
113	NC_003064	CCG	2	6	9537	9542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186458
114	NC_003064	ATC	2	6	9575	9580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186458
115	NC_003064	CGC	2	6	9590	9595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186458
116	NC_003064	GCG	2	6	9618	9623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186458
117	NC_003064	GGA	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186458
118	NC_003064	ACG	2	6	9863	9868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186458
119	NC_003064	ACC	2	6	9886	9891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186458
120	NC_003064	CGT	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186458
121	NC_003064	GCC	2	6	9982	9987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186458
122	NC_003064	GGT	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186458
123	NC_003064	GTT	2	6	10012	10017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186458
124	NC_003064	ATC	2	6	10483	10488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186671
125	NC_003064	TGA	3	9	10575	10583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186671
126	NC_003064	ATG	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186671
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128	NC_003064	GAG	2	6	10912	10917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186459
129	NC_003064	ATG	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186459
130	NC_003064	ATC	2	6	11202	11207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186459
131	NC_003064	TCC	2	6	11445	11450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186459
132	NC_003064	GAG	2	6	12533	12538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186460
133	NC_003064	GCC	2	6	12547	12552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186460
134	NC_003064	CCT	2	6	12582	12587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186460
135	NC_003064	GGC	2	6	12651	12656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186460
136	NC_003064	GCC	2	6	12661	12666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186460
137	NC_003064	CGG	2	6	12671	12676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186460
138	NC_003064	GCC	2	6	12709	12714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186460
139	NC_003064	CAT	2	6	13126	13131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186461
140	NC_003064	TCT	2	6	13252	13257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186461
141	NC_003064	GCA	2	6	13417	13422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186461
142	NC_003064	AGG	2	6	13578	13583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186461
143	NC_003064	CGG	2	6	13633	13638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186461
144	NC_003064	GGA	2	6	13655	13660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186461
145	NC_003064	TCG	2	6	14507	14512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119245
146	NC_003064	GTC	2	6	14576	14581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119245
147	NC_003064	ATC	2	6	14620	14625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119245
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149	NC_003064	GAA	2	6	14892	14897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119246
150	NC_003064	GCA	2	6	14898	14903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119246
151	NC_003064	TGG	2	6	14996	15001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119246
152	NC_003064	ACA	2	6	15036	15041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119246
153	NC_003064	ACA	2	6	15091	15096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186462
154	NC_003064	ATC	2	6	15443	15448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186462
155	NC_003064	CGC	2	6	15454	15459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186462
156	NC_003064	TTG	2	6	15460	15465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186462
157	NC_003064	GCC	2	6	15509	15514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186462
158	NC_003064	GTT	2	6	15544	15549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186462
159	NC_003064	GCC	2	6	15577	15582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186462
160	NC_003064	GCC	2	6	15584	15589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186462
161	NC_003064	CCA	2	6	15601	15606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186462
162	NC_003064	AGC	2	6	15660	15665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186462
163	NC_003064	GCC	2	6	15820	15825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186462
164	NC_003064	AGT	2	6	15972	15977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186462
165	NC_003064	GGT	2	6	16010	16015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186462
166	NC_003064	TCC	2	6	16633	16638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119248
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169	NC_003064	CGC	2	6	16718	16723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119248
170	NC_003064	CCG	2	6	16747	16752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119248
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172	NC_003064	GTG	2	6	16879	16884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119248
173	NC_003064	CGG	2	6	16976	16981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119248
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189	NC_003064	CTG	2	6	18310	18315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17938606
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192	NC_003064	TCT	2	6	18599	18604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186463
193	NC_003064	GGA	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186463
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212	NC_003064	AGT	2	6	20641	20646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119251
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219	NC_003064	GAT	2	6	21551	21556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119252
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224	NC_003064	GGA	2	6	22008	22013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119252
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240	NC_003064	TGA	2	6	23295	23300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119253
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243	NC_003064	ATC	2	6	23354	23359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119253
244	NC_003064	GTC	2	6	23362	23367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119253
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247	NC_003064	TCG	2	6	23462	23467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119253
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249	NC_003064	TCT	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119253
250	NC_003064	TGC	2	6	23516	23521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119253
251	NC_003064	ATC	2	6	23534	23539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119253
252	NC_003064	TTC	2	6	23557	23562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119253
253	NC_003064	GAG	2	6	23569	23574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119253
254	NC_003064	CAT	2	6	23625	23630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119253
255	NC_003064	TGC	2	6	23801	23806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119253
256	NC_003064	TCC	2	6	23840	23845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119253
257	NC_003064	CAT	3	9	23862	23870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119253
258	NC_003064	CTC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119253
259	NC_003064	ATC	2	6	24053	24058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119253
260	NC_003064	ACG	2	6	24476	24481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186464
261	NC_003064	TCG	2	6	24510	24515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186464
262	NC_003064	AAC	2	6	24521	24526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186464
263	NC_003064	GAT	2	6	24578	24583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186464
264	NC_003064	CGA	2	6	24604	24609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186464
265	NC_003064	GCG	2	6	24639	24644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186464
266	NC_003064	TGA	2	6	24667	24672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186464
267	NC_003064	ATG	2	6	24684	24689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186464
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270	NC_003064	GCC	2	6	25127	25132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186464
271	NC_003064	ACA	2	6	25185	25190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186464
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276	NC_003064	TTG	2	6	25557	25562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186464
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280	NC_003064	ACA	2	6	25809	25814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186464
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283	NC_003064	GCC	2	6	26116	26121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186464
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285	NC_003064	TCC	2	6	26309	26314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186465
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288	NC_003064	CCT	2	6	26442	26447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186465
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293	NC_003064	AAG	2	6	27118	27123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186465
294	NC_003064	GTA	2	6	27137	27142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186465
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369	NC_003064	ATT	2	6	34120	34125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159186467
370	NC_003064	TGA	2	6	34314	34319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186467
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379	NC_003064	GAT	2	6	35907	35912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119262
380	NC_003064	CAA	2	6	35957	35962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119262
381	NC_003064	TCA	2	6	36016	36021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119262
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383	NC_003064	ATG	2	6	36307	36312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119262
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392	NC_003064	TTC	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119263
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412	NC_003064	GCT	2	6	39974	39979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119266
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500	NC_003064	CAG	2	6	47337	47342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119275

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