MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 33312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_003063	GAT	2	6	2050143	2050148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186352
33002	NC_003063	TCG	2	6	2050198	2050203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186352
33003	NC_003063	CTC	2	6	2050229	2050234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186352
33004	NC_003063	GAA	2	6	2050235	2050240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186352
33005	NC_003063	CGT	2	6	2050304	2050309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186352
33006	NC_003063	TGC	2	6	2050493	2050498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186352
33007	NC_003063	CGA	2	6	2050571	2050576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186352
33008	NC_003063	GAC	2	6	2050659	2050664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186352
33009	NC_003063	TTC	2	6	2050716	2050721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186352
33010	NC_003063	CCA	2	6	2050756	2050761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186352
33011	NC_003063	CGC	2	6	2050792	2050797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186352
33012	NC_003063	TTG	2	6	2050937	2050942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33013	NC_003063	GAT	2	6	2051026	2051031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33014	NC_003063	GAC	2	6	2051033	2051038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33015	NC_003063	AAT	2	6	2051178	2051183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15890124
33016	NC_003063	GAG	2	6	2051399	2051404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33017	NC_003063	GCA	2	6	2051499	2051504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890123
33018	NC_003063	GTC	2	6	2051734	2051739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890123
33019	NC_003063	ACA	2	6	2051789	2051794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15890123
33020	NC_003063	GAA	2	6	2051815	2051820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890123
33021	NC_003063	CGG	2	6	2051832	2051837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890123
33022	NC_003063	GGC	2	6	2051851	2051856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890123
33023	NC_003063	CCT	2	6	2051889	2051894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890123
33024	NC_003063	GCA	2	6	2051931	2051936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890123
33025	NC_003063	AGA	2	6	2051951	2051956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890123
33026	NC_003063	CTA	2	6	2052022	2052027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890122
33027	NC_003063	GGC	2	6	2052064	2052069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890122
33028	NC_003063	CGG	2	6	2052092	2052097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890122
33029	NC_003063	AGC	2	6	2052225	2052230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890122
33030	NC_003063	CAC	2	6	2052287	2052292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890122
33031	NC_003063	CGT	2	6	2052370	2052375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890122
33032	NC_003063	GCC	3	9	2052419	2052427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890122
33033	NC_003063	GCA	2	6	2052442	2052447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890122
33034	NC_003063	ATC	2	6	2052638	2052643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890122
33035	NC_003063	AGA	2	6	2052699	2052704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890122
33036	NC_003063	GCC	2	6	2052773	2052778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890122
33037	NC_003063	GCC	2	6	2052857	2052862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890122
33038	NC_003063	GCG	2	6	2052947	2052952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890122
33039	NC_003063	ATC	2	6	2053186	2053191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33040	NC_003063	GAG	2	6	2053520	2053525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890121
33041	NC_003063	CCA	2	6	2053591	2053596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890121
33042	NC_003063	GCC	3	9	2053687	2053695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890121
33043	NC_003063	ATC	2	6	2053807	2053812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890120
33044	NC_003063	CGA	2	6	2053825	2053830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890120
33045	NC_003063	GCG	2	6	2054215	2054220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890120
33046	NC_003063	CGC	2	6	2054235	2054240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890120
33047	NC_003063	TGG	2	6	2054296	2054301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890120
33048	NC_003063	ACG	2	6	2054473	2054478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890120
33049	NC_003063	TGC	2	6	2054487	2054492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890120
33050	NC_003063	AGG	2	6	2054517	2054522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890120
33051	NC_003063	CGA	2	6	2054533	2054538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890120
33052	NC_003063	TCC	2	6	2054550	2054555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890120
33053	NC_003063	CAT	2	6	2054588	2054593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890120
33054	NC_003063	CTT	2	6	2054678	2054683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33055	NC_003063	GCG	2	6	2054711	2054716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33056	NC_003063	GAA	2	6	2054797	2054802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33057	NC_003063	AAG	2	6	2054844	2054849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33058	NC_003063	TCC	2	6	2054884	2054889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890118
33059	NC_003063	CGT	2	6	2055152	2055157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890118
33060	NC_003063	GAT	2	6	2055167	2055172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890118
33061	NC_003063	TGC	2	6	2055205	2055210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890118
33062	NC_003063	TGG	2	6	2055334	2055339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890118
33063	NC_003063	CGA	2	6	2055545	2055550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890118
33064	NC_003063	GCG	2	6	2055555	2055560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890118
33065	NC_003063	TAT	2	6	2055693	2055698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890118
33066	NC_003063	AGG	2	6	2055754	2055759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890118
33067	NC_003063	AGC	2	6	2055864	2055869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33068	NC_003063	CGT	2	6	2056023	2056028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890117
33069	NC_003063	AAG	2	6	2056061	2056066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890117
33070	NC_003063	CTG	2	6	2056098	2056103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890117
33071	NC_003063	AGC	2	6	2056219	2056224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890117
33072	NC_003063	CAT	2	6	2056287	2056292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890117
33073	NC_003063	TCG	2	6	2056385	2056390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890117
33074	NC_003063	TTC	2	6	2056443	2056448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890117
33075	NC_003063	GCT	2	6	2056582	2056587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890116
33076	NC_003063	TCC	2	6	2056625	2056630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890116
33077	NC_003063	CAG	2	6	2056723	2056728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890116
33078	NC_003063	TGA	2	6	2056781	2056786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890116
33079	NC_003063	GAC	2	6	2056816	2056821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890116
33080	NC_003063	AAT	2	6	2056863	2056868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15890116
33081	NC_003063	CGT	2	6	2056917	2056922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890116
33082	NC_003063	TCG	2	6	2056934	2056939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890116
33083	NC_003063	CGA	2	6	2056964	2056969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33084	NC_003063	ATA	2	6	2057249	2057254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33085	NC_003063	TCT	2	6	2057299	2057304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33086	NC_003063	ACA	2	6	2057336	2057341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33087	NC_003063	AAG	2	6	2057349	2057354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33088	NC_003063	GTG	2	6	2057466	2057471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186353
33089	NC_003063	CAA	2	6	2057484	2057489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186353
33090	NC_003063	CGC	2	6	2057550	2057555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186353
33091	NC_003063	GAA	2	6	2057593	2057598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186353
33092	NC_003063	GTC	2	6	2057611	2057616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186353
33093	NC_003063	AAC	2	6	2057659	2057664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186353
33094	NC_003063	TCT	2	6	2057673	2057678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186353
33095	NC_003063	CAC	2	6	2057819	2057824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33096	NC_003063	CTT	2	6	2057952	2057957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890114
33097	NC_003063	CTT	2	6	2058083	2058088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890114
33098	NC_003063	CCG	2	6	2058094	2058099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890114
33099	NC_003063	ACG	2	6	2058220	2058225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890114
33100	NC_003063	TGA	2	6	2058359	2058364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890114
33101	NC_003063	GCT	2	6	2058584	2058589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890114
33102	NC_003063	CGC	2	6	2058633	2058638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890114
33103	NC_003063	ATA	2	6	2058817	2058822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15890114
33104	NC_003063	CGC	2	6	2058824	2058829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890114
33105	NC_003063	GAC	2	6	2058849	2058854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890114
33106	NC_003063	GCC	2	6	2058887	2058892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890114
33107	NC_003063	TCA	2	6	2059166	2059171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890113
33108	NC_003063	CGC	2	6	2059215	2059220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890113
33109	NC_003063	GTA	2	6	2059237	2059242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890113
33110	NC_003063	ACT	2	6	2059244	2059249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890113
33111	NC_003063	GTT	2	6	2059276	2059281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890113
33112	NC_003063	GAG	2	6	2059282	2059287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890113
33113	NC_003063	ATC	2	6	2059288	2059293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890113
33114	NC_003063	TGG	2	6	2059299	2059304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890113
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33116	NC_003063	CAA	2	6	2059404	2059409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15890113
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33232	NC_003063	AAT	2	6	2068921	2068926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159186358
33233	NC_003063	CGA	2	6	2068949	2068954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186358
33234	NC_003063	TCG	2	6	2069055	2069060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186358
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.