MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 41932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003062	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887360
2	NC_003062	GAT	2	6	331	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887360
3	NC_003062	AGC	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887360
4	NC_003062	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887360
5	NC_003062	ATC	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887360
6	NC_003062	GGC	2	6	528	533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887360
7	NC_003062	ATT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15887360
8	NC_003062	ATG	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887360
9	NC_003062	GTC	2	6	647	652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887360
10	NC_003062	ATC	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887360
11	NC_003062	TCG	2	6	789	794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887360
12	NC_003062	TCG	2	6	798	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887360
13	NC_003062	CGG	2	6	856	861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887360
14	NC_003062	CCA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15887360
15	NC_003062	CAA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15887360
16	NC_003062	TGA	2	6	1151	1156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159184119
17	NC_003062	TGA	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159184119
18	NC_003062	CTG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184119
19	NC_003062	GGT	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184119
20	NC_003062	CAG	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184119
21	NC_003062	ATT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159184119
22	NC_003062	ATC	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184120
23	NC_003062	CCA	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159184120
24	NC_003062	ATC	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184120
25	NC_003062	GAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159184120
26	NC_003062	GCC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184120
27	NC_003062	GGT	2	6	2046	2051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184120
28	NC_003062	CGG	2	6	2061	2066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184120
29	NC_003062	CGT	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184120
30	NC_003062	AGG	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159184120
31	NC_003062	GTT	2	6	2229	2234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159184120
32	NC_003062	GGT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184120
33	NC_003062	TCA	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184120
34	NC_003062	ATC	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184120
35	NC_003062	TGA	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159184120
36	NC_003062	ACG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184121
37	NC_003062	CGC	2	6	2651	2656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184121
38	NC_003062	ACG	2	6	2667	2672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184121
39	NC_003062	TGC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184121
40	NC_003062	GTG	3	9	2883	2891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184121
41	NC_003062	GGA	2	6	2945	2950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159184121
42	NC_003062	GTC	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184121
43	NC_003062	CGG	2	6	3178	3183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887364
44	NC_003062	GGA	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15887364
45	NC_003062	TTC	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887364
46	NC_003062	TCA	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887364
47	NC_003062	CCG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887364
48	NC_003062	CGG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887364
49	NC_003062	CCG	2	6	3642	3647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887364
50	NC_003062	ATC	3	9	3662	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887364
51	NC_003062	GAA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15887364
52	NC_003062	TTC	2	6	3943	3948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887365
53	NC_003062	ATC	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887365
54	NC_003062	GCG	2	6	3999	4004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887365
55	NC_003062	GCA	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887365
56	NC_003062	CGC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887365
57	NC_003062	AAC	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15887365
58	NC_003062	GAG	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15887365
59	NC_003062	ATC	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887366
60	NC_003062	CTC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15887366
61	NC_003062	CCA	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15887366
62	NC_003062	ACG	3	9	4674	4682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887366
63	NC_003062	TGA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887366
64	NC_003062	ATG	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887366
65	NC_003062	CGA	2	6	4786	4791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887366
66	NC_003062	CCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887366
67	NC_003062	CGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887366
68	NC_003062	CGA	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887366
69	NC_003062	TGA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887366
70	NC_003062	CAT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887366
71	NC_003062	TCT	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887366
72	NC_003062	TCT	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159184122
73	NC_003062	GCC	2	6	5249	5254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184122
74	NC_003062	GCC	2	6	5271	5276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184122
75	NC_003062	GAA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159184122
76	NC_003062	CTG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184122
77	NC_003062	TGA	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159184122
78	NC_003062	GAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159184122
79	NC_003062	AGG	2	6	5564	5569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159184122
80	NC_003062	GGC	2	6	5586	5591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184122
81	NC_003062	GTG	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184122
82	NC_003062	TGG	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184122
83	NC_003062	GAT	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15887368
84	NC_003062	CCG	2	6	6221	6226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887368
85	NC_003062	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887368
86	NC_003062	TGG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15887368
87	NC_003062	CGC	2	6	6333	6338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887368
88	NC_003062	TTC	2	6	6408	6413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887368
89	NC_003062	CGC	3	9	6680	6688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887368
90	NC_003062	TTC	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15887368
91	NC_003062	CGA	2	6	6788	6793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887368
92	NC_003062	CTG	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887368
93	NC_003062	TGC	2	6	6953	6958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887368
94	NC_003062	GAA	2	6	7001	7006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15887369
95	NC_003062	CGA	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887369
96	NC_003062	AGA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15887369
97	NC_003062	CGG	2	6	7158	7163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887369
98	NC_003062	CTG	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887369
99	NC_003062	TCA	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887369
100	NC_003062	TGG	2	6	7486	7491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15887369
101	NC_003062	CGG	2	6	7520	7525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15887369
102	NC_003062	CTG	2	6	7681	7686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887370
103	NC_003062	CAT	2	6	7710	7715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15887370
104	NC_003062	GGA	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15887370
105	NC_003062	GGT	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15887370
106	NC_003062	GCC	2	6	7791	7796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887370
107	NC_003062	GCC	2	6	7845	7850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15887370
108	NC_003062	TGC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15887370
109	NC_003062	GTC	2	6	8220	8225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184123
110	NC_003062	TCC	2	6	8343	8348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159184123
111	NC_003062	CCG	3	9	8359	8367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
112	NC_003062	TCA	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184123
113	NC_003062	GGT	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184123
114	NC_003062	GGT	2	6	8456	8461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184123
115	NC_003062	CCG	2	6	8495	8500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
116	NC_003062	AGC	2	6	8734	8739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184123
117	NC_003062	CGG	2	6	8756	8761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184123
118	NC_003062	AAG	2	6	8796	8801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159184123
119	NC_003062	TGG	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184123
120	NC_003062	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159184123
121	NC_003062	CAA	2	6	8909	8914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159184123
122	NC_003062	GGC	2	6	8931	8936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184123
123	NC_003062	CCT	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159184123
124	NC_003062	CAT	2	6	9002	9007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184123
125	NC_003062	TCG	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184123
126	NC_003062	GCC	2	6	9249	9254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
127	NC_003062	CGC	2	6	9276	9281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
128	NC_003062	TCG	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184123
129	NC_003062	CCG	2	6	9379	9384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
130	NC_003062	TGT	2	6	9481	9486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159184123
131	NC_003062	ATC	3	9	9576	9584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184123
132	NC_003062	CTA	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184123
133	NC_003062	CTT	3	9	9635	9643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159184123
134	NC_003062	GCC	2	6	9692	9697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
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136	NC_003062	GGC	2	6	9920	9925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184123
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138	NC_003062	GGA	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159184123
139	NC_003062	GGC	2	6	10062	10067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184123
140	NC_003062	CGC	2	6	10192	10197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159184123
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255	NC_003062	ATC	2	6	19852	19857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159184127
256	NC_003062	CAC	2	6	19870	19875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159184127
257	NC_003062	CCA	2	6	19889	19894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159184127
258	NC_003062	CGG	2	6	19904	19909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184127
259	NC_003062	GGC	2	6	19935	19940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184127
260	NC_003062	TCG	2	6	20079	20084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159184128
261	NC_003062	GCG	2	6	20152	20157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184128
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263	NC_003062	GCA	2	6	20521	20526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184128
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272	NC_003062	CGG	2	6	20932	20937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159184128
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288	NC_003062	GAT	2	6	21809	21814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159184128
289	NC_003062	CGA	2	6	21862	21867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159184128
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367	NC_003062	CCA	2	6	26217	26222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15887383
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374	NC_003062	CGA	2	6	26570	26575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15887383
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378	NC_003062	GTG	2	6	26754	26759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15887383
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