MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	TTTAA	2	10	1688	1697	40 %	60 %	0 %	0 %	15081480
2	NC_003042	TATAT	2	10	5907	5916	40 %	60 %	0 %	0 %	15081488
3	NC_003042	TCATA	2	10	6208	6217	40 %	40 %	0 %	20 %	15081488
4	NC_003042	TGATT	2	10	6408	6417	20 %	60 %	20 %	0 %	15081488
5	NC_003042	TGCTT	2	10	6699	6708	0 %	60 %	20 %	20 %	15081488
6	NC_003042	AATAT	2	10	6854	6863	60 %	40 %	0 %	0 %	15081488
7	NC_003042	TGTTT	2	10	6864	6873	0 %	80 %	20 %	0 %	15081488
8	NC_003042	GAAAA	2	10	7737	7746	80 %	0 %	20 %	0 %	15081488
9	NC_003042	TGGAT	2	10	10796	10805	20 %	40 %	40 %	0 %	15081494
10	NC_003042	TTTTA	2	10	12631	12640	20 %	80 %	0 %	0 %	15081496
11	NC_003042	TATGA	2	10	13993	14002	40 %	40 %	20 %	0 %	15081497
12	NC_003042	AAATA	2	10	14570	14579	80 %	20 %	0 %	0 %	15081498
13	NC_003042	ATTAT	2	10	16015	16024	40 %	60 %	0 %	0 %	15081500
14	NC_003042	TAAAA	2	10	16230	16239	80 %	20 %	0 %	0 %	15081500
15	NC_003042	AATGA	2	10	17066	17075	60 %	20 %	20 %	0 %	15081502
16	NC_003042	ATATA	2	10	17175	17184	60 %	40 %	0 %	0 %	15081503
17	NC_003042	TTAAT	2	10	17456	17465	40 %	60 %	0 %	0 %	15081503
18	NC_003042	TAATA	2	10	18294	18303	60 %	40 %	0 %	0 %	15081505
19	NC_003042	AATTT	2	10	19392	19401	40 %	60 %	0 %	0 %	15081506
20	NC_003042	ATGAA	2	10	19521	19530	60 %	20 %	20 %	0 %	15081506
21	NC_003042	ACAAA	2	10	21265	21274	80 %	0 %	0 %	20 %	15081509
22	NC_003042	TTATT	2	10	22702	22711	20 %	80 %	0 %	0 %	15081511
23	NC_003042	TTATT	2	10	24131	24140	20 %	80 %	0 %	0 %	15081514
24	NC_003042	TACTA	2	10	24168	24177	40 %	40 %	0 %	20 %	15081514
25	NC_003042	TTTTA	2	10	24306	24315	20 %	80 %	0 %	0 %	15081514
26	NC_003042	AAATC	2	10	24962	24971	60 %	20 %	0 %	20 %	15081515
27	NC_003042	CTTTT	2	10	27384	27393	0 %	80 %	0 %	20 %	15081516
28	NC_003042	CATAT	2	10	27986	27995	40 %	40 %	0 %	20 %	15081519
29	NC_003042	CTTTT	2	10	28261	28270	0 %	80 %	0 %	20 %	15081519
30	NC_003042	AGTTA	2	10	28364	28373	40 %	40 %	20 %	0 %	15081519
31	NC_003042	TGTAG	2	10	28687	28696	20 %	40 %	40 %	0 %	15081519
32	NC_003042	TGTTT	2	10	29453	29462	0 %	80 %	20 %	0 %	15081520
33	NC_003042	AAATC	2	10	31326	31335	60 %	20 %	0 %	20 %	15081524
34	NC_003042	AATTT	2	10	32414	32423	40 %	60 %	0 %	0 %	15081525
35	NC_003042	TCTTT	2	10	33780	33789	0 %	80 %	0 %	20 %	15081526
36	NC_003042	TAACC	2	10	34534	34543	40 %	20 %	0 %	40 %	15081526
37	NC_003042	TATCT	2	10	35771	35780	20 %	60 %	0 %	20 %	15081527
38	NC_003042	TACCT	2	10	36131	36140	20 %	40 %	0 %	40 %	15081527
39	NC_003042	ATATA	2	10	36683	36692	60 %	40 %	0 %	0 %	15081527
40	NC_003042	TATAA	2	10	37019	37028	60 %	40 %	0 %	0 %	15081527
41	NC_003042	TTTAA	2	10	37747	37756	40 %	60 %	0 %	0 %	15081528
42	NC_003042	ATATT	2	10	38205	38214	40 %	60 %	0 %	0 %	15081529
43	NC_003042	TTCAT	2	10	38510	38519	20 %	60 %	0 %	20 %	15081530
44	NC_003042	TGAAG	2	10	38645	38654	40 %	20 %	40 %	0 %	15081530
45	NC_003042	TTCAT	2	10	39047	39056	20 %	60 %	0 %	20 %	15081530
46	NC_003042	GTTTT	2	10	39113	39122	0 %	80 %	20 %	0 %	15081530
47	NC_003042	ATATA	2	10	39453	39462	60 %	40 %	0 %	0 %	15081530
48	NC_003042	TATAT	2	10	39685	39694	40 %	60 %	0 %	0 %	15081530
49	NC_003042	AATTA	2	10	42567	42576	60 %	40 %	0 %	0 %	15081531
50	NC_003042	CAAAT	2	10	42756	42765	60 %	20 %	0 %	20 %	15081531
51	NC_003042	TAAAT	2	10	43005	43014	60 %	40 %	0 %	0 %	15081531
52	NC_003042	CTAAA	2	10	44222	44231	60 %	20 %	0 %	20 %	15081535
53	NC_003042	ATTTT	2	10	45008	45017	20 %	80 %	0 %	0 %	15081536
54	NC_003042	TTTGC	2	10	49348	49357	0 %	60 %	20 %	20 %	15081537
55	NC_003042	TAATT	2	10	51100	51109	40 %	60 %	0 %	0 %	15081540
56	NC_003042	ATTAT	2	10	53232	53241	40 %	60 %	0 %	0 %	15081542
57	NC_003042	TTTAA	2	10	53845	53854	40 %	60 %	0 %	0 %	15081543
58	NC_003042	TATCT	2	10	54117	54126	20 %	60 %	0 %	20 %	15081543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.