MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	ATT	2	6	157	162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003042	ATT	3	9	166	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003042	CCT	2	6	193	198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_003042	TTA	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003042	TTA	3	9	478	486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003042	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003042	AGA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003042	CTT	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003042	AGC	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003042	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003042	CAA	2	6	773	778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_003042	GTT	2	6	799	804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003042	GAA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
14	NC_003042	AAC	2	6	984	989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081480
15	NC_003042	AGA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
16	NC_003042	TAT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081480
17	NC_003042	TAG	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081480
18	NC_003042	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081480
19	NC_003042	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081480
20	NC_003042	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
21	NC_003042	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081480
22	NC_003042	CCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081480
23	NC_003042	AGA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
24	NC_003042	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081480
25	NC_003042	TAC	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081480
26	NC_003042	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081480
27	NC_003042	GTA	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081480
28	NC_003042	GAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
29	NC_003042	TCT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081480
30	NC_003042	GGT	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003042	GAG	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15081481
32	NC_003042	AGA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
33	NC_003042	TAG	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081481
34	NC_003042	TAA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
35	NC_003042	GTG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15081481
36	NC_003042	AGA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
37	NC_003042	ATA	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
38	NC_003042	ATT	2	6	2243	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081481
39	NC_003042	GAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
40	NC_003042	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
41	NC_003042	GAT	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081481
42	NC_003042	AAG	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
43	NC_003042	GAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
44	NC_003042	GAA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
45	NC_003042	AGA	3	9	2548	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
46	NC_003042	TAA	2	6	2620	2625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
47	NC_003042	GAA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
48	NC_003042	GAA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
49	NC_003042	AGA	3	9	2707	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
50	NC_003042	AGA	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
51	NC_003042	TAA	2	6	2827	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
52	NC_003042	TAA	2	6	2926	2931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
53	NC_003042	AGA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
54	NC_003042	TTA	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081481
55	NC_003042	GAT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003042	AAC	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081482
57	NC_003042	ACC	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081482
58	NC_003042	AGA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
59	NC_003042	AGA	2	6	3332	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
60	NC_003042	AGA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
61	NC_003042	ATA	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081482
62	NC_003042	TAA	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081482
63	NC_003042	TAT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003042	ATA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003042	TAA	2	6	3592	3597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003042	ATT	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003042	AAT	2	6	3680	3685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003042	CTT	3	9	3708	3716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003042	AAT	2	6	3720	3725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003042	AAG	3	9	3746	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003042	AAT	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081484
72	NC_003042	ATG	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081484
73	NC_003042	TTC	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081484
74	NC_003042	AAG	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081484
75	NC_003042	TAG	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081484
76	NC_003042	AAT	2	6	4039	4044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081485
77	NC_003042	ACT	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081485
78	NC_003042	AAT	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081485
79	NC_003042	TTG	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003042	TTA	2	6	4323	4328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003042	TAA	2	6	4407	4412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003042	AAG	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003042	TCA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_003042	AGG	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003042	ATG	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081486
86	NC_003042	TAA	2	6	4679	4684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081486
87	NC_003042	TGT	2	6	4688	4693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081486
88	NC_003042	TAA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081486
89	NC_003042	TAT	2	6	4860	4865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003042	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003042	TAG	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003042	TAT	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003042	TAT	3	9	5018	5026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003042	TAA	3	9	5041	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003042	TAA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003042	AAT	2	6	5081	5086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003042	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003042	TCT	2	6	5124	5129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003042	TAT	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003042	TAT	2	6	5167	5172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
101	NC_003042	ATT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
102	NC_003042	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
103	NC_003042	TTC	2	6	5286	5291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
104	NC_003042	AAT	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
105	NC_003042	CAC	3	9	5375	5383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081487
106	NC_003042	CAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081487
107	NC_003042	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
108	NC_003042	TCT	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
109	NC_003042	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
110	NC_003042	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
111	NC_003042	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
112	NC_003042	ATC	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081487
113	NC_003042	TAA	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
114	NC_003042	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
115	NC_003042	TAC	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
116	NC_003042	TTA	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
117	NC_003042	ATT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
118	NC_003042	ATG	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081488
119	NC_003042	ATA	2	6	6123	6128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
120	NC_003042	TAA	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
121	NC_003042	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
122	NC_003042	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081488
123	NC_003042	ATA	2	6	6521	6526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
124	NC_003042	TAA	2	6	6641	6646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
125	NC_003042	TCT	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
126	NC_003042	TTA	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
127	NC_003042	ATC	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
128	NC_003042	TAC	2	6	7187	7192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
129	NC_003042	GTA	2	6	7216	7221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081488
130	NC_003042	TAA	2	6	7226	7231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
131	NC_003042	TAA	2	6	7265	7270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
132	NC_003042	ACT	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
133	NC_003042	AAT	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
134	NC_003042	AAT	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
135	NC_003042	TCT	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
136	NC_003042	TAA	2	6	7561	7566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
137	NC_003042	TGT	2	6	7575	7580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081488
138	NC_003042	TCT	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
139	NC_003042	TTG	2	6	7597	7602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081488
140	NC_003042	TAT	2	6	7618	7623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
141	NC_003042	TAT	2	6	7775	7780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
142	NC_003042	TAT	2	6	7795	7800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
143	NC_003042	TAA	4	12	7924	7935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
144	NC_003042	AAT	2	6	7940	7945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
145	NC_003042	ATT	3	9	8007	8015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003042	AGT	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081489
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148	NC_003042	AAT	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003042	TTA	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_003042	AGA	2	6	8718	8723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003042	TTG	2	6	8732	8737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003042	ATG	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003042	TGT	2	6	9134	9139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081491
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157	NC_003042	TTG	2	6	9320	9325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081491
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160	NC_003042	ATA	2	6	9434	9439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_003042	TAT	2	6	9466	9471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_003042	TAA	2	6	9533	9538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081492
163	NC_003042	TTC	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
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173	NC_003042	TAT	2	6	9916	9921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081492
174	NC_003042	CTT	2	6	9930	9935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
175	NC_003042	TTC	2	6	9947	9952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
176	NC_003042	ATA	2	6	9999	10004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_003042	TAG	2	6	12024	12029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_003042	TGT	2	6	16337	16342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081501
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271	NC_003042	TAT	2	6	16589	16594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081501
272	NC_003042	ATC	2	6	16606	16611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081501
273	NC_003042	GAT	2	6	16638	16643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081501
274	NC_003042	TGA	2	6	16718	16723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081501
275	NC_003042	TTA	2	6	16729	16734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081501
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277	NC_003042	TAA	2	6	16764	16769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_003042	AGA	2	6	16870	16875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081502
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280	NC_003042	AAT	2	6	16961	16966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081502
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303	NC_003042	CTT	2	6	17983	17988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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316	NC_003042	ATT	2	6	18548	18553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_003042	ATA	2	6	20454	20459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_003042	AAT	2	6	23718	23723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081513
400	NC_003042	TGT	2	6	23820	23825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_003042	CTA	2	6	23924	23929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_003042	ATT	2	6	23968	23973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_003042	TTA	2	6	24011	24016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_003042	TAT	2	6	24063	24068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081514
405	NC_003042	TCA	2	6	24223	24228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081514
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433	NC_003042	TCA	2	6	26334	26339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081516
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455	NC_003042	TAA	2	6	27686	27691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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