MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	AT	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003042	TC	3	6	92	97	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003042	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003042	TA	3	6	342	347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003042	TA	3	6	361	366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003042	TA	3	6	1853	1858	50 %	50 %	0 %	0 %	15081481
7	NC_003042	AG	3	6	2138	2143	50 %	0 %	50 %	0 %	15081481
8	NC_003042	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	15081481
9	NC_003042	TA	3	6	3068	3073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003042	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003042	GA	3	6	3429	3434	50 %	0 %	50 %	0 %	15081482
12	NC_003042	AT	3	6	3493	3498	50 %	50 %	0 %	0 %	15081482
13	NC_003042	TA	3	6	3797	3802	50 %	50 %	0 %	0 %	15081484
14	NC_003042	TA	3	6	4592	4597	50 %	50 %	0 %	0 %	15081486
15	NC_003042	AT	3	6	4969	4974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003042	TA	3	6	5034	5039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003042	CT	3	6	5363	5368	0 %	50 %	0 %	50 %	15081487
18	NC_003042	AT	4	8	5391	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	15081487
19	NC_003042	TG	3	6	5478	5483	0 %	50 %	50 %	0 %	15081487
20	NC_003042	TC	4	8	6670	6677	0 %	50 %	0 %	50 %	15081488
21	NC_003042	AT	3	6	6678	6683	50 %	50 %	0 %	0 %	15081488
22	NC_003042	AT	3	6	7059	7064	50 %	50 %	0 %	0 %	15081488
23	NC_003042	TA	4	8	7105	7112	50 %	50 %	0 %	0 %	15081488
24	NC_003042	TA	3	6	7700	7705	50 %	50 %	0 %	0 %	15081488
25	NC_003042	TA	3	6	9038	9043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003042	AG	3	6	9148	9153	50 %	0 %	50 %	0 %	15081491
27	NC_003042	TA	3	6	10312	10317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003042	TA	3	6	10323	10328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003042	TG	3	6	10369	10374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003042	TA	5	10	10450	10459	50 %	50 %	0 %	0 %	15081494
31	NC_003042	TA	3	6	10707	10712	50 %	50 %	0 %	0 %	15081494
32	NC_003042	AT	3	6	11017	11022	50 %	50 %	0 %	0 %	15081494
33	NC_003042	AT	4	8	11408	11415	50 %	50 %	0 %	0 %	15081495
34	NC_003042	TA	3	6	11789	11794	50 %	50 %	0 %	0 %	15081495
35	NC_003042	TA	3	6	11852	11857	50 %	50 %	0 %	0 %	15081495
36	NC_003042	TA	3	6	11941	11946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003042	AT	3	6	12790	12795	50 %	50 %	0 %	0 %	15081496
38	NC_003042	TA	3	6	12946	12951	50 %	50 %	0 %	0 %	15081496
39	NC_003042	TA	3	6	13360	13365	50 %	50 %	0 %	0 %	15081496
40	NC_003042	AT	4	8	13490	13497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003042	AT	3	6	14079	14084	50 %	50 %	0 %	0 %	15081497
42	NC_003042	AT	3	6	14198	14203	50 %	50 %	0 %	0 %	15081497
43	NC_003042	TA	4	8	14351	14358	50 %	50 %	0 %	0 %	15081497
44	NC_003042	CA	3	6	14833	14838	50 %	0 %	0 %	50 %	15081498
45	NC_003042	TA	3	6	14856	14861	50 %	50 %	0 %	0 %	15081498
46	NC_003042	AT	3	6	15075	15080	50 %	50 %	0 %	0 %	15081498
47	NC_003042	TC	3	6	15437	15442	0 %	50 %	0 %	50 %	15081499
48	NC_003042	TA	3	6	15529	15534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003042	GA	3	6	15762	15767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003042	AT	3	6	16202	16207	50 %	50 %	0 %	0 %	15081500
51	NC_003042	AC	3	6	16266	16271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003042	AG	3	6	16449	16454	50 %	0 %	50 %	0 %	15081501
53	NC_003042	AT	3	6	16939	16944	50 %	50 %	0 %	0 %	15081502
54	NC_003042	TA	3	6	17097	17102	50 %	50 %	0 %	0 %	15081502
55	NC_003042	TA	3	6	17379	17384	50 %	50 %	0 %	0 %	15081503
56	NC_003042	GA	3	6	17494	17499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003042	TA	3	6	17774	17779	50 %	50 %	0 %	0 %	15081504
58	NC_003042	TA	3	6	17795	17800	50 %	50 %	0 %	0 %	15081504
59	NC_003042	AC	3	6	17971	17976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_003042	GA	3	6	18264	18269	50 %	0 %	50 %	0 %	15081505
61	NC_003042	AT	3	6	18612	18617	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
62	NC_003042	AT	3	6	18627	18632	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
63	NC_003042	AT	3	6	18938	18943	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
64	NC_003042	TA	3	6	19011	19016	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
65	NC_003042	TA	3	6	19028	19033	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
66	NC_003042	AT	4	8	19432	19439	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
67	NC_003042	AT	3	6	19635	19640	50 %	50 %	0 %	0 %	15081506
68	NC_003042	AT	4	8	19697	19704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003042	GT	3	6	20428	20433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003042	TA	4	8	20590	20597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003042	AT	3	6	20771	20776	50 %	50 %	0 %	0 %	15081509
72	NC_003042	TA	3	6	21310	21315	50 %	50 %	0 %	0 %	15081509
73	NC_003042	TA	3	6	21352	21357	50 %	50 %	0 %	0 %	15081509
74	NC_003042	TA	3	6	21401	21406	50 %	50 %	0 %	0 %	15081509
75	NC_003042	TA	3	6	21562	21567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003042	GT	3	6	21661	21666	0 %	50 %	50 %	0 %	15081510
77	NC_003042	TA	6	12	21776	21787	50 %	50 %	0 %	0 %	15081510
78	NC_003042	AT	5	10	22186	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	15081510
79	NC_003042	TA	3	6	22570	22575	50 %	50 %	0 %	0 %	15081510
80	NC_003042	TA	3	6	22886	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	15081511
81	NC_003042	AT	4	8	22911	22918	50 %	50 %	0 %	0 %	15081511
82	NC_003042	AT	3	6	22973	22978	50 %	50 %	0 %	0 %	15081511
83	NC_003042	AT	3	6	23048	23053	50 %	50 %	0 %	0 %	15081511
84	NC_003042	GA	3	6	23535	23540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003042	AG	3	6	23609	23614	50 %	0 %	50 %	0 %	15081513
86	NC_003042	TA	3	6	23983	23988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003042	AT	3	6	24810	24815	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
88	NC_003042	TA	3	6	24996	25001	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
89	NC_003042	TA	3	6	25053	25058	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
90	NC_003042	TC	3	6	25123	25128	0 %	50 %	0 %	50 %	15081515
91	NC_003042	TA	3	6	25158	25163	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
92	NC_003042	AT	3	6	25356	25361	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
93	NC_003042	TA	4	8	25428	25435	50 %	50 %	0 %	0 %	15081515
94	NC_003042	TA	3	6	26012	26017	50 %	50 %	0 %	0 %	15081516
95	NC_003042	CT	3	6	26048	26053	0 %	50 %	0 %	50 %	15081516
96	NC_003042	TA	3	6	26188	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	15081516
97	NC_003042	AT	3	6	26213	26218	50 %	50 %	0 %	0 %	15081516
98	NC_003042	TC	3	6	27055	27060	0 %	50 %	0 %	50 %	15081516
99	NC_003042	TA	3	6	27533	27538	50 %	50 %	0 %	0 %	15081517
100	NC_003042	AT	4	8	27669	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	15081517
101	NC_003042	TA	3	6	28216	28221	50 %	50 %	0 %	0 %	15081519
102	NC_003042	TA	3	6	28352	28357	50 %	50 %	0 %	0 %	15081519
103	NC_003042	TA	3	6	28600	28605	50 %	50 %	0 %	0 %	15081519
104	NC_003042	TA	3	6	29042	29047	50 %	50 %	0 %	0 %	15081519
105	NC_003042	AT	3	6	29223	29228	50 %	50 %	0 %	0 %	15081520
106	NC_003042	CT	3	6	29407	29412	0 %	50 %	0 %	50 %	15081520
107	NC_003042	CA	3	6	29980	29985	50 %	0 %	0 %	50 %	15081522
108	NC_003042	AT	3	6	30589	30594	50 %	50 %	0 %	0 %	15081523
109	NC_003042	CT	3	6	30751	30756	0 %	50 %	0 %	50 %	15081523
110	NC_003042	AT	3	6	32478	32483	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
111	NC_003042	TA	3	6	32825	32830	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
112	NC_003042	TA	3	6	33041	33046	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
113	NC_003042	TC	3	6	33137	33142	0 %	50 %	0 %	50 %	15081526
114	NC_003042	AT	3	6	33927	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	15081526
115	NC_003042	AT	4	8	35282	35289	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
116	NC_003042	TA	3	6	35431	35436	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
117	NC_003042	AT	4	8	35560	35567	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
118	NC_003042	TC	4	8	36501	36508	0 %	50 %	0 %	50 %	15081527
119	NC_003042	AT	3	6	36509	36514	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
120	NC_003042	AT	3	6	37265	37270	50 %	50 %	0 %	0 %	15081528
121	NC_003042	AT	3	6	37408	37413	50 %	50 %	0 %	0 %	15081528
122	NC_003042	TA	6	12	37538	37549	50 %	50 %	0 %	0 %	15081528
123	NC_003042	TC	3	6	37971	37976	0 %	50 %	0 %	50 %	15081529
124	NC_003042	AT	3	6	38065	38070	50 %	50 %	0 %	0 %	15081529
125	NC_003042	CA	3	6	39628	39633	50 %	0 %	0 %	50 %	15081530
126	NC_003042	TA	3	6	40206	40211	50 %	50 %	0 %	0 %	15081530
127	NC_003042	TA	3	6	40436	40441	50 %	50 %	0 %	0 %	15081531
128	NC_003042	TA	3	6	40716	40721	50 %	50 %	0 %	0 %	15081531
129	NC_003042	TC	3	6	41033	41038	0 %	50 %	0 %	50 %	15081531
130	NC_003042	TA	3	6	41478	41483	50 %	50 %	0 %	0 %	15081531
131	NC_003042	AT	3	6	41734	41739	50 %	50 %	0 %	0 %	15081531
132	NC_003042	TA	3	6	41993	41998	50 %	50 %	0 %	0 %	15081531
133	NC_003042	TA	3	6	43182	43187	50 %	50 %	0 %	0 %	15081532
134	NC_003042	TA	3	6	43433	43438	50 %	50 %	0 %	0 %	15081533
135	NC_003042	CT	3	6	43779	43784	0 %	50 %	0 %	50 %	15081534
136	NC_003042	CT	3	6	43917	43922	0 %	50 %	0 %	50 %	15081535
137	NC_003042	TA	3	6	44048	44053	50 %	50 %	0 %	0 %	15081535
138	NC_003042	AT	3	6	44383	44388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003042	TC	3	6	44440	44445	0 %	50 %	0 %	50 %	15081536
140	NC_003042	AT	3	6	44490	44495	50 %	50 %	0 %	0 %	15081536
141	NC_003042	TA	3	6	44607	44612	50 %	50 %	0 %	0 %	15081536
142	NC_003042	TA	3	6	44944	44949	50 %	50 %	0 %	0 %	15081536
143	NC_003042	CT	3	6	45058	45063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_003042	TA	3	6	45083	45088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003042	AT	3	6	47122	47127	50 %	50 %	0 %	0 %	15081537
146	NC_003042	AT	3	6	48556	48561	50 %	50 %	0 %	0 %	15081537
147	NC_003042	AT	3	6	48634	48639	50 %	50 %	0 %	0 %	15081537
148	NC_003042	CT	3	6	49249	49254	0 %	50 %	0 %	50 %	15081537
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150	NC_003042	TA	4	8	49913	49920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.