MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	AT	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003042	TC	3	6	92	97	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003042	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003042	TA	3	6	342	347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003042	TA	3	6	361	366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003042	TA	3	6	3068	3073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003042	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003042	AT	3	6	4969	4974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003042	TA	3	6	5034	5039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003042	TA	3	6	9038	9043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003042	TA	3	6	10312	10317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003042	TA	3	6	10323	10328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003042	TG	3	6	10369	10374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003042	TA	3	6	11941	11946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003042	AT	4	8	13490	13497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003042	TA	3	6	15529	15534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003042	GA	3	6	15762	15767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003042	AC	3	6	16266	16271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003042	GA	3	6	17494	17499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003042	AC	3	6	17971	17976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003042	AT	4	8	19697	19704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003042	GT	3	6	20428	20433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003042	TA	4	8	20590	20597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003042	TA	3	6	21562	21567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003042	GA	3	6	23535	23540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003042	TA	3	6	23983	23988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003042	AT	3	6	44383	44388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003042	CT	3	6	45058	45063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003042	TA	3	6	45083	45088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003042	TA	4	8	49913	49920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003042	TA	3	6	51598	51603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003042	TA	3	6	51617	51622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003042	TA	3	6	51777	51782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003042	AT	3	6	51786	51791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003042	TA	3	6	51805	51810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003042	TA	3	6	51813	51818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003042	TA	3	6	51839	51844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003042	TC	3	6	51864	51869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003042	TA	3	6	53072	53077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003042	AT	3	6	53103	53108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.