MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	A	6	6	1556	1561	100 %	0 %	0 %	0 %	15081480
2	NC_003042	A	6	6	1798	1803	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
3	NC_003042	A	6	6	2200	2205	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
4	NC_003042	A	6	6	2507	2512	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
5	NC_003042	A	8	8	2603	2610	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
6	NC_003042	A	6	6	2936	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
7	NC_003042	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
8	NC_003042	A	6	6	3151	3156	100 %	0 %	0 %	0 %	15081482
9	NC_003042	A	6	6	3197	3202	100 %	0 %	0 %	0 %	15081482
10	NC_003042	T	6	6	3281	3286	0 %	100 %	0 %	0 %	15081482
11	NC_003042	T	6	6	3784	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	15081484
12	NC_003042	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	15081486
13	NC_003042	T	7	7	5401	5407	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
14	NC_003042	T	6	6	5605	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
15	NC_003042	T	7	7	5721	5727	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
16	NC_003042	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
17	NC_003042	T	6	6	6430	6435	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
18	NC_003042	T	7	7	6891	6897	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
19	NC_003042	A	8	8	6941	6948	100 %	0 %	0 %	0 %	15081488
20	NC_003042	T	6	6	7020	7025	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
21	NC_003042	A	8	8	7166	7173	100 %	0 %	0 %	0 %	15081488
22	NC_003042	T	6	6	7402	7407	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
23	NC_003042	T	6	6	7860	7865	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
24	NC_003042	T	9	9	7955	7963	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
25	NC_003042	A	6	6	9163	9168	100 %	0 %	0 %	0 %	15081491
26	NC_003042	A	10	10	9250	9259	100 %	0 %	0 %	0 %	15081491
27	NC_003042	T	7	7	9505	9511	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
28	NC_003042	T	6	6	9513	9518	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
29	NC_003042	T	6	6	9543	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
30	NC_003042	T	7	7	9782	9788	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
31	NC_003042	T	6	6	9809	9814	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
32	NC_003042	T	8	8	9876	9883	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
33	NC_003042	A	6	6	10459	10464	100 %	0 %	0 %	0 %	15081494
34	NC_003042	A	7	7	10466	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	15081494
35	NC_003042	A	6	6	11420	11425	100 %	0 %	0 %	0 %	15081495
36	NC_003042	T	6	6	12108	12113	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
37	NC_003042	T	6	6	12374	12379	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
38	NC_003042	A	6	6	12403	12408	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
39	NC_003042	T	6	6	12425	12430	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
40	NC_003042	A	6	6	12877	12882	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
41	NC_003042	A	6	6	12927	12932	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
42	NC_003042	A	6	6	13194	13199	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
43	NC_003042	A	6	6	13263	13268	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
44	NC_003042	A	7	7	13657	13663	100 %	0 %	0 %	0 %	15081497
45	NC_003042	T	8	8	14484	14491	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
46	NC_003042	A	6	6	14708	14713	100 %	0 %	0 %	0 %	15081498
47	NC_003042	A	6	6	14759	14764	100 %	0 %	0 %	0 %	15081498
48	NC_003042	T	6	6	15014	15019	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
49	NC_003042	T	6	6	15086	15091	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
50	NC_003042	T	6	6	15235	15240	0 %	100 %	0 %	0 %	15081499
51	NC_003042	T	6	6	15349	15354	0 %	100 %	0 %	0 %	15081499
52	NC_003042	T	6	6	15391	15396	0 %	100 %	0 %	0 %	15081499
53	NC_003042	A	6	6	16178	16183	100 %	0 %	0 %	0 %	15081500
54	NC_003042	A	8	8	16221	16228	100 %	0 %	0 %	0 %	15081500
55	NC_003042	A	7	7	16326	16332	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
56	NC_003042	A	7	7	16394	16400	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
57	NC_003042	A	6	6	16481	16486	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
58	NC_003042	A	6	6	16739	16744	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
59	NC_003042	A	7	7	16875	16881	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
60	NC_003042	A	7	7	16920	16926	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
61	NC_003042	A	7	7	17036	17042	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
62	NC_003042	A	7	7	17221	17227	100 %	0 %	0 %	0 %	15081503
63	NC_003042	A	6	6	17906	17911	100 %	0 %	0 %	0 %	15081504
64	NC_003042	A	6	6	17941	17946	100 %	0 %	0 %	0 %	15081504
65	NC_003042	A	7	7	18043	18049	100 %	0 %	0 %	0 %	15081505
66	NC_003042	T	8	8	18362	18369	0 %	100 %	0 %	0 %	15081505
67	NC_003042	A	7	7	18734	18740	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
68	NC_003042	T	7	7	18754	18760	0 %	100 %	0 %	0 %	15081506
69	NC_003042	A	6	6	18931	18936	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
70	NC_003042	A	6	6	19000	19005	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
71	NC_003042	A	8	8	19190	19197	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
72	NC_003042	A	6	6	19281	19286	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
73	NC_003042	T	6	6	19328	19333	0 %	100 %	0 %	0 %	15081506
74	NC_003042	A	6	6	19414	19419	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
75	NC_003042	T	6	6	19543	19548	0 %	100 %	0 %	0 %	15081506
76	NC_003042	A	6	6	19595	19600	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
77	NC_003042	A	6	6	19975	19980	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
78	NC_003042	A	7	7	20204	20210	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
79	NC_003042	A	6	6	20320	20325	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
80	NC_003042	A	8	8	21626	21633	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
81	NC_003042	A	8	8	21757	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
82	NC_003042	A	6	6	21819	21824	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
83	NC_003042	A	6	6	21838	21843	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
84	NC_003042	T	6	6	21856	21861	0 %	100 %	0 %	0 %	15081510
85	NC_003042	A	6	6	22105	22110	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
86	NC_003042	A	7	7	22487	22493	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
87	NC_003042	A	6	6	22495	22500	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
88	NC_003042	A	7	7	22511	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
89	NC_003042	T	6	6	22662	22667	0 %	100 %	0 %	0 %	15081511
90	NC_003042	T	6	6	22729	22734	0 %	100 %	0 %	0 %	15081511
91	NC_003042	A	6	6	22786	22791	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
92	NC_003042	A	7	7	22895	22901	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
93	NC_003042	A	6	6	23007	23012	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
94	NC_003042	T	6	6	23018	23023	0 %	100 %	0 %	0 %	15081511
95	NC_003042	T	6	6	23624	23629	0 %	100 %	0 %	0 %	15081513
96	NC_003042	T	6	6	24148	24153	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
97	NC_003042	T	6	6	24268	24273	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
98	NC_003042	T	6	6	24324	24329	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
99	NC_003042	T	6	6	24431	24436	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
100	NC_003042	T	7	7	24506	24512	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
101	NC_003042	T	6	6	24524	24529	0 %	100 %	0 %	0 %	15081514
102	NC_003042	T	6	6	24623	24628	0 %	100 %	0 %	0 %	15081515
103	NC_003042	T	6	6	24666	24671	0 %	100 %	0 %	0 %	15081515
104	NC_003042	T	7	7	24673	24679	0 %	100 %	0 %	0 %	15081515
105	NC_003042	T	6	6	25554	25559	0 %	100 %	0 %	0 %	15081515
106	NC_003042	T	6	6	25976	25981	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
107	NC_003042	A	7	7	25982	25988	100 %	0 %	0 %	0 %	15081516
108	NC_003042	T	8	8	26130	26137	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
109	NC_003042	A	8	8	26140	26147	100 %	0 %	0 %	0 %	15081516
110	NC_003042	T	6	6	26177	26182	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
111	NC_003042	T	6	6	26390	26395	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
112	NC_003042	A	6	6	26888	26893	100 %	0 %	0 %	0 %	15081516
113	NC_003042	T	7	7	27328	27334	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
114	NC_003042	T	6	6	27365	27370	0 %	100 %	0 %	0 %	15081516
115	NC_003042	T	6	6	27662	27667	0 %	100 %	0 %	0 %	15081517
116	NC_003042	T	6	6	27890	27895	0 %	100 %	0 %	0 %	15081518
117	NC_003042	T	7	7	28063	28069	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
118	NC_003042	T	7	7	28143	28149	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
119	NC_003042	T	6	6	28337	28342	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
120	NC_003042	T	6	6	28442	28447	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
121	NC_003042	T	6	6	28774	28779	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
122	NC_003042	T	7	7	28898	28904	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
123	NC_003042	T	6	6	28963	28968	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
124	NC_003042	T	6	6	29016	29021	0 %	100 %	0 %	0 %	15081519
125	NC_003042	T	6	6	29176	29181	0 %	100 %	0 %	0 %	15081520
126	NC_003042	T	6	6	29337	29342	0 %	100 %	0 %	0 %	15081520
127	NC_003042	T	7	7	29396	29402	0 %	100 %	0 %	0 %	15081520
128	NC_003042	A	6	6	29819	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	15081522
129	NC_003042	T	6	6	29840	29845	0 %	100 %	0 %	0 %	15081522
130	NC_003042	A	6	6	29881	29886	100 %	0 %	0 %	0 %	15081522
131	NC_003042	T	6	6	30202	30207	0 %	100 %	0 %	0 %	15081523
132	NC_003042	T	6	6	30210	30215	0 %	100 %	0 %	0 %	15081523
133	NC_003042	T	6	6	30394	30399	0 %	100 %	0 %	0 %	15081523
134	NC_003042	T	6	6	30568	30573	0 %	100 %	0 %	0 %	15081523
135	NC_003042	A	6	6	30788	30793	100 %	0 %	0 %	0 %	15081523
136	NC_003042	A	6	6	31000	31005	100 %	0 %	0 %	0 %	15081523
137	NC_003042	T	7	7	31819	31825	0 %	100 %	0 %	0 %	15081524
138	NC_003042	A	7	7	32274	32280	100 %	0 %	0 %	0 %	15081524
139	NC_003042	T	6	6	32534	32539	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
140	NC_003042	T	7	7	32614	32620	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
141	NC_003042	T	6	6	33029	33034	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
142	NC_003042	T	7	7	33094	33100	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
143	NC_003042	T	6	6	33341	33346	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
144	NC_003042	T	6	6	33805	33810	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
145	NC_003042	T	7	7	34233	34239	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
146	NC_003042	T	6	6	34571	34576	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
147	NC_003042	A	6	6	34966	34971	100 %	0 %	0 %	0 %	15081526
148	NC_003042	T	6	6	35115	35120	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
149	NC_003042	A	6	6	35198	35203	100 %	0 %	0 %	0 %	15081527
150	NC_003042	T	6	6	35467	35472	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
151	NC_003042	A	6	6	35934	35939	100 %	0 %	0 %	0 %	15081527
152	NC_003042	T	6	6	36248	36253	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
153	NC_003042	T	6	6	36311	36316	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
154	NC_003042	T	6	6	36731	36736	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
155	NC_003042	T	6	6	36872	36877	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
156	NC_003042	T	6	6	37130	37135	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
157	NC_003042	T	6	6	37178	37183	0 %	100 %	0 %	0 %	15081528
158	NC_003042	T	7	7	37229	37235	0 %	100 %	0 %	0 %	15081528
159	NC_003042	A	6	6	37609	37614	100 %	0 %	0 %	0 %	15081528
160	NC_003042	A	7	7	37629	37635	100 %	0 %	0 %	0 %	15081528
161	NC_003042	T	8	8	37722	37729	0 %	100 %	0 %	0 %	15081528
162	NC_003042	T	6	6	37964	37969	0 %	100 %	0 %	0 %	15081529
163	NC_003042	T	7	7	38008	38014	0 %	100 %	0 %	0 %	15081529
164	NC_003042	A	6	6	38071	38076	100 %	0 %	0 %	0 %	15081529
165	NC_003042	A	6	6	39507	39512	100 %	0 %	0 %	0 %	15081530
166	NC_003042	T	6	6	39515	39520	0 %	100 %	0 %	0 %	15081530
167	NC_003042	T	7	7	39534	39540	0 %	100 %	0 %	0 %	15081530
168	NC_003042	T	6	6	39775	39780	0 %	100 %	0 %	0 %	15081530
169	NC_003042	T	7	7	39869	39875	0 %	100 %	0 %	0 %	15081530
170	NC_003042	A	7	7	40188	40194	100 %	0 %	0 %	0 %	15081530
171	NC_003042	T	6	6	40371	40376	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
172	NC_003042	T	6	6	41153	41158	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
173	NC_003042	T	7	7	41175	41181	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
174	NC_003042	T	7	7	41681	41687	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
175	NC_003042	T	7	7	42021	42027	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
176	NC_003042	T	8	8	42654	42661	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
177	NC_003042	T	6	6	42750	42755	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
178	NC_003042	A	6	6	42812	42817	100 %	0 %	0 %	0 %	15081531
179	NC_003042	T	6	6	43063	43068	0 %	100 %	0 %	0 %	15081531
180	NC_003042	A	6	6	43077	43082	100 %	0 %	0 %	0 %	15081531
181	NC_003042	T	6	6	43135	43140	0 %	100 %	0 %	0 %	15081532
182	NC_003042	T	6	6	43566	43571	0 %	100 %	0 %	0 %	15081533
183	NC_003042	T	7	7	43682	43688	0 %	100 %	0 %	0 %	15081534
184	NC_003042	T	6	6	43996	44001	0 %	100 %	0 %	0 %	15081535
185	NC_003042	T	6	6	44087	44092	0 %	100 %	0 %	0 %	15081535
186	NC_003042	T	6	6	44482	44487	0 %	100 %	0 %	0 %	15081536
187	NC_003042	T	7	7	45000	45006	0 %	100 %	0 %	0 %	15081536
188	NC_003042	T	6	6	46490	46495	0 %	100 %	0 %	0 %	15081537
189	NC_003042	T	6	6	46530	46535	0 %	100 %	0 %	0 %	15081537
190	NC_003042	T	6	6	46647	46652	0 %	100 %	0 %	0 %	15081537
191	NC_003042	T	6	6	48435	48440	0 %	100 %	0 %	0 %	15081537
192	NC_003042	A	7	7	48849	48855	100 %	0 %	0 %	0 %	15081537
193	NC_003042	A	6	6	48889	48894	100 %	0 %	0 %	0 %	15081537
194	NC_003042	A	6	6	49303	49308	100 %	0 %	0 %	0 %	15081537
195	NC_003042	A	6	6	49802	49807	100 %	0 %	0 %	0 %	15081538
196	NC_003042	T	6	6	50614	50619	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
197	NC_003042	T	6	6	50643	50648	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
198	NC_003042	T	6	6	50661	50666	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
199	NC_003042	T	6	6	50708	50713	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
200	NC_003042	T	7	7	51002	51008	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
201	NC_003042	T	6	6	51042	51047	0 %	100 %	0 %	0 %	15081539
202	NC_003042	T	6	6	51118	51123	0 %	100 %	0 %	0 %	15081540
203	NC_003042	T	6	6	51301	51306	0 %	100 %	0 %	0 %	15081540
204	NC_003042	T	6	6	51333	51338	0 %	100 %	0 %	0 %	15081540
205	NC_003042	T	6	6	51548	51553	0 %	100 %	0 %	0 %	15081540
206	NC_003042	A	7	7	51947	51953	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
207	NC_003042	A	7	7	51981	51987	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
208	NC_003042	A	6	6	52114	52119	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
209	NC_003042	A	6	6	52207	52212	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
210	NC_003042	A	8	8	52226	52233	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
211	NC_003042	A	7	7	52277	52283	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
212	NC_003042	A	7	7	52319	52325	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
213	NC_003042	A	8	8	52403	52410	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
214	NC_003042	A	7	7	52446	52452	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
215	NC_003042	A	6	6	52498	52503	100 %	0 %	0 %	0 %	15081541
216	NC_003042	T	7	7	53132	53138	0 %	100 %	0 %	0 %	15081542
217	NC_003042	A	6	6	53373	53378	100 %	0 %	0 %	0 %	15081542
218	NC_003042	T	6	6	53449	53454	0 %	100 %	0 %	0 %	15081542
219	NC_003042	T	6	6	53622	53627	0 %	100 %	0 %	0 %	15081543
220	NC_003042	T	6	6	53697	53702	0 %	100 %	0 %	0 %	15081543
221	NC_003042	T	6	6	53895	53900	0 %	100 %	0 %	0 %	15081543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.