MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003037	TAAGG	2	10	986	995	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003037	GTCAG	2	10	21135	21144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003037	GAATT	2	10	48006	48015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003037	GGCGC	2	10	48141	48150	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_003037	GCCAA	2	10	51180	51189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_003037	TCGGC	2	10	62695	62704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_003037	CTGAT	2	10	65670	65679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003037	CGTGA	2	10	68294	68303	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003037	AACGG	2	10	81704	81713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003037	ATGAG	2	10	105369	105378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003037	GACTT	2	10	127839	127848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003037	GCTTC	2	10	158895	158904	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_003037	AGGCC	2	10	159549	159558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_003037	AGTCG	2	10	162172	162181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003037	AAACG	2	10	179070	179079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003037	CTGGT	2	10	185651	185660	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003037	CTTGG	2	10	190740	190749	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003037	TCTGC	2	10	192826	192835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_003037	GTTCT	2	10	198738	198747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003037	GCGTG	2	10	198849	198858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003037	CTGTG	2	10	207305	207314	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_003037	GAATA	2	10	211280	211289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003037	GTCAT	2	10	217818	217827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003037	TGCTT	2	10	231177	231186	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003037	GCAGG	2	10	234699	234708	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003037	TGGCT	2	10	240765	240774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_003037	TTTCC	2	10	244032	244041	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003037	TCGCC	2	10	251880	251889	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_003037	ACTAG	2	10	260537	260546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_003037	TCTGC	2	10	286687	286696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_003037	CAAAC	2	10	296572	296581	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_003037	ATGCC	2	10	297863	297872	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_003037	CGGCA	2	10	301789	301798	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_003037	AAATG	2	10	303811	303820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003037	CCTGG	2	10	317761	317770	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_003037	GTCCC	2	10	326776	326785	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_003037	CTTTC	2	10	335030	335039	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_003037	GTCTC	2	10	336473	336482	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_003037	GTCCC	2	10	342452	342461	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_003037	GCGAC	2	10	346015	346024	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_003037	GTCGC	2	10	346836	346845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003037	GCCGC	2	10	346868	346877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_003037	GCGCC	2	10	374939	374948	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_003037	TTTTC	2	10	380811	380820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003037	TTTCG	2	10	393740	393749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003037	GCCGA	2	10	396632	396641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_003037	CCTTC	2	10	398694	398703	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_003037	TCGCT	2	10	401888	401897	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003037	TGTCG	2	10	408139	408148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003037	AATAC	2	10	408876	408885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003037	GACAG	2	10	410505	410514	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003037	CCGCA	2	10	422474	422483	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_003037	TAATT	2	10	425403	425412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003037	AAGGC	2	10	451745	451754	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_003037	TGTCG	2	10	451999	452008	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003037	GGGAC	2	10	452073	452082	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003037	TCCGC	2	10	460220	460229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_003037	GCGCC	2	10	460334	460343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_003037	GACAG	2	10	463774	463783	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_003037	TTCGA	2	10	482799	482808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003037	TAACA	2	10	502040	502049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_003037	CCACC	2	10	503102	503111	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_003037	GCAAG	2	10	528135	528144	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_003037	CCTTT	2	10	533750	533759	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_003037	TTTCC	2	10	539818	539827	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_003037	GGAAA	2	10	541791	541800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003037	CGAGA	2	10	543737	543746	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003037	AGCAA	2	10	551143	551152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003037	CTTTT	2	10	552975	552984	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_003037	TGGTA	2	10	555687	555696	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003037	GCATC	2	10	566866	566875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_003037	TTTCG	2	10	588453	588462	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003037	GTGCT	2	10	597467	597476	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_003037	GCAGG	2	10	604183	604192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003037	GTTCG	2	10	604696	604705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_003037	GTGCT	2	10	608440	608449	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003037	CGCCT	2	10	619596	619605	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_003037	CAGCC	2	10	654582	654591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_003037	ATAGA	2	10	681404	681413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003037	ACGAC	2	10	691331	691340	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_003037	CGGTG	2	10	692246	692255	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003037	TTCTC	2	10	706476	706485	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_003037	GCCTT	2	10	742254	742263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_003037	CAGGA	2	10	745494	745503	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003037	ACGCG	2	10	759556	759565	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_003037	ACGTC	2	10	759572	759581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_003037	TTTTG	2	10	761190	761199	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003037	GCGTC	2	10	777481	777490	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_003037	TCCCC	2	10	789045	789054	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_003037	TCGCC	2	10	796269	796278	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_003037	AAGGT	2	10	824225	824234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003037	TTGAT	2	10	830289	830298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003037	CCGCG	2	10	832351	832360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_003037	GTGTC	2	10	854212	854221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003037	CGCTT	2	10	868856	868865	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_003037	GGGCC	2	10	869117	869126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_003037	CACGC	2	10	873043	873052	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_003037	AGCGG	2	10	874523	874532	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003037	AGAGC	2	10	878649	878658	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_003037	GCGCC	2	10	879625	879634	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_003037	ACGGC	2	10	880465	880474	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_003037	CTCAC	2	10	880501	880510	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_003037	GCGGG	2	10	880581	880590	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
104	NC_003037	TCCGT	2	10	882637	882646	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_003037	CTCCG	2	10	884085	884094	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_003037	GGTGC	2	10	889832	889841	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_003037	GCGAC	2	10	897908	897917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_003037	AGCCA	2	10	911072	911081	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_003037	CTAGT	2	10	911641	911650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003037	CAAGG	2	10	927708	927717	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_003037	CTGGT	2	10	933159	933168	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003037	AACCG	2	10	938917	938926	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_003037	AGGTC	2	10	946910	946919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003037	TTCCA	2	10	954266	954275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_003037	CTGCT	2	10	958786	958795	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_003037	GTTCA	2	10	958893	958902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_003037	CACCG	2	10	1004653	1004662	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_003037	ACCTG	2	10	1005422	1005431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_003037	AGCAG	2	10	1006340	1006349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_003037	AGCCC	2	10	1006544	1006553	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_003037	TTCTG	2	10	1008215	1008224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_003037	CAAGG	2	10	1008698	1008707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_003037	GATGC	2	10	1017363	1017372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003037	CCCGC	2	10	1018068	1018077	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_003037	GATCA	2	10	1018517	1018526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003037	CGGTG	2	10	1025194	1025203	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003037	ACCGT	2	10	1033222	1033231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_003037	GCCGC	2	10	1037717	1037726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_003037	AGGAA	2	10	1044437	1044446	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003037	CTGGG	2	10	1056554	1056563	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003037	CTGCC	2	10	1060155	1060164	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_003037	TTTGG	2	10	1060785	1060794	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003037	CAACC	2	10	1067673	1067682	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_003037	CGTTG	2	10	1068121	1068130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003037	GCTTT	2	10	1068524	1068533	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_003037	CAGTT	2	10	1080212	1080221	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_003037	ACAGT	2	10	1082072	1082081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_003037	CGCGC	2	10	1087092	1087101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_003037	ACCGC	2	10	1092029	1092038	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_003037	ATGAA	2	10	1108724	1108733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003037	CTGCA	2	10	1116523	1116532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_003037	GACAG	2	10	1121800	1121809	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003037	CGCCA	2	10	1126321	1126330	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_003037	TCGGA	2	10	1137174	1137183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_003037	ACGTA	3	15	1138162	1138176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_003037	CTGAC	2	10	1142987	1142996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_003037	AGTCG	2	10	1149402	1149411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003037	GCGCT	2	10	1149473	1149482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_003037	CGAAA	2	10	1151225	1151234	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_003037	CGCGG	2	10	1172698	1172707	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_003037	GAATC	2	10	1187557	1187566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_003037	TTTCA	2	10	1199399	1199408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_003037	CCCTT	2	10	1205481	1205490	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
154	NC_003037	AACTG	2	10	1213357	1213366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_003037	CTCCG	2	10	1216090	1216099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_003037	CAGAC	2	10	1216237	1216246	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_003037	CGCGA	2	10	1245617	1245626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_003037	TCCCC	2	10	1260158	1260167	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
159	NC_003037	GGCGG	2	10	1263261	1263270	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
160	NC_003037	TCGCC	2	10	1269596	1269605	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_003037	AAAGC	2	10	1269800	1269809	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_003037	GCCGG	2	10	1270909	1270918	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_003037	CGCGG	2	10	1271005	1271014	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
164	NC_003037	CATCT	2	10	1272891	1272900	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_003037	GTCTG	2	10	1275762	1275771	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_003037	CAAAT	2	10	1279834	1279843	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_003037	CCGGC	2	10	1281876	1281885	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
168	NC_003037	GGCTG	2	10	1286117	1286126	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
169	NC_003037	CGAGT	2	10	1295657	1295666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_003037	ATAGA	2	10	1326982	1326991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_003037	AAAAT	2	10	1328455	1328464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003037	CCCAA	2	10	1329630	1329639	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.