MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893299
2	NC_003030	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15893299
3	NC_003030	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893302
4	NC_003030	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
5	NC_003030	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893304
6	NC_003030	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893304
7	NC_003030	CCGATG	2	12	6336	6347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15893304
8	NC_003030	TGATAT	2	12	8252	8263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893305
9	NC_003030	GCTTAT	2	12	9056	9067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15893305
10	NC_003030	TCTAGC	2	12	9173	9184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15893305
11	NC_003030	TAATTC	2	12	15473	15484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15893307
12	NC_003030	CAAGTG	2	12	16942	16953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15893308
13	NC_003030	TAGTAA	2	12	17421	17432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893308
14	NC_003030	AAAGAT	2	12	17983	17994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893308
15	NC_003030	TGGAGT	2	12	22936	22947	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15893313
16	NC_003030	TTAGAT	2	12	24979	24990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893315
17	NC_003030	AATTTG	2	12	25367	25378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893315
18	NC_003030	GAAGGT	2	12	25645	25656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15893315
19	NC_003030	TGAATA	2	12	26358	26369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893316
20	NC_003030	ATCCAA	2	12	26388	26399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15893316
21	NC_003030	TTGGAA	2	12	28796	28807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893318
22	NC_003030	AGATAA	2	12	34095	34106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893321
23	NC_003030	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003030	GCTTTT	2	12	39494	39505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893326
25	NC_003030	TCTACC	2	12	39692	39703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15893326
26	NC_003030	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003030	TATAGC	2	12	48011	48022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893334
28	NC_003030	CTATAG	2	12	48973	48984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893335
29	NC_003030	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003030	TAATAG	2	12	57505	57516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893342
31	NC_003030	TAAAAA	2	12	57566	57577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15893342
32	NC_003030	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003030	GAAAAG	2	12	58652	58663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893343
34	NC_003030	TAAATA	2	12	59374	59385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893344
35	NC_003030	AGGAAA	2	12	60206	60217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893346
36	NC_003030	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003030	TAAAAA	2	12	68317	68328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15893358
38	NC_003030	GTAAAT	2	12	75406	75417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893360
39	NC_003030	TAAAAA	2	12	78119	78130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15893365
40	NC_003030	AGTTTT	2	12	80370	80381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15893367
41	NC_003030	TATTAG	2	12	83700	83711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003030	ATTGTA	2	12	85204	85215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893372
43	NC_003030	ATATAA	2	12	86464	86475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893373
44	NC_003030	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003030	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003030	GATATA	2	12	91141	91152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893378
47	NC_003030	AAAAAT	2	12	92118	92129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003030	TAAAGA	2	12	96250	96261	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893384
49	NC_003030	GCTGGA	2	12	97199	97210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15893385
50	NC_003030	TTATGA	2	12	98525	98536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893386
51	NC_003030	AAACAA	2	12	99651	99662	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15893387
52	NC_003030	GAAACT	2	12	99957	99968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15893387
53	NC_003030	TAGAAA	2	12	107405	107416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893394
54	NC_003030	TAATAT	2	12	110531	110542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003030	TCAGGT	2	12	113854	113865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15893399
56	NC_003030	ATAACA	2	12	114049	114060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15893399
57	NC_003030	AATGGT	2	12	115217	115228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893400
58	NC_003030	ATAGAA	2	12	115358	115369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893400
59	NC_003030	GGACCA	2	12	116629	116640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893402
60	NC_003030	ATAAAT	2	12	119334	119345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893405
61	NC_003030	ATAGAT	2	12	121942	121953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893407
62	NC_003030	TTCAGG	2	12	123344	123355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15893408
63	NC_003030	CAAAAG	2	12	128324	128335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15893413
64	NC_003030	TAACCT	2	12	131775	131786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893416
65	NC_003030	AAAAGG	2	12	132543	132554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893416
66	NC_003030	AGTTAT	2	12	134088	134099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003030	AGAGTT	2	12	137927	137938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893421
68	NC_003030	TAAAAT	2	12	138478	138489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893422
69	NC_003030	ATATCT	2	12	141483	141494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003030	CTTTAT	2	12	144510	144521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_003030	AAAAAG	2	12	144791	144802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15893433
72	NC_003030	AAAAAG	2	12	145544	145555	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15893434
73	NC_003030	TGGGCA	2	12	146628	146639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15893434
74	NC_003030	AGATCA	2	12	148333	148344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15893436
75	NC_003030	TAAGTA	2	12	148809	148820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893436
76	NC_003030	TTTTGC	2	12	152105	152116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893442
77	NC_003030	TCTTTT	2	12	152202	152213	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15893442
78	NC_003030	ACTATT	2	12	153025	153036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003030	ATAAGA	2	12	153423	153434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893443
80	NC_003030	TTTTGT	2	12	155334	155345	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15893445
81	NC_003030	GATTTT	2	12	156035	156046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15893446
82	NC_003030	ATTAAA	2	12	156541	156552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893446
83	NC_003030	TAAAAA	2	12	163265	163276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003030	TAAAAA	2	12	168404	168415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003030	AAGCAA	2	12	177630	177641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15893450
86	NC_003030	AAAATT	2	12	179587	179598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893452
87	NC_003030	ATTGGA	2	12	180363	180374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893453
88	NC_003030	CAATTA	2	12	181899	181910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15893453
89	NC_003030	ATATTG	2	12	183075	183086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893455
90	NC_003030	TTTTAA	2	12	187085	187096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003030	TATAAA	2	12	187244	187255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003030	GATAAG	2	12	187462	187473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893458
93	NC_003030	ATCAGG	2	12	187539	187550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15893458
94	NC_003030	AAAATT	2	12	188846	188857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893459
95	NC_003030	ACATCA	2	12	193737	193748	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15893464
96	NC_003030	GATATT	2	12	196567	196578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003030	GTAAAA	2	12	196936	196947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003030	AGAAAA	2	12	198915	198926	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15893468
99	NC_003030	ACTCAA	2	12	200608	200619	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15893469
100	NC_003030	GGATAA	2	12	200657	200668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893469
101	NC_003030	AAAGAA	2	12	202971	202982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15893472
102	NC_003030	GTATTT	2	12	211497	211508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15893479
103	NC_003030	TTCTAC	2	12	212003	212014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15893479
104	NC_003030	GATGAA	2	12	213574	213585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893481
105	NC_003030	ATATTT	2	12	214353	214364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893482
106	NC_003030	GAAGAG	2	12	215030	215041	50 %	0 %	50 %	0 %	15893482
107	NC_003030	ATAGCT	2	12	216321	216332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893484
108	NC_003030	TAAAAG	2	12	221883	221894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003030	TAAAGA	2	12	221945	221956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893489
110	NC_003030	ACTTTT	2	12	223746	223757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15893491
111	NC_003030	TTTTAT	2	12	225654	225665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15893493
112	NC_003030	TTACAC	2	12	230132	230143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893498
113	NC_003030	GAATAA	2	12	231630	231641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893499
114	NC_003030	GCAATA	2	12	231653	231664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15893499
115	NC_003030	AATAGA	2	12	231940	231951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893499
116	NC_003030	ATTTAT	2	12	232018	232029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893499
117	NC_003030	GCAGTT	2	12	233042	233053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15893500
118	NC_003030	TTTAAA	2	12	234470	234481	50 %	50 %	0 %	0 %	15893501
119	NC_003030	AAGGAA	2	12	239060	239071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893507
120	NC_003030	AGTTGA	2	12	239530	239541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893507
121	NC_003030	AAAAAT	2	12	241604	241615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15893509
122	NC_003030	ATTTTA	2	12	243663	243674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893511
123	NC_003030	TTTTTA	2	12	243966	243977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15893511
124	NC_003030	TACAAA	2	12	244546	244557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15893512
125	NC_003030	TAAAAA	2	12	244831	244842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15893512
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231	NC_003030	ATTATA	2	12	475623	475634	50 %	50 %	0 %	0 %	15893699
232	NC_003030	GTTAAG	2	12	476039	476050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893699
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236	NC_003030	ATAAAA	2	12	481084	481095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_003030	ATTGAT	2	12	481527	481538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893706
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239	NC_003030	AGACTT	2	12	489111	489122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893714
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241	NC_003030	GGGAAA	2	12	492307	492318	50 %	0 %	50 %	0 %	15893716
242	NC_003030	ATTTGA	2	12	493064	493075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893716
243	NC_003030	GTCATC	2	12	494900	494911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15893718
244	NC_003030	CATTTT	2	12	495725	495736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15893719
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277	NC_003030	ATTTAA	2	12	563061	563072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_003030	GATATG	2	12	567701	567712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893785
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280	NC_003030	TTTGTA	2	12	569698	569709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15893788
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283	NC_003030	GTTAGA	2	12	577785	577796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893794
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345	NC_003030	TAAATA	2	12	728100	728111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_003030	GGTAAA	2	12	730683	730694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893916
347	NC_003030	ACTTCA	2	12	731891	731902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893917
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349	NC_003030	CTTACA	2	12	733911	733922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893918
350	NC_003030	CTAAAA	2	12	735008	735019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15893919
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352	NC_003030	CACCAA	2	12	739094	739105	50 %	0 %	0 %	50 %	15893922
353	NC_003030	CTTATG	2	12	741230	741241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15893925
354	NC_003030	AATATA	2	12	743312	743323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893926
355	NC_003030	TAATTA	2	12	746540	746551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_003030	TATAAG	2	12	747209	747220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893930
357	NC_003030	TAAGGA	2	12	748985	748996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893932
358	NC_003030	TATAAC	2	12	751345	751356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15893934
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360	NC_003030	GCAAAA	2	12	752705	752716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15893934
361	NC_003030	ATAAGC	2	12	756207	756218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15893937
362	NC_003030	TTTCTA	2	12	756407	756418	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15893938
363	NC_003030	ATTTCA	2	12	756568	756579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15893938
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372	NC_003030	TATTAA	2	12	772465	772476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_003030	CAATTG	2	12	773492	773503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893952
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405	NC_003030	GTAGCT	2	12	835134	835145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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470	NC_003030	TTTAAA	2	12	959127	959138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_003030	ATATGA	2	12	959286	959297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15894115
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478	NC_003030	CATATT	2	12	967668	967679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15894124
479	NC_003030	CTTTAT	2	12	967923	967934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15894124
480	NC_003030	TTCATT	2	12	970260	970271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15894127
481	NC_003030	TAACTT	2	12	972567	972578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_003030	ATATAA	2	12	975194	975205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_003030	ATAAAA	2	12	978370	978381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15894137
484	NC_003030	AAAAAT	2	12	981206	981217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_003030	ATGCCA	2	12	986058	986069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15894143
486	NC_003030	TTTTAC	2	12	988334	988345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15894144
487	NC_003030	ATATGC	2	12	988944	988955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15894145
488	NC_003030	ATATAA	2	12	990206	990217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15894147
489	NC_003030	GTTATT	2	12	990427	990438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15894147
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