MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 276

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	AGTAAA	2	12	36177	36188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003030	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003030	ATTGAA	2	12	55161	55172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003030	TAGAAA	2	12	57926	57937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003030	TAAAAA	2	12	61867	61878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003030	TATTAG	2	12	83700	83711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003030	TAAGGT	2	12	86689	86700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003030	TTAAAT	2	12	87523	87534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003030	AAAAAT	2	12	92118	92129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003030	TAATAT	2	12	110531	110542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003030	AGTTAT	2	12	134088	134099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003030	ATATCT	2	12	141483	141494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003030	CTTTAT	2	12	144510	144521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003030	ACTATT	2	12	153025	153036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_003030	TAAAAA	2	12	163265	163276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003030	TAAAAA	2	12	168404	168415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003030	TTTTAA	2	12	187085	187096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003030	TATAAA	2	12	187244	187255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003030	GATATT	2	12	196567	196578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003030	GTAAAA	2	12	196936	196947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003030	TAAAAG	2	12	221883	221894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003030	TAAAAA	2	12	310528	310539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003030	TAGTTA	2	12	315812	315823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003030	TAAAAA	2	12	335972	335983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003030	TAAAAA	2	12	341111	341122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003030	TTATAG	2	12	351232	351243	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003030	TTAAAA	2	12	352482	352493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003030	GGTATT	2	12	367703	367714	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003030	CAAAAT	2	12	368105	368116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003030	GGTAAA	2	12	385624	385635	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003030	TATAAT	2	12	397593	397604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003030	AAAATA	2	12	402764	402775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003030	ACGTTA	2	12	419467	419478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003030	GTTAAC	2	12	420769	420780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_003030	TACAAA	2	12	425147	425158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003030	TACAAA	2	12	439380	439391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_003030	ATTTTT	2	12	443487	443498	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003030	ATGCAA	2	12	444633	444644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003030	AACATA	2	12	461582	461593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003030	GATTTA	2	12	462208	462219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003030	ATAAAA	2	12	481084	481095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003030	AAATAT	2	12	531689	531700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003030	TAAGTA	2	12	536427	536438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003030	ATTTAA	2	12	563061	563072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003030	TAAATT	2	12	567790	567801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003030	TATATT	2	12	575172	575183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003030	TTTTTG	2	12	598895	598906	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003030	AACTTG	2	12	601228	601239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_003030	ATGATT	2	12	612274	612285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003030	ATATTT	2	12	617045	617056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003030	CAAATG	2	12	638778	638789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003030	AATTAA	2	12	645904	645915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003030	TGATTT	2	12	646022	646033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003030	TAAATA	2	12	648849	648860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003030	TGATAA	2	12	676119	676130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003030	TAAATA	2	12	728100	728111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003030	TAATTA	2	12	746540	746551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003030	ATTTAT	2	12	772436	772447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003030	TATTAA	2	12	772465	772476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003030	TTATAT	2	12	784039	784050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003030	GTTTTT	2	12	785431	785442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003030	TTTTAA	2	12	789221	789232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003030	AAAATA	2	12	797082	797093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003030	AAATTA	2	12	815879	815890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003030	TTTTAA	2	12	832923	832934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003030	TTTAGC	2	12	833093	833104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003030	GTAGCT	2	12	835134	835145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003030	AAAAAT	2	12	885025	885036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003030	TAAGAG	2	12	896416	896427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003030	ATTATA	2	12	928411	928422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003030	ATATTT	2	12	928431	928442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003030	TAAAAA	2	12	933564	933575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003030	TAAAAA	2	12	939084	939095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003030	TTTAAA	2	12	959127	959138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003030	TAACTT	2	12	972567	972578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_003030	ATATAA	2	12	975194	975205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003030	AAAAAT	2	12	981206	981217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003030	TTAAAT	2	12	1004550	1004561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003030	TTAAGT	2	12	1008036	1008047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003030	AATATA	2	12	1011161	1011172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003030	AGATTA	2	12	1070568	1070579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003030	TAAGAT	2	12	1090096	1090107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003030	TAAAAA	2	12	1105078	1105089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003030	TTTACT	2	12	1114729	1114740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_003030	TAAAAT	2	12	1115791	1115802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003030	TAAAAA	2	12	1116010	1116021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003030	ATATTT	2	12	1123192	1123203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003030	AATATT	2	12	1134369	1134380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003030	CATAAA	2	12	1159810	1159821	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003030	TTAATA	2	12	1171979	1171990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003030	ATCATT	2	12	1181453	1181464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003030	CATATA	2	12	1195407	1195418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003030	ATTTAA	2	12	1198899	1198910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003030	TTTATT	2	12	1199973	1199984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003030	ATATTA	2	12	1210751	1210762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003030	ATATTA	2	12	1213633	1213644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003030	ATATAG	2	12	1243439	1243450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003030	CTATAT	2	12	1243459	1243470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_003030	TTGTGC	2	12	1262596	1262607	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_003030	TAAAAA	2	12	1297831	1297842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003030	TTCTTT	2	12	1311625	1311636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_003030	ATAACA	2	12	1313973	1313984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_003030	ATATTT	2	12	1314663	1314674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003030	CAAGGA	2	12	1330215	1330226	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003030	ACAATT	2	12	1330460	1330471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_003030	TTTTAT	2	12	1337333	1337344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003030	TAGTAA	2	12	1352983	1352994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003030	TATAAA	2	12	1358082	1358093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003030	TAAAAA	2	12	1375216	1375227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003030	TATGAA	2	12	1375727	1375738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003030	ATATGG	2	12	1376882	1376893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003030	TTTAAG	2	12	1377045	1377056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003030	CTTTTT	2	12	1395544	1395555	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_003030	CTTTTA	2	12	1396949	1396960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003030	ATATAA	2	12	1411559	1411570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003030	AAATGA	2	12	1439040	1439051	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003030	TTTTTA	2	12	1444784	1444795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003030	ATATAA	2	12	1460760	1460771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003030	TATTAA	2	12	1467445	1467456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003030	AGAAAA	2	12	1480177	1480188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003030	TTTTAT	2	12	1480197	1480208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003030	TTTTTA	2	12	1550270	1550281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003030	TATAAA	2	12	1570183	1570194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003030	GTTATG	2	12	1573375	1573386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003030	ATTTTT	2	12	1577142	1577153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003030	TATTAA	2	12	1591527	1591538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003030	AAATAT	2	12	1593887	1593898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003030	TAATTA	2	12	1598233	1598244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003030	CTGAAG	2	12	1627516	1627527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003030	ATTAGA	2	12	1643460	1643471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003030	TGAAAT	2	12	1647170	1647181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003030	AATAAA	2	12	1703396	1703407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003030	CAAAGT	2	12	1708986	1708997	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_003030	ATAATC	2	12	1746785	1746796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_003030	AGTTTC	2	12	1752983	1752994	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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257	NC_003030	CTTTAA	2	12	3685112	3685123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_003030	AGGAGA	2	12	3692288	3692299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
259	NC_003030	ATTTTT	2	12	3697465	3697476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_003030	ATTATA	2	12	3723444	3723455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_003030	ACAATA	2	12	3766393	3766404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_003030	TTTTAT	2	12	3789916	3789927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_003030	TGATTA	2	12	3795133	3795144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_003030	ACTATA	2	12	3797902	3797913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_003030	AATTGA	2	12	3802841	3802852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_003030	AGATTA	2	12	3804903	3804914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_003030	AAAATT	2	12	3808810	3808821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_003030	TTAATA	2	12	3834277	3834288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_003030	ATATAG	2	12	3846931	3846942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_003030	ATTTTT	2	12	3849467	3849478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_003030	ATTTAA	2	12	3855924	3855935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_003030	ATTAAT	2	12	3858761	3858772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_003030	AGTTTA	2	12	3868497	3868508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_003030	TATTTA	2	12	3874076	3874087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_003030	TAAAAA	2	12	3886404	3886415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_003030	TCATAT	2	12	3891783	3891794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.