MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 3187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	15893299
2	NC_003030	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	15893299
3	NC_003030	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	15893300
4	NC_003030	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	15893302
5	NC_003030	TGAAA	2	10	6824	6833	60 %	20 %	20 %	0 %	15893305
6	NC_003030	ATATT	2	10	6921	6930	40 %	60 %	0 %	0 %	15893305
7	NC_003030	CTTAA	2	10	14972	14981	40 %	40 %	0 %	20 %	15893306
8	NC_003030	GACAA	2	10	15380	15389	60 %	0 %	20 %	20 %	15893307
9	NC_003030	GGTAA	2	10	15889	15898	40 %	20 %	40 %	0 %	15893308
10	NC_003030	ATTTA	2	10	16506	16515	40 %	60 %	0 %	0 %	15893308
11	NC_003030	TGAAT	2	10	18531	18540	40 %	40 %	20 %	0 %	15893308
12	NC_003030	AAAAG	2	10	18985	18994	80 %	0 %	20 %	0 %	15893309
13	NC_003030	GTATG	2	10	19300	19309	20 %	40 %	40 %	0 %	15893309
14	NC_003030	TAATT	2	10	20208	20217	40 %	60 %	0 %	0 %	15893310
15	NC_003030	TACAG	2	10	23889	23898	40 %	20 %	20 %	20 %	15893314
16	NC_003030	GAAAA	2	10	25322	25331	80 %	0 %	20 %	0 %	15893315
17	NC_003030	TGATT	2	10	25413	25422	20 %	60 %	20 %	0 %	15893315
18	NC_003030	AGAGG	2	10	26534	26543	40 %	0 %	60 %	0 %	15893316
19	NC_003030	AAAGA	2	10	28933	28942	80 %	0 %	20 %	0 %	15893318
20	NC_003030	AAGAA	2	10	29109	29118	80 %	0 %	20 %	0 %	15893318
21	NC_003030	AGAGG	2	10	32389	32398	40 %	0 %	60 %	0 %	15893320
22	NC_003030	TATAA	2	10	33844	33853	60 %	40 %	0 %	0 %	15893321
23	NC_003030	CATTT	2	10	35480	35489	20 %	60 %	0 %	20 %	15893322
24	NC_003030	GTTTA	2	10	38452	38461	20 %	60 %	20 %	0 %	15893326
25	NC_003030	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	15893326
26	NC_003030	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	15893326
27	NC_003030	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	15893327
28	NC_003030	ATATA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	15893328
29	NC_003030	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	15893329
30	NC_003030	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	15893329
31	NC_003030	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	15893330
32	NC_003030	ATTTT	2	10	44301	44310	20 %	80 %	0 %	0 %	15893331
33	NC_003030	TTTTG	2	10	46847	46856	0 %	80 %	20 %	0 %	15893333
34	NC_003030	ACAAA	2	10	49445	49454	80 %	0 %	0 %	20 %	15893335
35	NC_003030	TAAAT	2	10	49893	49902	60 %	40 %	0 %	0 %	15893336
36	NC_003030	AATAA	2	10	50107	50116	80 %	20 %	0 %	0 %	15893337
37	NC_003030	TGGTT	2	10	52044	52053	0 %	60 %	40 %	0 %	15893337
38	NC_003030	TTAGT	2	10	53480	53489	20 %	60 %	20 %	0 %	15893337
39	NC_003030	AGATA	2	10	55011	55020	60 %	20 %	20 %	0 %	15893338
40	NC_003030	CATTT	2	10	57553	57562	20 %	60 %	0 %	20 %	15893342
41	NC_003030	GAAAA	2	10	59205	59214	80 %	0 %	20 %	0 %	15893343
42	NC_003030	AGTGC	2	10	59479	59488	20 %	20 %	40 %	20 %	15893344
43	NC_003030	AGAAT	2	10	60599	60608	60 %	20 %	20 %	0 %	15893347
44	NC_003030	AATCA	2	10	60983	60992	60 %	20 %	0 %	20 %	15893347
45	NC_003030	TAAAT	2	10	62510	62519	60 %	40 %	0 %	0 %	15893350
46	NC_003030	AGAAA	2	10	67393	67402	80 %	0 %	20 %	0 %	15893357
47	NC_003030	GTTGT	2	10	75334	75343	0 %	60 %	40 %	0 %	15893360
48	NC_003030	AAGGC	2	10	77541	77550	40 %	0 %	40 %	20 %	15893364
49	NC_003030	AAGTT	2	10	80333	80342	40 %	40 %	20 %	0 %	15893367
50	NC_003030	TTAAA	2	10	80393	80402	60 %	40 %	0 %	0 %	15893367
51	NC_003030	AATTA	2	10	80424	80433	60 %	40 %	0 %	0 %	15893367
52	NC_003030	ATAGT	2	10	81877	81886	40 %	40 %	20 %	0 %	15893369
53	NC_003030	TTAAA	2	10	86221	86230	60 %	40 %	0 %	0 %	15893373
54	NC_003030	TAAAA	2	10	86357	86366	80 %	20 %	0 %	0 %	15893373
55	NC_003030	ATTTT	2	10	86872	86881	20 %	80 %	0 %	0 %	15893374
56	NC_003030	ATGTT	2	10	88869	88878	20 %	60 %	20 %	0 %	15893376
57	NC_003030	AAATA	2	10	89957	89966	80 %	20 %	0 %	0 %	15893378
58	NC_003030	AAAAT	2	10	93484	93493	80 %	20 %	0 %	0 %	15893380
59	NC_003030	GTGAT	2	10	97035	97044	20 %	40 %	40 %	0 %	15893385
60	NC_003030	GATGG	2	10	104076	104085	20 %	20 %	60 %	0 %	15893391
61	NC_003030	TCTTA	2	10	104172	104181	20 %	60 %	0 %	20 %	15893391
62	NC_003030	TCCTT	2	10	104516	104525	0 %	60 %	0 %	40 %	15893391
63	NC_003030	AAGAA	2	10	105612	105621	80 %	0 %	20 %	0 %	15893392
64	NC_003030	CAGCT	2	10	106065	106074	20 %	20 %	20 %	40 %	15893393
65	NC_003030	AAATG	2	10	106767	106776	60 %	20 %	20 %	0 %	15893394
66	NC_003030	ATGGA	2	10	107111	107120	40 %	20 %	40 %	0 %	15893394
67	NC_003030	AAAGA	2	10	107592	107601	80 %	0 %	20 %	0 %	15893394
68	NC_003030	AGATA	2	10	108409	108418	60 %	20 %	20 %	0 %	15893395
69	NC_003030	TAAAG	2	10	111040	111049	60 %	20 %	20 %	0 %	15893397
70	NC_003030	TAAAA	2	10	113784	113793	80 %	20 %	0 %	0 %	15893399
71	NC_003030	GTAAA	2	10	115977	115986	60 %	20 %	20 %	0 %	15893400
72	NC_003030	GAAGT	2	10	116351	116360	40 %	20 %	40 %	0 %	15893402
73	NC_003030	TAAAA	2	10	116547	116556	80 %	20 %	0 %	0 %	15893402
74	NC_003030	AAGAA	2	10	117045	117054	80 %	0 %	20 %	0 %	15893402
75	NC_003030	AAAAG	2	10	117465	117474	80 %	0 %	20 %	0 %	15893403
76	NC_003030	CCTTC	2	10	118302	118311	0 %	40 %	0 %	60 %	15893404
77	NC_003030	GAAAA	2	10	118958	118967	80 %	0 %	20 %	0 %	15893404
78	NC_003030	AAAGA	2	10	120038	120047	80 %	0 %	20 %	0 %	15893406
79	NC_003030	CAATC	2	10	122035	122044	40 %	20 %	0 %	40 %	15893407
80	NC_003030	GATAC	2	10	124105	124114	40 %	20 %	20 %	20 %	15893409
81	NC_003030	AATAA	2	10	124284	124293	80 %	20 %	0 %	0 %	15893409
82	NC_003030	ATTTT	2	10	124727	124736	20 %	80 %	0 %	0 %	15893409
83	NC_003030	GTATT	2	10	128916	128925	20 %	60 %	20 %	0 %	15893414
84	NC_003030	CAATA	2	10	129046	129055	60 %	20 %	0 %	20 %	15893414
85	NC_003030	AGATG	2	10	131000	131009	40 %	20 %	40 %	0 %	15893415
86	NC_003030	CAAGC	2	10	132497	132506	40 %	0 %	20 %	40 %	15893416
87	NC_003030	ATGGA	2	10	132578	132587	40 %	20 %	40 %	0 %	15893416
88	NC_003030	GAACT	2	10	133961	133970	40 %	20 %	20 %	20 %	15893418
89	NC_003030	AAGCT	2	10	134237	134246	40 %	20 %	20 %	20 %	15893419
90	NC_003030	AATAG	2	10	136517	136526	60 %	20 %	20 %	0 %	15893421
91	NC_003030	GATTT	2	10	136929	136938	20 %	60 %	20 %	0 %	15893421
92	NC_003030	GCGGT	2	10	138278	138287	0 %	20 %	60 %	20 %	15893422
93	NC_003030	CTGTT	2	10	138743	138752	0 %	60 %	20 %	20 %	15893423
94	NC_003030	AAAAG	2	10	140286	140295	80 %	0 %	20 %	0 %	15893426
95	NC_003030	TATTT	2	10	141884	141893	20 %	80 %	0 %	0 %	15893428
96	NC_003030	TAAAA	2	10	142376	142385	80 %	20 %	0 %	0 %	15893429
97	NC_003030	TACCT	2	10	142959	142968	20 %	40 %	0 %	40 %	15893430
98	NC_003030	TTCTT	2	10	145981	145990	0 %	80 %	0 %	20 %	15893434
99	NC_003030	ATAAG	2	10	148898	148907	60 %	20 %	20 %	0 %	15893437
100	NC_003030	ATAGT	2	10	150846	150855	40 %	40 %	20 %	0 %	15893441
101	NC_003030	CTTAA	2	10	151943	151952	40 %	40 %	0 %	20 %	15893441
102	NC_003030	ATAAA	2	10	154821	154830	80 %	20 %	0 %	0 %	15893444
103	NC_003030	ACTTT	2	10	156087	156096	20 %	60 %	0 %	20 %	15893446
104	NC_003030	ATATT	2	10	157436	157445	40 %	60 %	0 %	0 %	15893447
105	NC_003030	ATAGA	2	10	157747	157756	60 %	20 %	20 %	0 %	15893447
106	NC_003030	AAATG	2	10	174099	174108	60 %	20 %	20 %	0 %	15893448
107	NC_003030	AAAAT	2	10	174869	174878	80 %	20 %	0 %	0 %	15893449
108	NC_003030	ATTAA	2	10	175654	175663	60 %	40 %	0 %	0 %	15893449
109	NC_003030	TAAAG	2	10	176694	176703	60 %	20 %	20 %	0 %	15893450
110	NC_003030	AGTTA	2	10	176792	176801	40 %	40 %	20 %	0 %	15893450
111	NC_003030	ATATA	2	10	177102	177111	60 %	40 %	0 %	0 %	15893450
112	NC_003030	TAAAA	2	10	177444	177453	80 %	20 %	0 %	0 %	15893450
113	NC_003030	CAAAA	2	10	181422	181431	80 %	0 %	0 %	20 %	15893453
114	NC_003030	GAATT	2	10	183419	183428	40 %	40 %	20 %	0 %	15893455
115	NC_003030	TGCCA	2	10	184245	184254	20 %	20 %	20 %	40 %	15893456
116	NC_003030	CGCTC	2	10	184460	184469	0 %	20 %	20 %	60 %	15893456
117	NC_003030	TATTT	2	10	188671	188680	20 %	80 %	0 %	0 %	15893459
118	NC_003030	TTTTA	2	10	190304	190313	20 %	80 %	0 %	0 %	15893461
119	NC_003030	GGAAA	2	10	190961	190970	60 %	0 %	40 %	0 %	15893461
120	NC_003030	GAATA	2	10	193721	193730	60 %	20 %	20 %	0 %	15893464
121	NC_003030	TGGTA	2	10	193778	193787	20 %	40 %	40 %	0 %	15893464
122	NC_003030	ATTGA	2	10	197323	197332	40 %	40 %	20 %	0 %	15893467
123	NC_003030	ATCTT	2	10	200240	200249	20 %	60 %	0 %	20 %	15893469
124	NC_003030	TCGTA	2	10	202485	202494	20 %	40 %	20 %	20 %	15893471
125	NC_003030	CTAAA	2	10	202847	202856	60 %	20 %	0 %	20 %	15893471
126	NC_003030	AAATA	2	10	203147	203156	80 %	20 %	0 %	0 %	15893472
127	NC_003030	ATTTA	2	10	205328	205337	40 %	60 %	0 %	0 %	15893474
128	NC_003030	CATTT	2	10	207085	207094	20 %	60 %	0 %	20 %	15893475
129	NC_003030	ATAGT	2	10	207384	207393	40 %	40 %	20 %	0 %	15893475
130	NC_003030	TAATG	2	10	209075	209084	40 %	40 %	20 %	0 %	15893477
131	NC_003030	AGACA	2	10	209330	209339	60 %	0 %	20 %	20 %	15893477
132	NC_003030	ATAAG	2	10	211989	211998	60 %	20 %	20 %	0 %	15893479
133	NC_003030	GGAAT	2	10	217846	217855	40 %	20 %	40 %	0 %	15893485
134	NC_003030	GAAGG	2	10	217876	217885	40 %	0 %	60 %	0 %	15893485
135	NC_003030	CCAAC	2	10	220561	220570	40 %	0 %	0 %	60 %	15893487
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137	NC_003030	TTGGT	2	10	222903	222912	0 %	60 %	40 %	0 %	15893489
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