MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 50290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
2	NC_003030	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
3	NC_003030	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
4	NC_003030	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893299
5	NC_003030	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
6	NC_003030	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
7	NC_003030	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893299
8	NC_003030	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893299
9	NC_003030	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
10	NC_003030	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
11	NC_003030	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
12	NC_003030	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893299
13	NC_003030	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
14	NC_003030	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
15	NC_003030	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15893299
16	NC_003030	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
17	NC_003030	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
18	NC_003030	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
19	NC_003030	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
20	NC_003030	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
21	NC_003030	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
22	NC_003030	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
23	NC_003030	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
24	NC_003030	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893300
25	NC_003030	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
26	NC_003030	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893300
27	NC_003030	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
28	NC_003030	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
29	NC_003030	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
30	NC_003030	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
31	NC_003030	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
32	NC_003030	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
33	NC_003030	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
34	NC_003030	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893300
35	NC_003030	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
36	NC_003030	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
37	NC_003030	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
38	NC_003030	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
39	NC_003030	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
40	NC_003030	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
41	NC_003030	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
42	NC_003030	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
43	NC_003030	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893301
44	NC_003030	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
45	NC_003030	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
46	NC_003030	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
47	NC_003030	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
48	NC_003030	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
49	NC_003030	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893302
50	NC_003030	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
51	NC_003030	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
52	NC_003030	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
53	NC_003030	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
54	NC_003030	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893302
55	NC_003030	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
56	NC_003030	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
57	NC_003030	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
58	NC_003030	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
59	NC_003030	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893303
60	NC_003030	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
61	NC_003030	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893303
62	NC_003030	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
63	NC_003030	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
64	NC_003030	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
65	NC_003030	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
66	NC_003030	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
67	NC_003030	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
68	NC_003030	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893304
69	NC_003030	TGT	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893304
70	NC_003030	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
71	NC_003030	TGA	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
72	NC_003030	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893304
73	NC_003030	ATG	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
74	NC_003030	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
75	NC_003030	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893304
76	NC_003030	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893304
77	NC_003030	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
78	NC_003030	GAA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
79	NC_003030	TAG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
80	NC_003030	GCT	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893304
81	NC_003030	AGA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
82	NC_003030	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893304
83	NC_003030	GAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
84	NC_003030	AAT	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
85	NC_003030	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15893304
86	NC_003030	ATT	2	6	6323	6328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893304
87	NC_003030	TTC	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893304
88	NC_003030	GCC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15893304
89	NC_003030	AGA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
90	NC_003030	TGG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15893304
91	NC_003030	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
92	NC_003030	GCA	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893304
93	NC_003030	AAG	2	6	6703	6708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
94	NC_003030	AGA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
95	NC_003030	CTA	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893304
96	NC_003030	ATC	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893305
97	NC_003030	TTC	2	6	7025	7030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893305
98	NC_003030	GTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
99	NC_003030	CTG	3	9	7126	7134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893305
100	NC_003030	GAA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
101	NC_003030	GTT	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
102	NC_003030	ACC	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15893305
103	NC_003030	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893305
104	NC_003030	CAG	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893305
105	NC_003030	AAT	3	9	7442	7450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
106	NC_003030	TAG	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
107	NC_003030	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
108	NC_003030	GCA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893305
109	NC_003030	AAG	3	9	7862	7870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
110	NC_003030	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
111	NC_003030	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
112	NC_003030	AGA	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
113	NC_003030	TGA	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
114	NC_003030	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
115	NC_003030	TGA	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
116	NC_003030	GAA	2	6	8280	8285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
117	NC_003030	TGT	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
118	NC_003030	ACA	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893305
119	NC_003030	AGA	2	6	8393	8398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
120	NC_003030	TTG	2	6	8404	8409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
121	NC_003030	ATA	3	9	8434	8442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
122	NC_003030	GAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
123	NC_003030	AGC	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893305
124	NC_003030	TGT	2	6	8528	8533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
125	NC_003030	TGA	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
126	NC_003030	CTT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893305
127	NC_003030	AAT	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893305
128	NC_003030	AGA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
129	NC_003030	TGT	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893305
130	NC_003030	ATG	4	12	8704	8715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
131	NC_003030	TGA	3	9	8744	8752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893305
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133	NC_003030	AGA	2	6	8855	8860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893305
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