MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 1297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003028	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	15899950
2	NC_003028	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	15899950
3	NC_003028	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	15899950
4	NC_003028	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	15899951
5	NC_003028	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	15899952
6	NC_003028	TGAAT	2	10	3954	3963	40 %	40 %	20 %	0 %	15899953
7	NC_003028	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	15899954
8	NC_003028	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	15899955
9	NC_003028	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	15899955
10	NC_003028	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	15899955
11	NC_003028	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	15899955
12	NC_003028	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	15899955
13	NC_003028	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	15899955
14	NC_003028	CAATT	2	10	8238	8247	40 %	40 %	0 %	20 %	15899955
15	NC_003028	AGGAA	2	10	9254	9263	60 %	0 %	40 %	0 %	15899958
16	NC_003028	ATTGA	2	10	10672	10681	40 %	40 %	20 %	0 %	15899960
17	NC_003028	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	15899962
18	NC_003028	ATGCT	2	10	14033	14042	20 %	40 %	20 %	20 %	15899962
19	NC_003028	ATGGT	2	10	23040	23049	20 %	40 %	40 %	0 %	15899967
20	NC_003028	TTTAT	2	10	27930	27939	20 %	80 %	0 %	0 %	15899972
21	NC_003028	AATCA	2	10	31238	31247	60 %	20 %	0 %	20 %	15899977
22	NC_003028	AGCAG	2	10	31909	31918	40 %	0 %	40 %	20 %	15899978
23	NC_003028	TAAAG	2	10	35248	35257	60 %	20 %	20 %	0 %	15899980
24	NC_003028	CAGAT	2	10	41408	41417	40 %	20 %	20 %	20 %	15899987
25	NC_003028	TTTAC	2	10	42110	42119	20 %	60 %	0 %	20 %	15899987
26	NC_003028	GTGAC	2	10	45741	45750	20 %	20 %	40 %	20 %	15899990
27	NC_003028	GTGAT	2	10	46731	46740	20 %	40 %	40 %	0 %	15899990
28	NC_003028	GCTTG	2	10	47725	47734	0 %	40 %	40 %	20 %	15899990
29	NC_003028	CCTAC	2	10	48682	48691	20 %	20 %	0 %	60 %	15899990
30	NC_003028	GTTTG	2	10	49548	49557	0 %	60 %	40 %	0 %	15899991
31	NC_003028	AAATG	2	10	50157	50166	60 %	20 %	20 %	0 %	15899991
32	NC_003028	AAAAT	2	10	50881	50890	80 %	20 %	0 %	0 %	15899992
33	NC_003028	AGCTA	2	10	51233	51242	40 %	20 %	20 %	20 %	15899992
34	NC_003028	CCTTG	2	10	54123	54132	0 %	40 %	20 %	40 %	15899995
35	NC_003028	TCAAA	2	10	54317	54326	60 %	20 %	0 %	20 %	15899995
36	NC_003028	AGTGG	2	10	56684	56693	20 %	20 %	60 %	0 %	15899998
37	NC_003028	GGGTG	2	10	56722	56731	0 %	20 %	80 %	0 %	15899998
38	NC_003028	CTATT	2	10	57689	57698	20 %	60 %	0 %	20 %	15899999
39	NC_003028	AAGCA	2	10	57880	57889	60 %	0 %	20 %	20 %	15899999
40	NC_003028	GCTTG	2	10	58334	58343	0 %	40 %	40 %	20 %	15900001
41	NC_003028	TCTGG	2	10	60369	60378	0 %	40 %	40 %	20 %	15900002
42	NC_003028	AGCAT	2	10	61323	61332	40 %	20 %	20 %	20 %	15900002
43	NC_003028	TACCA	2	10	62021	62030	40 %	20 %	0 %	40 %	15900002
44	NC_003028	TTCCT	2	10	63038	63047	0 %	60 %	0 %	40 %	15900002
45	NC_003028	TTGGT	2	10	67007	67016	0 %	60 %	40 %	0 %	15900006
46	NC_003028	CTTCA	2	10	68062	68071	20 %	40 %	0 %	40 %	15900007
47	NC_003028	AATCA	2	10	68174	68183	60 %	20 %	0 %	20 %	15900008
48	NC_003028	AGCTC	2	10	70397	70406	20 %	20 %	20 %	40 %	15900010
49	NC_003028	CAAGT	2	10	74545	74554	40 %	20 %	20 %	20 %	15900016
50	NC_003028	GTTAT	2	10	76564	76573	20 %	60 %	20 %	0 %	15900016
51	NC_003028	CTAGT	2	10	79531	79540	20 %	40 %	20 %	20 %	15900017
52	NC_003028	GCTCC	2	10	81677	81686	0 %	20 %	20 %	60 %	15900020
53	NC_003028	GCTGT	2	10	81995	82004	0 %	40 %	40 %	20 %	15900020
54	NC_003028	TCTAT	2	10	83201	83210	20 %	60 %	0 %	20 %	15900023
55	NC_003028	AGAAA	2	10	84126	84135	80 %	0 %	20 %	0 %	15900023
56	NC_003028	TGACT	2	10	87128	87137	20 %	40 %	20 %	20 %	15900026
57	NC_003028	ATTCT	2	10	93074	93083	20 %	60 %	0 %	20 %	15900033
58	NC_003028	TTACT	2	10	96891	96900	20 %	60 %	0 %	20 %	15900038
59	NC_003028	TGGGA	2	10	97545	97554	20 %	20 %	60 %	0 %	15900038
60	NC_003028	TGCTT	2	10	98418	98427	0 %	60 %	20 %	20 %	15900039
61	NC_003028	TGGCT	2	10	98601	98610	0 %	40 %	40 %	20 %	15900039
62	NC_003028	AGATA	2	10	102674	102683	60 %	20 %	20 %	0 %	15900044
63	NC_003028	GTTTG	2	10	102841	102850	0 %	60 %	40 %	0 %	15900044
64	NC_003028	TTTAT	2	10	104486	104495	20 %	80 %	0 %	0 %	15900045
65	NC_003028	TATTT	2	10	104790	104799	20 %	80 %	0 %	0 %	15900046
66	NC_003028	AAAGC	2	10	107788	107797	60 %	0 %	20 %	20 %	15900048
67	NC_003028	CACAA	2	10	109551	109560	60 %	0 %	0 %	40 %	15900050
68	NC_003028	GGAAT	2	10	111052	111061	40 %	20 %	40 %	0 %	15900052
69	NC_003028	AGGAT	2	10	111617	111626	40 %	20 %	40 %	0 %	15900053
70	NC_003028	CTTTG	2	10	112926	112935	0 %	60 %	20 %	20 %	15900053
71	NC_003028	TCCTC	2	10	113052	113061	0 %	40 %	0 %	60 %	15900053
72	NC_003028	TGACT	2	10	114493	114502	20 %	40 %	20 %	20 %	15900055
73	NC_003028	CGTGG	2	10	121487	121496	0 %	20 %	60 %	20 %	15900060
74	NC_003028	GTGAA	2	10	122489	122498	40 %	20 %	40 %	0 %	15900061
75	NC_003028	GTTTG	2	10	127425	127434	0 %	60 %	40 %	0 %	15900065
76	NC_003028	GAAAA	2	10	128162	128171	80 %	0 %	20 %	0 %	15900068
77	NC_003028	TTGGA	2	10	128447	128456	20 %	40 %	40 %	0 %	15900069
78	NC_003028	GAAAT	2	10	142242	142251	60 %	20 %	20 %	0 %	15900082
79	NC_003028	TTAGT	2	10	143114	143123	20 %	60 %	20 %	0 %	15900083
80	NC_003028	GGCCT	2	10	144470	144479	0 %	20 %	40 %	40 %	15900084
81	NC_003028	CTGTT	2	10	145038	145047	0 %	60 %	20 %	20 %	15900084
82	NC_003028	TCAAA	2	10	145283	145292	60 %	20 %	0 %	20 %	15900085
83	NC_003028	AGAAA	2	10	146574	146583	80 %	0 %	20 %	0 %	15900087
84	NC_003028	TATAC	2	10	148535	148544	40 %	40 %	0 %	20 %	15900088
85	NC_003028	AGATC	2	10	148840	148849	40 %	20 %	20 %	20 %	15900089
86	NC_003028	TTTGT	2	10	150849	150858	0 %	80 %	20 %	0 %	15900091
87	NC_003028	ACTAT	2	10	154855	154864	40 %	40 %	0 %	20 %	15900094
88	NC_003028	TTGAG	2	10	157435	157444	20 %	40 %	40 %	0 %	15900097
89	NC_003028	ATGGA	2	10	159534	159543	40 %	20 %	40 %	0 %	15900101
90	NC_003028	TTATT	2	10	164536	164545	20 %	80 %	0 %	0 %	15900106
91	NC_003028	TAGTT	2	10	164681	164690	20 %	60 %	20 %	0 %	15900106
92	NC_003028	GCCTT	2	10	166045	166054	0 %	40 %	20 %	40 %	15900110
93	NC_003028	AAGTA	2	10	168827	168836	60 %	20 %	20 %	0 %	15900113
94	NC_003028	TTGAT	2	10	169986	169995	20 %	60 %	20 %	0 %	15900114
95	NC_003028	TCACT	2	10	170361	170370	20 %	40 %	0 %	40 %	15900115
96	NC_003028	ATTTT	2	10	170684	170693	20 %	80 %	0 %	0 %	15900115
97	NC_003028	TTAAG	2	10	171036	171045	40 %	40 %	20 %	0 %	15900115
98	NC_003028	TCAGG	2	10	171951	171960	20 %	20 %	40 %	20 %	15900116
99	NC_003028	GCCTT	2	10	173565	173574	0 %	40 %	20 %	40 %	15900118
100	NC_003028	AAATG	2	10	173678	173687	60 %	20 %	20 %	0 %	15900118
101	NC_003028	TTCCC	2	10	174121	174130	0 %	40 %	0 %	60 %	15900119
102	NC_003028	TCTTT	2	10	177670	177679	0 %	80 %	0 %	20 %	15900123
103	NC_003028	GGCTA	2	10	179326	179335	20 %	20 %	40 %	20 %	15900123
104	NC_003028	GAAAG	2	10	179684	179693	60 %	0 %	40 %	0 %	15900123
105	NC_003028	AGTTA	2	10	180964	180973	40 %	40 %	20 %	0 %	15900126
106	NC_003028	TGGAG	2	10	181654	181663	20 %	20 %	60 %	0 %	15900128
107	NC_003028	AAATC	2	10	182196	182205	60 %	20 %	0 %	20 %	15900129
108	NC_003028	GCAGA	2	10	183814	183823	40 %	0 %	40 %	20 %	15900133
109	NC_003028	GTAGA	2	10	187024	187033	40 %	20 %	40 %	0 %	15900136
110	NC_003028	TTTAG	2	10	187509	187518	20 %	60 %	20 %	0 %	15900136
111	NC_003028	CTTTT	2	10	187983	187992	0 %	80 %	0 %	20 %	15900136
112	NC_003028	GTCTG	2	10	188461	188470	0 %	40 %	40 %	20 %	15900137
113	NC_003028	GTCTT	2	10	189807	189816	0 %	60 %	20 %	20 %	15900138
114	NC_003028	AGCAG	2	10	191490	191499	40 %	0 %	40 %	20 %	15900140
115	NC_003028	GGGAG	2	10	191829	191838	20 %	0 %	80 %	0 %	15900141
116	NC_003028	ACTTA	2	10	192770	192779	40 %	40 %	0 %	20 %	15900143
117	NC_003028	TACAC	2	10	195435	195444	40 %	20 %	0 %	40 %	15900148
118	NC_003028	TTTGG	2	10	196580	196589	0 %	60 %	40 %	0 %	15900150
119	NC_003028	TTCAC	2	10	196936	196945	20 %	40 %	0 %	40 %	15900151
120	NC_003028	GACAA	2	10	198107	198116	60 %	0 %	20 %	20 %	15900154
121	NC_003028	TCCAA	2	10	203831	203840	40 %	20 %	0 %	40 %	15900166
122	NC_003028	ACAGA	2	10	204397	204406	60 %	0 %	20 %	20 %	15900166
123	NC_003028	GAGAT	2	10	208749	208758	40 %	20 %	40 %	0 %	15900175
124	NC_003028	ATTCC	2	10	208767	208776	20 %	40 %	0 %	40 %	15900175
125	NC_003028	TCTGT	2	10	209442	209451	0 %	60 %	20 %	20 %	15900175
126	NC_003028	TGGAT	2	10	209452	209461	20 %	40 %	40 %	0 %	15900175
127	NC_003028	GAGTA	2	10	214147	214156	40 %	20 %	40 %	0 %	15900178
128	NC_003028	AAGTC	2	10	216642	216651	40 %	20 %	20 %	20 %	15900181
129	NC_003028	TTAAT	2	10	218194	218203	40 %	60 %	0 %	0 %	15900183
130	NC_003028	GTTTG	2	10	219016	219025	0 %	60 %	40 %	0 %	15900185
131	NC_003028	GCCAT	2	10	223114	223123	20 %	20 %	20 %	40 %	15900187
132	NC_003028	CTATT	2	10	223300	223309	20 %	60 %	0 %	20 %	15900188
133	NC_003028	CAACA	2	10	225126	225135	60 %	0 %	0 %	40 %	15900189
134	NC_003028	GCAAC	2	10	225408	225417	40 %	0 %	20 %	40 %	15900189
135	NC_003028	ACAGT	2	10	234732	234741	40 %	20 %	20 %	20 %	15900196
136	NC_003028	TTTTG	2	10	238642	238651	0 %	80 %	20 %	0 %	15900199
137	NC_003028	ACTTG	2	10	240480	240489	20 %	40 %	20 %	20 %	15900200
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