MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003028	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003028	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003028	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003028	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003028	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003028	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003028	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003028	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003028	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003028	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003028	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003028	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003028	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_003028	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003028	CTTT	2	8	21354	21361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003028	ATGT	2	8	22790	22797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003028	AATA	2	8	24921	24928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003028	CCAG	2	8	26432	26439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003028	TCCA	2	8	26457	26464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003028	AGAA	2	8	27890	27897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003028	TTGA	2	8	28773	28780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003028	AATA	2	8	29876	29883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003028	TTCT	2	8	30250	30257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003028	AATT	2	8	31343	31350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003028	CTAT	2	8	31447	31454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003028	GAAT	2	8	39622	39629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003028	ATTT	2	8	40447	40454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003028	GGGA	2	8	40564	40571	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003028	GAAG	2	8	40587	40594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003028	TGAC	2	8	40701	40708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003028	ATAG	2	8	49153	49160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003028	TTTC	2	8	54642	54649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003028	TAAT	2	8	64900	64907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003028	GTTT	2	8	70904	70911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003028	AAGA	2	8	72105	72112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003028	CTTA	2	8	73336	73343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003028	ACTT	2	8	73526	73533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003028	TTGA	2	8	79426	79433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003028	TAGC	2	8	85317	85324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003028	AAAT	2	8	85360	85367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003028	AAGG	2	8	85544	85551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003028	TAAT	2	8	86176	86183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003028	AAAG	2	8	86273	86280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003028	AAAT	2	8	88882	88889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003028	CTTT	2	8	88943	88950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003028	AATT	2	8	91976	91983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003028	TTTG	2	8	92827	92834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003028	ATTC	2	8	96620	96627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003028	ATAA	2	8	96821	96828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003028	AGCT	2	8	97941	97948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003028	GTTT	2	8	98064	98071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003028	TGTA	2	8	98100	98107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003028	TTAG	2	8	100249	100256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003028	ACAT	2	8	102157	102164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003028	AAAG	2	8	102175	102182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003028	TCCA	2	8	106790	106797	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003028	AGAA	2	8	109381	109388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003028	GAAG	2	8	110701	110708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003028	AAAT	2	8	110785	110792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003028	GTTC	2	8	113880	113887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003028	AAAG	2	8	114977	114984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003028	GTAT	2	8	116167	116174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003028	TGCT	2	8	116304	116311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003028	AGGA	2	8	116500	116507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003028	TTAT	2	8	117019	117026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003028	AATT	2	8	117366	117373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003028	GAAA	2	8	118113	118120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003028	GAAG	2	8	118223	118230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003028	TTAT	2	8	120841	120848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003028	TGAA	2	8	120859	120866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003028	TCTA	2	8	124908	124915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003028	AAAG	2	8	125001	125008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003028	TCAA	2	8	130707	130714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003028	GGAT	2	8	131229	131236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003028	TAGG	2	8	132216	132223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003028	GTAG	2	8	132314	132321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003028	AAGC	2	8	132335	132342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003028	CTGC	2	8	132503	132510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003028	GGGA	2	8	136818	136825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003028	ATAA	2	8	138374	138381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003028	CAAA	2	8	138642	138649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003028	GAAG	2	8	138767	138774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003028	GTTT	2	8	138973	138980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003028	AAAT	2	8	139079	139086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003028	TAAT	2	8	139241	139248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003028	ATTG	2	8	139254	139261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003028	GGCT	2	8	139748	139755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003028	AATT	2	8	144042	144049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003028	GAAA	2	8	144403	144410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003028	GCAG	2	8	144430	144437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003028	AGAT	2	8	145437	145444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003028	GGTG	2	8	146371	146378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003028	CAAA	2	8	146446	146453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003028	TTTC	2	8	157832	157839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003028	TGAA	2	8	159042	159049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003028	CAAA	2	8	160118	160125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_003028	GCAG	2	8	161111	161118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003028	TTCA	2	8	164822	164829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003028	TGGA	2	8	164992	164999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003028	AGCT	2	8	175010	175017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003028	AGAA	2	8	176864	176871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003028	GGTA	2	8	180885	180892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003028	AAAT	2	8	181935	181942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003028	TTGA	2	8	182602	182609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003028	TAGA	2	8	182687	182694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003028	ATTG	2	8	183253	183260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003028	TCTT	2	8	185309	185316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_003028	AGAA	2	8	186808	186815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003028	CTAA	2	8	186834	186841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003028	AGAA	2	8	188640	188647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003028	GCAT	2	8	188662	188669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003028	AGAA	2	8	192816	192823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003028	GTTT	2	8	200679	200686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003028	ACAA	2	8	200687	200694	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003028	TAAA	2	8	209770	209777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003028	TTTA	2	8	209844	209851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003028	TCAT	2	8	209919	209926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003028	CTTG	2	8	210660	210667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_003028	GAAG	2	8	211196	211203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003028	TAGG	2	8	211301	211308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003028	TGGA	2	8	211568	211575	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003028	CAAG	2	8	211780	211787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_003028	AATA	2	8	211974	211981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003028	CATA	2	8	212133	212140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003028	AAAG	2	8	212245	212252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003028	TGCT	2	8	212293	212300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_003028	AAGA	2	8	212344	212351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003028	AATT	2	8	214636	214643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003028	GTAT	2	8	215037	215044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003028	GAAA	2	8	215912	215919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003028	ACGA	2	8	215927	215934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003028	GAAA	2	8	220027	220034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003028	GAAA	2	8	220048	220055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003028	AATT	2	8	224402	224409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003028	TATT	2	8	224501	224508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003028	ATTA	2	8	224517	224524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003028	TTGT	2	8	228578	228585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003028	TAAA	2	8	228628	228635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003028	TTTA	2	8	228647	228654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003028	AGAT	2	8	229810	229817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003028	TTCA	2	8	229881	229888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003028	TCAG	2	8	230087	230094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003028	GGAT	2	8	230310	230317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003028	CTGG	2	8	230482	230489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003028	AGTT	2	8	230612	230619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003028	TTTA	2	8	230800	230807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003028	AATA	2	8	233304	233311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003028	CTGA	2	8	239586	239593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003028	GAAA	2	8	239669	239676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003028	AGAT	2	8	241676	241683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003028	CAAT	2	8	246699	246706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_003028	GAAA	2	8	246767	246774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_003028	TGAT	2	8	310279	310286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_003028	CTAG	2	8	310637	310644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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