MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 5241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003028	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	15899950
2	NC_003028	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	15899950
3	NC_003028	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	15899950
4	NC_003028	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	15899950
5	NC_003028	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	15899950
6	NC_003028	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	15899950
7	NC_003028	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	15899951
8	NC_003028	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	15899951
9	NC_003028	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	15899951
10	NC_003028	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	15899951
11	NC_003028	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	15899953
12	NC_003028	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	15899953
13	NC_003028	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	15899953
14	NC_003028	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	15899953
15	NC_003028	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	15899954
16	NC_003028	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	15899954
17	NC_003028	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	15899954
18	NC_003028	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	15899955
19	NC_003028	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	15899955
20	NC_003028	TTTA	2	8	7633	7640	25 %	75 %	0 %	0 %	15899955
21	NC_003028	GTCG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	15899955
22	NC_003028	ATCA	2	8	7747	7754	50 %	25 %	0 %	25 %	15899955
23	NC_003028	GAAA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	15899955
24	NC_003028	AAGA	2	8	8372	8379	75 %	0 %	25 %	0 %	15899955
25	NC_003028	GAAA	2	8	9355	9362	75 %	0 %	25 %	0 %	15899959
26	NC_003028	TATT	2	8	9391	9398	25 %	75 %	0 %	0 %	15899959
27	NC_003028	TAAA	2	8	9522	9529	75 %	25 %	0 %	0 %	15899959
28	NC_003028	ATCA	2	8	9597	9604	50 %	25 %	0 %	25 %	15899959
29	NC_003028	GAAG	2	8	9740	9747	50 %	0 %	50 %	0 %	15899959
30	NC_003028	TTCT	2	8	9859	9866	0 %	75 %	0 %	25 %	15899959
31	NC_003028	ATCA	2	8	9908	9915	50 %	25 %	0 %	25 %	15899959
32	NC_003028	CAGC	2	8	9933	9940	25 %	0 %	25 %	50 %	15899959
33	NC_003028	TTCT	2	8	10455	10462	0 %	75 %	0 %	25 %	15899959
34	NC_003028	CTAT	2	8	10947	10954	25 %	50 %	0 %	25 %	15899960
35	NC_003028	CTTA	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	15899960
36	NC_003028	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	15899960
37	NC_003028	AATT	2	8	11534	11541	50 %	50 %	0 %	0 %	15899960
38	NC_003028	TTTA	2	8	11640	11647	25 %	75 %	0 %	0 %	15899960
39	NC_003028	AAAG	2	8	12157	12164	75 %	0 %	25 %	0 %	15899961
40	NC_003028	AGAA	2	8	12353	12360	75 %	0 %	25 %	0 %	15899961
41	NC_003028	TTAA	2	8	12391	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	15899962
42	NC_003028	ACCA	2	8	12548	12555	50 %	0 %	0 %	50 %	15899962
43	NC_003028	TGCT	2	8	13073	13080	0 %	50 %	25 %	25 %	15899962
44	NC_003028	GATG	2	8	13317	13324	25 %	25 %	50 %	0 %	15899962
45	NC_003028	TTGG	2	8	13426	13433	0 %	50 %	50 %	0 %	15899962
46	NC_003028	TGAA	2	8	13568	13575	50 %	25 %	25 %	0 %	15899962
47	NC_003028	AAGA	2	8	13666	13673	75 %	0 %	25 %	0 %	15899962
48	NC_003028	TCTA	2	8	13842	13849	25 %	50 %	0 %	25 %	15899962
49	NC_003028	TGGC	2	8	13871	13878	0 %	25 %	50 %	25 %	15899962
50	NC_003028	AACA	2	8	14075	14082	75 %	0 %	0 %	25 %	15899962
51	NC_003028	GTTC	2	8	14104	14111	0 %	50 %	25 %	25 %	15899962
52	NC_003028	ATGA	2	8	14311	14318	50 %	25 %	25 %	0 %	15899962
53	NC_003028	AAAC	2	8	14800	14807	75 %	0 %	0 %	25 %	15899963
54	NC_003028	GATA	2	8	23431	23438	50 %	25 %	25 %	0 %	15899967
55	NC_003028	CAAG	2	8	23595	23602	50 %	0 %	25 %	25 %	15899967
56	NC_003028	GGTT	2	8	23750	23757	0 %	50 %	50 %	0 %	15899967
57	NC_003028	CTTT	2	8	23807	23814	0 %	75 %	0 %	25 %	15899967
58	NC_003028	CTAT	2	8	23934	23941	25 %	50 %	0 %	25 %	15899967
59	NC_003028	TTGG	2	8	24038	24045	0 %	50 %	50 %	0 %	15899967
60	NC_003028	AACA	2	8	24084	24091	75 %	0 %	0 %	25 %	15899967
61	NC_003028	GAGG	2	8	24354	24361	25 %	0 %	75 %	0 %	15899968
62	NC_003028	AGCG	2	8	24473	24480	25 %	0 %	50 %	25 %	15899968
63	NC_003028	ATGC	2	8	24484	24491	25 %	25 %	25 %	25 %	15899968
64	NC_003028	TGAG	2	8	24521	24528	25 %	25 %	50 %	0 %	15899968
65	NC_003028	TTAA	2	8	25201	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	15899969
66	NC_003028	ATGT	2	8	25807	25814	25 %	50 %	25 %	0 %	15899970
67	NC_003028	GATT	2	8	25891	25898	25 %	50 %	25 %	0 %	15899970
68	NC_003028	GAAG	2	8	27698	27705	50 %	0 %	50 %	0 %	15899971
69	NC_003028	TATT	2	8	27922	27929	25 %	75 %	0 %	0 %	15899972
70	NC_003028	ACGG	2	8	27978	27985	25 %	0 %	50 %	25 %	15899972
71	NC_003028	GGGA	2	8	28126	28133	25 %	0 %	75 %	0 %	15899973
72	NC_003028	TGGT	2	8	29346	29353	0 %	50 %	50 %	0 %	15899974
73	NC_003028	TTGA	2	8	29525	29532	25 %	50 %	25 %	0 %	15899974
74	NC_003028	TGAT	2	8	29538	29545	25 %	50 %	25 %	0 %	15899974
75	NC_003028	TTCT	2	8	29628	29635	0 %	75 %	0 %	25 %	15899974
76	NC_003028	ATCT	2	8	29696	29703	25 %	50 %	0 %	25 %	15899974
77	NC_003028	TGAT	2	8	29718	29725	25 %	50 %	25 %	0 %	15899974
78	NC_003028	CGTA	2	8	29770	29777	25 %	25 %	25 %	25 %	15899974
79	NC_003028	GCTG	2	8	30413	30420	0 %	25 %	50 %	25 %	15899975
80	NC_003028	CTTC	2	8	30487	30494	0 %	50 %	0 %	50 %	15899975
81	NC_003028	TGAT	2	8	31005	31012	25 %	50 %	25 %	0 %	15899977
82	NC_003028	TTGA	2	8	31556	31563	25 %	50 %	25 %	0 %	15899978
83	NC_003028	TTGG	2	8	32534	32541	0 %	50 %	50 %	0 %	15899978
84	NC_003028	ACTT	2	8	32789	32796	25 %	50 %	0 %	25 %	15899978
85	NC_003028	AAGA	2	8	33017	33024	75 %	0 %	25 %	0 %	15899978
86	NC_003028	CTTG	2	8	33028	33035	0 %	50 %	25 %	25 %	15899978
87	NC_003028	GCTG	2	8	33091	33098	0 %	25 %	50 %	25 %	15899978
88	NC_003028	AAAC	2	8	34082	34089	75 %	0 %	0 %	25 %	15899978
89	NC_003028	TAAA	2	8	34162	34169	75 %	25 %	0 %	0 %	15899978
90	NC_003028	TTGA	2	8	34673	34680	25 %	50 %	25 %	0 %	15899979
91	NC_003028	CCAA	2	8	35655	35662	50 %	0 %	0 %	50 %	15899980
92	NC_003028	CAAG	2	8	35800	35807	50 %	0 %	25 %	25 %	15899980
93	NC_003028	AGGC	2	8	35976	35983	25 %	0 %	50 %	25 %	15899980
94	NC_003028	AGCG	2	8	36325	36332	25 %	0 %	50 %	25 %	15899981
95	NC_003028	CAGC	2	8	37273	37280	25 %	0 %	25 %	50 %	15899981
96	NC_003028	TTTC	2	8	37827	37834	0 %	75 %	0 %	25 %	15899982
97	NC_003028	GCCT	2	8	37844	37851	0 %	25 %	25 %	50 %	15899982
98	NC_003028	TCAA	2	8	37917	37924	50 %	25 %	0 %	25 %	15899982
99	NC_003028	CAAG	2	8	37978	37985	50 %	0 %	25 %	25 %	15899982
100	NC_003028	TCAA	2	8	38165	38172	50 %	25 %	0 %	25 %	15899983
101	NC_003028	GATT	2	8	38283	38290	25 %	50 %	25 %	0 %	15899983
102	NC_003028	TGCT	2	8	39917	39924	0 %	50 %	25 %	25 %	15899986
103	NC_003028	ATGG	2	8	40951	40958	25 %	25 %	50 %	0 %	15899987
104	NC_003028	AAGG	2	8	41083	41090	50 %	0 %	50 %	0 %	15899987
105	NC_003028	CTTG	2	8	41502	41509	0 %	50 %	25 %	25 %	15899987
106	NC_003028	ATGG	2	8	42058	42065	25 %	25 %	50 %	0 %	15899987
107	NC_003028	CAGA	2	8	42649	42656	50 %	0 %	25 %	25 %	15899987
108	NC_003028	TTGC	2	8	42925	42932	0 %	50 %	25 %	25 %	15899987
109	NC_003028	CAGT	2	8	43290	43297	25 %	25 %	25 %	25 %	15899988
110	NC_003028	GCAG	2	8	43426	43433	25 %	0 %	50 %	25 %	15899988
111	NC_003028	GAAG	2	8	44950	44957	50 %	0 %	50 %	0 %	15899989
112	NC_003028	ATTG	2	8	45013	45020	25 %	50 %	25 %	0 %	15899989
113	NC_003028	CTTT	2	8	45654	45661	0 %	75 %	0 %	25 %	15899990
114	NC_003028	CTTT	2	8	45918	45925	0 %	75 %	0 %	25 %	15899990
115	NC_003028	GGTC	2	8	46199	46206	0 %	25 %	50 %	25 %	15899990
116	NC_003028	GATT	2	8	47908	47915	25 %	50 %	25 %	0 %	15899990
117	NC_003028	ACTG	2	8	48172	48179	25 %	25 %	25 %	25 %	15899990
118	NC_003028	TGAA	2	8	48444	48451	50 %	25 %	25 %	0 %	15899990
119	NC_003028	CCAA	2	8	48744	48751	50 %	0 %	0 %	50 %	15899990
120	NC_003028	TGGT	3	12	48800	48811	0 %	50 %	50 %	0 %	15899990
121	NC_003028	AAGA	2	8	49594	49601	75 %	0 %	25 %	0 %	15899991
122	NC_003028	TTGA	2	8	50524	50531	25 %	50 %	25 %	0 %	15899991
123	NC_003028	CGGT	2	8	51364	51371	0 %	25 %	50 %	25 %	15899992
124	NC_003028	AAGA	2	8	51879	51886	75 %	0 %	25 %	0 %	15899992
125	NC_003028	GTTT	2	8	52759	52766	0 %	75 %	25 %	0 %	15899994
126	NC_003028	TTGG	2	8	53144	53151	0 %	50 %	50 %	0 %	15899995
127	NC_003028	AAGC	2	8	53658	53665	50 %	0 %	25 %	25 %	15899995
128	NC_003028	AACC	2	8	54378	54385	50 %	0 %	0 %	50 %	15899995
129	NC_003028	ATTG	2	8	54901	54908	25 %	50 %	25 %	0 %	15899996
130	NC_003028	GGAC	2	8	55704	55711	25 %	0 %	50 %	25 %	15899996
131	NC_003028	GCCA	2	8	55783	55790	25 %	0 %	25 %	50 %	15899996
132	NC_003028	GATT	2	8	57959	57966	25 %	50 %	25 %	0 %	15899999
133	NC_003028	CTAT	2	8	58123	58130	25 %	50 %	0 %	25 %	15900000
134	NC_003028	AATA	2	8	58322	58329	75 %	25 %	0 %	0 %	15900001
135	NC_003028	TCCT	2	8	58908	58915	0 %	50 %	0 %	50 %	15900001
136	NC_003028	TTGA	2	8	59225	59232	25 %	50 %	25 %	0 %	15900001
137	NC_003028	ATTG	2	8	59350	59357	25 %	50 %	25 %	0 %	15900001
138	NC_003028	ATTA	2	8	59565	59572	50 %	50 %	0 %	0 %	15900001
139	NC_003028	GTTC	2	8	60258	60265	0 %	50 %	25 %	25 %	15900002
140	NC_003028	TCTT	2	8	60321	60328	0 %	75 %	0 %	25 %	15900002
141	NC_003028	CTTT	2	8	60552	60559	0 %	75 %	0 %	25 %	15900002
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