MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 27827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003028	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003028	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003028	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003028	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003028	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003028	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899950
7	NC_003028	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899950
8	NC_003028	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899950
9	NC_003028	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899950
10	NC_003028	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899950
11	NC_003028	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15899950
12	NC_003028	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899950
13	NC_003028	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899950
14	NC_003028	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899950
15	NC_003028	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899950
16	NC_003028	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15899950
17	NC_003028	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899950
18	NC_003028	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899950
19	NC_003028	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899950
20	NC_003028	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003028	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003028	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899951
23	NC_003028	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899951
24	NC_003028	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899951
25	NC_003028	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899951
26	NC_003028	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899951
27	NC_003028	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899951
28	NC_003028	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899951
29	NC_003028	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899951
30	NC_003028	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899951
31	NC_003028	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899951
32	NC_003028	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899951
33	NC_003028	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899951
34	NC_003028	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899951
35	NC_003028	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899951
36	NC_003028	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899952
37	NC_003028	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899952
38	NC_003028	GTA	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899952
39	NC_003028	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899952
40	NC_003028	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899952
41	NC_003028	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899952
42	NC_003028	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899953
43	NC_003028	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899953
44	NC_003028	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899953
45	NC_003028	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15899953
46	NC_003028	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899953
47	NC_003028	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899953
48	NC_003028	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899953
49	NC_003028	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899953
50	NC_003028	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899953
51	NC_003028	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899953
52	NC_003028	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899953
53	NC_003028	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15899953
54	NC_003028	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899953
55	NC_003028	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899953
56	NC_003028	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899953
57	NC_003028	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899953
58	NC_003028	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003028	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899954
60	NC_003028	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899954
61	NC_003028	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899954
62	NC_003028	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899954
63	NC_003028	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899954
64	NC_003028	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899954
65	NC_003028	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899954
66	NC_003028	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899954
67	NC_003028	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899954
68	NC_003028	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
69	NC_003028	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899955
70	NC_003028	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
71	NC_003028	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
72	NC_003028	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15899955
73	NC_003028	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899955
74	NC_003028	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
75	NC_003028	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15899955
76	NC_003028	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
77	NC_003028	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
78	NC_003028	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
79	NC_003028	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
80	NC_003028	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
81	NC_003028	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
82	NC_003028	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
83	NC_003028	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15899955
84	NC_003028	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899955
85	NC_003028	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899955
86	NC_003028	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899955
87	NC_003028	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899955
88	NC_003028	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
89	NC_003028	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
90	NC_003028	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
91	NC_003028	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
92	NC_003028	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
93	NC_003028	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899955
94	NC_003028	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899955
95	NC_003028	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
96	NC_003028	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
97	NC_003028	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
98	NC_003028	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15899955
99	NC_003028	TAT	2	6	7424	7429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
100	NC_003028	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899955
101	NC_003028	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899955
102	NC_003028	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
103	NC_003028	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
104	NC_003028	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899955
105	NC_003028	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899955
106	NC_003028	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
107	NC_003028	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899955
108	NC_003028	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899955
109	NC_003028	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003028	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003028	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003028	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899956
113	NC_003028	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899956
114	NC_003028	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899956
115	NC_003028	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899956
116	NC_003028	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899957
117	NC_003028	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899957
118	NC_003028	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899957
119	NC_003028	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899957
120	NC_003028	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899957
121	NC_003028	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899957
122	NC_003028	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899957
123	NC_003028	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899958
124	NC_003028	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899958
125	NC_003028	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899958
126	NC_003028	AAG	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899958
127	NC_003028	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899959
128	NC_003028	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899959
129	NC_003028	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899959
130	NC_003028	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899959
131	NC_003028	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899959
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133	NC_003028	CAA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899959
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263	NC_003028	AGT	2	6	20192	20197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_003028	GTA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_003028	ATG	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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