MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylococcus capsulatus str. Bath chromosome

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002977	GGCCGA	2	12	2947033	2947044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	53803107
1502	NC_002977	CATCGT	2	12	2951176	2951187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53803095
1503	NC_002977	AGGACA	2	12	2951457	2951468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	53803095
1504	NC_002977	CATCGG	2	12	2951956	2951967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803095
1505	NC_002977	GGGCGA	2	12	2955046	2955057	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	53803103
1506	NC_002977	CGATGG	2	12	2960635	2960646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53803089
1507	NC_002977	GACATC	2	12	2961569	2961580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53803088
1508	NC_002977	TTCCAC	2	12	2961677	2961688	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	53803088
1509	NC_002977	GCCAAA	2	12	2963663	2963674	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	53803087
1510	NC_002977	GATGCC	2	12	2963835	2963846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803086
1511	NC_002977	ACGCCG	2	12	2964577	2964588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53803086
1512	NC_002977	GCGCGG	2	12	2965289	2965300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53803085
1513	NC_002977	CGCCGG	2	12	2971740	2971751	0 %	0 %	50 %	50 %	53803069
1514	NC_002977	CCCTGC	2	12	2978210	2978221	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	53803057
1515	NC_002977	GCTTCG	2	12	2979151	2979162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53803056
1516	NC_002977	GATCGC	2	12	2982179	2982190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803046
1517	NC_002977	CGGGAG	2	12	2982977	2982988	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	53803045
1518	NC_002977	ATAGCA	2	12	2983795	2983806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	53803044
1519	NC_002977	TCCGCC	2	12	2984004	2984015	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	53803043
1520	NC_002977	CATGGT	2	12	2984731	2984742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53803043
1521	NC_002977	CGGCAT	2	12	2985693	2985704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803042
1522	NC_002977	CACGGT	2	12	2987976	2987987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803040
1523	NC_002977	GATTGC	2	12	2988562	2988573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53803040
1524	NC_002977	GTGACG	2	12	2989516	2989527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53803040
1525	NC_002977	GCCGAT	2	12	2990737	2990748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803032
1526	NC_002977	CTGATC	2	12	2991168	2991179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53803031
1527	NC_002977	CGTGAC	2	12	2995581	2995592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803017
1528	NC_002977	GCCGCT	2	12	2996698	2996709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53803015
1529	NC_002977	CGGCAT	2	12	2997206	2997217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803015
1530	NC_002977	TTCGGC	2	12	2997672	2997683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53803015
1531	NC_002977	CGCCGG	2	12	3008190	3008201	0 %	0 %	50 %	50 %	53802997
1532	NC_002977	GGAAGC	2	12	3008569	3008580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	53802997
1533	NC_002977	CCAGGC	2	12	3009001	3009012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802997
1534	NC_002977	GCCGCA	2	12	3011565	3011576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802994
1535	NC_002977	CGACAG	2	12	3012687	3012698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802985
1536	NC_002977	GGTCAG	2	12	3015188	3015199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802982
1537	NC_002977	GAGCCG	2	12	3018476	3018487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	53802968
1538	NC_002977	CCGAGA	2	12	3018709	3018720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802968
1539	NC_002977	TCGGCC	2	12	3019883	3019894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802967
1540	NC_002977	ATGCGG	2	12	3020213	3020224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802967
1541	NC_002977	GGCCAA	2	12	3022385	3022396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802966
1542	NC_002977	CGCTCC	2	12	3025301	3025312	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	53802964
1543	NC_002977	CACCGG	2	12	3026059	3026070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802964
1544	NC_002977	TGGCGT	2	12	3028457	3028468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53803093
1545	NC_002977	GATCAG	2	12	3029778	3029789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53803092
1546	NC_002977	ACGGTG	2	12	3031072	3031083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53803091
1547	NC_002977	GCCTGC	2	12	3031582	3031593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53803091
1548	NC_002977	GGTCGG	2	12	3032027	3032038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	53803091
1549	NC_002977	GTCGGC	2	12	3034585	3034596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53803081
1550	NC_002977	GAGCAC	2	12	3034753	3034764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53803081
1551	NC_002977	GTCCGC	2	12	3035481	3035492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53803080
1552	NC_002977	CCGGTC	2	12	3037336	3037347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53803078
1553	NC_002977	AGGTCA	2	12	3042871	3042882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53803067
1554	NC_002977	CATTGG	2	12	3045330	3045341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53803064
1555	NC_002977	TACGCA	2	12	3047774	3047785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53803063
1556	NC_002977	GGCGCT	2	12	3047814	3047825	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53803063
1557	NC_002977	TGCCGG	2	12	3055487	3055498	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53803050
1558	NC_002977	TCACCC	2	12	3057377	3057388	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	53803048
1559	NC_002977	ACGGCG	2	12	3061732	3061743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	53803035
1560	NC_002977	CCGGGA	2	12	3061951	3061962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	53803035
1561	NC_002977	CATAGG	2	12	3066135	3066146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53803024
1562	NC_002977	CCTCGA	2	12	3066204	3066215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53803024
1563	NC_002977	GCCCCA	2	12	3068546	3068557	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	53803023
1564	NC_002977	CCTGGA	3	18	3070601	3070618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803019
1565	NC_002977	TACGAA	2	12	3071076	3071087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	53803019
1566	NC_002977	CGGCAT	2	12	3071897	3071908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53803009
1567	NC_002977	GCTGCG	2	12	3077457	3077468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53803003
1568	NC_002977	CTCGGC	2	12	3081638	3081649	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802990
1569	NC_002977	CGTCTA	2	12	3082995	3083006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53802989
1570	NC_002977	GACCCG	2	12	3083114	3083125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802988
1571	NC_002977	CTGGTG	2	12	3084949	3084960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802987
1572	NC_002977	CGTCAC	2	12	3086516	3086527	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802977
1573	NC_002977	GCCGGT	2	12	3088603	3088614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802975
1574	NC_002977	GGGCTG	2	12	3089128	3089139	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	53802974
1575	NC_002977	TGGGAT	2	12	3089411	3089422	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	53802974
1576	NC_002977	GTCGGC	2	12	3091370	3091381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802972
1577	NC_002977	GACGAT	2	12	3092357	3092368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53802971
1578	NC_002977	AGCCGA	2	12	3092550	3092561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802971
1579	NC_002977	CACCTG	2	12	3093447	3093458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802970
1580	NC_002977	GACTTC	2	12	3095882	3095893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53802960
1581	NC_002977	CGGTAG	2	12	3096933	3096944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802959
1582	NC_002977	CCGGCG	2	12	3098286	3098297	0 %	0 %	50 %	50 %	53802957
1583	NC_002977	TCGGTG	2	12	3098597	3098608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802957
1584	NC_002977	TCGGGC	2	12	3098975	3098986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802957
1585	NC_002977	TTGGCG	2	12	3100818	3100829	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802955
1586	NC_002977	GGCGTT	2	12	3102903	3102914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802962
1587	NC_002977	GCCTTG	2	12	3103578	3103589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53802953
1588	NC_002977	GCCGCG	2	12	3104679	3104690	0 %	0 %	50 %	50 %	53802953
1589	NC_002977	GGAACC	2	12	3106846	3106857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802952
1590	NC_002977	TCGAAC	2	12	3107606	3107617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53802950
1591	NC_002977	CGTTGG	2	12	3108015	3108026	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802950
1592	NC_002977	CGCCGG	2	12	3114664	3114675	0 %	0 %	50 %	50 %	53802933
1593	NC_002977	AGCCTG	2	12	3120028	3120039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802922
1594	NC_002977	GATCCG	2	12	3121581	3121592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802921
1595	NC_002977	CTTGCC	2	12	3122708	3122719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	53802920
1596	NC_002977	CCAGCG	2	12	3123399	3123410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802919
1597	NC_002977	TCGTTC	2	12	3124836	3124847	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	53802907
1598	NC_002977	GCAGAT	2	12	3133025	3133036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53802877
1599	NC_002977	ATCGAG	2	12	3133389	3133400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53802877
1600	NC_002977	CCCCAC	2	12	3134621	3134632	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	53802875
1601	NC_002977	GCGACC	2	12	3134949	3134960	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802875
1602	NC_002977	GATGGG	2	12	3134990	3135001	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	53802875
1603	NC_002977	TTCCTG	2	12	3140686	3140697	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	53802861
1604	NC_002977	TCATGC	2	12	3142405	3142416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53802859
1605	NC_002977	CTCGGC	2	12	3145271	3145282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802856
1606	NC_002977	TGACCC	2	12	3147215	3147226	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802847
1607	NC_002977	CGGTGT	2	12	3148452	3148463	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802845
1608	NC_002977	CGGTGT	2	12	3150920	3150931	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	53802844
1609	NC_002977	CGAACC	2	12	3152765	3152776	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	53802842
1610	NC_002977	TCCGAA	2	12	3153313	3153324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53802842
1611	NC_002977	GAAATG	2	12	3157507	3157518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	53802830
1612	NC_002977	TTCCGG	2	12	3159701	3159712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53802827
1613	NC_002977	GCCGAT	2	12	3159866	3159877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802827
1614	NC_002977	TCGAGA	2	12	3162338	3162349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	53802815
1615	NC_002977	TCTGGC	2	12	3162975	3162986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53802814
1616	NC_002977	CTGAAA	2	12	3163477	3163488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	53802943
1617	NC_002977	CCAGGC	2	12	3163806	3163817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802943
1618	NC_002977	AACGCA	2	12	3164352	3164363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	53802942
1619	NC_002977	CCCCGA	2	12	3167376	3167387	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	53802939
1620	NC_002977	TACGGC	2	12	3167455	3167466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802939
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1629	NC_002977	ATGCCG	2	12	3190535	3190546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802910
1630	NC_002977	TCGACC	2	12	3196718	3196729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802900
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1634	NC_002977	CACCGA	2	12	3203872	3203883	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	53802884
1635	NC_002977	CCTTGA	2	12	3204787	3204798	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	53802884
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1637	NC_002977	TGCCTT	2	12	3208932	3208943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	53802880
1638	NC_002977	CCTCGC	2	12	3209212	3209223	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	53802879
1639	NC_002977	ACCCGG	2	12	3209972	3209983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802879
1640	NC_002977	CAGGCA	2	12	3210755	3210766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802879
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1644	NC_002977	CGTCGG	2	12	3215866	3215877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802866
1645	NC_002977	CGACGC	2	12	3216610	3216621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802866
1646	NC_002977	TCTTGT	2	12	3216667	3216678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	53802866
1647	NC_002977	CTCGAA	2	12	3216710	3216721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53802866
1648	NC_002977	TCTCAT	2	12	3217506	3217517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	53802865
1649	NC_002977	ATCCGA	2	12	3217995	3218006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	53802865
1650	NC_002977	GCACCC	2	12	3225308	3225319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	53802850
1651	NC_002977	GAAACC	2	12	3231177	3231188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	53802836
1652	NC_002977	GAAACC	2	12	3237859	3237870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	53802823
1653	NC_002977	CCTGGG	2	12	3244879	3244890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802807
1654	NC_002977	CCGGGC	2	12	3246191	3246202	0 %	0 %	50 %	50 %	53802805
1655	NC_002977	GTGGGC	2	12	3251390	3251401	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	53802801
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1664	NC_002977	CGCGGT	2	12	3266642	3266653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	53802775
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1666	NC_002977	CGCGGC	2	12	3269123	3269134	0 %	0 %	50 %	50 %	53802773
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1669	NC_002977	GAGCTG	2	12	3271594	3271605	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802770
1670	NC_002977	TGACGG	2	12	3272848	3272859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802769
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1676	NC_002977	GCCCGT	2	12	3280703	3280714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802755
1677	NC_002977	CTCCGG	2	12	3280920	3280931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802755
1678	NC_002977	GCGACC	2	12	3283575	3283586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802752
1679	NC_002977	GTTCGA	2	12	3285172	3285183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53802742
1680	NC_002977	CGCTGA	2	12	3285304	3285315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802742
1681	NC_002977	ACCTCG	2	12	3288016	3288027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802739
1682	NC_002977	AGGCCC	2	12	3292477	3292488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802736
1683	NC_002977	TCAGCC	2	12	3293298	3293309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802726
1684	NC_002977	GGCCAT	2	12	3293771	3293782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53802726
1685	NC_002977	CAGGAA	2	12	3294072	3294083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	53802726
1686	NC_002977	CGGCCA	2	12	3294335	3294346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	53802726
1687	NC_002977	ATGCGG	2	12	3294676	3294687	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	53802726
1688	NC_002977	GGCCTC	2	12	3296502	3296513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53802724
1689	NC_002977	GTCACC	2	12	3298105	3298116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	53802722
1690	NC_002977	CGAAGA	2	12	3301588	3301599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	53802721
1691	NC_002977	TGGTCA	2	12	3302373	3302384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53802720
1692	NC_002977	CGAGCA	2	12	3303581	3303592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53802711
1693	NC_002977	CGCGAG	2	12	3304296	3304307	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	53802711

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.