MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methylococcus capsulatus str. Bath chromosome

Total Repeats: 2482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002977	CGCGG	2	10	115	124	0 %	0 %	60 %	40 %	53802710
2	NC_002977	GTTCC	2	10	478	487	0 %	40 %	20 %	40 %	53802710
3	NC_002977	GGCGC	2	10	592	601	0 %	0 %	60 %	40 %	53802710
4	NC_002977	CCGGG	2	10	1250	1259	0 %	0 %	60 %	40 %	53802710
5	NC_002977	ACCGT	2	10	1315	1324	20 %	20 %	20 %	40 %	53802710
6	NC_002977	GGCAA	2	10	2557	2566	40 %	0 %	40 %	20 %	53802708
7	NC_002977	CGACC	2	10	4459	4468	20 %	0 %	20 %	60 %	53802706
8	NC_002977	CGGCG	2	10	9476	9485	0 %	0 %	60 %	40 %	53802691
9	NC_002977	ATGCT	2	10	11163	11172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_002977	ACGCC	2	10	11705	11714	20 %	0 %	20 %	60 %	53802689
11	NC_002977	AACGC	2	10	12862	12871	40 %	0 %	20 %	40 %	53802680
12	NC_002977	GCCGG	2	10	13115	13124	0 %	0 %	60 %	40 %	53802680
13	NC_002977	GCGCC	2	10	15069	15078	0 %	0 %	40 %	60 %	53802679
14	NC_002977	GGCAG	2	10	16219	16228	20 %	0 %	60 %	20 %	53802679
15	NC_002977	CGCGC	2	10	16495	16504	0 %	0 %	40 %	60 %	53802679
16	NC_002977	TCGGT	2	10	18541	18550	0 %	40 %	40 %	20 %	53802677
17	NC_002977	GGTGG	2	10	18989	18998	0 %	20 %	80 %	0 %	53802676
18	NC_002977	GGGCC	2	10	20432	20441	0 %	0 %	60 %	40 %	53802674
19	NC_002977	CAGCG	2	10	20523	20532	20 %	0 %	40 %	40 %	53802674
20	NC_002977	CCGGC	2	10	21276	21285	0 %	0 %	40 %	60 %	53802666
21	NC_002977	GACTC	2	10	22334	22343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002977	CTGGG	2	10	22993	23002	0 %	20 %	60 %	20 %	53802665
23	NC_002977	CCGCG	2	10	23293	23302	0 %	0 %	40 %	60 %	53802664
24	NC_002977	CAGGG	2	10	23444	23453	20 %	0 %	60 %	20 %	53802664
25	NC_002977	GTCAT	2	10	23990	23999	20 %	40 %	20 %	20 %	53802664
26	NC_002977	CGGCG	2	10	24220	24229	0 %	0 %	60 %	40 %	53802663
27	NC_002977	GGGGC	2	10	25630	25639	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002977	TGCTC	2	10	27192	27201	0 %	40 %	20 %	40 %	53802662
29	NC_002977	CGGCG	2	10	28345	28354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002977	CCTGC	2	10	29261	29270	0 %	20 %	20 %	60 %	53802661
31	NC_002977	CAAAT	2	10	31740	31749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002977	TCCGC	2	10	33485	33494	0 %	20 %	20 %	60 %	53802798
33	NC_002977	TGCGC	2	10	36238	36247	0 %	20 %	40 %	40 %	53802794
34	NC_002977	TCGCA	2	10	36945	36954	20 %	20 %	20 %	40 %	53802794
35	NC_002977	CTGGC	2	10	39261	39270	0 %	20 %	40 %	40 %	53802793
36	NC_002977	GATCA	2	10	39955	39964	40 %	20 %	20 %	20 %	53802784
37	NC_002977	TGCCG	2	10	40014	40023	0 %	20 %	40 %	40 %	53802784
38	NC_002977	GGGCG	2	10	41087	41096	0 %	0 %	80 %	20 %	53802783
39	NC_002977	GCCGC	2	10	41332	41341	0 %	0 %	40 %	60 %	53802783
40	NC_002977	GCCGG	2	10	43042	43051	0 %	0 %	60 %	40 %	53802781
41	NC_002977	GTGCG	2	10	43385	43394	0 %	20 %	60 %	20 %	53802781
42	NC_002977	GCATC	2	10	44303	44312	20 %	20 %	20 %	40 %	53802779
43	NC_002977	TCGCT	2	10	44357	44366	0 %	40 %	20 %	40 %	53802779
44	NC_002977	GCGAT	2	10	44814	44823	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_002977	CGCGG	2	10	45657	45666	0 %	0 %	60 %	40 %	53802777
46	NC_002977	GCCCG	2	10	46789	46798	0 %	0 %	40 %	60 %	53802766
47	NC_002977	GCCGG	2	10	46936	46945	0 %	0 %	60 %	40 %	53802766
48	NC_002977	CGTGG	2	10	48424	48433	0 %	20 %	60 %	20 %	53802764
49	NC_002977	GCCGG	2	10	49114	49123	0 %	0 %	60 %	40 %	53802764
50	NC_002977	CCACG	2	10	51820	51829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_002977	CGCGG	2	10	53449	53458	0 %	0 %	60 %	40 %	53802761
52	NC_002977	GCTGG	2	10	55452	55461	0 %	20 %	60 %	20 %	53802750
53	NC_002977	GGCGT	2	10	56439	56448	0 %	20 %	60 %	20 %	53802750
54	NC_002977	GCGAA	2	10	56650	56659	40 %	0 %	40 %	20 %	53802750
55	NC_002977	GCTGG	2	10	56912	56921	0 %	20 %	60 %	20 %	53802750
56	NC_002977	CGCTG	2	10	57916	57925	0 %	20 %	40 %	40 %	53802749
57	NC_002977	AGATC	2	10	58477	58486	40 %	20 %	20 %	20 %	53802749
58	NC_002977	CCGGC	2	10	60742	60751	0 %	0 %	40 %	60 %	53802746
59	NC_002977	TTCGT	2	10	61767	61776	0 %	60 %	20 %	20 %	53802744
60	NC_002977	GCCGG	2	10	61949	61958	0 %	0 %	60 %	40 %	53802744
61	NC_002977	GCGGG	2	10	62692	62701	0 %	0 %	80 %	20 %	53802744
62	NC_002977	CCAGC	2	10	63909	63918	20 %	0 %	20 %	60 %	53802735
63	NC_002977	AGTTC	2	10	64466	64475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002977	GGAGC	2	10	64812	64821	20 %	0 %	60 %	20 %	53802734
65	NC_002977	CTTCC	2	10	66616	66625	0 %	40 %	0 %	60 %	53802733
66	NC_002977	GGTCG	2	10	69060	69069	0 %	20 %	60 %	20 %	53802730
67	NC_002977	GGCAT	2	10	69661	69670	20 %	20 %	40 %	20 %	53802730
68	NC_002977	GCGGG	2	10	72401	72410	0 %	0 %	80 %	20 %	53802719
69	NC_002977	TGCCC	2	10	73095	73104	0 %	20 %	20 %	60 %	53802719
70	NC_002977	CAGAG	2	10	73292	73301	40 %	0 %	40 %	20 %	53802719
71	NC_002977	GAAAC	2	10	73888	73897	60 %	0 %	20 %	20 %	53802718
72	NC_002977	CTTCG	2	10	74926	74935	0 %	40 %	20 %	40 %	53802717
73	NC_002977	TAAGT	2	10	76873	76882	40 %	40 %	20 %	0 %	53802715
74	NC_002977	CGTCT	2	10	77952	77961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_002977	CAAAA	2	10	78708	78717	80 %	0 %	0 %	20 %	53802713
76	NC_002977	TTGCC	2	10	79373	79382	0 %	40 %	20 %	40 %	53802713
77	NC_002977	GGAAG	2	10	80119	80128	40 %	0 %	60 %	0 %	53802712
78	NC_002977	CGGCG	2	10	80703	80712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_002977	TCGTT	2	10	82025	82034	0 %	60 %	20 %	20 %	53802703
80	NC_002977	GCCCA	2	10	82362	82371	20 %	0 %	20 %	60 %	53802703
81	NC_002977	GCCGG	2	10	82421	82430	0 %	0 %	60 %	40 %	53802703
82	NC_002977	GCGGG	2	10	82732	82741	0 %	0 %	80 %	20 %	53802703
83	NC_002977	GGAAA	2	10	84962	84971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002977	GGGGC	2	10	84998	85007	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
85	NC_002977	GCCGC	2	10	85913	85922	0 %	0 %	40 %	60 %	53802700
86	NC_002977	ACCGC	2	10	87319	87328	20 %	0 %	20 %	60 %	53802699
87	NC_002977	CGGCG	2	10	89951	89960	0 %	0 %	60 %	40 %	53802696
88	NC_002977	GTTCG	2	10	90102	90111	0 %	40 %	40 %	20 %	53802696
89	NC_002977	CCGGT	2	10	90738	90747	0 %	20 %	40 %	40 %	53802688
90	NC_002977	GCCGT	2	10	91924	91933	0 %	20 %	40 %	40 %	53802688
91	NC_002977	GACGT	2	10	92521	92530	20 %	20 %	40 %	20 %	53802688
92	NC_002977	TGGCC	2	10	92906	92915	0 %	20 %	40 %	40 %	53802688
93	NC_002977	GGGCA	2	10	95355	95364	20 %	0 %	60 %	20 %	53802685
94	NC_002977	CATGC	2	10	99647	99656	20 %	20 %	20 %	40 %	53802673
95	NC_002977	GGGAC	2	10	100497	100506	20 %	0 %	60 %	20 %	53802673
96	NC_002977	TGGCC	2	10	103453	103462	0 %	20 %	40 %	40 %	53802671
97	NC_002977	GCCGC	2	10	105813	105822	0 %	0 %	40 %	60 %	53802670
98	NC_002977	GTTCC	2	10	107788	107797	0 %	40 %	20 %	40 %	53802668
99	NC_002977	CGGCG	2	10	109175	109184	0 %	0 %	60 %	40 %	53802659
100	NC_002977	CGGTG	2	10	110012	110021	0 %	20 %	60 %	20 %	53802658
101	NC_002977	CGGCG	2	10	110675	110684	0 %	0 %	60 %	40 %	53802658
102	NC_002977	CCCCG	2	10	112446	112455	0 %	0 %	20 %	80 %	53802656
103	NC_002977	AAACC	2	10	113189	113198	60 %	0 %	0 %	40 %	53802656
104	NC_002977	CACCC	2	10	114107	114116	20 %	0 %	0 %	80 %	53802655
105	NC_002977	GTCCT	2	10	115218	115227	0 %	40 %	20 %	40 %	53802650
106	NC_002977	CTGAA	2	10	116181	116190	40 %	20 %	20 %	20 %	53802650
107	NC_002977	CCGGG	2	10	116953	116962	0 %	0 %	60 %	40 %	53802648
108	NC_002977	CGAGC	2	10	117892	117901	20 %	0 %	40 %	40 %	53802647
109	NC_002977	CCGGC	2	10	118177	118186	0 %	0 %	40 %	60 %	53802647
110	NC_002977	GATTC	2	10	119190	119199	20 %	40 %	20 %	20 %	53802645
111	NC_002977	TCCGG	2	10	121812	121821	0 %	20 %	40 %	40 %	53802626
112	NC_002977	CCCTG	2	10	122855	122864	0 %	20 %	20 %	60 %	53802624
113	NC_002977	AGCGC	2	10	123598	123607	20 %	0 %	40 %	40 %	53802623
114	NC_002977	GGTCC	2	10	124836	124845	0 %	20 %	40 %	40 %	53802622
115	NC_002977	GGGGC	2	10	126301	126310	0 %	0 %	80 %	20 %	53802621
116	NC_002977	CGGCG	2	10	127180	127189	0 %	0 %	60 %	40 %	53802620
117	NC_002977	GTCCC	2	10	127730	127739	0 %	20 %	20 %	60 %	53802620
118	NC_002977	GCGAT	2	10	132400	132409	20 %	20 %	40 %	20 %	53802605
119	NC_002977	CAGGA	2	10	133035	133044	40 %	0 %	40 %	20 %	53802605
120	NC_002977	CTGTT	2	10	135683	135692	0 %	60 %	20 %	20 %	53802593
121	NC_002977	GGCCG	2	10	135802	135811	0 %	0 %	60 %	40 %	53802593
122	NC_002977	GCGCA	2	10	136329	136338	20 %	0 %	40 %	40 %	53802593
123	NC_002977	CAGGC	2	10	138779	138788	20 %	0 %	40 %	40 %	53802591
124	NC_002977	TGGCG	2	10	142180	142189	0 %	20 %	60 %	20 %	53802580
125	NC_002977	TCGGC	2	10	144568	144577	0 %	20 %	40 %	40 %	53802578
126	NC_002977	CTCGG	2	10	147471	147480	0 %	20 %	40 %	40 %	53802575
127	NC_002977	GCTGA	2	10	147519	147528	20 %	20 %	40 %	20 %	53802575
128	NC_002977	AGCAC	2	10	148081	148090	40 %	0 %	20 %	40 %	53802575
129	NC_002977	TCCCT	2	10	148513	148522	0 %	40 %	0 %	60 %	53802574
130	NC_002977	CTCGC	2	10	148558	148567	0 %	20 %	20 %	60 %	53802574
131	NC_002977	GCCCG	2	10	148808	148817	0 %	0 %	40 %	60 %	53802574
132	NC_002977	GCCGA	2	10	148987	148996	20 %	0 %	40 %	40 %	53802574
133	NC_002977	CGGCG	2	10	149733	149742	0 %	0 %	60 %	40 %	53802574
134	NC_002977	TTTCC	2	10	150532	150541	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_002977	TGATC	2	10	152075	152084	20 %	40 %	20 %	20 %	53802566
136	NC_002977	CCGAT	2	10	152866	152875	20 %	20 %	20 %	40 %	53802566
137	NC_002977	TGGCT	2	10	152898	152907	0 %	40 %	40 %	20 %	53802566
138	NC_002977	GGCAA	2	10	152925	152934	40 %	0 %	40 %	20 %	53802566
139	NC_002977	ACCGC	2	10	153704	153713	20 %	0 %	20 %	60 %	53802565
140	NC_002977	AGGCG	2	10	157180	157189	20 %	0 %	60 %	20 %	53802562
141	NC_002977	GGCCG	2	10	159694	159703	0 %	0 %	60 %	40 %	53802560
142	NC_002977	TCGTC	2	10	159757	159766	0 %	40 %	20 %	40 %	53802560
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161	NC_002977	TCGTT	2	10	184238	184247	0 %	60 %	20 %	20 %	53802513
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179	NC_002977	CCGAG	2	10	204796	204805	20 %	0 %	40 %	40 %	53802637
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201	NC_002977	GCGGG	2	10	221934	221943	0 %	0 %	80 %	20 %	53802587
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242	NC_002977	CCCGC	2	10	277796	277805	0 %	0 %	20 %	80 %	53802430
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244	NC_002977	GAGTG	2	10	278900	278909	20 %	20 %	60 %	0 %	53802430
245	NC_002977	ATGCC	2	10	279133	279142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
246	NC_002977	CCCGC	2	10	279737	279746	0 %	0 %	20 %	80 %	53802429
247	NC_002977	CCGTT	2	10	279891	279900	0 %	40 %	20 %	40 %	53802429
248	NC_002977	CCGGG	2	10	280600	280609	0 %	0 %	60 %	40 %	53802429
249	NC_002977	CGGCG	2	10	281587	281596	0 %	0 %	60 %	40 %	53802427
250	NC_002977	CCGAT	2	10	282192	282201	20 %	20 %	20 %	40 %	53802427
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253	NC_002977	AGTCC	2	10	288785	288794	20 %	20 %	20 %	40 %	53802414
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256	NC_002977	GGCCG	2	10	292316	292325	0 %	0 %	60 %	40 %	53802411
257	NC_002977	ACGCT	2	10	293862	293871	20 %	20 %	20 %	40 %	53802410
258	NC_002977	GGCTG	2	10	295130	295139	0 %	20 %	60 %	20 %	53802410
259	NC_002977	TGAGC	2	10	295285	295294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_002977	GCGCC	2	10	296652	296661	0 %	0 %	40 %	60 %	53802401
261	NC_002977	TTCGG	2	10	298162	298171	0 %	40 %	40 %	20 %	53802400
262	NC_002977	TGACT	2	10	303246	303255	20 %	40 %	20 %	20 %	53802396
263	NC_002977	CGACG	2	10	304962	304971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_002977	CGGAA	2	10	305295	305304	40 %	0 %	40 %	20 %	53802386
265	NC_002977	CGTTT	2	10	305911	305920	0 %	60 %	20 %	20 %	53802386
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267	NC_002977	GATCG	2	10	307376	307385	20 %	20 %	40 %	20 %	53802383
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269	NC_002977	CCTGG	2	10	309213	309222	0 %	20 %	40 %	40 %	53802381
270	NC_002977	GAAGC	2	10	310117	310126	40 %	0 %	40 %	20 %	53802380
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402	NC_002977	GCCAG	2	10	496001	496010	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
403	NC_002977	GCCAG	2	10	496205	496214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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405	NC_002977	AGCCG	2	10	498303	498312	20 %	0 %	40 %	40 %	53802294
406	NC_002977	CGCGG	3	15	498823	498837	0 %	0 %	60 %	40 %	53802293
407	NC_002977	GGCGG	2	10	499271	499280	0 %	0 %	80 %	20 %	53802293
408	NC_002977	TTTCA	2	10	500156	500165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
409	NC_002977	CGTTT	2	10	500265	500274	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
410	NC_002977	TCCGC	2	10	501430	501439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
411	NC_002977	CAAAG	2	10	503628	503637	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
412	NC_002977	CCAGG	2	10	503713	503722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
413	NC_002977	GCCGT	2	10	505656	505665	0 %	20 %	40 %	40 %	53805162
414	NC_002977	GCGCG	2	10	505946	505955	0 %	0 %	60 %	40 %	53805161
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420	NC_002977	TCTGC	2	10	518058	518067	0 %	40 %	20 %	40 %	53805133
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438	NC_002977	CCGCG	2	10	536204	536213	0 %	0 %	40 %	60 %	53805241
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447	NC_002977	AGGGG	2	10	542654	542663	20 %	0 %	80 %	0 %	53805233
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451	NC_002977	GCAGG	2	10	557113	557122	20 %	0 %	60 %	20 %	53805217
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454	NC_002977	ACCGA	2	10	562757	562766	40 %	0 %	20 %	40 %	53805213
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459	NC_002977	CGTGC	2	10	570176	570185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_002977	TGGTC	2	10	609411	609420	0 %	40 %	40 %	20 %	53805173
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499	NC_002977	GGGCA	2	10	617277	617286	20 %	0 %	60 %	20 %	53805120
500	NC_002977	CACGG	2	10	617753	617762	20 %	0 %	40 %	40 %	53805120

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