MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylococcus capsulatus str. Bath chromosome

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002977	ATGCT	2	10	11163	11172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002977	GACTC	2	10	22334	22343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_002977	GGGGC	2	10	25630	25639	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002977	CGGCG	2	10	28345	28354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_002977	CAAAT	2	10	31740	31749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_002977	GCGAT	2	10	44814	44823	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_002977	CCACG	2	10	51820	51829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_002977	AGTTC	2	10	64466	64475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002977	CGTCT	2	10	77952	77961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002977	CGGCG	2	10	80703	80712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_002977	GGAAA	2	10	84962	84971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002977	GGGGC	2	10	84998	85007	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002977	TTTCC	2	10	150532	150541	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_002977	CTTTC	2	10	164386	164395	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002977	CTGGG	2	10	185572	185581	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002977	CAAAC	2	10	191702	191711	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_002977	GTGTG	2	10	192985	192994	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002977	GGTTG	2	10	201041	201050	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002977	CGTGG	2	10	203086	203095	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002977	CGCCA	2	10	203105	203114	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_002977	CGGTT	2	10	219425	219434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002977	GGAAG	2	10	223644	223653	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002977	TCGCC	2	10	231075	231084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_002977	TGGAA	2	10	240581	240590	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002977	GGGAA	2	10	248660	248669	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002977	ATGCC	2	10	279133	279142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_002977	TGAGC	2	10	295285	295294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002977	CGACG	2	10	304962	304971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_002977	CAATA	2	10	333074	333083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002977	TTGCC	2	10	349445	349454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_002977	GTGTC	2	10	354467	354476	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002977	GTTCG	2	10	364034	364043	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002977	GATCA	2	10	369498	369507	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002977	TTTTC	2	10	397835	397844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002977	CGTGG	2	10	407425	407434	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_002977	GTACC	2	10	419992	420001	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002977	AGCGT	2	10	450250	450259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002977	AAGCG	2	10	454794	454803	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002977	CGAAG	2	10	458112	458121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002977	GCGCC	2	10	461955	461964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_002977	GGTCT	2	10	477199	477208	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002977	CCCGG	2	10	479079	479088	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_002977	GCCAG	2	10	496001	496010	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_002977	GCCAG	2	10	496205	496214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_002977	TTTCA	2	10	500156	500165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002977	CGTTT	2	10	500265	500274	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002977	TCCGC	2	10	501430	501439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_002977	CAAAG	2	10	503628	503637	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002977	CCAGG	2	10	503713	503722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002977	CCGGC	2	10	508830	508839	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_002977	GCATG	2	10	511551	511560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_002977	GTGCC	2	10	515560	515569	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_002977	CCGGG	2	10	518597	518606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002977	TTTCC	2	10	545740	545749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_002977	TCCGC	2	10	548874	548883	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_002977	GATCT	2	10	564711	564720	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002977	CGTGC	2	10	570176	570185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_002977	TTTCT	2	10	588105	588114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002977	CCGGC	2	10	596908	596917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_002977	CGTTC	2	10	604512	604521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_002977	CGCCC	2	10	609126	609135	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
62	NC_002977	TCAGA	2	10	610335	610344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002977	CAGGC	2	10	613560	613569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_002977	TCGGG	2	10	614057	614066	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_002977	GCCGC	2	10	627059	627068	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_002977	GAAGG	2	10	642850	642859	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002977	AATAC	2	10	664180	664189	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002977	GCAAG	2	10	667579	667588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_002977	AGCGA	2	10	675140	675149	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002977	TCGTC	2	10	675818	675827	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_002977	GGCGA	2	10	678925	678934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002977	TAATT	2	10	680514	680523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002977	TTTTC	2	10	682660	682669	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002977	TACGC	2	10	684090	684099	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_002977	TTGAA	2	10	687881	687890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002977	GGCTG	2	10	700470	700479	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002977	GAACA	2	10	731350	731359	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_002977	TTCGG	2	10	743506	743515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002977	GCCAC	2	10	743582	743591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_002977	CTCTT	2	10	757961	757970	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002977	GATCG	2	10	761238	761247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_002977	CGGAA	2	10	765432	765441	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_002977	GCCGG	2	10	786505	786514	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_002977	GGGTG	2	10	788590	788599	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002977	TCGTG	2	10	789208	789217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_002977	GGCGA	2	10	790358	790367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002977	ATCCC	2	10	793210	793219	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_002977	GGAGC	2	10	816668	816677	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002977	CCGGT	2	10	833373	833382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_002977	GGGCG	2	10	833577	833586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002977	TTACT	2	10	835270	835279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002977	CGTCG	2	10	841249	841258	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_002977	TGAGT	2	10	856595	856604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002977	CGCTC	2	10	867618	867627	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_002977	GTTGT	2	10	868931	868940	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002977	GGGGT	2	10	930283	930292	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002977	TTCTT	2	10	930483	930492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002977	CTAGA	2	10	932269	932278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002977	GATCG	2	10	934382	934391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002977	CTTGC	2	10	934852	934861	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002977	CGGAG	2	10	935681	935690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002977	CGATT	2	10	936370	936379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002977	CGCAG	2	10	941389	941398	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_002977	TTCTT	2	10	942006	942015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002977	AGGCA	2	10	953762	953771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_002977	CGGGG	2	10	953884	953893	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_002977	GGCGG	2	10	958761	958770	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002977	CAGGG	2	10	972207	972216	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002977	TTCGG	2	10	981656	981665	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002977	CCGGA	2	10	982338	982347	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_002977	GGGCG	2	10	989753	989762	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002977	CCGGA	2	10	1027136	1027145	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_002977	GGGCG	2	10	1027904	1027913	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002977	CGGCG	2	10	1033578	1033587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_002977	AGGGC	2	10	1046998	1047007	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_002977	GAGGG	2	10	1047052	1047061	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002977	GGCCT	2	10	1047929	1047938	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_002977	GGGCG	2	10	1061777	1061786	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
119	NC_002977	GTTTT	2	10	1062976	1062985	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002977	GGCGG	2	10	1078583	1078592	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_002977	GTATG	2	10	1081768	1081777	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002977	CAAAC	2	10	1114685	1114694	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_002977	TCAGG	2	10	1114695	1114704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002977	GGGTG	2	10	1133983	1133992	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002977	GCCCG	2	10	1134099	1134108	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_002977	GCACT	2	10	1150445	1150454	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_002977	CTGGC	2	10	1164299	1164308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_002977	GATGA	2	10	1171413	1171422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002977	CGCGG	2	10	1180624	1180633	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_002977	ATATT	2	10	1205516	1205525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002977	GGCCG	2	10	1235920	1235929	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_002977	GGTGT	2	10	1238995	1239004	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002977	GTGAT	2	10	1239106	1239115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002977	TTTCC	2	10	1279997	1280006	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_002977	ATGTA	2	10	1280525	1280534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002977	GTTCA	2	10	1285940	1285949	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002977	TCCTT	2	10	1334513	1334522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_002977	CCAGC	2	10	1337927	1337936	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_002977	ATTCC	2	10	1340741	1340750	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_002977	AGCCG	2	10	1341176	1341185	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002977	CGGCG	2	10	1358441	1358450	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_002977	CGGGT	2	10	1362227	1362236	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_002977	AAAGT	2	10	1373362	1373371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002977	ATGGC	2	10	1389460	1389469	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_002977	GTGCA	2	10	1424654	1424663	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_002977	GGGAC	2	10	1429114	1429123	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_002977	CCAGC	2	10	2926131	2926140	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
285	NC_002977	AAAAG	2	10	2929556	2929565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_002977	CGGCG	2	10	2948128	2948137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
287	NC_002977	AAAGA	2	10	2948275	2948284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_002977	CGGGA	2	10	2959340	2959349	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_002977	TTCAT	2	10	2969523	2969532	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_002977	AGCCG	2	10	2974520	2974529	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_002977	CCCCT	2	10	2974861	2974870	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
292	NC_002977	ATTCG	2	10	2983939	2983948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_002977	CCTCG	2	10	3009611	3009620	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
294	NC_002977	GGAAC	2	10	3017262	3017271	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_002977	CCGCG	2	10	3018048	3018057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
296	NC_002977	ACCGT	2	10	3025147	3025156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_002977	CACGC	2	10	3054820	3054829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
298	NC_002977	GGGAA	2	10	3060644	3060653	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
299	NC_002977	TGATA	2	10	3071290	3071299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
300	NC_002977	CCGCG	2	10	3090796	3090805	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
301	NC_002977	CTTGA	2	10	3142039	3142048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
302	NC_002977	CGATG	2	10	3142135	3142144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
303	NC_002977	AGCCC	2	10	3158311	3158320	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
304	NC_002977	CGACG	2	10	3169003	3169012	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
305	NC_002977	GGACG	2	10	3180597	3180606	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
306	NC_002977	ACTGG	2	10	3199080	3199089	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
307	NC_002977	GCGCG	2	10	3226054	3226063	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
308	NC_002977	CCCGC	2	10	3229377	3229386	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
309	NC_002977	CCCGC	2	10	3236059	3236068	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
310	NC_002977	GTTCA	2	10	3251225	3251234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
311	NC_002977	GGACA	2	10	3285452	3285461	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
312	NC_002977	TCTAA	2	10	3293227	3293236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.