MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002976	GTATTA	2	12	5985	5996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57865945
2	NC_002976	TAGGAA	2	12	8472	8483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57865959
3	NC_002976	GGAAAA	2	12	10437	10448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57865961
4	NC_002976	AAGAGG	2	12	11553	11564	50 %	0 %	50 %	0 %	57865968
5	NC_002976	AGGATA	2	12	11878	11889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57865969
6	NC_002976	ACATCA	2	12	14524	14535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	57865971
7	NC_002976	ATTTAG	2	12	15686	15697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57865971
8	NC_002976	GTATTA	2	12	17049	17060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57865973
9	NC_002976	CAAGTA	2	12	19614	19625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57865976
10	NC_002976	AAATAA	2	12	21053	21064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57865987
11	NC_002976	TTTTGG	2	12	27735	27746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57866009
12	NC_002976	TCGTAG	2	12	29444	29455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57865964
13	NC_002976	ATGTAT	2	12	44003	44014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57865998
14	NC_002976	AGCACC	2	12	46372	46383	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	57866004
15	NC_002976	TTTTGG	2	12	53570	53581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57866018
16	NC_002976	CAAAAT	2	12	56841	56852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57866021
17	NC_002976	AGGTGT	2	12	58023	58034	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	57866022
18	NC_002976	AAGAGC	2	12	58731	58742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	57866023
19	NC_002976	ATTGAA	2	12	59330	59341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866023
20	NC_002976	AGGTGA	2	12	59491	59502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	57866023
21	NC_002976	AACGTA	2	12	59604	59615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57866023
22	NC_002976	ATTTAA	2	12	60785	60796	50 %	50 %	0 %	0 %	57866032
23	NC_002976	TCTTTG	2	12	63707	63718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	57866034
24	NC_002976	TTTTAG	2	12	65303	65314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57866038
25	NC_002976	TCCTAT	2	12	66027	66038	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57866038
26	NC_002976	AAGCAA	2	12	72763	72774	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57866052
27	NC_002976	AATCAT	2	12	74814	74825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866055
28	NC_002976	TTACAA	2	12	79021	79032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866068
29	NC_002976	AGATAA	2	12	79176	79187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866068
30	NC_002976	TTAACG	2	12	82669	82680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866079
31	NC_002976	TTGGTA	2	12	99867	99878	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57866099
32	NC_002976	AATTGA	2	12	102513	102524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866110
33	NC_002976	TGAGAG	2	12	103796	103807	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	57866110
34	NC_002976	AAAATG	2	12	113680	113691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866012
35	NC_002976	TCAAGA	2	12	113706	113717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57866012
36	NC_002976	AGTTGA	2	12	113946	113957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57866012
37	NC_002976	TGAAAA	2	12	116194	116205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866015
38	NC_002976	AGATAA	2	12	116254	116265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866015
39	NC_002976	CTTACA	2	12	118059	118070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57866026
40	NC_002976	GTGTAC	2	12	119193	119204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866027
41	NC_002976	TGAAAT	2	12	123767	123778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866039
42	NC_002976	TTATGG	2	12	127164	127175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57866043
43	NC_002976	GATTTA	2	12	130579	130590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57866046
44	NC_002976	TTGATG	2	12	131314	131325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57866056
45	NC_002976	AACGTA	2	12	132304	132315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57866056
46	NC_002976	GTGCAT	2	12	132381	132392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866056
47	NC_002976	AGTTTT	2	12	134737	134748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57866057
48	NC_002976	ACTTAA	2	12	134982	134993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866057
49	NC_002976	TCCATA	2	12	135046	135057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57866057
50	NC_002976	TACAAT	2	12	135920	135931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866058
51	NC_002976	AAAGAA	2	12	136956	136967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57866058
52	NC_002976	TGTTGA	2	12	138459	138470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57866062
53	NC_002976	AAATGG	2	12	140746	140757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57866073
54	NC_002976	CAGGTA	2	12	141291	141302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57866073
55	NC_002976	AGTGAA	2	12	143869	143880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57866074
56	NC_002976	AGGTAA	2	12	145095	145106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57866075
57	NC_002976	TAGATA	2	12	146917	146928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866078
58	NC_002976	GGTAAA	2	12	147665	147676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57866087
59	NC_002976	GGTATC	2	12	148850	148861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866087
60	NC_002976	TTTTAA	2	12	160902	160913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57866088
61	NC_002976	AATCAT	2	12	161333	161344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866088
62	NC_002976	CTGGTA	2	12	162700	162711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866089
63	NC_002976	CGGTCA	2	12	169205	169216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	57866102
64	NC_002976	GATAAA	2	12	175052	175063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866105
65	NC_002976	ACAAAA	2	12	179335	179346	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	57866117
66	NC_002976	AAAGAA	2	12	180055	180066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57866118
67	NC_002976	AGAATT	2	12	180277	180288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866118
68	NC_002976	TGCAGG	2	12	181809	181820	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	57866121
69	NC_002976	CTGAAG	2	12	183290	183301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57866130
70	NC_002976	TATGCT	2	12	191021	191032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57866135
71	NC_002976	CAGCTA	2	12	192961	192972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57866135
72	NC_002976	TTAATG	2	12	193780	193791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57866136
73	NC_002976	AGTTGA	2	12	195254	195265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57866147
74	NC_002976	AACGTG	2	12	196030	196041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57866147
75	NC_002976	TTCGAA	2	12	196551	196562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866147
76	NC_002976	GATAAA	2	12	198917	198928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866149
77	NC_002976	CATAAT	2	12	206147	206158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866164
78	NC_002976	AAAGCA	2	12	206552	206563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57866164
79	NC_002976	TTTGAA	2	12	208713	208724	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57866165
80	NC_002976	AATTTT	2	12	210475	210486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57866167
81	NC_002976	CAGCAT	2	12	210576	210587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57866167
82	NC_002976	GTAATC	2	12	213144	213155	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866179
83	NC_002976	TCAGAT	2	12	218807	218818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866125
84	NC_002976	GATTCA	2	12	218897	218908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866125
85	NC_002976	GACTCA	2	12	218915	218926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57866125
86	NC_002976	GATTCA	2	12	218933	218944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866125
87	NC_002976	TGCATC	2	12	221512	221523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	57866127
88	NC_002976	TCACGT	2	12	224896	224907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	57866139
89	NC_002976	AGAAGC	2	12	226087	226098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	57866141
90	NC_002976	TTCAGG	2	12	227499	227510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866143
91	NC_002976	TTTTGA	2	12	227934	227945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57866144
92	NC_002976	TGTTTC	2	12	233119	233130	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	57866157
93	NC_002976	TCATAG	2	12	233235	233246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866157
94	NC_002976	GAAAAA	2	12	233375	233386	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57866157
95	NC_002976	AAAATA	2	12	238298	238309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57866173
96	NC_002976	AGTAGC	2	12	245429	245440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57866187
97	NC_002976	TTTATA	2	12	247472	247483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57866189
98	NC_002976	TTGAAA	2	12	247916	247927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866189
99	NC_002976	TGAAAT	2	12	248415	248426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57866190
100	NC_002976	CATTTG	2	12	248465	248476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57866190
101	NC_002976	ATGTTG	2	12	251485	251496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57866193
102	NC_002976	ATTAAA	2	12	253369	253380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57866201
103	NC_002976	ACGTTG	2	12	254480	254491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57866201
104	NC_002976	GACCAA	2	12	255654	255665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	57866202
105	NC_002976	ACTATA	2	12	256859	256870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866203
106	NC_002976	TTAAAC	2	12	257594	257605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57866205
107	NC_002976	TTATGA	2	12	259919	259930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57866207
108	NC_002976	TTTCAA	2	12	260212	260223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57866208
109	NC_002976	TTTCAT	2	12	260908	260919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57866209
110	NC_002976	ATTTCA	2	12	264838	264849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57866228
111	NC_002976	ATGCAC	2	12	270436	270447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	57866242
112	NC_002976	GCATTA	2	12	270747	270758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57866242
113	NC_002976	AACGTG	2	12	272411	272422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57866244
114	NC_002976	GTTGGG	2	12	272599	272610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57866245
115	NC_002976	GTTGGG	2	12	272657	272668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57866245
116	NC_002976	AAATCA	2	12	273636	273647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57866246
117	NC_002976	TTCATT	2	12	279430	279441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57866263
118	NC_002976	AATGAA	2	12	281117	281128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57866264
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