MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002973	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002973	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002973	ATTTAT	2	12	87398	87409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002973	CAGGTT	2	12	150684	150695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_002973	ACACTT	2	12	178575	178586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002973	AATAAA	2	12	204904	204915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002973	GAAAAC	2	12	231819	231830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002973	ATTCAA	2	12	242713	242724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002973	AAGGAA	2	12	244284	244295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002973	TAGGCG	2	12	245937	245948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002973	ATTCAA	2	12	248732	248743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002973	AAGGAA	2	12	250303	250314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002973	TAGGCG	2	12	251956	251967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_002973	AGTCAA	2	12	253770	253781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_002973	TTATAT	2	12	268554	268565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002973	TTTATA	2	12	297186	297197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002973	AACTTT	2	12	304269	304280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_002973	TAAAAA	2	12	309638	309649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002973	AATACA	2	12	314087	314098	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002973	CATAGA	2	12	362428	362439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002973	AAATTT	2	12	386004	386015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002973	TAGTTT	2	12	405935	405946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002973	TTGTTT	2	12	421441	421452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002973	TAATTA	2	12	467272	467283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002973	AAGTCA	2	12	475855	475866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_002973	AAAAGC	2	12	487813	487824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002973	TTAAAT	2	12	518722	518733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002973	CTATAA	2	12	520492	520503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_002973	AAATGT	2	12	569316	569327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002973	AGATTT	2	12	577447	577458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002973	AAATAA	2	12	617750	617761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002973	ATCATT	2	12	646105	646116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_002973	TGTAAA	2	12	668042	668053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002973	ATCATT	2	12	687862	687873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_002973	GAATAA	2	12	717587	717598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002973	TATAGG	2	12	740497	740508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002973	AATTAG	2	12	767944	767955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002973	TGTTGA	2	12	779001	779012	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002973	TTACTT	2	12	853947	853958	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002973	AAATAG	2	12	890350	890361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002973	GTAATC	2	12	897153	897164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002973	TTACAA	2	12	897171	897182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_002973	ATGAAA	2	12	905775	905786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002973	GAAGCG	2	12	972791	972802	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002973	TGTAGC	2	12	973096	973107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002973	TTGACT	2	12	1029709	1029720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002973	AGGAAG	2	12	1039900	1039911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002973	AACAAT	2	12	1078903	1078914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002973	CTTTTT	2	12	1095204	1095215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_002973	GTGCAT	2	12	1126899	1126910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_002973	TTAATT	2	12	1135682	1135693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002973	AAATAA	2	12	1138692	1138703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002973	TTTAGT	2	12	1142569	1142580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002973	CTTTTT	2	12	1180920	1180931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_002973	CTTTTT	2	12	1213723	1213734	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002973	GAAAAA	2	12	1243688	1243699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002973	TATTAA	2	12	1275375	1275386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002973	GTACAA	2	12	1388670	1388681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_002973	TAATCA	2	12	1422035	1422046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_002973	TACCAA	2	12	1439967	1439978	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002973	CTCTTC	2	12	1568813	1568824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002973	TCATTA	2	12	1605136	1605147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_002973	GAATAA	2	12	1621013	1621024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002973	GTAAAC	2	12	1622164	1622175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_002973	ACAAAA	2	12	1630788	1630799	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_002973	AAAATA	2	12	1635108	1635119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002973	TAAAAA	2	12	1636018	1636029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002973	AGTTTT	2	12	1637856	1637867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002973	TAAAAA	2	12	1662590	1662601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002973	AAATAA	2	12	1680027	1680038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002973	CTTATT	2	12	1722009	1722020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_002973	CGCCTA	2	12	1725519	1725530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002973	TTTCCT	2	12	1727171	1727182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002973	TTGAAT	2	12	1728743	1728754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002973	TTGCAA	2	12	1761583	1761594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_002973	TGTAAA	2	12	1762595	1762606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002973	CGCCTA	2	12	1830196	1830207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002973	TTTCCT	2	12	1831848	1831859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002973	TTGAAT	2	12	1833420	1833431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002973	GTTTTG	2	12	1841372	1841383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002973	GCATCG	2	12	1849480	1849491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002973	GCATCG	2	12	1849504	1849515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002973	TCGGCA	2	12	1849922	1849933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002973	GCATCG	2	12	1849955	1849966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002973	GCATCC	2	12	1850051	1850062	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002973	GCATCA	3	18	1850063	1850080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002973	TCAGCG	2	12	1850090	1850101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002973	TCGGCG	2	12	1850132	1850143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002973	TCAGCA	7	42	1850174	1850215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002973	TCAGCG	2	12	1850216	1850227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002973	TCGGCA	2	12	1850240	1850251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002973	GCATCA	2	12	1850273	1850284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002973	GCATCA	2	12	1850291	1850302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002973	GCGTCA	2	12	1850381	1850392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002973	GCATCA	2	12	1850399	1850410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_002973	GCATCA	4	24	1850423	1850446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002973	GCATCA	4	24	1850465	1850488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002973	GCATCC	2	12	1850531	1850542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002973	GCGTCG	2	12	1850549	1850560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002973	TCGGCA	2	12	1850618	1850629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002973	TCAGCA	4	24	1850630	1850653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002973	GCATCC	2	12	1850663	1850674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002973	GCATCA	2	12	1850675	1850686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002973	GCATCG	3	18	1850723	1850740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002973	GCATCA	3	18	1850777	1850794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_002973	GCATCC	2	12	1850801	1850812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002973	GCATCC	2	12	1850861	1850872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002973	GCATCA	2	12	1850897	1850908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002973	CAACTC	2	12	1851111	1851122	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002973	GCACTA	2	12	1851347	1851358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002973	AAAAGA	2	12	1924234	1924245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002973	CTCTAT	2	12	1943558	1943569	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002973	TCATTT	2	12	1944756	1944767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_002973	ATTTCT	2	12	1953049	1953060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_002973	CATTTT	2	12	1953089	1953100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_002973	GTTTTC	2	12	1971925	1971936	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_002973	CAAAAA	2	12	1989649	1989660	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_002973	GAAAAA	2	12	1993509	1993520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002973	AGAAAA	2	12	2000360	2000371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002973	TTCACT	2	12	2143684	2143695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002973	ATTCAA	2	12	2154413	2154424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_002973	TTTAAT	2	12	2190244	2190255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002973	AACAGA	2	12	2191452	2191463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_002973	TATATT	2	12	2217330	2217341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002973	AATTTT	2	12	2275295	2275306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002973	AAATTG	2	12	2281471	2281482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002973	CTCTGT	2	12	2288315	2288326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002973	TTATTT	2	12	2343332	2343343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002973	TAATAC	2	12	2372076	2372087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_002973	CGCCTA	2	12	2392871	2392882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002973	TTTCCT	2	12	2394774	2394785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002973	TTGAAT	2	12	2396346	2396357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002973	TTTGTT	2	12	2477512	2477523	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002973	CTTTTT	2	12	2547570	2547581	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_002973	ATCCCA	2	12	2567483	2567494	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002973	TTTTTA	2	12	2579310	2579321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002973	CGCCTA	2	12	2623298	2623309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002973	TTTCCT	2	12	2625201	2625212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002973	TTGAAT	2	12	2626773	2626784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002973	CCTCTT	2	12	2669243	2669254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002973	AGCTAG	2	12	2684238	2684249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_002973	TAAATC	2	12	2696278	2696289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_002973	TTTTTC	2	12	2753581	2753592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_002973	TATCAA	2	12	2843844	2843855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_002973	AAATGA	2	12	2843858	2843869	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002973	TAAAAA	2	12	2843928	2843939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002973	ATTTTA	2	12	2852711	2852722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.