MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906229
2	NC_002973	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906230
3	NC_002973	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906230
4	NC_002973	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906230
5	NC_002973	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906231
6	NC_002973	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906232
7	NC_002973	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906236
8	NC_002973	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906236
9	NC_002973	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46906241
10	NC_002973	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906243
11	NC_002973	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906243
12	NC_002973	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906246
13	NC_002973	CCAAAA	2	12	37140	37151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906258
14	NC_002973	AATTAT	2	12	37754	37765	50 %	50 %	0 %	0 %	46906259
15	NC_002973	TCACCA	2	12	38902	38913	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	46906261
16	NC_002973	CGATTA	2	12	44332	44343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906265
17	NC_002973	TTATGT	2	12	48821	48832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906268
18	NC_002973	AAAGAT	2	12	52473	52484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906271
19	NC_002973	TGAAAT	2	12	53310	53321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906272
20	NC_002973	TGGCGG	2	12	56443	56454	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46906276
21	NC_002973	TCAAAA	2	12	56563	56574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906276
22	NC_002973	AAAAAT	2	12	59010	59021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906281
23	NC_002973	GCAGAA	2	12	62935	62946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46906283
24	NC_002973	AGGTAA	2	12	63026	63037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906284
25	NC_002973	TGATTG	2	12	64414	64425	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46906285
26	NC_002973	TGATTT	2	12	69745	69756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906290
27	NC_002973	TTTTGC	2	12	70350	70361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906291
28	NC_002973	AAATAA	2	12	84072	84083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906305
29	NC_002973	TAAATT	2	12	87224	87235	50 %	50 %	0 %	0 %	46906309
30	NC_002973	CTTTTT	2	12	96571	96582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906322
31	NC_002973	ATCACT	2	12	99631	99642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906325
32	NC_002973	GATATT	2	12	99690	99701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906325
33	NC_002973	CAGATT	2	12	103207	103218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906325
34	NC_002973	AACTAT	2	12	105983	105994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46906326
35	NC_002973	AACCAG	2	12	111221	111232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46906331
36	NC_002973	TATTAG	2	12	115514	115525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906336
37	NC_002973	TAGCAG	2	12	115577	115588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906336
38	NC_002973	TTATTT	2	12	119039	119050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906340
39	NC_002973	ATTACA	2	12	123233	123244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46906345
40	NC_002973	TAAAAT	2	12	126957	126968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906348
41	NC_002973	CAAAAT	2	12	127098	127109	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906348
42	NC_002973	CAAGCG	2	12	128099	128110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906348
43	NC_002973	GTTTTA	2	12	133865	133876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906356
44	NC_002973	TGATTT	2	12	135881	135892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906360
45	NC_002973	AAGTAA	2	12	139852	139863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906363
46	NC_002973	CCGTTA	2	12	143359	143370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906370
47	NC_002973	CAACTG	2	12	153105	153116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906379
48	NC_002973	TCTGAA	2	12	156086	156097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906383
49	NC_002973	GTTGCA	2	12	161833	161844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906391
50	NC_002973	GATTGC	2	12	161895	161906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906391
51	NC_002973	AGGCGG	2	12	167543	167554	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46906395
52	NC_002973	CGTAAC	2	12	170364	170375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906396
53	NC_002973	AGTACC	2	12	170409	170420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906396
54	NC_002973	GTTTTC	2	12	171386	171397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906397
55	NC_002973	GTTGAT	2	12	173002	173013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46906399
56	NC_002973	GTAAAA	2	12	173365	173376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906399
57	NC_002973	TTTTAC	2	12	175409	175420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46906403
58	NC_002973	TTTTTA	2	12	176446	176457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906405
59	NC_002973	GCATTA	2	12	176676	176687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906405
60	NC_002973	AAAGTA	2	12	177658	177669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906406
61	NC_002973	TTGCAC	2	12	180552	180563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906408
62	NC_002973	AGAAGT	2	12	182700	182711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906409
63	NC_002973	CAATCC	2	12	184616	184627	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	46906411
64	NC_002973	AAAGAT	2	12	186627	186638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906413
65	NC_002973	TGAAGT	2	12	190872	190883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906414
66	NC_002973	CATTGA	2	12	199005	199016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906421
67	NC_002973	TGCAGC	2	12	199660	199671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46906422
68	NC_002973	TAAAAA	2	12	201898	201909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906424
69	NC_002973	AAAGCA	2	12	215110	215121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906436
70	NC_002973	TTCTTT	2	12	219809	219820	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906442
71	NC_002973	GAAAAA	2	12	221898	221909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906444
72	NC_002973	GAAAAA	2	12	223122	223133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906446
73	NC_002973	GCAAGT	2	12	228949	228960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906449
74	NC_002973	TGTCGG	2	12	232869	232880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46906452
75	NC_002973	AAAAAC	2	12	234354	234365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46906453
76	NC_002973	GCAGAA	2	12	235898	235909	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46906454
77	NC_002973	TAAAAT	2	12	239211	239222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906459
78	NC_002973	CCAGAA	2	12	240424	240435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85700164
79	NC_002973	TTTACC	2	12	254199	254210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906462
80	NC_002973	AGTAAA	2	12	261456	261467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906468
81	NC_002973	GTACGT	2	12	262262	262273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906470
82	NC_002973	AAGTCG	2	12	267530	267541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46906475
83	NC_002973	ACAGTA	2	12	268883	268894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906478
84	NC_002973	AAAACA	2	12	269258	269269	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46906479
85	NC_002973	GCATGG	2	12	269439	269450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46906479
86	NC_002973	CTGTAG	2	12	272383	272394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906484
87	NC_002973	GACAAT	2	12	273895	273906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906486
88	NC_002973	GTGAGC	2	12	274350	274361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46906486
89	NC_002973	ATTGAT	2	12	274544	274555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906486
90	NC_002973	TAAAAA	2	12	275614	275625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46906487
91	NC_002973	TGAATC	2	12	276399	276410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906488
92	NC_002973	GCTACT	2	12	278091	278102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906489
93	NC_002973	TTCTGA	2	12	281165	281176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	46906491
94	NC_002973	AAGAAA	2	12	284381	284392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46906495
95	NC_002973	TTCGTG	2	12	290137	290148	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46906496
96	NC_002973	TAACAA	2	12	293442	293453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46906499
97	NC_002973	TTTAAC	2	12	294515	294526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46906500
98	NC_002973	GTTGAG	2	12	296369	296380	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	46906501
99	NC_002973	ATTTTT	2	12	296642	296653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46906501
100	NC_002973	CCAAAT	2	12	299175	299186	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	46906502
101	NC_002973	AGAACT	2	12	301789	301800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906504
102	NC_002973	TACAAG	2	12	306033	306044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906508
103	NC_002973	CGAAAT	2	12	306087	306098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46906508
104	NC_002973	CATTAT	2	12	309817	309828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46906511
105	NC_002973	TCTTTT	2	12	310278	310289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46906511
106	NC_002973	ATCAAT	2	12	312685	312696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46906513
107	NC_002973	ATGAAA	2	12	313043	313054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906514
108	NC_002973	GCTTTT	2	12	314386	314397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906516
109	NC_002973	CTTTTA	2	12	314915	314926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46906516
110	NC_002973	TAGAAA	2	12	315861	315872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46906517
111	NC_002973	ACGTTG	2	12	317790	317801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46906519
112	NC_002973	GAAAAC	2	12	319697	319708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46906520
113	NC_002973	TTTTGA	2	12	325359	325370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906526
114	NC_002973	GAAGGG	2	12	330461	330472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46906530
115	NC_002973	AGAACC	2	12	333496	333507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46906533
116	NC_002973	GATTCA	2	12	334103	334114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906533
117	NC_002973	GCAATT	2	12	334133	334144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906533
118	NC_002973	TCTGTT	2	12	339042	339053	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906539
119	NC_002973	GAACCA	2	12	340937	340948	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46906540
120	NC_002973	TCCATT	2	12	343545	343556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906543
121	NC_002973	TTTCTG	2	12	344601	344612	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	46906545
122	NC_002973	CTGGTT	2	12	354509	354520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46906554
123	NC_002973	TAGTTG	2	12	358698	358709	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46906558
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125	NC_002973	GACTTA	2	12	365183	365194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46906565
126	NC_002973	TAGATT	2	12	371066	371077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46906567
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230	NC_002973	TGCAAC	2	12	672404	672415	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46906872
231	NC_002973	AAGATG	2	12	672691	672702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46906872
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464	NC_002973	GAAGCC	2	12	1361475	1361486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46907583
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