MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 2130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002973	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	46906226
3	NC_002973	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	46906226
4	NC_002973	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	46906227
5	NC_002973	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	46906230
6	NC_002973	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	46906232
7	NC_002973	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	46906233
8	NC_002973	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	46906235
9	NC_002973	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	46906236
10	NC_002973	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002973	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002973	ATGAA	2	10	19331	19340	60 %	20 %	20 %	0 %	46906239
13	NC_002973	GAATG	2	10	21073	21082	40 %	20 %	40 %	0 %	46906240
14	NC_002973	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	46906243
15	NC_002973	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	46906244
16	NC_002973	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	46906244
17	NC_002973	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	46906245
18	NC_002973	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	46906245
19	NC_002973	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002973	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	46906252
21	NC_002973	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	46906254
22	NC_002973	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	46906255
23	NC_002973	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	46906255
24	NC_002973	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002973	CCATA	2	10	35591	35600	40 %	20 %	0 %	40 %	46906256
26	NC_002973	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	46906257
27	NC_002973	AGATA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	46906257
28	NC_002973	AATTG	2	10	37004	37013	40 %	40 %	20 %	0 %	46906258
29	NC_002973	TAAAA	2	10	37256	37265	80 %	20 %	0 %	0 %	46906258
30	NC_002973	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002973	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002973	GAAAA	2	10	39247	39256	80 %	0 %	20 %	0 %	46906261
33	NC_002973	TGAAA	2	10	40402	40411	60 %	20 %	20 %	0 %	46906262
34	NC_002973	GAATG	2	10	42273	42282	40 %	20 %	40 %	0 %	46906264
35	NC_002973	AAATT	2	10	42400	42409	60 %	40 %	0 %	0 %	46906264
36	NC_002973	ATTTT	2	10	43006	43015	20 %	80 %	0 %	0 %	46906264
37	NC_002973	AAAAC	2	10	46633	46642	80 %	0 %	0 %	20 %	46906266
38	NC_002973	TTATT	2	10	48119	48128	20 %	80 %	0 %	0 %	46906268
39	NC_002973	GAAAA	2	10	49332	49341	80 %	0 %	20 %	0 %	46906268
40	NC_002973	ATAAA	2	10	50157	50166	80 %	20 %	0 %	0 %	46906269
41	NC_002973	ATTTT	2	10	51961	51970	20 %	80 %	0 %	0 %	46906271
42	NC_002973	GACAT	2	10	53174	53183	40 %	20 %	20 %	20 %	46906272
43	NC_002973	GACTT	2	10	53458	53467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002973	ATTTT	2	10	53544	53553	20 %	80 %	0 %	0 %	46906273
45	NC_002973	AAATG	2	10	54673	54682	60 %	20 %	20 %	0 %	46906274
46	NC_002973	ATGGT	2	10	55710	55719	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002973	GTAGA	2	10	55759	55768	40 %	20 %	40 %	0 %	46906275
48	NC_002973	TTACT	2	10	56741	56750	20 %	60 %	0 %	20 %	46906277
49	NC_002973	CAAAA	2	10	57248	57257	80 %	0 %	0 %	20 %	46906278
50	NC_002973	GAAAT	2	10	57398	57407	60 %	20 %	20 %	0 %	46906278
51	NC_002973	CTTAG	2	10	57497	57506	20 %	40 %	20 %	20 %	46906278
52	NC_002973	AAATA	2	10	57766	57775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002973	TAAAA	2	10	58748	58757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002973	TGCTA	2	10	58922	58931	20 %	40 %	20 %	20 %	46906281
55	NC_002973	TTTTA	2	10	59090	59099	20 %	80 %	0 %	0 %	46906281
56	NC_002973	AGTTA	2	10	60406	60415	40 %	40 %	20 %	0 %	46906282
57	NC_002973	TTATG	2	10	60955	60964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002973	AGTCT	2	10	61871	61880	20 %	40 %	20 %	20 %	46906283
59	NC_002973	TTTTA	2	10	64867	64876	20 %	80 %	0 %	0 %	46906286
60	NC_002973	AAACG	2	10	69236	69245	60 %	0 %	20 %	20 %	46906290
61	NC_002973	CAAAA	2	10	70736	70745	80 %	0 %	0 %	20 %	46906291
62	NC_002973	AACAA	2	10	72155	72164	80 %	0 %	0 %	20 %	46906293
63	NC_002973	GAGAG	2	10	77211	77220	40 %	0 %	60 %	0 %	46906295
64	NC_002973	GCAAA	2	10	78393	78402	60 %	0 %	20 %	20 %	46906298
65	NC_002973	CAATA	2	10	78458	78467	60 %	20 %	0 %	20 %	46906298
66	NC_002973	GCCTT	2	10	79261	79270	0 %	40 %	20 %	40 %	46906299
67	NC_002973	CAAAA	2	10	79638	79647	80 %	0 %	0 %	20 %	46906299
68	NC_002973	TAATT	2	10	81841	81850	40 %	60 %	0 %	0 %	46906303
69	NC_002973	AAATG	2	10	82258	82267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002973	GCCTT	2	10	83038	83047	0 %	40 %	20 %	40 %	46906304
71	NC_002973	CAAAA	2	10	83415	83424	80 %	0 %	0 %	20 %	46906304
72	NC_002973	AATTA	2	10	84357	84366	60 %	40 %	0 %	0 %	46906305
73	NC_002973	AATAG	2	10	84797	84806	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002973	ATAAA	2	10	85609	85618	80 %	20 %	0 %	0 %	46906306
75	NC_002973	GAAAT	2	10	85935	85944	60 %	20 %	20 %	0 %	46906307
76	NC_002973	ATAGC	2	10	85955	85964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002973	GCTTT	2	10	86733	86742	0 %	60 %	20 %	20 %	46906309
78	NC_002973	AGTAG	2	10	88078	88087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002973	AGTAA	2	10	88329	88338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002973	TTATA	2	10	88578	88587	40 %	60 %	0 %	0 %	46906312
81	NC_002973	TATTT	2	10	88673	88682	20 %	80 %	0 %	0 %	46906313
82	NC_002973	GCTTG	2	10	90654	90663	0 %	40 %	40 %	20 %	46906315
83	NC_002973	GCGCT	2	10	92708	92717	0 %	20 %	40 %	40 %	46906317
84	NC_002973	ATTTG	2	10	94684	94693	20 %	60 %	20 %	0 %	46906318
85	NC_002973	TAAAA	2	10	95928	95937	80 %	20 %	0 %	0 %	46906320
86	NC_002973	TTTGT	2	10	97033	97042	0 %	80 %	20 %	0 %	46906323
87	NC_002973	TTTCT	2	10	97771	97780	0 %	80 %	0 %	20 %	46906323
88	NC_002973	ATTTT	2	10	98020	98029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002973	CTAAA	2	10	100132	100141	60 %	20 %	0 %	20 %	46906325
90	NC_002973	GAAAA	2	10	101475	101484	80 %	0 %	20 %	0 %	46906325
91	NC_002973	TGAAA	2	10	101717	101726	60 %	20 %	20 %	0 %	46906325
92	NC_002973	AAATT	2	10	102061	102070	60 %	40 %	0 %	0 %	46906325
93	NC_002973	AGCGG	2	10	102645	102654	20 %	0 %	60 %	20 %	46906325
94	NC_002973	GGAAA	2	10	103824	103833	60 %	0 %	40 %	0 %	46906325
95	NC_002973	CGAAA	2	10	105140	105149	60 %	0 %	20 %	20 %	46906326
96	NC_002973	AAAAG	2	10	105453	105462	80 %	0 %	20 %	0 %	46906326
97	NC_002973	TGCAT	2	10	109113	109122	20 %	40 %	20 %	20 %	46906329
98	NC_002973	TTACT	2	10	109359	109368	20 %	60 %	0 %	20 %	46906329
99	NC_002973	GTTTT	2	10	110957	110966	0 %	80 %	20 %	0 %	46906331
100	NC_002973	TGGCT	2	10	111108	111117	0 %	40 %	40 %	20 %	46906331
101	NC_002973	AGCGG	2	10	112557	112566	20 %	0 %	60 %	20 %	46906332
102	NC_002973	ATATC	2	10	119968	119977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002973	AAAAG	2	10	122656	122665	80 %	0 %	20 %	0 %	46906345
104	NC_002973	ACGGT	2	10	124200	124209	20 %	20 %	40 %	20 %	46906346
105	NC_002973	GAAAT	2	10	125439	125448	60 %	20 %	20 %	0 %	46906347
106	NC_002973	GAATT	2	10	126080	126089	40 %	40 %	20 %	0 %	46906347
107	NC_002973	CTTTA	2	10	130284	130293	20 %	60 %	0 %	20 %	46906350
108	NC_002973	AGAGA	2	10	130794	130803	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002973	CTCGA	2	10	131635	131644	20 %	20 %	20 %	40 %	46906352
110	NC_002973	TTCCA	2	10	131969	131978	20 %	40 %	0 %	40 %	46906352
111	NC_002973	TTACT	2	10	132233	132242	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002973	TTTTA	2	10	133167	133176	20 %	80 %	0 %	0 %	46906354
113	NC_002973	AAAAG	2	10	133436	133445	80 %	0 %	20 %	0 %	46906355
114	NC_002973	AAAGT	2	10	134474	134483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002973	TTAGT	2	10	135596	135605	20 %	60 %	20 %	0 %	46906359
116	NC_002973	TGAAC	2	10	136278	136287	40 %	20 %	20 %	20 %	46906361
117	NC_002973	AGATG	2	10	136320	136329	40 %	20 %	40 %	0 %	46906361
118	NC_002973	TTTAT	2	10	138596	138605	20 %	80 %	0 %	0 %	46906362
119	NC_002973	AAGTG	2	10	140618	140627	40 %	20 %	40 %	0 %	46906365
120	NC_002973	AGTCT	2	10	140898	140907	20 %	40 %	20 %	20 %	46906365
121	NC_002973	TGTAA	2	10	141978	141987	40 %	40 %	20 %	0 %	46906367
122	NC_002973	AATTT	2	10	142360	142369	40 %	60 %	0 %	0 %	46906368
123	NC_002973	TTGTT	2	10	144726	144735	0 %	80 %	20 %	0 %	46906370
124	NC_002973	ATTTT	2	10	146528	146537	20 %	80 %	0 %	0 %	46906372
125	NC_002973	AAAAT	2	10	148030	148039	80 %	20 %	0 %	0 %	46906372
126	NC_002973	AACTT	2	10	149339	149348	40 %	40 %	0 %	20 %	46906375
127	NC_002973	ACAAA	2	10	149441	149450	80 %	0 %	0 %	20 %	46906375
128	NC_002973	ACTTG	2	10	150235	150244	20 %	40 %	20 %	20 %	46906375
129	NC_002973	CCACA	2	10	150576	150585	40 %	0 %	0 %	60 %	46906375
130	NC_002973	TTGGT	2	10	151031	151040	0 %	60 %	40 %	0 %	46906376
131	NC_002973	TGTTT	2	10	151374	151383	0 %	80 %	20 %	0 %	46906376
132	NC_002973	TATGA	2	10	154009	154018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002973	TAACG	2	10	155858	155867	40 %	20 %	20 %	20 %	46906382
134	NC_002973	AGTAG	2	10	156180	156189	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002973	ATAAA	2	10	157391	157400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002973	ATCCG	2	10	158523	158532	20 %	20 %	20 %	40 %	46906388
137	NC_002973	ACGGC	2	10	159144	159153	20 %	0 %	40 %	40 %	46906388
138	NC_002973	TTTAA	2	10	159216	159225	40 %	60 %	0 %	0 %	46906388
139	NC_002973	AATTT	2	10	159402	159411	40 %	60 %	0 %	0 %	46906388
140	NC_002973	GATAA	2	10	159569	159578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_002973	TTATT	2	10	335389	335398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_002973	GTTAT	2	10	336950	336959	20 %	60 %	20 %	0 %	46906537
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