MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 41620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906225
2	NC_002973	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
3	NC_002973	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
4	NC_002973	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
5	NC_002973	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
6	NC_002973	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906225
7	NC_002973	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46906225
8	NC_002973	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906225
9	NC_002973	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
10	NC_002973	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
11	NC_002973	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
12	NC_002973	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
13	NC_002973	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
14	NC_002973	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
15	NC_002973	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
16	NC_002973	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906225
17	NC_002973	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
18	NC_002973	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906225
19	NC_002973	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
20	NC_002973	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906225
21	NC_002973	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
22	NC_002973	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
23	NC_002973	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
24	NC_002973	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
25	NC_002973	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906225
26	NC_002973	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906225
27	NC_002973	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
28	NC_002973	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
29	NC_002973	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
30	NC_002973	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906226
31	NC_002973	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906226
32	NC_002973	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906226
33	NC_002973	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
34	NC_002973	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
35	NC_002973	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
36	NC_002973	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
37	NC_002973	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906226
38	NC_002973	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906226
39	NC_002973	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906226
40	NC_002973	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906226
41	NC_002973	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
42	NC_002973	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
43	NC_002973	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
44	NC_002973	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906227
45	NC_002973	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
46	NC_002973	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
47	NC_002973	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
48	NC_002973	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
49	NC_002973	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906227
50	NC_002973	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
51	NC_002973	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
52	NC_002973	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906227
53	NC_002973	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906227
54	NC_002973	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906227
55	NC_002973	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906227
56	NC_002973	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906227
57	NC_002973	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906227
58	NC_002973	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906227
59	NC_002973	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906227
60	NC_002973	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
61	NC_002973	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
62	NC_002973	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
63	NC_002973	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
64	NC_002973	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
65	NC_002973	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906227
66	NC_002973	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
67	NC_002973	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002973	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906228
69	NC_002973	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906229
70	NC_002973	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
71	NC_002973	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
72	NC_002973	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
73	NC_002973	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906229
74	NC_002973	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906229
75	NC_002973	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906229
76	NC_002973	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
77	NC_002973	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
78	NC_002973	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906229
79	NC_002973	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
80	NC_002973	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
81	NC_002973	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
82	NC_002973	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
83	NC_002973	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002973	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002973	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
86	NC_002973	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906230
87	NC_002973	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
88	NC_002973	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906230
89	NC_002973	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
90	NC_002973	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906230
91	NC_002973	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
92	NC_002973	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
93	NC_002973	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
94	NC_002973	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906230
95	NC_002973	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
96	NC_002973	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906230
97	NC_002973	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906230
98	NC_002973	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906230
99	NC_002973	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906230
100	NC_002973	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
101	NC_002973	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
102	NC_002973	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906230
103	NC_002973	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906230
104	NC_002973	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
105	NC_002973	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
106	NC_002973	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
107	NC_002973	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906230
108	NC_002973	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906230
109	NC_002973	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
110	NC_002973	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906230
111	NC_002973	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906230
112	NC_002973	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906230
113	NC_002973	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906230
114	NC_002973	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002973	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002973	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906231
117	NC_002973	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906231
118	NC_002973	TCG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906231
119	NC_002973	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906231
120	NC_002973	CTT	2	6	8467	8472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906231
121	NC_002973	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906231
122	NC_002973	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906231
123	NC_002973	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906231
124	NC_002973	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906231
125	NC_002973	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906231
126	NC_002973	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906231
127	NC_002973	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906231
128	NC_002973	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906231
129	NC_002973	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906231
130	NC_002973	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906231
131	NC_002973	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906231
132	NC_002973	ATC	2	6	9083	9088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906231
133	NC_002973	ATT	2	6	9122	9127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906231
134	NC_002973	AGT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906231
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258	NC_002973	ATC	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_002973	TAT	2	6	17879	17884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_002973	ATT	2	6	17927	17932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_002973	CTT	2	6	18221	18226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_002973	TGC	2	6	18323	18328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906239
263	NC_002973	ACT	2	6	18336	18341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906239
264	NC_002973	ATT	2	6	18427	18432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906239
265	NC_002973	GTA	2	6	18548	18553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906239
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267	NC_002973	CAA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906239
268	NC_002973	GTA	2	6	18961	18966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906239
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285	NC_002973	TCT	2	6	19974	19979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906240
286	NC_002973	TGA	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906240
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288	NC_002973	TTC	2	6	20191	20196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906240
289	NC_002973	ATG	2	6	20221	20226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906240
290	NC_002973	ATT	2	6	20305	20310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906240
291	NC_002973	CTT	2	6	20406	20411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906240
292	NC_002973	CTT	2	6	20442	20447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906240
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372	NC_002973	TTA	2	6	26154	26159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_002973	TAT	3	9	26295	26303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906246
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