MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 1262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	TAGC	2	8	8168	8175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002971	CGTT	2	8	12416	12423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002971	CTAA	2	8	12527	12534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002971	TCGA	2	8	12885	12892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002971	TTTC	2	8	17438	17445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002971	ATTG	2	8	18177	18184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002971	AAGA	2	8	20928	20935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002971	GAGC	2	8	22924	22931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002971	TAAA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002971	CCGC	2	8	25053	25060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_002971	ATAA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002971	ACCG	3	12	25767	25778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002971	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002971	AGGA	2	8	43654	43661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002971	AAAT	2	8	43948	43955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002971	TCGC	2	8	44084	44091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002971	TAAT	2	8	44110	44117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002971	TAAA	2	8	44254	44261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002971	ATGC	2	8	44357	44364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002971	AATT	2	8	44594	44601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002971	TCAC	2	8	44713	44720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002971	GGGA	2	8	44766	44773	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002971	CATG	2	8	49391	49398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002971	AAAT	2	8	54694	54701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002971	CCAC	2	8	55362	55369	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_002971	GAAG	2	8	55588	55595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002971	TCGA	2	8	55754	55761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002971	GAAG	2	8	55810	55817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002971	TTAA	2	8	61271	61278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002971	ATTG	2	8	62256	62263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002971	CTGG	2	8	63737	63744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002971	ATAA	2	8	64062	64069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002971	GTGG	2	8	64426	64433	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002971	GTGG	2	8	64514	64521	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002971	CAGG	2	8	65188	65195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002971	GCCA	2	8	65420	65427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002971	AAAT	2	8	71534	71541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002971	AAGA	2	8	72720	72727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002971	AAGT	2	8	72733	72740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002971	AAAG	2	8	72761	72768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002971	AGAA	2	8	72781	72788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002971	AGAT	2	8	72924	72931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002971	GAAA	2	8	73060	73067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002971	GAAT	2	8	80968	80975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002971	AGCG	2	8	81073	81080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002971	AAAG	2	8	81203	81210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002971	GTGG	2	8	82427	82434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002971	AAAC	2	8	85962	85969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002971	ATGA	2	8	91362	91369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002971	TAAT	2	8	91406	91413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002971	CAAT	2	8	93467	93474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002971	CGGG	2	8	98425	98432	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002971	TAAA	2	8	99073	99080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002971	AATA	2	8	99335	99342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002971	AATA	2	8	99907	99914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002971	AGCC	2	8	103049	103056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002971	AGAT	2	8	103339	103346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002971	GGCT	2	8	103375	103382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002971	CTGT	2	8	106700	106707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002971	AAAT	2	8	116064	116071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002971	AAGG	2	8	116954	116961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002971	AGAT	2	8	117379	117386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002971	GGAA	2	8	117457	117464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002971	CTTT	2	8	117470	117477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002971	ATCA	2	8	117995	118002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002971	TATT	2	8	120503	120510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002971	TATC	2	8	120538	120545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002971	AAAT	2	8	120638	120645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002971	ATTT	2	8	121553	121560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002971	AGGC	2	8	121632	121639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002971	TAAA	2	8	121743	121750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002971	GTTT	2	8	131014	131021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002971	GAGC	2	8	131184	131191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002971	ATGT	2	8	132022	132029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002971	TGTC	2	8	136088	136095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002971	ACCA	2	8	145908	145915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002971	TGGG	2	8	146706	146713	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002971	ATTT	2	8	146946	146953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002971	TTTC	2	8	147039	147046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002971	ACTT	2	8	148001	148008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002971	TGTT	2	8	148081	148088	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002971	CGCC	2	8	148549	148556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_002971	TTAA	2	8	149923	149930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002971	CCTG	2	8	150986	150993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002971	TAAG	2	8	151371	151378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002971	GTAA	2	8	151381	151388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002971	GAAA	2	8	154047	154054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002971	AAAT	2	8	155224	155231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002971	AATT	2	8	156161	156168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002971	TGAT	2	8	165208	165215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002971	CCAT	2	8	165401	165408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002971	TACC	2	8	166555	166562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002971	ACTT	2	8	168161	168168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002971	ATCT	2	8	168260	168267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002971	ACTG	2	8	168293	168300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002971	AAAG	2	8	168658	168665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002971	TGAT	2	8	169550	169557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002971	TAAA	2	8	169943	169950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002971	ATTT	2	8	170451	170458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002971	ACGG	2	8	171741	171748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002971	TAAT	2	8	171892	171899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002971	AGCG	2	8	171974	171981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002971	CGAA	2	8	173880	173887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002971	CAAA	2	8	174103	174110	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002971	AATT	2	8	174234	174241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002971	AAAG	2	8	175291	175298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002971	GGCA	2	8	175585	175592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002971	GCCA	2	8	175720	175727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002971	ATAA	2	8	176717	176724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002971	TTTA	2	8	177189	177196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002971	TAAA	2	8	177413	177420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002971	TATT	2	8	178465	178472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002971	ACTG	2	8	178576	178583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002971	CATA	2	8	182998	183005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002971	TTCT	3	12	187627	187638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002971	TGGA	2	8	189585	189592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002971	AACC	2	8	190288	190295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002971	CGGG	2	8	190810	190817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002971	AGGC	2	8	190825	190832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002971	AGTA	2	8	192908	192915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002971	TGTT	2	8	193518	193525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002971	TTGC	2	8	193747	193754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002971	GTGA	2	8	193879	193886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002971	CTGC	2	8	194038	194045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002971	GAAA	2	8	194078	194085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002971	TTCT	2	8	194236	194243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002971	TATT	2	8	194383	194390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002971	TTAT	2	8	194507	194514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002971	CCTC	2	8	195793	195800	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_002971	AGAC	2	8	197152	197159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002971	AATG	2	8	197316	197323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002971	AATT	2	8	197603	197610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002971	ATCA	2	8	200374	200381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002971	AATT	2	8	200410	200417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002971	TGTT	2	8	200427	200434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002971	CAAA	2	8	200613	200620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002971	AAGC	2	8	200958	200965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002971	GAAA	2	8	200990	200997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002971	CTGC	2	8	204155	204162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002971	TTTA	2	8	204770	204777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002971	CAAA	2	8	204823	204830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002971	CTTT	2	8	205735	205742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002971	CATA	2	8	215627	215634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002971	CATT	2	8	220115	220122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002971	TTAA	2	8	220196	220203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002971	TTTA	2	8	220223	220230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002971	CCTT	2	8	235400	235407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002971	GTGC	2	8	235414	235421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002971	TAAT	2	8	239779	239786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002971	AAAG	2	8	239944	239951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002971	AAAT	2	8	241005	241012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002971	CCAG	2	8	248503	248510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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