MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 20556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653365
2	NC_002971	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653365
3	NC_002971	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653365
4	NC_002971	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653365
5	NC_002971	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653365
6	NC_002971	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653365
7	NC_002971	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653365
8	NC_002971	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653365
9	NC_002971	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653365
10	NC_002971	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653365
11	NC_002971	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653365
12	NC_002971	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653365
13	NC_002971	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653365
14	NC_002971	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653365
15	NC_002971	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653365
16	NC_002971	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
17	NC_002971	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653366
18	NC_002971	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653366
19	NC_002971	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
20	NC_002971	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653366
21	NC_002971	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
22	NC_002971	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653366
23	NC_002971	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653366
24	NC_002971	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653366
25	NC_002971	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653366
26	NC_002971	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653366
27	NC_002971	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653366
28	NC_002971	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653366
29	NC_002971	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653366
30	NC_002971	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653366
31	NC_002971	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918858
32	NC_002971	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918858
33	NC_002971	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918858
34	NC_002971	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918858
35	NC_002971	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918858
36	NC_002971	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918858
37	NC_002971	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918858
38	NC_002971	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
39	NC_002971	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
40	NC_002971	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
41	NC_002971	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
42	NC_002971	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
43	NC_002971	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
44	NC_002971	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918859
45	NC_002971	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
46	NC_002971	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
47	NC_002971	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
48	NC_002971	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918859
49	NC_002971	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
50	NC_002971	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918859
51	NC_002971	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
52	NC_002971	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918859
53	NC_002971	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918859
54	NC_002971	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918859
55	NC_002971	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918859
56	NC_002971	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
57	NC_002971	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918859
58	NC_002971	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918859
59	NC_002971	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918859
60	NC_002971	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918859
61	NC_002971	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918859
62	NC_002971	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918859
63	NC_002971	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918859
64	NC_002971	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
65	NC_002971	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918859
66	NC_002971	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918859
67	NC_002971	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215918859
68	NC_002971	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918859
69	NC_002971	TGA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918860
70	NC_002971	GTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918860
71	NC_002971	GGA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918860
72	NC_002971	GCA	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918860
73	NC_002971	AAC	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918860
74	NC_002971	GTT	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918860
75	NC_002971	GTG	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918860
76	NC_002971	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918860
77	NC_002971	GAG	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918860
78	NC_002971	TCA	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918860
79	NC_002971	ACA	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918860
80	NC_002971	AGG	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918860
81	NC_002971	TGT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918860
82	NC_002971	CCG	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918861
83	NC_002971	TGA	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918861
84	NC_002971	TCA	2	6	7942	7947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918861
85	NC_002971	TGG	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918861
86	NC_002971	TCA	2	6	8010	8015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918861
87	NC_002971	TTG	2	6	8023	8028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918861
88	NC_002971	ACA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918861
89	NC_002971	AAT	2	6	8296	8301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653371
90	NC_002971	GAT	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918862
91	NC_002971	TCC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215918862
92	NC_002971	ATC	2	6	8573	8578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918862
93	NC_002971	CTT	2	6	8632	8637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918862
94	NC_002971	TTG	2	6	8639	8644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918862
95	NC_002971	CAA	2	6	8734	8739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653372
96	NC_002971	ACA	2	6	8839	8844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653372
97	NC_002971	TCC	2	6	8847	8852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653372
98	NC_002971	GCT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918863
99	NC_002971	TTG	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918863
100	NC_002971	TAT	2	6	9083	9088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
101	NC_002971	TTA	2	6	9103	9108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
102	NC_002971	TAT	2	6	9116	9121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
103	NC_002971	CGC	2	6	9134	9139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918863
104	NC_002971	CAT	2	6	9158	9163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918863
105	NC_002971	TTA	2	6	9301	9306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
106	NC_002971	AAG	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918863
107	NC_002971	TGC	3	9	9349	9357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918863
108	NC_002971	ATT	2	6	9396	9401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
109	NC_002971	TTA	2	6	9405	9410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918863
110	NC_002971	AAC	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918863
111	NC_002971	ATT	2	6	9775	9780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653373
112	NC_002971	TAT	2	6	9800	9805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653373
113	NC_002971	CAC	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653373
114	NC_002971	GAC	2	6	9913	9918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653373
115	NC_002971	AGA	2	6	9919	9924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653373
116	NC_002971	ATA	2	6	9993	9998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653373
117	NC_002971	ACG	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653373
118	NC_002971	CCG	2	6	10022	10027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653373
119	NC_002971	GAT	2	6	10040	10045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653373
120	NC_002971	ATT	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653373
121	NC_002971	AAC	2	6	10198	10203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653373
122	NC_002971	CAG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653373
123	NC_002971	ATG	2	6	10419	10424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653373
124	NC_002971	GAA	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653373
125	NC_002971	ACG	2	6	10499	10504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653373
126	NC_002971	GGC	2	6	10748	10753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653373
127	NC_002971	TAT	2	6	10878	10883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653373
128	NC_002971	AGA	2	6	10939	10944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653373
129	NC_002971	ATT	2	6	11080	11085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653374
130	NC_002971	TGC	2	6	11114	11119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653374
131	NC_002971	ACG	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653374
132	NC_002971	AGG	2	6	11144	11149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653374
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381	NC_002971	TCG	2	6	34655	34660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653402
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