MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 2674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	29653365
2	NC_002971	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	29653366
3	NC_002971	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
4	NC_002971	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
5	NC_002971	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	215918859
6	NC_002971	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
7	NC_002971	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
8	NC_002971	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
9	NC_002971	TG	3	6	6811	6816	0 %	50 %	50 %	0 %	215918860
10	NC_002971	TG	3	6	7698	7703	0 %	50 %	50 %	0 %	215918860
11	NC_002971	AC	3	6	7817	7822	50 %	0 %	0 %	50 %	215918861
12	NC_002971	CT	3	6	8425	8430	0 %	50 %	0 %	50 %	215918862
13	NC_002971	AC	3	6	8622	8627	50 %	0 %	0 %	50 %	215918862
14	NC_002971	CA	3	6	9766	9771	50 %	0 %	0 %	50 %	29653373
15	NC_002971	CG	3	6	10283	10288	0 %	0 %	50 %	50 %	29653373
16	NC_002971	CG	3	6	11380	11385	0 %	0 %	50 %	50 %	29653374
17	NC_002971	GA	4	8	12064	12071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002971	TC	3	6	12174	12179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002971	GC	3	6	13118	13123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002971	GC	3	6	13552	13557	0 %	0 %	50 %	50 %	29653378
21	NC_002971	GC	4	8	15510	15517	0 %	0 %	50 %	50 %	29653380
22	NC_002971	TA	3	6	15820	15825	50 %	50 %	0 %	0 %	29653380
23	NC_002971	GC	3	6	17489	17494	0 %	0 %	50 %	50 %	29653383
24	NC_002971	GC	3	6	17607	17612	0 %	0 %	50 %	50 %	215918865
25	NC_002971	GA	3	6	18811	18816	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
26	NC_002971	GA	3	6	19376	19381	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
27	NC_002971	CT	4	8	20228	20235	0 %	50 %	0 %	50 %	29653385
28	NC_002971	CA	3	6	20542	20547	50 %	0 %	0 %	50 %	29653385
29	NC_002971	AG	3	6	20563	20568	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
30	NC_002971	AG	3	6	21026	21031	50 %	0 %	50 %	0 %	29653386
31	NC_002971	TC	3	6	24366	24371	0 %	50 %	0 %	50 %	29653391
32	NC_002971	AT	3	6	24427	24432	50 %	50 %	0 %	0 %	29653391
33	NC_002971	TG	3	6	24902	24907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002971	AC	3	6	25340	25345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002971	GT	3	6	26170	26175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002971	AC	3	6	28090	28095	50 %	0 %	0 %	50 %	29653393
37	NC_002971	GA	3	6	28636	28641	50 %	0 %	50 %	0 %	29653394
38	NC_002971	CT	3	6	29511	29516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002971	CT	3	6	29811	29816	0 %	50 %	0 %	50 %	29653395
40	NC_002971	GC	3	6	30121	30126	0 %	0 %	50 %	50 %	29653396
41	NC_002971	AC	3	6	30176	30181	50 %	0 %	0 %	50 %	29653396
42	NC_002971	AC	3	6	31537	31542	50 %	0 %	0 %	50 %	29653398
43	NC_002971	AT	3	6	32972	32977	50 %	50 %	0 %	0 %	161511219
44	NC_002971	GC	3	6	33357	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	215918868
45	NC_002971	CG	3	6	34659	34664	0 %	0 %	50 %	50 %	29653402
46	NC_002971	TG	3	6	36747	36752	0 %	50 %	50 %	0 %	215918869
47	NC_002971	TG	3	6	37634	37639	0 %	50 %	50 %	0 %	215918869
48	NC_002971	AC	3	6	37753	37758	50 %	0 %	0 %	50 %	215918870
49	NC_002971	CG	3	6	38922	38927	0 %	0 %	50 %	50 %	29653404
50	NC_002971	TC	3	6	39047	39052	0 %	50 %	0 %	50 %	29653404
51	NC_002971	CG	3	6	41838	41843	0 %	0 %	50 %	50 %	29653406
52	NC_002971	TC	3	6	42478	42483	0 %	50 %	0 %	50 %	215918872
53	NC_002971	GC	3	6	42760	42765	0 %	0 %	50 %	50 %	215918872
54	NC_002971	CT	3	6	42890	42895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002971	AG	3	6	43786	43791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002971	TA	3	6	48094	48099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002971	TA	3	6	48900	48905	50 %	50 %	0 %	0 %	215918874
58	NC_002971	CT	3	6	50394	50399	0 %	50 %	0 %	50 %	29653415
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60	NC_002971	AG	3	6	50838	50843	50 %	0 %	50 %	0 %	29653415
61	NC_002971	GC	3	6	51025	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	29653416
62	NC_002971	TA	3	6	52614	52619	50 %	50 %	0 %	0 %	29653417
63	NC_002971	CA	4	8	53262	53269	50 %	0 %	0 %	50 %	29653417
64	NC_002971	GC	3	6	53302	53307	0 %	0 %	50 %	50 %	29653417
65	NC_002971	GA	3	6	54841	54846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002971	GA	3	6	55092	55097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002971	TA	3	6	55212	55217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002971	AG	3	6	55227	55232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002971	TA	3	6	55520	55525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002971	AG	3	6	56883	56888	50 %	0 %	50 %	0 %	29653423
71	NC_002971	CG	3	6	60616	60621	0 %	0 %	50 %	50 %	215918876
72	NC_002971	CA	3	6	64352	64357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002971	CT	3	6	65372	65377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002971	CT	3	6	65592	65597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002971	AG	3	6	65599	65604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002971	TC	3	6	65670	65675	0 %	50 %	0 %	50 %	29653433
77	NC_002971	CT	4	8	66354	66361	0 %	50 %	0 %	50 %	29653433
78	NC_002971	AT	3	6	66474	66479	50 %	50 %	0 %	0 %	29653433
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80	NC_002971	CT	3	6	68134	68139	0 %	50 %	0 %	50 %	215918879
81	NC_002971	GC	3	6	68308	68313	0 %	0 %	50 %	50 %	215918879
82	NC_002971	CT	3	6	68700	68705	0 %	50 %	0 %	50 %	215918879
83	NC_002971	GC	3	6	68868	68873	0 %	0 %	50 %	50 %	29653435
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87	NC_002971	CG	3	6	69739	69744	0 %	0 %	50 %	50 %	29653436
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89	NC_002971	CG	3	6	70577	70582	0 %	0 %	50 %	50 %	215918880
90	NC_002971	GC	3	6	71333	71338	0 %	0 %	50 %	50 %	215918880
91	NC_002971	CA	3	6	71905	71910	50 %	0 %	0 %	50 %	29653438
92	NC_002971	GC	3	6	71966	71971	0 %	0 %	50 %	50 %	29653438
93	NC_002971	CT	3	6	72714	72719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002971	AG	3	6	73076	73081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002971	TA	3	6	73107	73112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002971	TA	3	6	73181	73186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002971	GC	3	6	76263	76268	0 %	0 %	50 %	50 %	29653445
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99	NC_002971	GT	3	6	77529	77534	0 %	50 %	50 %	0 %	29653445
100	NC_002971	GC	3	6	78264	78269	0 %	0 %	50 %	50 %	29653447
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103	NC_002971	GC	3	6	79864	79869	0 %	0 %	50 %	50 %	215918882
104	NC_002971	GC	3	6	80623	80628	0 %	0 %	50 %	50 %	215918882
105	NC_002971	AT	3	6	82515	82520	50 %	50 %	0 %	0 %	215918884
106	NC_002971	GC	3	6	83583	83588	0 %	0 %	50 %	50 %	215918884
107	NC_002971	TG	3	6	85573	85578	0 %	50 %	50 %	0 %	29653453
108	NC_002971	CG	3	6	85639	85644	0 %	0 %	50 %	50 %	29653453
109	NC_002971	CG	3	6	85810	85815	0 %	0 %	50 %	50 %	29653453
110	NC_002971	GC	3	6	86192	86197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002971	TG	3	6	87192	87197	0 %	50 %	50 %	0 %	29653454
112	NC_002971	TC	3	6	88958	88963	0 %	50 %	0 %	50 %	29653455
113	NC_002971	TC	3	6	89588	89593	0 %	50 %	0 %	50 %	29653455
114	NC_002971	TC	3	6	91198	91203	0 %	50 %	0 %	50 %	215918887
115	NC_002971	TA	3	6	91253	91258	50 %	50 %	0 %	0 %	215918887
116	NC_002971	CG	3	6	92312	92317	0 %	0 %	50 %	50 %	29653458
117	NC_002971	GA	3	6	95703	95708	50 %	0 %	50 %	0 %	29653461
118	NC_002971	TA	3	6	96602	96607	50 %	50 %	0 %	0 %	29653463
119	NC_002971	AT	3	6	97023	97028	50 %	50 %	0 %	0 %	29653463
120	NC_002971	GC	4	8	100312	100319	0 %	0 %	50 %	50 %	29653465
121	NC_002971	GA	3	6	101093	101098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002971	CG	3	6	101364	101369	0 %	0 %	50 %	50 %	215918892
123	NC_002971	TG	3	6	103279	103284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002971	CA	3	6	103288	103293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002971	GC	3	6	104514	104519	0 %	0 %	50 %	50 %	29653469
126	NC_002971	CG	4	8	107720	107727	0 %	0 %	50 %	50 %	29653474
127	NC_002971	GA	3	6	107791	107796	50 %	0 %	50 %	0 %	29653474
128	NC_002971	TG	3	6	110360	110365	0 %	50 %	50 %	0 %	215918897
129	NC_002971	AG	3	6	111895	111900	50 %	0 %	50 %	0 %	29653480
130	NC_002971	CG	3	6	112727	112732	0 %	0 %	50 %	50 %	29653481
131	NC_002971	CG	3	6	112767	112772	0 %	0 %	50 %	50 %	29653481
132	NC_002971	TG	3	6	113069	113074	0 %	50 %	50 %	0 %	29653481
133	NC_002971	AC	3	6	114758	114763	50 %	0 %	0 %	50 %	29653482
134	NC_002971	GA	3	6	116225	116230	50 %	0 %	50 %	0 %	29653485
135	NC_002971	CT	3	6	117289	117294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002971	AT	3	6	117511	117516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002971	CT	3	6	117883	117888	0 %	50 %	0 %	50 %	215918898
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139	NC_002971	AC	3	6	117942	117947	50 %	0 %	0 %	50 %	215918898
140	NC_002971	TG	3	6	119937	119942	0 %	50 %	50 %	0 %	29653490
141	NC_002971	CA	3	6	120151	120156	50 %	0 %	0 %	50 %	29653490
142	NC_002971	AG	3	6	120674	120679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002971	TC	3	6	120703	120708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002971	CG	3	6	120851	120856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002971	AG	3	6	121778	121783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002971	GA	3	6	121831	121836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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