MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	CGAAAT	2	12	406	417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42525520
2	NC_002967	TTTTTG	2	12	5432	5443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42525524
3	NC_002967	TCTTTA	2	12	8430	8441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42525525
4	NC_002967	GCCTCG	2	12	12102	12113	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	42525527
5	NC_002967	ATAAAA	2	12	13480	13491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42525527
6	NC_002967	GTTATT	2	12	14864	14875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42525529
7	NC_002967	TATTTT	2	12	19584	19595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525534
8	NC_002967	TCAAAA	2	12	19759	19770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525534
9	NC_002967	ATATCA	2	12	20245	20256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42525534
10	NC_002967	AGCCGC	2	12	21071	21082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	42525535
11	NC_002967	AAAACT	2	12	23159	23170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525537
12	NC_002967	TCTTTT	2	12	27473	27484	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525540
13	NC_002967	AGTTTA	2	12	30651	30662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42525543
14	NC_002967	AAATGG	2	12	30858	30869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42525543
15	NC_002967	TACACA	2	12	32960	32971	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42525545
16	NC_002967	TAAAAT	2	12	37303	37314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525548
17	NC_002967	AAATTA	2	12	38080	38091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525549
18	NC_002967	TCTTTT	2	12	39589	39600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525551
19	NC_002967	TTTTTA	2	12	40300	40311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525552
20	NC_002967	TATATC	2	12	40622	40633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42525552
21	NC_002967	TTCAAA	2	12	40643	40654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42525552
22	NC_002967	ATTTAT	2	12	41123	41134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525553
23	NC_002967	TTTCTT	2	12	43013	43024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002967	AAAATT	2	12	47423	47434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525559
25	NC_002967	AATTTT	2	12	49899	49910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525562
26	NC_002967	CGATTA	2	12	53484	53495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42525564
27	NC_002967	TTTCGG	2	12	54621	54632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	42525564
28	NC_002967	TTTCTT	2	12	58649	58660	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525568
29	NC_002967	AGGTAT	2	12	61480	61491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525571
30	NC_002967	GAAGCC	2	12	64212	64223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525574
31	NC_002967	GCATAT	2	12	66242	66253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42525576
32	NC_002967	CGTTTT	2	12	73560	73571	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42525585
33	NC_002967	GATAAT	2	12	73672	73683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42525585
34	NC_002967	ATAGGA	2	12	76496	76507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42525587
35	NC_002967	ACTTTT	2	12	81135	81146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42525591
36	NC_002967	TTGGAA	2	12	83458	83469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525592
37	NC_002967	AGAAAT	2	12	84714	84725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42525593
38	NC_002967	AAATAC	2	12	85362	85373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525593
39	NC_002967	TCCTTC	2	12	88592	88603	0 %	50 %	0 %	50 %	42525596
40	NC_002967	CTATCC	2	12	90892	90903	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	42525599
41	NC_002967	AAATCA	2	12	93586	93597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525600
42	NC_002967	TAAAGG	2	12	94529	94540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42525602
43	NC_002967	TAAAAA	2	12	96598	96609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42525603
44	NC_002967	TCGTTT	2	12	97328	97339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42525603
45	NC_002967	AGCTTC	2	12	99564	99575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	42525604
46	NC_002967	ACTAAA	2	12	102356	102367	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525605
47	NC_002967	TAAATC	2	12	104872	104883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42525606
48	NC_002967	TTTCGG	2	12	105680	105691	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	42525607
49	NC_002967	TAGGAG	2	12	105944	105955	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	42525607
50	NC_002967	TAAGGT	2	12	110262	110273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525611
51	NC_002967	GAATAT	2	12	111913	111924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42525612
52	NC_002967	ATTTTT	2	12	115011	115022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525617
53	NC_002967	ATCAAA	2	12	118429	118440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525619
54	NC_002967	AAAAGA	2	12	118892	118903	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42525619
55	NC_002967	ATTTTC	2	12	120574	120585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42525620
56	NC_002967	ATCAAA	2	12	120586	120597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525620
57	NC_002967	AAAAAC	2	12	121967	121978	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42525621
58	NC_002967	TTTTTC	2	12	123263	123274	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525622
59	NC_002967	TAAAAC	2	12	124786	124797	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525623
60	NC_002967	CAAAAA	2	12	125921	125932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42525625
61	NC_002967	TTGTTT	2	12	130917	130928	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42525629
62	NC_002967	TAAGCA	2	12	131539	131550	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42525629
63	NC_002967	AAAAAG	2	12	133089	133100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42525632
64	NC_002967	ATAAGA	2	12	137509	137520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42525638
65	NC_002967	AAAAAT	2	12	137599	137610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002967	TAAAGT	2	12	138734	138745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42525639
67	NC_002967	AAAAAC	2	12	140363	140374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42525640
68	NC_002967	GCTCAA	2	12	142022	142033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42525642
69	NC_002967	AAAAAC	2	12	142877	142888	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42525643
70	NC_002967	TTATGA	2	12	145895	145906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42525646
71	NC_002967	ACAAAA	2	12	150966	150977	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42525649
72	NC_002967	GTGAAA	2	12	151097	151108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42525649
73	NC_002967	ACCTCA	2	12	151420	151431	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	42525649
74	NC_002967	AGCCGG	2	12	154905	154916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	42525653
75	NC_002967	CGGTTT	2	12	155231	155242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	42525654
76	NC_002967	GATAAG	2	12	158340	158351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002967	ATTTTT	2	12	164025	164036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525660
78	NC_002967	ATTTCC	2	12	166903	166914	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	42525664
79	NC_002967	CGGAAT	2	12	167070	167081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	42525664
80	NC_002967	AGCCAT	2	12	168395	168406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42525665
81	NC_002967	TTTTAT	2	12	169032	169043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525666
82	NC_002967	TATTTT	2	12	170763	170774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42525669
83	NC_002967	AAAATT	2	12	171878	171889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525669
84	NC_002967	ACCGAA	2	12	172853	172864	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42525670
85	NC_002967	AACATC	2	12	172974	172985	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42525670
86	NC_002967	TTTCCT	2	12	175086	175097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525672
87	NC_002967	CCTTTT	2	12	180645	180656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525675
88	NC_002967	CTTTTA	2	12	182947	182958	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42525675
89	NC_002967	GTTTTA	2	12	187699	187710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42525678
90	NC_002967	GTAACC	2	12	188347	188358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42525680
91	NC_002967	AAATCC	2	12	190404	190415	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42525680
92	NC_002967	AGAAAG	2	12	192321	192332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525680
93	NC_002967	AATACA	2	12	192645	192656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525680
94	NC_002967	ACCTTC	2	12	196973	196984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	42525686
95	NC_002967	TTTATA	2	12	197324	197335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525687
96	NC_002967	CTTTCT	2	12	198281	198292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525687
97	NC_002967	GTAGAT	2	12	199670	199681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525688
98	NC_002967	AAGAAA	2	12	201114	201125	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42525689
99	NC_002967	CGAAGA	2	12	205066	205077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	42525691
100	NC_002967	AGCCTC	2	12	206512	206523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	42525691
101	NC_002967	TAAGAA	2	12	214917	214928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42525699
102	NC_002967	CTTAAA	2	12	215677	215688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42525700
103	NC_002967	TTAAAT	2	12	216801	216812	50 %	50 %	0 %	0 %	42525700
104	NC_002967	AATTAA	2	12	216951	216962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525701
105	NC_002967	CAAAGG	2	12	217640	217651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	42525701
106	NC_002967	TTTTGA	2	12	218022	218033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42525701
107	NC_002967	GTTTCA	2	12	219113	219124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42525702
108	NC_002967	TGCAAA	2	12	221012	221023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42525703
109	NC_002967	TTAATT	2	12	221130	221141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525703
110	NC_002967	AGCAAA	2	12	221174	221185	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	42525703
111	NC_002967	AAAATC	2	12	225215	225226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525706
112	NC_002967	TAAAAA	2	12	227109	227120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42525708
113	NC_002967	TGTTTT	2	12	227798	227809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42525709
114	NC_002967	CTTTTC	2	12	229372	229383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525711
115	NC_002967	ACCTGC	2	12	236035	236046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	42525720
116	NC_002967	AATTTA	2	12	238687	238698	50 %	50 %	0 %	0 %	42525723
117	NC_002967	AATCAA	2	12	238705	238716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525723
118	NC_002967	TCTTTT	2	12	239945	239956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525724
119	NC_002967	TATTGC	2	12	241774	241785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42525725
120	NC_002967	GGAGCA	2	12	242930	242941	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	42525725
121	NC_002967	TATATT	2	12	246581	246592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002967	AAGAAA	2	12	248294	248305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42525730
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239	NC_002967	GGGTTT	2	12	494415	494426	0 %	50 %	50 %	0 %	42525954
240	NC_002967	GCTTTG	2	12	495588	495599	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	42525955
241	NC_002967	ATATGA	2	12	496557	496568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42525957
242	NC_002967	TTGCCG	2	12	500503	500514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525961
243	NC_002967	CTTCCT	2	12	502588	502599	0 %	50 %	0 %	50 %	42525962
244	NC_002967	AAAGGC	2	12	503200	503211	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	42525963
245	NC_002967	TAAATA	2	12	507050	507061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525965
246	NC_002967	CGCGGC	2	12	509966	509977	0 %	0 %	50 %	50 %	42525967
247	NC_002967	TGCAGG	2	12	510631	510642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	42525970
248	NC_002967	CAAAAT	2	12	513842	513853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42525973
249	NC_002967	ATAATT	2	12	513981	513992	50 %	50 %	0 %	0 %	42525973
250	NC_002967	TCGATT	2	12	516851	516862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42525978
251	NC_002967	CAAGCT	2	12	519947	519958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42525983
252	NC_002967	TTATCA	2	12	521506	521517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42525985
253	NC_002967	TCCTAT	2	12	521717	521728	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	42525985
254	NC_002967	CCGCTT	2	12	527207	527218	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	42525987
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269	NC_002967	AAAATA	2	12	547357	547368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42526007
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283	NC_002967	TATATT	2	12	581224	581235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_002967	GAACCT	2	12	582180	582191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42526056
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305	NC_002967	CAGTAA	2	12	626603	626614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42526104
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325	NC_002967	TTTATT	2	12	663926	663937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_002967	AGAAAT	2	12	666838	666849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42526147
327	NC_002967	TCTTTG	2	12	671117	671128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42526152
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329	NC_002967	TAAATT	2	12	678670	678681	50 %	50 %	0 %	0 %	42526158
330	NC_002967	GCCTAT	2	12	679507	679518	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	42526159
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333	NC_002967	AAGGTA	2	12	684557	684568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
334	NC_002967	AGCTCA	2	12	688625	688636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42526167
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344	NC_002967	CGGCAT	2	12	695980	695991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	42526174
345	NC_002967	TTTAAA	2	12	698634	698645	50 %	50 %	0 %	0 %	42526179
346	NC_002967	GAAAAA	2	12	699504	699515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42526179
347	NC_002967	CTTAGC	2	12	699927	699938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	42526180
348	NC_002967	GACATA	2	12	700281	700292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42526180
349	NC_002967	TGCCTT	2	12	700698	700709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	42526180
350	NC_002967	CGGCTT	2	12	701684	701695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42526180
351	NC_002967	TTCACC	2	12	710101	710112	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	42526185
352	NC_002967	GAATAT	2	12	712006	712017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42526187
353	NC_002967	TACACA	2	12	713029	713040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42526188
354	NC_002967	CGAAAA	2	12	715934	715945	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	42526192
355	NC_002967	TAAGGC	2	12	717847	717858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	42526195
356	NC_002967	AAATAT	2	12	721196	721207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_002967	CGGCAA	2	12	738719	738730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42526218
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457	NC_002967	TTTAAA	2	12	941610	941621	50 %	50 %	0 %	0 %	42526433
458	NC_002967	GGGCAA	2	12	942275	942286	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	42526434
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462	NC_002967	TATTTT	2	12	950068	950079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42526438
463	NC_002967	TTCCCG	2	12	950225	950236	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	42526439
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465	NC_002967	ACAATT	2	12	953827	953838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
466	NC_002967	GTAATT	2	12	954224	954235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42526443
467	NC_002967	CGAATA	2	12	956210	956221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42526444
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470	NC_002967	ATTTAA	2	12	962776	962787	50 %	50 %	0 %	0 %	42526451
471	NC_002967	AAGGCA	2	12	967083	967094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	42526456
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