MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	TTTCTT	2	12	43013	43024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002967	AAAAAT	2	12	137599	137610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002967	GATAAG	2	12	158340	158351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002967	TATATT	2	12	246581	246592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002967	TTGAAA	2	12	330836	330847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002967	ATTTTG	2	12	357345	357356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002967	TGTCCA	2	12	369311	369322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002967	ATTTTT	2	12	390379	390390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002967	TATTTT	2	12	410081	410092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002967	ATTTTT	2	12	443999	444010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002967	TATATT	2	12	581224	581235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002967	TCCAAT	2	12	601194	601205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002967	AAAATA	2	12	626565	626576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002967	TTTATT	2	12	663926	663937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002967	AAGGTA	2	12	684557	684568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002967	AAATAT	2	12	721196	721207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002967	AGTCCT	2	12	760351	760362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002967	ATTTGC	2	12	803124	803135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_002967	GTTACC	2	12	803617	803628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002967	GCGCTT	2	12	806076	806087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002967	TTTCTT	2	12	920242	920253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002967	ACAATT	2	12	953827	953838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002967	ATAATC	2	12	1046964	1046975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002967	ATAAGT	2	12	1067151	1067162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002967	CTTTAT	2	12	1068395	1068406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_002967	ACACCC	2	12	1084996	1085007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_002967	TCTTTT	2	12	1145745	1145756	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002967	ACAGAA	2	12	1388423	1388434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002967	TTGTAA	2	12	1545328	1545339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002967	GAATTT	2	12	1563255	1563266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002967	TAAAAA	2	12	1634020	1634031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002967	TAATTA	2	12	1634039	1634050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002967	ATTTAA	2	12	1674924	1674935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002967	GTAAAA	2	12	1701565	1701576	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002967	ATAAAC	2	12	1702221	1702232	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_002967	AAATAC	2	12	1747383	1747394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_002967	ATTTCT	2	12	1822532	1822543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_002967	TTTCTA	2	12	1846609	1846620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_002967	TTAAAA	2	12	1858552	1858563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002967	AAAACT	2	12	1864055	1864066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002967	AATAAA	2	12	1875646	1875657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002967	TTAAGT	2	12	1940865	1940876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002967	AATTAT	2	12	2002310	2002321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002967	TTTATA	2	12	2033834	2033845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002967	CTGCAC	2	12	2034904	2034915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002967	TCTTTT	2	12	2075237	2075248	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002967	CCCCTG	2	12	2075739	2075750	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_002967	TACCCA	2	12	2092518	2092529	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002967	TGCAGG	2	12	2093867	2093878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002967	TTTTAA	2	12	2116301	2116312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002967	GCAGAC	2	12	2121448	2121459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002967	GAAAAA	2	12	2121526	2121537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002967	AAATTA	2	12	2181848	2181859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002967	CTTCAA	2	12	2204140	2204151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002967	ATTTTA	2	12	2247705	2247716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002967	AAACAA	2	12	2260808	2260819	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002967	AGTTAC	2	12	2296604	2296615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_002967	TATAAA	2	12	2325161	2325172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002967	CGGCAT	2	12	2367526	2367537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002967	TTTAAA	2	12	2509224	2509235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002967	TATTTT	2	12	2547908	2547919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002967	TTTGCA	2	12	2555405	2555416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_002967	ATTTTT	2	12	2583805	2583816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002967	ATATAA	2	12	2587418	2587429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002967	AAAATA	2	12	2611840	2611851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002967	ATAAAA	2	12	2623521	2623532	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002967	GTTAGC	2	12	2668527	2668538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_002967	ATTTTT	2	12	2819451	2819462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.