MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	GATGG	2	10	9804	9813	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002967	AAGAT	2	10	18801	18810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002967	TGTTA	2	10	18811	18820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002967	TTGCT	2	10	48716	48725	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002967	GATAG	2	10	57935	57944	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002967	TTATT	2	10	67942	67951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002967	AAAAT	2	10	85605	85614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002967	AAATC	2	10	87492	87501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002967	ATAAA	2	10	115664	115673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002967	AGTAT	2	10	121255	121264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002967	TATCA	2	10	134138	134147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_002967	TTTTA	2	10	150601	150610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002967	GCTCT	2	10	171907	171916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_002967	TAAAA	2	10	176287	176296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002967	ACAAA	2	10	183969	183978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002967	AATGG	2	10	187063	187072	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002967	TAAAA	2	10	250581	250590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002967	ATAAA	2	10	253229	253238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002967	TCTAT	2	10	281785	281794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002967	TTCAT	2	10	282060	282069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002967	TACAA	2	10	284755	284764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002967	ATATA	2	10	286375	286384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002967	TCATT	2	10	293314	293323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002967	TATAA	2	10	297498	297507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002967	TATAT	2	10	301992	302001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002967	TTATT	2	10	306544	306553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002967	AAAAG	2	10	306726	306735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002967	TATTT	2	10	313570	313579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002967	ATAAA	2	10	326865	326874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002967	TTTTA	2	10	330755	330764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002967	ATATT	2	10	347036	347045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002967	ACTTT	2	10	355713	355722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002967	TACCG	2	10	355724	355733	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_002967	TAAGC	2	10	357478	357487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002967	TTTGA	2	10	370766	370775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002967	ATTTT	2	10	377314	377323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002967	ATAAA	2	10	390513	390522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002967	ATATT	2	10	400849	400858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002967	AGGAG	2	10	406117	406126	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002967	ATTTG	2	10	461591	461600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002967	ATTTA	2	10	488308	488317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002967	GCAAA	2	10	495098	495107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_002967	AAACC	2	10	501203	501212	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_002967	TTATT	2	10	501322	501331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002967	ATTTT	2	10	514494	514503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002967	ATATA	2	10	533007	533016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002967	TAAAA	2	10	546190	546199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002967	TCAAA	2	10	552424	552433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002967	TTTTG	2	10	553997	554006	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002967	GGAAT	2	10	580196	580205	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002967	CTTAA	2	10	587432	587441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_002967	TATAT	2	10	592794	592803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002967	TAGGT	2	10	594850	594859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002967	AATTG	2	10	601231	601240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002967	CTTGA	2	10	610831	610840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002967	CGGTG	2	10	611548	611557	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002967	AGGGA	2	10	612018	612027	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002967	TGAAC	2	10	612322	612331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002967	AGGTT	2	10	613780	613789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002967	ACCGT	2	10	613797	613806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_002967	AGAGG	2	10	614036	614045	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002967	TTGAA	2	10	614065	614074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002967	GCTTT	2	10	625173	625182	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002967	TTTAA	2	10	637328	637337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002967	TGATA	2	10	640968	640977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002967	TTTAT	2	10	648107	648116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002967	AAAAT	2	10	669674	669683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002967	GTTGT	2	10	688076	688085	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002967	TTATA	2	10	703662	703671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002967	TACAA	2	10	710619	710628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002967	AAAAT	2	10	715427	715436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002967	ATATA	6	30	728158	728187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002967	CAGAA	2	10	730022	730031	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002967	TTATC	2	10	734289	734298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002967	TATTT	2	10	736578	736587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002967	TTTTA	2	10	747127	747136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002967	TGAGA	2	10	758582	758591	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002967	GCATA	2	10	774766	774775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002967	ATTTT	2	10	784396	784405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002967	GCACG	2	10	802812	802821	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002967	AATCA	2	10	806438	806447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_002967	ATCTT	2	10	820067	820076	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_002967	TTTAT	2	10	838848	838857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002967	TTTTA	2	10	846074	846083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002967	TCTTA	2	10	867907	867916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_002967	ATTAA	2	10	878442	878451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002967	ATAAA	2	10	887738	887747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002967	CTCTT	2	10	912273	912282	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_002967	TATTT	2	10	918918	918927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002967	AGAAA	2	10	931591	931600	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002967	TTAAA	2	10	966363	966372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002967	AAGGG	2	10	967127	967136	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002967	CTTTT	2	10	972016	972025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002967	ATTTT	2	10	972094	972103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002967	ATTGA	2	10	974126	974135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002967	TTAAA	2	10	978941	978950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002967	TATAA	2	10	1017242	1017251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002967	ATTTT	2	10	1018374	1018383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002967	AAATA	2	10	1035202	1035211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002967	TTTTC	2	10	1045714	1045723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002967	GGAAA	2	10	1046236	1046245	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002967	ATTCG	2	10	1047050	1047059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002967	AATAT	2	10	1051643	1051652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002967	GTTTT	2	10	1057679	1057688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002967	ATATA	2	10	1062563	1062572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002967	TATAT	2	10	1063572	1063581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002967	TTAAA	2	10	1084812	1084821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002967	CTTGC	2	10	1086468	1086477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_002967	ATTAA	2	10	1094372	1094381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002967	TTAAA	2	10	1098850	1098859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002967	TTTAA	2	10	1136789	1136798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002967	GGCAA	2	10	1147803	1147812	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002967	CAAAA	2	10	1209933	1209942	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002967	CTTGA	2	10	1220459	1220468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002967	CGGTG	2	10	1221176	1221185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_002967	AGGGA	2	10	1221629	1221638	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002967	TGAAC	2	10	1221933	1221942	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002967	AGGTT	2	10	1223391	1223400	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002967	ACCGT	2	10	1223408	1223417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_002967	AGAGG	2	10	1223647	1223656	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002967	TTGAA	2	10	1223676	1223685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002967	TTTAA	2	10	1246830	1246839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002967	AATTC	2	10	1277968	1277977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002967	GGGTT	2	10	1315350	1315359	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002967	AATAA	2	10	1322155	1322164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002967	TAAAA	2	10	1329314	1329323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002967	TAAAA	2	10	1333496	1333505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002967	ATATT	2	10	1349141	1349150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002967	ATTTT	2	10	1363598	1363607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002967	TTTCG	2	10	1417044	1417053	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002967	TTTTC	2	10	1417177	1417186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002967	TATTC	2	10	1424992	1425001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_002967	GAAAC	2	10	1450945	1450954	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_002967	ACAAA	2	10	1468728	1468737	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_002967	TTGAC	2	10	1487508	1487517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_002967	TAAAA	2	10	1487543	1487552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002967	GTAGG	2	10	1495442	1495451	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002967	ATAAA	2	10	1527008	1527017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002967	AAAAG	2	10	1531621	1531630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002967	TATCC	2	10	1540329	1540338	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002967	TTTAA	2	10	1551032	1551041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002967	AAAAT	2	10	1551670	1551679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002967	CATAG	2	10	1551785	1551794	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_002967	TAAGC	2	10	1553703	1553712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_002967	TAAAT	2	10	1556001	1556010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002967	AAAAC	2	10	1617589	1617598	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.