MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	GCA	2	6	233	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525520
2	NC_002967	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525520
3	NC_002967	GAA	2	6	593	598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525520
4	NC_002967	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
5	NC_002967	CAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525520
6	NC_002967	TTA	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525520
7	NC_002967	ACA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525520
8	NC_002967	TCC	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525520
9	NC_002967	TCT	2	6	1265	1270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
10	NC_002967	TCC	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525520
11	NC_002967	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525520
12	NC_002967	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525520
13	NC_002967	TTC	2	6	1516	1521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
14	NC_002967	ATT	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525521
15	NC_002967	ATA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525521
16	NC_002967	CGG	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525521
17	NC_002967	ACC	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42525521
18	NC_002967	CTT	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525521
19	NC_002967	CCT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525521
20	NC_002967	AAG	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
21	NC_002967	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
22	NC_002967	GCC	3	9	2833	2841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
23	NC_002967	TGC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525521
24	NC_002967	AGA	2	6	2854	2859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
25	NC_002967	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
26	NC_002967	GGC	2	6	2983	2988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525521
27	NC_002967	AAC	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525521
28	NC_002967	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525521
29	NC_002967	TAA	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525521
30	NC_002967	CTT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525521
31	NC_002967	GCC	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
32	NC_002967	ATG	3	9	3338	3346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525521
33	NC_002967	TGC	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525521
34	NC_002967	AAC	2	6	3444	3449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525521
35	NC_002967	ATG	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525521
36	NC_002967	GAA	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
37	NC_002967	CCG	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
38	NC_002967	GAA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
39	NC_002967	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525522
40	NC_002967	AGC	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525522
41	NC_002967	GCT	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525522
42	NC_002967	AAT	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525522
43	NC_002967	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525522
44	NC_002967	CTC	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525522
45	NC_002967	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525523
46	NC_002967	GTT	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525523
47	NC_002967	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525523
48	NC_002967	GAA	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525523
49	NC_002967	TTC	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525523
50	NC_002967	TAC	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
51	NC_002967	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
52	NC_002967	GGC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525523
53	NC_002967	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
54	NC_002967	TTA	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525524
55	NC_002967	TGT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525524
56	NC_002967	CTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525524
57	NC_002967	TAT	2	6	5249	5254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525524
58	NC_002967	ATC	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525524
59	NC_002967	TTC	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525524
60	NC_002967	GTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525524
61	NC_002967	GAT	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525524
62	NC_002967	ATC	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525524
63	NC_002967	CCG	2	6	5788	5793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525524
64	NC_002967	CGG	2	6	5884	5889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525524
65	NC_002967	TTC	2	6	6224	6229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
66	NC_002967	ATC	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
67	NC_002967	TCA	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
68	NC_002967	AAT	2	6	6605	6610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525525
69	NC_002967	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525525
70	NC_002967	GAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
71	NC_002967	ATT	2	6	6675	6680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
72	NC_002967	GAT	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525525
73	NC_002967	GCT	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
74	NC_002967	CGG	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
75	NC_002967	ATC	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
76	NC_002967	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
77	NC_002967	GAA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
78	NC_002967	GTT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525525
79	NC_002967	TTA	3	9	7300	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
80	NC_002967	CGG	2	6	7351	7356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
81	NC_002967	AAG	2	6	7403	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
82	NC_002967	CTT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
83	NC_002967	GTC	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
84	NC_002967	CTT	2	6	7621	7626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
85	NC_002967	CTT	2	6	7750	7755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
86	NC_002967	CAT	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
87	NC_002967	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
88	NC_002967	TCG	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
89	NC_002967	CTC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525525
90	NC_002967	TGC	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
91	NC_002967	TCG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
92	NC_002967	TTC	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
93	NC_002967	GAA	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
94	NC_002967	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
95	NC_002967	CGG	2	6	8659	8664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
96	NC_002967	TCT	2	6	8934	8939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
97	NC_002967	TAT	2	6	9020	9025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
98	NC_002967	TGA	2	6	9035	9040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525525
99	NC_002967	AGG	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42525525
100	NC_002967	CTG	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
101	NC_002967	GCT	2	6	9220	9225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
102	NC_002967	GGA	2	6	9229	9234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42525525
103	NC_002967	TCC	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525525
104	NC_002967	GCC	2	6	9369	9374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525525
105	NC_002967	CCG	2	6	9634	9639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525525
106	NC_002967	ATC	2	6	9713	9718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
107	NC_002967	GTC	2	6	9759	9764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
108	NC_002967	AGA	2	6	10076	10081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
109	NC_002967	TTC	2	6	10093	10098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525526
110	NC_002967	TTG	2	6	10104	10109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525526
111	NC_002967	AAC	2	6	10260	10265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525526
112	NC_002967	TAT	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525526
113	NC_002967	AAG	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
114	NC_002967	ATA	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525526
115	NC_002967	TTA	2	6	10545	10550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525526
116	NC_002967	ATG	2	6	10617	10622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525526
117	NC_002967	TGA	2	6	10789	10794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525526
118	NC_002967	AGA	2	6	10847	10852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
119	NC_002967	TTC	2	6	11081	11086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
120	NC_002967	CTT	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
121	NC_002967	GCC	2	6	11322	11327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525527
122	NC_002967	GAT	2	6	11708	11713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
123	NC_002967	TGA	2	6	11788	11793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
124	NC_002967	GAA	2	6	11853	11858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525527
125	NC_002967	TAG	2	6	11920	11925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
126	NC_002967	TTC	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
127	NC_002967	GTA	2	6	12000	12005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
128	NC_002967	GAT	2	6	12060	12065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
129	NC_002967	AAT	2	6	12080	12085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525527
130	NC_002967	AGA	2	6	12095	12100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525527
131	NC_002967	ACT	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525527
132	NC_002967	GCC	2	6	12424	12429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525527
133	NC_002967	GAA	2	6	12621	12626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525527
134	NC_002967	GCG	2	6	12757	12762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525527
135	NC_002967	ACA	2	6	12907	12912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525527
136	NC_002967	GAT	2	6	12951	12956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
137	NC_002967	TGC	2	6	12959	12964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525527
138	NC_002967	ATT	2	6	13131	13136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525527
139	NC_002967	TGA	2	6	13138	13143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
140	NC_002967	GAT	2	6	13301	13306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
141	NC_002967	GCA	2	6	13308	13313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525527
142	NC_002967	GCT	2	6	13314	13319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525527
143	NC_002967	TGT	2	6	13340	13345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525527
144	NC_002967	ATT	2	6	13366	13371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525527
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148	NC_002967	TCT	2	6	14067	14072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525528
149	NC_002967	CGG	2	6	14110	14115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525528
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152	NC_002967	CTT	2	6	14245	14250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525528
153	NC_002967	AAT	2	6	14257	14262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525528
154	NC_002967	TCA	2	6	14272	14277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525528
155	NC_002967	TCG	2	6	14295	14300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525528
156	NC_002967	GCA	2	6	14301	14306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525528
157	NC_002967	GAA	2	6	14385	14390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525528
158	NC_002967	AAT	2	6	14416	14421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525528
159	NC_002967	TCA	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525528
160	NC_002967	AAT	2	6	14729	14734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525529
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163	NC_002967	AGA	2	6	15022	15027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525529
164	NC_002967	AAT	2	6	15085	15090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525529
165	NC_002967	TGA	2	6	15151	15156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525529
166	NC_002967	TAT	2	6	15235	15240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525529
167	NC_002967	GAC	2	6	15584	15589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525530
168	NC_002967	ACA	2	6	15611	15616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525530
169	NC_002967	TAC	2	6	15700	15705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525530
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172	NC_002967	TAA	2	6	16075	16080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525530
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175	NC_002967	ATT	2	6	16475	16480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525531
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241	NC_002967	ATG	2	6	22713	22718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525536
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252	NC_002967	ATC	2	6	24011	24016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525538
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256	NC_002967	GAA	2	6	24493	24498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525538
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