MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002953	GTAGG	2	10	14400	14409	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002953	TCGAT	2	10	23815	23824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002953	ATATT	2	10	24353	24362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002953	TTTTG	2	10	42707	42716	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002953	TAAGA	2	10	49858	49867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002953	GAATT	2	10	52320	52329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002953	AATAT	2	10	52588	52597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002953	ATGAA	2	10	53707	53716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002953	ACTGT	2	10	55278	55287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002953	TAATT	2	10	56893	56902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002953	AAAGA	2	10	56917	56926	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002953	AGATA	2	10	58647	58656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002953	CTTTT	2	10	59520	59529	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002953	GTGTT	2	10	67748	67757	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002953	AGAAA	2	10	74784	74793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002953	TAAAG	2	10	74825	74834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002953	ATTCA	2	10	75097	75106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_002953	TTACC	2	10	80145	80154	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002953	GTAAT	2	10	95513	95522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002953	ATTTT	2	10	118220	118229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002953	AATAT	2	10	138411	138420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002953	ATTTT	2	10	139905	139914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002953	GATTT	2	10	139959	139968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002953	GGGGC	2	10	140227	140236	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_002953	CAAAA	2	10	163846	163855	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002953	TATCA	2	10	174223	174232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002953	ATCAT	2	10	182355	182364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002953	CAACT	2	10	194484	194493	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002953	GCTTT	2	10	198996	199005	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002953	TGATT	2	10	199342	199351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002953	GAAAA	2	10	209633	209642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002953	CTAAG	2	10	209798	209807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002953	TAACA	2	10	210004	210013	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002953	AATAT	2	10	229199	229208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002953	TATTT	2	10	235190	235199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002953	AACAT	2	10	243472	243481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002953	GATAA	2	10	247425	247434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002953	ATAAC	2	10	252073	252082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002953	TGAAT	2	10	252184	252193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002953	ATTAA	2	10	252325	252334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002953	AAAGT	2	10	256069	256078	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002953	TAAAA	2	10	257782	257791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002953	AAATT	2	10	259098	259107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002953	TAAAA	2	10	273841	273850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002953	TTTTA	2	10	280770	280779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002953	GAAAA	2	10	281631	281640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002953	ATAAA	2	10	281748	281757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002953	TCATA	2	10	290216	290225	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002953	ATTTA	2	10	304140	304149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002953	TAAAT	2	10	336742	336751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002953	ATTTT	2	10	342301	342310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002953	ATAGA	2	10	348542	348551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002953	TGACA	2	10	348734	348743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002953	GATAA	2	10	361041	361050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002953	ATTAA	2	10	366464	366473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002953	TATCA	2	10	375574	375583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_002953	ATTCT	2	10	393373	393382	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002953	AGAAT	2	10	396935	396944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002953	TAAGG	2	10	396999	397008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002953	TAAAT	2	10	405797	405806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002953	ACAGT	2	10	408567	408576	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002953	TTTAT	2	10	416182	416191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002953	TTGAT	2	10	416284	416293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002953	GCTTT	2	10	422839	422848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002953	CAATT	2	10	423750	423759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002953	CATAA	2	10	427445	427454	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002953	TAAAA	2	10	427669	427678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002953	AATAT	2	10	429814	429823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002953	TTTTG	2	10	434500	434509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002953	AAATT	2	10	445064	445073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002953	TTTAT	2	10	451488	451497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002953	TAAAG	2	10	451944	451953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002953	CTCAC	2	10	453860	453869	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_002953	CAAAG	2	10	453885	453894	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002953	TTTTA	2	10	454825	454834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002953	CTTAA	2	10	471597	471606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_002953	TGGTG	2	10	489418	489427	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002953	GGTAA	2	10	490457	490466	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002953	TCGTG	2	10	491276	491285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002953	GATTG	2	10	493548	493557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002953	GATTT	2	10	498480	498489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002953	ATATA	2	10	500898	500907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002953	CAAAG	2	10	507446	507455	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_002953	TTGAT	2	10	510607	510616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002953	AGACA	2	10	524537	524546	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002953	AAGTA	2	10	526972	526981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002953	TTAAA	2	10	529096	529105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002953	GATAA	2	10	529135	529144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002953	GGTAA	2	10	534665	534674	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002953	TCGTG	2	10	535484	535493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002953	GATTG	2	10	537789	537798	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002953	GGTAA	2	10	539876	539885	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002953	TCGTG	2	10	540695	540704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002953	GATTG	2	10	542983	542992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002953	ATATA	2	10	549783	549792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002953	AAAAT	2	10	554557	554566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002953	TTTAT	2	10	554666	554675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002953	TTATG	2	10	557672	557681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002953	ATTTA	2	10	557817	557826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002953	ACAAT	2	10	559622	559631	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002953	TGAAT	2	10	564089	564098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002953	GTATA	2	10	564146	564155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002953	TATAA	2	10	567863	567872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002953	GTTTA	2	10	584030	584039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002953	TAAAG	2	10	588224	588233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002953	GAAGC	2	10	589579	589588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002953	ATATT	2	10	594361	594370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002953	TTAAC	2	10	597285	597294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002953	AATTT	2	10	597370	597379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002953	ATAAA	2	10	605632	605641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002953	TTATA	2	10	620009	620018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002953	CACAT	2	10	620405	620414	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_002953	ATGAT	2	10	629428	629437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002953	TAATT	2	10	632915	632924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002953	TAAGT	2	10	637900	637909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002953	TATTG	2	10	639361	639370	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002953	ATTAT	2	10	640182	640191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002953	TTTAA	2	10	642459	642468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002953	AAATT	2	10	645703	645712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002953	TAAAT	2	10	648296	648305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002953	AAATT	2	10	650300	650309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002953	TAAAA	2	10	657316	657325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002953	ATTAA	2	10	659504	659513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002953	TTATT	2	10	659553	659562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002953	CAATA	2	10	659619	659628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002953	TTAAT	2	10	662243	662252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002953	AAATA	2	10	664508	664517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002953	ATTTT	2	10	664530	664539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002953	ATAAA	2	10	671222	671231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002953	TTTTA	2	10	673488	673497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002953	AAAGG	2	10	673810	673819	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002953	ATATA	2	10	677180	677189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002953	AAACT	2	10	680705	680714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_002953	TTCAC	2	10	685918	685927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_002953	TTTGT	2	10	689824	689833	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002953	AATGA	2	10	689897	689906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002953	GGTTG	2	10	696899	696908	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002953	AGTAG	2	10	706608	706617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002953	AAGTT	2	10	707057	707066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002953	AATTG	2	10	707089	707098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002953	AAACT	2	10	708964	708973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_002953	ATTTA	2	10	709355	709364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002953	AAAGT	2	10	711603	711612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002953	AATTT	2	10	714212	714221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002953	AGAAT	2	10	716155	716164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002953	CATGA	2	10	716372	716381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_002953	ATCAT	2	10	720963	720972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_002953	AATTA	2	10	732657	732666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002953	ATTTA	2	10	736838	736847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_002953	ATATT	2	10	783973	783982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_002953	AAATT	2	10	1325157	1325166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_002953	ATAGA	2	10	1325244	1325253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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