MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 2032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002953	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002953	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002953	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002953	CTAC	2	8	12570	12577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002953	ACGT	2	8	12734	12741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002953	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002953	TGCT	2	8	23801	23808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002953	ATCT	2	8	24135	24142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002953	GCCT	2	8	24263	24270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002953	ATTT	2	8	24595	24602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002953	CATT	2	8	29795	29802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002953	TTGA	2	8	30877	30884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002953	ATCA	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002953	ATTT	2	8	34214	34221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002953	TAGT	2	8	34256	34263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002953	AACT	2	8	34494	34501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002953	TAAT	2	8	34538	34545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002953	TTAA	2	8	40781	40788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002953	ACTT	2	8	42591	42598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_002953	TTAT	3	12	42611	42622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002953	ATCC	2	8	44461	44468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002953	TCAA	2	8	45963	45970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002953	TTAA	2	8	48203	48210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002953	ATTT	2	8	49752	49759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002953	AAGC	2	8	51572	51579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002953	TGAA	2	8	52242	52249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002953	GTAT	2	8	52266	52273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002953	TATT	2	8	52631	52638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002953	CATT	2	8	52776	52783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002953	ACGT	2	8	53553	53560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002953	TAAA	2	8	53647	53654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002953	ATTA	2	8	53926	53933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002953	TGTA	2	8	53968	53975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002953	AGTA	2	8	54069	54076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002953	ATTA	2	8	54096	54103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002953	TAAA	2	8	54122	54129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002953	AGTA	2	8	54922	54929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002953	TAAA	2	8	57127	57134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002953	ATAA	2	8	57157	57164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002953	TAAA	2	8	58530	58537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002953	TAAA	2	8	59226	59233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002953	ACAA	2	8	62381	62388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002953	ATTG	2	8	62500	62507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002953	CATA	2	8	62807	62814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002953	TCCA	2	8	63978	63985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002953	TAAT	2	8	67950	67957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002953	TGAC	2	8	67985	67992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002953	CATT	2	8	73134	73141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002953	TAGT	2	8	73188	73195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002953	GATT	2	8	73199	73206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002953	TTGA	2	8	74721	74728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002953	AATA	2	8	75903	75910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002953	AGCT	2	8	79731	79738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002953	TAAT	2	8	79876	79883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002953	AGAA	2	8	79895	79902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002953	TGGT	2	8	79965	79972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002953	TTGT	2	8	81013	81020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002953	AATC	2	8	81911	81918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002953	TAAA	2	8	82851	82858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002953	ATAA	2	8	85921	85928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002953	ATAA	2	8	88366	88373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002953	TTAT	2	8	91151	91158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002953	ATAA	2	8	91449	91456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002953	CAAT	2	8	93321	93328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002953	AAAG	2	8	95561	95568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002953	ATAA	2	8	96102	96109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002953	TATT	2	8	96140	96147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002953	AGTA	2	8	98082	98089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002953	TTGT	2	8	98225	98232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002953	TGTA	2	8	99726	99733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002953	AAAT	2	8	99826	99833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002953	ATTG	2	8	101072	101079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002953	GTTA	2	8	101194	101201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002953	TAAA	2	8	115839	115846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002953	TAAA	2	8	115877	115884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002953	TAAA	2	8	116334	116341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002953	ATAA	2	8	117985	117992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002953	TAAA	2	8	118232	118239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002953	AAAT	2	8	124144	124151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002953	ATTA	2	8	124178	124185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002953	ATTA	2	8	125017	125024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002953	TAAA	2	8	125041	125048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002953	GAGC	2	8	125955	125962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002953	TGAA	2	8	126018	126025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002953	ATAG	2	8	126929	126936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002953	TAAA	2	8	129206	129213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002953	CTTT	2	8	133639	133646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002953	TTTA	2	8	134916	134923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002953	ATTT	2	8	135002	135009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002953	AAGA	2	8	136588	136595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002953	GAGT	2	8	136611	136618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002953	ACTT	2	8	138173	138180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002953	ACAA	2	8	138880	138887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002953	AAAT	2	8	139452	139459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002953	AATT	2	8	139567	139574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002953	TAAT	2	8	140042	140049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002953	AAAT	2	8	140081	140088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002953	AAAT	2	8	140299	140306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002953	CCAA	2	8	140401	140408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002953	GTAA	2	8	140480	140487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002953	GAAA	2	8	140575	140582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002953	AGTA	2	8	140634	140641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002953	GTAG	2	8	140781	140788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002953	GAAA	2	8	140905	140912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002953	AAGG	2	8	140990	140997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002953	ATTT	2	8	141234	141241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002953	TATT	2	8	144078	144085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002953	TAAT	2	8	144240	144247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002953	TAAA	2	8	158540	158547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002953	AATA	2	8	163764	163771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002953	ATTA	2	8	163996	164003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002953	GTTT	2	8	164044	164051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002953	TAAC	2	8	164144	164151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002953	ATTT	2	8	164386	164393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002953	TTTA	2	8	165889	165896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002953	GAGT	2	8	167639	167646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002953	TCAT	2	8	172390	172397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002953	TTTG	2	8	172473	172480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002953	ATTT	2	8	173839	173846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002953	ATTT	2	8	173851	173858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002953	ATGT	2	8	174082	174089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002953	TTAA	2	8	174203	174210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002953	AGTA	2	8	174245	174252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002953	AAGT	2	8	182250	182257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002953	ATCA	2	8	182389	182396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002953	TAAA	2	8	183114	183121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002953	ATGT	2	8	187651	187658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002953	TTAA	2	8	189131	189138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002953	AATA	2	8	189181	189188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002953	AATA	2	8	189211	189218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002953	TGTA	2	8	193966	193973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002953	CTTA	2	8	194055	194062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002953	TAAT	2	8	194081	194088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002953	TTTG	2	8	194171	194178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002953	AAAG	2	8	194352	194359	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002953	AGTT	2	8	198851	198858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002953	CTTT	2	8	206240	206247	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002953	CTAT	2	8	209402	209409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002953	ATTT	2	8	209738	209745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002953	GAAA	2	8	209761	209768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002953	ATAA	2	8	209844	209851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002953	TAGT	2	8	209982	209989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002953	TGAA	2	8	218153	218160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002953	TAGT	2	8	218286	218293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002953	ATGA	2	8	218329	218336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002953	TTAA	2	8	219220	219227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002953	GGAT	2	8	220205	220212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002953	TTGT	2	8	229024	229031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002953	TATT	2	8	229856	229863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002953	GAAA	2	8	231654	231661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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