MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 chromosome

Total Repeats: 37159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002952	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
2	NC_002952	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
3	NC_002952	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482254
4	NC_002952	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482254
5	NC_002952	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
6	NC_002952	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482254
7	NC_002952	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
8	NC_002952	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
9	NC_002952	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
10	NC_002952	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482254
11	NC_002952	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482254
12	NC_002952	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
13	NC_002952	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
14	NC_002952	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482254
15	NC_002952	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
16	NC_002952	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
17	NC_002952	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482254
18	NC_002952	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482254
19	NC_002952	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
20	NC_002952	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
21	NC_002952	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482254
22	NC_002952	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
23	NC_002952	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482254
24	NC_002952	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
25	NC_002952	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482254
26	NC_002952	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
27	NC_002952	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
28	NC_002952	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
29	NC_002952	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
30	NC_002952	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482255
31	NC_002952	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
32	NC_002952	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482255
33	NC_002952	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
34	NC_002952	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
35	NC_002952	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482255
36	NC_002952	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
37	NC_002952	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
38	NC_002952	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
39	NC_002952	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482255
40	NC_002952	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
41	NC_002952	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482255
42	NC_002952	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
43	NC_002952	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
44	NC_002952	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482255
45	NC_002952	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
46	NC_002952	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
47	NC_002952	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482255
48	NC_002952	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
49	NC_002952	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
50	NC_002952	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482255
51	NC_002952	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482256
52	NC_002952	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482256
53	NC_002952	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482256
54	NC_002952	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482256
55	NC_002952	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482256
56	NC_002952	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
57	NC_002952	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482257
58	NC_002952	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
59	NC_002952	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49482257
60	NC_002952	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482257
61	NC_002952	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482257
62	NC_002952	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482257
63	NC_002952	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
64	NC_002952	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
65	NC_002952	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
66	NC_002952	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482257
67	NC_002952	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
68	NC_002952	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
69	NC_002952	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
70	NC_002952	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
71	NC_002952	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482258
72	NC_002952	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482258
73	NC_002952	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482258
74	NC_002952	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
75	NC_002952	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49482258
76	NC_002952	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
77	NC_002952	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
78	NC_002952	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
79	NC_002952	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
80	NC_002952	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
81	NC_002952	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
82	NC_002952	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
83	NC_002952	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
84	NC_002952	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
85	NC_002952	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
86	NC_002952	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
87	NC_002952	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
88	NC_002952	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
89	NC_002952	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49482258
90	NC_002952	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482258
91	NC_002952	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482258
92	NC_002952	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
93	NC_002952	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
94	NC_002952	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482258
95	NC_002952	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
96	NC_002952	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482258
97	NC_002952	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
98	NC_002952	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482259
99	NC_002952	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482259
100	NC_002952	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482259
101	NC_002952	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482259
102	NC_002952	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
103	NC_002952	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482259
104	NC_002952	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482259
105	NC_002952	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
106	NC_002952	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482259
107	NC_002952	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
108	NC_002952	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482259
109	NC_002952	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
110	NC_002952	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482259
111	NC_002952	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482259
112	NC_002952	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
113	NC_002952	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482259
114	NC_002952	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482259
115	NC_002952	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482259
116	NC_002952	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
117	NC_002952	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482259
118	NC_002952	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
119	NC_002952	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482259
120	NC_002952	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
121	NC_002952	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482259
122	NC_002952	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482259
123	NC_002952	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482259
124	NC_002952	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
125	NC_002952	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
126	NC_002952	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482259
127	NC_002952	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482259
128	NC_002952	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
129	NC_002952	TGA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
130	NC_002952	AAG	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482259
131	NC_002952	CAT	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482259
132	NC_002952	TGA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
133	NC_002952	TAG	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482259
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260	NC_002952	TCA	2	6	17877	17882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482266
261	NC_002952	TAT	2	6	18003	18008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482266
262	NC_002952	ATT	2	6	18017	18022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482266
263	NC_002952	TAT	2	6	18036	18041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482266
264	NC_002952	ACG	2	6	18212	18217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482266
265	NC_002952	ACT	2	6	18229	18234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482266
266	NC_002952	AAT	2	6	18278	18283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482266
267	NC_002952	AAT	2	6	18306	18311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482267
268	NC_002952	TCA	2	6	18353	18358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482267
269	NC_002952	ATC	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482267
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272	NC_002952	ATA	2	6	18536	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482267
273	NC_002952	ATT	2	6	18840	18845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482267
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279	NC_002952	ACG	2	6	19452	19457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482267
280	NC_002952	TGA	2	6	19460	19465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482267
281	NC_002952	TTA	2	6	19502	19507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482267
282	NC_002952	GAT	2	6	19513	19518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482267
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285	NC_002952	GTT	2	6	19621	19626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482267
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291	NC_002952	TAT	2	6	19788	19793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482267
292	NC_002952	GAT	2	6	19903	19908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482267
293	NC_002952	ATC	2	6	20003	20008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482267
294	NC_002952	AGC	2	6	20025	20030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482267
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