MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002951	ATAAAT	2	12	3319	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002951	TTTAAA	2	12	3496	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002951	TAAATC	2	12	17189	17200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_002951	AAAAAT	2	12	38302	38313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002951	ATTTGG	2	12	46087	46098	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002951	TTTATC	2	12	65355	65366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002951	ATTTAT	2	12	71019	71030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002951	AACAAA	2	12	89355	89366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002951	AATATA	2	12	97820	97831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002951	AATGAA	2	12	97832	97843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002951	TAACAA	2	12	110329	110340	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002951	ATTAAG	2	12	133158	133169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002951	AATGTA	2	12	134325	134336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002951	CTGTAA	2	12	136148	136159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_002951	GTTTTT	2	12	147375	147386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002951	TAAAGC	2	12	148076	148087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002951	TTTTGA	2	12	148262	148273	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002951	TTTATA	2	12	196167	196178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002951	ATTAAT	2	12	196190	196201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002951	GGAATA	2	12	257902	257913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002951	ATATAG	2	12	279130	279141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002951	ATTTTC	2	12	284446	284457	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002951	ATAATT	2	12	285397	285408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002951	AACGAT	2	12	292714	292725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_002951	TAACTT	2	12	301634	301645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_002951	TAAAAA	2	12	354748	354759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002951	TTTATA	2	12	357319	357330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002951	GTAAGT	2	12	395676	395687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002951	TTGTAA	2	12	410653	410664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002951	AATGTA	2	12	448571	448582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002951	AATTTG	2	12	448678	448689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002951	TAAAGA	2	12	450651	450662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002951	TTGAAA	2	12	472044	472055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002951	TGTATA	2	12	483074	483085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002951	TTTTTA	2	12	493781	493792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002951	AAAATG	2	12	499214	499225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002951	ACGTTG	2	12	519661	519672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_002951	AAAATA	2	12	520385	520396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002951	TATGGT	2	12	528523	528534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002951	TTATAA	2	12	539699	539710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002951	AAATTT	2	12	546458	546469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002951	TTATAA	2	12	606120	606131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002951	GTTATA	2	12	606791	606802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002951	CTTAAA	2	12	615223	615234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_002951	ACATGT	2	12	625194	625205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002951	ATTGCG	2	12	654546	654557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002951	AATGAT	2	12	658464	658475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002951	TAGATG	2	12	658537	658548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002951	TAAAAT	2	12	673859	673870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002951	TTTTAA	2	12	685965	685976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002951	CATTAT	2	12	702276	702287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_002951	CATCAA	2	12	712940	712951	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002951	TAATTT	2	12	717180	717191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002951	TGAATA	2	12	733658	733669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002951	GGATTC	2	12	745009	745020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_002951	AAATAT	2	12	747801	747812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002951	TTAAAA	2	12	759873	759884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002951	TAGTTA	2	12	764308	764319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002951	ATTAAA	2	12	781094	781105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002951	TTTTTA	2	12	782582	782593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002951	TGAAAA	2	12	790824	790835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002951	AATGAT	2	12	819594	819605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002951	ACAAAA	2	12	859611	859622	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_002951	TAAAAA	2	12	878872	878883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002951	TATCAA	2	12	885372	885383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_002951	TTTTGA	2	12	889144	889155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002951	TCATTT	2	12	895137	895148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_002951	TAAAAA	2	12	898224	898235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002951	AAATTA	2	12	921184	921195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002951	AAGCAC	2	12	929915	929926	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002951	TTTTAA	2	12	942960	942971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002951	TTTAAT	2	12	1010312	1010323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002951	TTCCAG	2	12	1022690	1022701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002951	ACAATA	2	12	1027709	1027720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_002951	AACGGA	2	12	1042231	1042242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_002951	AAAAGC	2	12	1046831	1046842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_002951	CATTTA	2	12	1072152	1072163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_002951	ATCATA	2	12	1074047	1074058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_002951	TCAAAA	2	12	1080555	1080566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_002951	ATTGCA	2	12	1081635	1081646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002951	TTTTCT	2	12	1094363	1094374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_002951	TTTATA	2	12	1130439	1130450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002951	ATTTTT	2	12	1154389	1154400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002951	ATAATT	2	12	1155186	1155197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002951	TAATGA	2	12	1168225	1168236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002951	ATTTAT	2	12	1187463	1187474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002951	ATTATA	2	12	1191381	1191392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002951	AAATTT	2	12	1192190	1192201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002951	AAGTAA	2	12	1213894	1213905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002951	TCGTTT	2	12	1217021	1217032	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_002951	TTAATT	2	12	1227737	1227748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002951	AATTAA	2	12	1230473	1230484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002951	TGGCAA	2	12	1243068	1243079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_002951	TAAAGA	2	12	1243795	1243806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002951	GAAATT	2	12	1275381	1275392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002951	AATGAT	2	12	1288165	1288176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002951	TAAAGA	2	12	1302667	1302678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002951	TTTCAT	2	12	1318473	1318484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_002951	TATATT	2	12	1323132	1323143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002951	CATATT	2	12	1348201	1348212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_002951	ATGTAT	2	12	1348822	1348833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002951	AAAGAA	2	12	1349054	1349065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002951	TTAAAG	2	12	1352636	1352647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002951	AATTCA	2	12	1354098	1354109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_002951	TTAAAG	2	12	1354310	1354321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002951	ATATAA	2	12	1390898	1390909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002951	AAAATA	2	12	1404966	1404977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002951	GTTTTA	2	12	1420713	1420724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002951	TAAAAT	2	12	1436288	1436299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002951	TATCTT	2	12	1459124	1459135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_002951	TTGATT	2	12	1459187	1459198	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002951	ATTCTA	2	12	1466527	1466538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_002951	CTTGGT	2	12	1468867	1468878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_002951	AATAAA	2	12	1469381	1469392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002951	TATTCT	2	12	1517043	1517054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_002951	TACTTG	2	12	1527290	1527301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_002951	AAAAAT	2	12	1527306	1527317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002951	TTAATC	2	12	1540813	1540824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_002951	TATGAT	2	12	1580728	1580739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002951	ATAAAA	2	12	1589631	1589642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002951	ACAAGA	2	12	1595208	1595219	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_002951	TAAAAA	2	12	1621452	1621463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002951	TTATAG	2	12	1630585	1630596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002951	AATTTA	2	12	1638620	1638631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002951	AGCCAA	2	12	1666506	1666517	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002951	TTGACT	2	12	1666525	1666536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_002951	TTTAAC	2	12	1671408	1671419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_002951	TTATAA	2	12	1673890	1673901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002951	ACCTTT	2	12	1683847	1683858	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002951	TTTTAT	2	12	1686315	1686326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002951	AGTTTT	2	12	1711971	1711982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002951	AATTAA	2	12	1713216	1713227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002951	TAAAAC	2	12	1716356	1716367	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_002951	TTAAAT	2	12	1723675	1723686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002951	AATTTA	2	12	1726165	1726176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_002951	TAAAAA	2	12	1765014	1765025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_002951	TATAAT	2	12	1917320	1917331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002951	ATTCAA	2	12	1923313	1923324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.