MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	ATATT	2	10	106	115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002946	CCGTC	2	10	1361	1370	0 %	20 %	20 %	60 %	59800474
3	NC_002946	GCGCG	2	10	3109	3118	0 %	0 %	60 %	40 %	59800476
4	NC_002946	TGACG	2	10	5197	5206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002946	GAAAA	2	10	5432	5441	80 %	0 %	20 %	0 %	59800477
6	NC_002946	GGCGG	2	10	5704	5713	0 %	0 %	80 %	20 %	59800477
7	NC_002946	CGGCT	2	10	5777	5786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_002946	AACGG	2	10	6962	6971	40 %	0 %	40 %	20 %	59800478
9	NC_002946	CGGTT	2	10	7393	7402	0 %	40 %	40 %	20 %	59800478
10	NC_002946	ATTAT	2	10	11558	11567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002946	AAGGG	2	10	12034	12043	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002946	CGTGT	2	10	15223	15232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002946	TGTTT	2	10	16795	16804	0 %	80 %	20 %	0 %	59800489
14	NC_002946	CGGGT	2	10	18962	18971	0 %	20 %	60 %	20 %	59800490
15	NC_002946	GCCCC	2	10	19570	19579	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_002946	TTTGA	2	10	22303	22312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002946	TGCGG	2	10	25919	25928	0 %	20 %	60 %	20 %	59800497
18	NC_002946	TTCCG	2	10	28193	28202	0 %	40 %	20 %	40 %	59800501
19	NC_002946	CGACC	2	10	31549	31558	20 %	0 %	20 %	60 %	59800504
20	NC_002946	TGGTT	2	10	34603	34612	0 %	60 %	40 %	0 %	59800506
21	NC_002946	GCCGC	2	10	35295	35304	0 %	0 %	40 %	60 %	59800506
22	NC_002946	GTTTC	2	10	37719	37728	0 %	60 %	20 %	20 %	59800508
23	NC_002946	GCCCC	2	10	38867	38876	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_002946	TTTCC	2	10	39678	39687	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_002946	GATGC	2	10	41094	41103	20 %	20 %	40 %	20 %	59800511
26	NC_002946	CGGGC	2	10	42337	42346	0 %	0 %	60 %	40 %	59800512
27	NC_002946	CCGTG	2	10	43309	43318	0 %	20 %	40 %	40 %	59800514
28	NC_002946	TTTGG	2	10	45007	45016	0 %	60 %	40 %	0 %	59800515
29	NC_002946	TTTTC	2	10	52727	52736	0 %	80 %	0 %	20 %	59800520
30	NC_002946	TCAAA	2	10	53375	53384	60 %	20 %	0 %	20 %	59800520
31	NC_002946	GCCCG	2	10	55250	55259	0 %	0 %	40 %	60 %	59800520
32	NC_002946	TTGTT	2	10	55420	55429	0 %	80 %	20 %	0 %	59800520
33	NC_002946	GCCCG	2	10	56063	56072	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_002946	GCCGG	2	10	57938	57947	0 %	0 %	60 %	40 %	59800521
35	NC_002946	CGGCT	2	10	60694	60703	0 %	20 %	40 %	40 %	59800525
36	NC_002946	CGTTG	2	10	63402	63411	0 %	40 %	40 %	20 %	59800526
37	NC_002946	AAAAT	2	10	64814	64823	80 %	20 %	0 %	0 %	59800528
38	NC_002946	TGCCT	2	10	66050	66059	0 %	40 %	20 %	40 %	59800529
39	NC_002946	TTTGG	2	10	68202	68211	0 %	60 %	40 %	0 %	59800530
40	NC_002946	AACCG	2	10	68782	68791	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_002946	GAAGA	13	65	69754	69818	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002946	CCCAA	2	10	70419	70428	40 %	0 %	0 %	60 %	59800531
43	NC_002946	CGGGG	2	10	70648	70657	0 %	0 %	80 %	20 %	59800531
44	NC_002946	CGCGG	2	10	70956	70965	0 %	0 %	60 %	40 %	59800531
45	NC_002946	AACCG	2	10	74540	74549	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_002946	GAAGA	9	45	75510	75554	60 %	0 %	40 %	0 %	59800533
47	NC_002946	GCCCC	2	10	75707	75716	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_002946	CGGTT	2	10	75954	75963	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002946	AACCG	2	10	76359	76368	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002946	CGGTG	2	10	76999	77008	0 %	20 %	60 %	20 %	59800534
51	NC_002946	AAACC	2	10	78029	78038	60 %	0 %	0 %	40 %	59800535
52	NC_002946	CGATG	2	10	80174	80183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002946	CGGTT	2	10	80474	80483	0 %	40 %	40 %	20 %	59800537
54	NC_002946	AAATC	2	10	80584	80593	60 %	20 %	0 %	20 %	59800537
55	NC_002946	GGCAG	2	10	81187	81196	20 %	0 %	60 %	20 %	59800538
56	NC_002946	GGCGC	2	10	83312	83321	0 %	0 %	60 %	40 %	59800539
57	NC_002946	ATGTG	2	10	84598	84607	20 %	40 %	40 %	0 %	59800539
58	NC_002946	GGCGG	2	10	89564	89573	0 %	0 %	80 %	20 %	59800544
59	NC_002946	GCACG	2	10	95073	95082	20 %	0 %	40 %	40 %	59800548
60	NC_002946	GAAAT	2	10	95140	95149	60 %	20 %	20 %	0 %	59800548
61	NC_002946	GCGTT	2	10	98779	98788	0 %	40 %	40 %	20 %	59800551
62	NC_002946	GCCCC	2	10	100146	100155	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_002946	GGTTT	2	10	101584	101593	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002946	TTTGG	2	10	103995	104004	0 %	60 %	40 %	0 %	59800555
65	NC_002946	GTTTT	2	10	104718	104727	0 %	80 %	20 %	0 %	59800555
66	NC_002946	GTATT	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	59800555
67	NC_002946	TCGCG	2	10	106036	106045	0 %	20 %	40 %	40 %	59800556
68	NC_002946	CGGTT	2	10	110152	110161	0 %	40 %	40 %	20 %	59800560
69	NC_002946	GAAAG	2	10	110785	110794	60 %	0 %	40 %	0 %	59800560
70	NC_002946	GGCAG	2	10	114081	114090	20 %	0 %	60 %	20 %	59800563
71	NC_002946	GAATC	2	10	116182	116191	40 %	20 %	20 %	20 %	59800565
72	NC_002946	AAGGT	2	10	118274	118283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002946	TACCG	2	10	120897	120906	20 %	20 %	20 %	40 %	59800568
74	NC_002946	GAATG	2	10	122173	122182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002946	AAAAT	2	10	122238	122247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002946	GGTGT	2	10	122811	122820	0 %	40 %	60 %	0 %	59800571
77	NC_002946	CGATG	2	10	123819	123828	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_002946	GAGGG	2	10	124231	124240	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002946	CGGCA	2	10	124896	124905	20 %	0 %	40 %	40 %	59800572
80	NC_002946	CCGCC	2	10	127371	127380	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
81	NC_002946	CAGCG	2	10	127697	127706	20 %	0 %	40 %	40 %	59800574
82	NC_002946	GCGTG	2	10	128117	128126	0 %	20 %	60 %	20 %	59800575
83	NC_002946	CGGTA	2	10	128166	128175	20 %	20 %	40 %	20 %	59800575
84	NC_002946	GGCGT	2	10	129482	129491	0 %	20 %	60 %	20 %	59800577
85	NC_002946	GCGCG	2	10	130072	130081	0 %	0 %	60 %	40 %	59800577
86	NC_002946	ACCGC	2	10	132725	132734	20 %	0 %	20 %	60 %	59800581
87	NC_002946	GACGG	2	10	136724	136733	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002946	CTGGG	2	10	136999	137008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002946	CGTAT	2	10	137559	137568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_002946	CTCAA	2	10	137925	137934	40 %	20 %	0 %	40 %	59800586
91	NC_002946	CCGCC	2	10	138199	138208	0 %	0 %	20 %	80 %	59800586
92	NC_002946	ACGGC	2	10	138250	138259	20 %	0 %	40 %	40 %	59800586
93	NC_002946	CCGAC	2	10	138508	138517	20 %	0 %	20 %	60 %	59800586
94	NC_002946	TGGTT	2	10	138766	138775	0 %	60 %	40 %	0 %	59800586
95	NC_002946	CCTGC	2	10	141080	141089	0 %	20 %	20 %	60 %	59800590
96	NC_002946	CAATA	2	10	144168	144177	60 %	20 %	0 %	20 %	59800594
97	NC_002946	CAAGC	2	10	145447	145456	40 %	0 %	20 %	40 %	59800594
98	NC_002946	CCGAA	2	10	146961	146970	40 %	0 %	20 %	40 %	59800596
99	NC_002946	GCGGG	2	10	147111	147120	0 %	0 %	80 %	20 %	59800596
100	NC_002946	ACCGT	2	10	151988	151997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002946	GGCAG	2	10	153105	153114	20 %	0 %	60 %	20 %	59800603
102	NC_002946	CGGGG	2	10	155419	155428	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002946	CGGAA	2	10	156769	156778	40 %	0 %	40 %	20 %	59800605
104	NC_002946	CGGCG	2	10	157265	157274	0 %	0 %	60 %	40 %	59800605
105	NC_002946	AGGCG	2	10	159882	159891	20 %	0 %	60 %	20 %	59800609
106	NC_002946	GCGCG	2	10	160020	160029	0 %	0 %	60 %	40 %	59800609
107	NC_002946	GAAAA	2	10	161350	161359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002946	ACAAA	2	10	162253	162262	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002946	AAATT	2	10	162619	162628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002946	ATTTT	2	10	162758	162767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002946	CAAAC	2	10	164136	164145	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002946	CGGCG	2	10	164351	164360	0 %	0 %	60 %	40 %	59800615
113	NC_002946	GATGT	2	10	164556	164565	20 %	40 %	40 %	0 %	59800615
114	NC_002946	CCGCA	2	10	166665	166674	20 %	0 %	20 %	60 %	59800615
115	NC_002946	GCCGG	2	10	167026	167035	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_002946	CGCGG	2	10	167077	167086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_002946	CAAAC	2	10	167634	167643	60 %	0 %	0 %	40 %	59800616
118	NC_002946	CCTTA	2	10	168345	168354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_002946	TTTTC	2	10	169455	169464	0 %	80 %	0 %	20 %	59800620
120	NC_002946	CGGCT	2	10	171426	171435	0 %	20 %	40 %	40 %	59800624
121	NC_002946	ATAAC	2	10	172139	172148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002946	TTGCC	2	10	174080	174089	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_002946	CGTGT	2	10	176859	176868	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002946	GCAGT	2	10	177754	177763	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_002946	TGGTG	2	10	178359	178368	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002946	GCGTG	2	10	180778	180787	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002946	TTGCC	2	10	181106	181115	0 %	40 %	20 %	40 %	59800633
128	NC_002946	GTCCA	2	10	181367	181376	20 %	20 %	20 %	40 %	59800633
129	NC_002946	GAAGG	2	10	182023	182032	40 %	0 %	60 %	0 %	59800633
130	NC_002946	GCAGG	2	10	182671	182680	20 %	0 %	60 %	20 %	59800633
131	NC_002946	TGCCG	2	10	183998	184007	0 %	20 %	40 %	40 %	59800636
132	NC_002946	ATGCC	2	10	184132	184141	20 %	20 %	20 %	40 %	59800636
133	NC_002946	ACCGC	2	10	185313	185322	20 %	0 %	20 %	60 %	59800638
134	NC_002946	AGCGG	2	10	185680	185689	20 %	0 %	60 %	20 %	59800639
135	NC_002946	CGGCG	2	10	189200	189209	0 %	0 %	60 %	40 %	59800642
136	NC_002946	GGTAA	2	10	189664	189673	40 %	20 %	40 %	0 %	59800643
137	NC_002946	TTTCT	2	10	191370	191379	0 %	80 %	0 %	20 %	59800644
138	NC_002946	TTTTC	2	10	193286	193295	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002946	CCGTA	2	10	194727	194736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_002946	CCGTA	2	10	194886	194895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002946	CCGTA	2	10	195045	195054	20 %	20 %	20 %	40 %	59800648
142	NC_002946	TTTTA	2	10	199956	199965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002946	TCCAA	2	10	204144	204153	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_002946	ATTTT	2	10	204393	204402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002946	GCCGG	2	10	204689	204698	0 %	0 %	60 %	40 %	59800654
146	NC_002946	CGCGG	2	10	204740	204749	0 %	0 %	60 %	40 %	59800654
147	NC_002946	GGCAT	2	10	205997	206006	20 %	20 %	40 %	20 %	59800655
148	NC_002946	GCACG	2	10	208260	208269	20 %	0 %	40 %	40 %	59800658
149	NC_002946	AACGG	2	10	208806	208815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_002946	GCCTT	2	10	209014	209023	0 %	40 %	20 %	40 %	59800659
151	NC_002946	AGATG	2	10	210201	210210	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002946	TTCTT	2	10	210984	210993	0 %	80 %	0 %	20 %	59800660
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156	NC_002946	CGTCG	2	10	215030	215039	0 %	20 %	40 %	40 %	59800665
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158	NC_002946	GGCGT	2	10	221283	221292	0 %	20 %	60 %	20 %	59800670
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160	NC_002946	GTGTA	2	10	221782	221791	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_002946	CGCGC	2	10	224111	224120	0 %	0 %	40 %	60 %	59800673
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164	NC_002946	GGCGG	2	10	235160	235169	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
165	NC_002946	GGTCG	2	10	235432	235441	0 %	20 %	60 %	20 %	59800687
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177	NC_002946	TTATT	2	10	248465	248474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_002946	GGTAT	2	10	248715	248724	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_002946	TCCGA	2	10	249071	249080	20 %	20 %	20 %	40 %	59800701
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181	NC_002946	TGATT	2	10	250561	250570	20 %	60 %	20 %	0 %	59800702
182	NC_002946	GGCGC	2	10	251269	251278	0 %	0 %	60 %	40 %	59800703
183	NC_002946	TTTAT	2	10	251305	251314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_002946	GCCCC	2	10	252869	252878	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
185	NC_002946	CCGAC	2	10	253354	253363	20 %	0 %	20 %	60 %	59800706
186	NC_002946	CGATT	2	10	256113	256122	20 %	40 %	20 %	20 %	59800710
187	NC_002946	GTGCC	2	10	256581	256590	0 %	20 %	40 %	40 %	59800710
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189	NC_002946	CCGAA	2	10	257951	257960	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_002946	CCGAT	2	10	258292	258301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
191	NC_002946	TACGG	2	10	258428	258437	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_002946	AACCG	2	10	259261	259270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_002946	TTTTG	2	10	261402	261411	0 %	80 %	20 %	0 %	59800713
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197	NC_002946	TGCGG	2	10	264973	264982	0 %	20 %	60 %	20 %	59800716
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204	NC_002946	ATTTT	2	10	272267	272276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_002946	CGTTT	2	10	281493	281502	0 %	60 %	20 %	20 %	59800728
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221	NC_002946	TTGCG	2	10	288843	288852	0 %	40 %	40 %	20 %	59800736
222	NC_002946	GCTTG	2	10	289312	289321	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
223	NC_002946	TGGAT	2	10	292051	292060	20 %	40 %	40 %	0 %	59800739
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239	NC_002946	GTTTT	2	10	306283	306292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_002946	GAATG	2	10	306920	306929	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
241	NC_002946	GGTAT	2	10	307197	307206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
242	NC_002946	CAGGG	2	10	310782	310791	20 %	0 %	60 %	20 %	59800759
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244	NC_002946	ACGCA	2	10	314481	314490	40 %	0 %	20 %	40 %	59800763
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248	NC_002946	GCCTT	2	10	317049	317058	0 %	40 %	20 %	40 %	59800765
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252	NC_002946	ATATT	2	10	321399	321408	40 %	60 %	0 %	0 %	59800769
253	NC_002946	AAAAT	2	10	321948	321957	80 %	20 %	0 %	0 %	59800770
254	NC_002946	CGTAA	2	10	322869	322878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
255	NC_002946	GTGTC	2	10	323267	323276	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_002946	GACCT	2	10	323638	323647	20 %	20 %	20 %	40 %	59800772
257	NC_002946	CGATT	2	10	323901	323910	20 %	40 %	20 %	20 %	59800773
258	NC_002946	ATCGG	2	10	324673	324682	20 %	20 %	40 %	20 %	59800773
259	NC_002946	TGTTC	2	10	324695	324704	0 %	60 %	20 %	20 %	59800773
260	NC_002946	GGCAG	2	10	326306	326315	20 %	0 %	60 %	20 %	59800775
261	NC_002946	GGATT	2	10	326378	326387	20 %	40 %	40 %	0 %	59800775
262	NC_002946	ATCAA	2	10	326709	326718	60 %	20 %	0 %	20 %	59800776
263	NC_002946	ATCAT	2	10	327517	327526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_002946	CAAGG	2	10	328252	328261	40 %	0 %	40 %	20 %	59800778
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271	NC_002946	GCGGA	2	10	337005	337014	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
272	NC_002946	ATGGG	2	10	337161	337170	20 %	20 %	60 %	0 %	59800786
273	NC_002946	TGCCG	2	10	337548	337557	0 %	20 %	40 %	40 %	59800787
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275	NC_002946	AATCA	2	10	339055	339064	60 %	20 %	0 %	20 %	59800788
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278	NC_002946	TTTTC	2	10	346585	346594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_002946	ACAAA	2	10	348391	348400	80 %	0 %	0 %	20 %	59800801
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394	NC_002946	CGGAC	2	10	496915	496924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
395	NC_002946	GCCGG	2	10	501019	501028	0 %	0 %	60 %	40 %	59800966
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397	NC_002946	GTACG	2	10	502063	502072	20 %	20 %	40 %	20 %	59800967
398	NC_002946	ACGGC	2	10	503713	503722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
399	NC_002946	TGCCG	2	10	505207	505216	0 %	20 %	40 %	40 %	59800968
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405	NC_002946	GCCCC	2	10	510519	510528	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
406	NC_002946	CTGTC	2	10	514229	514238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
407	NC_002946	GTATC	2	10	514888	514897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_002946	GGGAA	2	10	518758	518767	40 %	0 %	60 %	0 %	59800979
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443	NC_002946	ATTTT	2	10	560615	560624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_002946	ATTTT	2	10	561315	561324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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