MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	CGTCGG	2	12	66726	66737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002945	CAACGG	2	12	76248	76259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002945	TCACCT	2	12	80432	80443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002945	CTCGGT	2	12	149412	149423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002945	GCCGCG	2	12	181122	181133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002945	ACAGCC	2	12	218672	218683	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002945	AGATTC	2	12	328688	328699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_002945	GGTCGC	2	12	343063	343074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002945	CCGATA	2	12	477498	477509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002945	ATAGTC	2	12	543991	544002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_002945	ACCAGT	2	12	592150	592161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002945	CGCCGT	2	12	721171	721182	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002945	CGCGGG	2	12	831644	831655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002945	CCGGCG	2	12	865348	865359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002945	ACCGGG	2	12	872069	872080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002945	GCGGCC	2	12	908958	908969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002945	ACAGCA	2	12	910331	910342	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002945	CTGGGT	2	12	925170	925181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_002945	CAGTCG	2	12	932827	932838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002945	TCGGGT	2	12	966039	966050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002945	CAACGG	2	12	1029824	1029835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002945	GATCGA	2	12	1029875	1029886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002945	GACTGC	2	12	1034278	1034289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002945	CGCCGG	2	12	1053144	1053155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002945	GGCGCA	2	12	1094914	1094925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002945	TTGGTG	2	12	1152233	1152244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002945	TTCCGT	2	12	1162926	1162937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002945	TAGCCA	2	12	1197609	1197620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002945	AGTTAC	2	12	1223316	1223327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_002945	AGGACG	2	12	1284308	1284319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_002945	AGGCCA	2	12	1342542	1342553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002945	TCGACA	2	12	1369988	1369999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002945	CCGAGT	2	12	1417968	1417979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002945	CACGCG	2	12	1523040	1523051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002945	ATATTC	2	12	1558069	1558080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_002945	GCCCCT	2	12	1631229	1631240	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002945	GCCCCT	2	12	1634993	1635004	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_002945	CGAGTG	2	12	1775473	1775484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_002945	GGCGCC	2	12	1821698	1821709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002945	CCGCGG	2	12	1885443	1885454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002945	TAGCGG	2	12	1912494	1912505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002945	ACCGCA	2	12	1914430	1914441	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002945	GGTGAT	2	12	2032198	2032209	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002945	TTCGGC	2	12	2046107	2046118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002945	AGAGGG	2	12	2066185	2066196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002945	ACCGTG	2	12	2132520	2132531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002945	GCTGGG	2	12	2135151	2135162	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002945	CGCGAG	2	12	2168164	2168175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002945	CGGTTG	2	12	2209860	2209871	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002945	GCCGCA	2	12	2212765	2212776	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002945	CGGCTC	2	12	2242078	2242089	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002945	CCCTGA	2	12	2305286	2305297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002945	TGCACT	2	12	2320473	2320484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002945	ATAGAA	2	12	2347486	2347497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002945	CTCAAC	2	12	2390094	2390105	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002945	CCGCTG	2	12	2410575	2410586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002945	CACCGC	2	12	2419032	2419043	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_002945	GCGTCG	2	12	2471517	2471528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002945	CACGAC	2	12	2489688	2489699	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002945	CACGTG	2	12	2683546	2683557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002945	GAGGTC	2	12	2687158	2687169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_002945	CCGGCA	2	12	2701187	2701198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002945	CGCCAC	2	12	2759373	2759384	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_002945	TCAAAC	2	12	2761126	2761137	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002945	GCACCC	2	12	2789191	2789202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_002945	CGACGG	2	12	2838128	2838139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002945	GCCCGA	2	12	2845222	2845233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002945	GTATTG	2	12	2883655	2883666	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002945	CCGTTG	2	12	2893600	2893611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002945	GGCGCC	2	12	2913297	2913308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002945	GTTCGG	2	12	2927515	2927526	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_002945	CATATT	2	12	2971715	2971726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_002945	CCGGCA	2	12	3035730	3035741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002945	CGTTGC	2	12	3056719	3056730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002945	GACATC	2	12	3078613	3078624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002945	ACGGCG	2	12	3079790	3079801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002945	CATCAC	2	12	3141298	3141309	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002945	TCGCCG	2	12	3248005	3248016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002945	TCGCCG	2	12	3248062	3248073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002945	TCGCCG	2	12	3248119	3248130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002945	TCGCCG	2	12	3248176	3248187	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002945	CGCCAC	2	12	3264198	3264209	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_002945	CGCCGG	2	12	3267572	3267583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002945	GGCCGG	2	12	3269898	3269909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002945	CGTAGG	2	12	3337717	3337728	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_002945	CGTGAC	2	12	3349467	3349478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002945	CGATGC	2	12	3371655	3371666	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002945	TGTACA	2	12	3386901	3386912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_002945	ACCAAC	2	12	3392250	3392261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002945	CCGTTG	2	12	3413948	3413959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002945	GCTCCT	2	12	3441550	3441561	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002945	CTGTCA	2	12	3456263	3456274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002945	GTCGAC	2	12	3458150	3458161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002945	TCCGCT	2	12	3504261	3504272	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002945	GCCTCC	2	12	3594844	3594855	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_002945	TGTCGA	2	12	3655015	3655026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_002945	GCGCCG	2	12	3690689	3690700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002945	GCTGCC	2	12	3691621	3691632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002945	TGCCGC	2	12	3691752	3691763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002945	CGTTGC	2	12	3691875	3691886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002945	CGCCAC	2	12	3692001	3692012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_002945	CCCGAA	2	12	3698796	3698807	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002945	AGGTTG	2	12	3698926	3698937	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002945	CGTTGC	2	12	3698957	3698968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002945	TGCCGG	2	12	3700382	3700393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002945	CGCAGC	2	12	3708919	3708930	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002945	TGCCGG	2	12	3710903	3710914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002945	GCCCAC	2	12	3710934	3710945	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_002945	TGCCGG	2	12	3712568	3712579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002945	CCCGAT	2	12	3712650	3712661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002945	TGCCGG	2	12	3712664	3712675	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002945	GCAGCG	2	12	3713347	3713358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002945	TCCCGG	2	12	3714319	3714330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002945	CCCGAT	2	12	3714431	3714442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002945	TGCCGG	2	12	3714445	3714456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002945	GCTGCC	2	12	3714503	3714514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002945	GGGGAT	2	12	3715655	3715666	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002945	TGCCGG	2	12	3716116	3716127	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002945	TGCCGG	2	12	3716146	3716157	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002945	CCCGAT	2	12	3716228	3716239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002945	GCCCAG	2	12	3716429	3716440	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002945	CGGGAT	2	12	3716885	3716896	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_002945	CCCGAT	2	12	3717989	3718000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002945	GCCCAG	2	12	3718190	3718201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002945	CAACGG	2	12	3718757	3718768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002945	GCGCAG	2	12	3731943	3731954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002945	TGTACA	2	12	3751396	3751407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_002945	TCCTCT	2	12	3827777	3827788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002945	TCGGAG	2	12	3851341	3851352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_002945	CCGCTC	2	12	3855370	3855381	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_002945	CGTTGG	2	12	3868010	3868021	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_002945	CGGCCG	2	12	3872150	3872161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002945	CGGCGA	2	12	3951862	3951873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002945	CGAACA	2	12	3959646	3959657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002945	GGCGAG	2	12	4048134	4048145	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_002945	GCGCCG	2	12	4088424	4088435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002945	CCGACG	2	12	4126924	4126935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002945	TGGCGG	2	12	4135422	4135433	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_002945	CTCATC	2	12	4202942	4202953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002945	GGGTTG	2	12	4260207	4260218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.