MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 3433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	31791178
2	NC_002945	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	31791179
3	NC_002945	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	31791179
4	NC_002945	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	31791181
5	NC_002945	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	31791182
6	NC_002945	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	31791183
7	NC_002945	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	31791183
8	NC_002945	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	31791183
9	NC_002945	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	31791184
10	NC_002945	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	31791184
11	NC_002945	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_002945	CGACC	2	10	13671	13680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_002945	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	31791189
14	NC_002945	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	31791189
15	NC_002945	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	31791190
16	NC_002945	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	31791191
17	NC_002945	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	31791191
18	NC_002945	ATCGG	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	31791191
19	NC_002945	CGGCC	2	10	17885	17894	0 %	0 %	40 %	60 %	31791192
20	NC_002945	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	31791193
21	NC_002945	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	31791193
22	NC_002945	GTCGT	2	10	21627	21636	0 %	40 %	40 %	20 %	31791194
23	NC_002945	ATCAC	2	10	23900	23909	40 %	20 %	0 %	40 %	31791197
24	NC_002945	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	31791197
25	NC_002945	CGAGC	2	10	26949	26958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002945	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	31791202
27	NC_002945	CGATC	2	10	30107	30116	20 %	20 %	20 %	40 %	31791203
28	NC_002945	CGACG	2	10	32294	32303	20 %	0 %	40 %	40 %	31791206
29	NC_002945	GCGTC	2	10	32349	32358	0 %	20 %	40 %	40 %	31791206
30	NC_002945	GACAC	2	10	32446	32455	40 %	0 %	20 %	40 %	31791206
31	NC_002945	CCGCC	2	10	33792	33801	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_002945	TCCTG	2	10	37451	37460	0 %	40 %	20 %	40 %	31791212
33	NC_002945	CTCGG	2	10	37544	37553	0 %	20 %	40 %	40 %	31791212
34	NC_002945	GGCGC	2	10	38087	38096	0 %	0 %	60 %	40 %	31791212
35	NC_002945	TGGCC	2	10	38235	38244	0 %	20 %	40 %	40 %	31791212
36	NC_002945	CGGCG	2	10	38767	38776	0 %	0 %	60 %	40 %	31791212
37	NC_002945	GTCCA	2	10	39379	39388	20 %	20 %	20 %	40 %	31791213
38	NC_002945	GCCAA	2	10	41513	41522	40 %	0 %	20 %	40 %	31791215
39	NC_002945	GCGTC	2	10	41928	41937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002945	GCACA	2	10	42312	42321	40 %	0 %	20 %	40 %	31791216
41	NC_002945	GGTAC	2	10	44846	44855	20 %	20 %	40 %	20 %	31791218
42	NC_002945	TCGAA	2	10	45078	45087	40 %	20 %	20 %	20 %	31791218
43	NC_002945	GCACC	2	10	46008	46017	20 %	0 %	20 %	60 %	31791218
44	NC_002945	CGGTG	2	10	47042	47051	0 %	20 %	60 %	20 %	31791219
45	NC_002945	TCATG	2	10	47188	47197	20 %	40 %	20 %	20 %	31791219
46	NC_002945	ATCGG	2	10	47335	47344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002945	GCAGC	2	10	48582	48591	20 %	0 %	40 %	40 %	31791221
48	NC_002945	CCCGA	2	10	48665	48674	20 %	0 %	20 %	60 %	31791221
49	NC_002945	CAGCG	2	10	49790	49799	20 %	0 %	40 %	40 %	31791222
50	NC_002945	CTCCC	2	10	56230	56239	0 %	20 %	0 %	80 %	31791228
51	NC_002945	CGGCG	2	10	56679	56688	0 %	0 %	60 %	40 %	31791228
52	NC_002945	CGACC	2	10	58211	58220	20 %	0 %	20 %	60 %	31791230
53	NC_002945	CTTCG	2	10	58898	58907	0 %	40 %	20 %	40 %	31791231
54	NC_002945	CGGTG	2	10	59954	59963	0 %	20 %	60 %	20 %	31791234
55	NC_002945	TCAGG	2	10	62440	62449	20 %	20 %	40 %	20 %	31791235
56	NC_002945	TGCCG	2	10	65471	65480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_002945	GGCGA	2	10	66403	66412	20 %	0 %	60 %	20 %	31791239
58	NC_002945	GGTGT	2	10	68979	68988	0 %	40 %	60 %	0 %	31791241
59	NC_002945	ATCGG	2	10	69616	69625	20 %	20 %	40 %	20 %	31791241
60	NC_002945	CCGCG	2	10	70153	70162	0 %	0 %	40 %	60 %	31791241
61	NC_002945	GGCAA	2	10	70504	70513	40 %	0 %	40 %	20 %	31791241
62	NC_002945	CGACC	2	10	70793	70802	20 %	0 %	20 %	60 %	31791241
63	NC_002945	CGGGT	2	10	71247	71256	0 %	20 %	60 %	20 %	31791241
64	NC_002945	GGTCG	2	10	71307	71316	0 %	20 %	60 %	20 %	31791241
65	NC_002945	TGCCT	2	10	72048	72057	0 %	40 %	20 %	40 %	31791242
66	NC_002945	GTCCA	2	10	72919	72928	20 %	20 %	20 %	40 %	31791243
67	NC_002945	TGACC	2	10	75543	75552	20 %	20 %	20 %	40 %	31791245
68	NC_002945	GCCAA	2	10	75857	75866	40 %	0 %	20 %	40 %	31791245
69	NC_002945	GTCGC	2	10	75934	75943	0 %	20 %	40 %	40 %	31791245
70	NC_002945	GCGCG	2	10	77022	77031	0 %	0 %	60 %	40 %	31791246
71	NC_002945	CACGA	2	10	79888	79897	40 %	0 %	20 %	40 %	31791248
72	NC_002945	GCACC	2	10	80328	80337	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_002945	CCACC	2	10	80521	80530	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_002945	GAGCA	2	10	82426	82435	40 %	0 %	40 %	20 %	31791250
75	NC_002945	GCCGG	2	10	82524	82533	0 %	0 %	60 %	40 %	31791250
76	NC_002945	GCGAC	2	10	82600	82609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_002945	ATCCG	2	10	83370	83379	20 %	20 %	20 %	40 %	31791251
78	NC_002945	CACCG	2	10	84150	84159	20 %	0 %	20 %	60 %	31791252
79	NC_002945	TGGTC	2	10	86285	86294	0 %	40 %	40 %	20 %	31791254
80	NC_002945	GCTGG	2	10	86922	86931	0 %	20 %	60 %	20 %	31791255
81	NC_002945	TGGGT	2	10	89960	89969	0 %	40 %	60 %	0 %	31791260
82	NC_002945	TCGCC	2	10	90167	90176	0 %	20 %	20 %	60 %	31791260
83	NC_002945	GGGCC	2	10	91140	91149	0 %	0 %	60 %	40 %	31791261
84	NC_002945	GGCCG	2	10	92459	92468	0 %	0 %	60 %	40 %	31791262
85	NC_002945	GCGCC	2	10	93111	93120	0 %	0 %	40 %	60 %	31791262
86	NC_002945	GCTTG	2	10	95143	95152	0 %	40 %	40 %	20 %	31791264
87	NC_002945	CGTGT	2	10	95575	95584	0 %	40 %	40 %	20 %	31791265
88	NC_002945	AGATC	2	10	95654	95663	40 %	20 %	20 %	20 %	31791265
89	NC_002945	CGGCG	2	10	99235	99244	0 %	0 %	60 %	40 %	31791268
90	NC_002945	CGGCG	2	10	99362	99371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_002945	GCGGT	2	10	100311	100320	0 %	20 %	60 %	20 %	31791269
92	NC_002945	GGTGA	2	10	100529	100538	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002945	GCGCC	2	10	103143	103152	0 %	0 %	40 %	60 %	31791271
94	NC_002945	GGTGG	2	10	103831	103840	0 %	20 %	80 %	0 %	31791272
95	NC_002945	CTGGC	2	10	105567	105576	0 %	20 %	40 %	40 %	31791274
96	NC_002945	GCACA	2	10	106688	106697	40 %	0 %	20 %	40 %	31791274
97	NC_002945	CTGAA	2	10	109018	109027	40 %	20 %	20 %	20 %	31791277
98	NC_002945	ATCGC	2	10	109513	109522	20 %	20 %	20 %	40 %	31791277
99	NC_002945	TCTGA	2	10	110847	110856	20 %	40 %	20 %	20 %	31791279
100	NC_002945	CGGTC	2	10	111122	111131	0 %	20 %	40 %	40 %	31791279
101	NC_002945	GACCA	2	10	112260	112269	40 %	0 %	20 %	40 %	31791279
102	NC_002945	GGCTG	2	10	114824	114833	0 %	20 %	60 %	20 %	31791279
103	NC_002945	CCGCG	2	10	118744	118753	0 %	0 %	40 %	60 %	31791280
104	NC_002945	TCGTG	2	10	122697	122706	0 %	40 %	40 %	20 %	31791282
105	NC_002945	GCACG	2	10	124352	124361	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_002945	CCGGA	2	10	124478	124487	20 %	0 %	40 %	40 %	31791284
107	NC_002945	GGCCG	2	10	126839	126848	0 %	0 %	60 %	40 %	31791285
108	NC_002945	TGCGC	2	10	126951	126960	0 %	20 %	40 %	40 %	31791285
109	NC_002945	GCGAG	2	10	127462	127471	20 %	0 %	60 %	20 %	31791285
110	NC_002945	GGGGT	2	10	128471	128480	0 %	20 %	80 %	0 %	31791285
111	NC_002945	CCCAC	2	10	129033	129042	20 %	0 %	0 %	80 %	31791285
112	NC_002945	CCGGC	2	10	129543	129552	0 %	0 %	40 %	60 %	31791285
113	NC_002945	TGCGG	2	10	129953	129962	0 %	20 %	60 %	20 %	31791285
114	NC_002945	ATCAC	2	10	131432	131441	40 %	20 %	0 %	40 %	31791287
115	NC_002945	ATCGG	2	10	131480	131489	20 %	20 %	40 %	20 %	31791287
116	NC_002945	CGGGC	2	10	132571	132580	0 %	0 %	60 %	40 %	31791287
117	NC_002945	GCGAT	2	10	134376	134385	20 %	20 %	40 %	20 %	31791289
118	NC_002945	GTTCG	2	10	134597	134606	0 %	40 %	40 %	20 %	31791289
119	NC_002945	CCTGG	2	10	134989	134998	0 %	20 %	40 %	40 %	31791289
120	NC_002945	GGCCC	2	10	135095	135104	0 %	0 %	40 %	60 %	31791289
121	NC_002945	CGTTG	2	10	135607	135616	0 %	40 %	40 %	20 %	31791289
122	NC_002945	CGACC	2	10	135679	135688	20 %	0 %	20 %	60 %	31791289
123	NC_002945	GAGAT	2	10	138699	138708	40 %	20 %	40 %	0 %	31791293
124	NC_002945	CGGCG	2	10	140855	140864	0 %	0 %	60 %	40 %	31791294
125	NC_002945	TGCGG	2	10	141488	141497	0 %	20 %	60 %	20 %	31791295
126	NC_002945	CGCTG	2	10	142195	142204	0 %	20 %	40 %	40 %	31791296
127	NC_002945	GTTGC	2	10	142741	142750	0 %	40 %	40 %	20 %	31791296
128	NC_002945	CCGAT	2	10	143489	143498	20 %	20 %	20 %	40 %	31791296
129	NC_002945	ATCGC	2	10	144180	144189	20 %	20 %	20 %	40 %	31791297
130	NC_002945	AACCG	2	10	144919	144928	40 %	0 %	20 %	40 %	31791297
131	NC_002945	CCGCC	2	10	145506	145515	0 %	0 %	20 %	80 %	31791297
132	NC_002945	CCGCC	2	10	146149	146158	0 %	0 %	20 %	80 %	31791298
133	NC_002945	GGGTC	2	10	147901	147910	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_002945	ATCGG	2	10	149631	149640	20 %	20 %	40 %	20 %	31791303
135	NC_002945	ATTGG	2	10	152439	152448	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002945	AGCGA	2	10	154342	154351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002945	AGCGA	2	10	154395	154404	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_002945	TCGTC	2	10	154742	154751	0 %	40 %	20 %	40 %	31791306
139	NC_002945	CACGC	2	10	155206	155215	20 %	0 %	20 %	60 %	31791306
140	NC_002945	ATTCT	2	10	156050	156059	20 %	60 %	0 %	20 %	31791307
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142	NC_002945	TGACC	2	10	159582	159591	20 %	20 %	20 %	40 %	31791310
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148	NC_002945	GTCGC	2	10	161744	161753	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_002945	GCCGG	2	10	162043	162052	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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187	NC_002945	GCCGA	2	10	215120	215129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_002945	CCTCG	2	10	215556	215565	0 %	20 %	20 %	60 %	31791362
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196	NC_002945	GCGTC	2	10	222116	222125	0 %	20 %	40 %	40 %	31791368
197	NC_002945	CCGTG	2	10	222269	222278	0 %	20 %	40 %	40 %	31791368
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237	NC_002945	GCAGT	2	10	274327	274336	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_002945	TCGAC	2	10	303673	303682	20 %	20 %	20 %	40 %	31791430
252	NC_002945	TGGGG	2	10	306715	306724	0 %	20 %	80 %	0 %	31791434
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254	NC_002945	TGCCA	2	10	309128	309137	20 %	20 %	20 %	40 %	31791437
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259	NC_002945	AGCGG	2	10	312623	312632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_002945	CGCAG	2	10	312945	312954	20 %	0 %	40 %	40 %	31791440
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263	NC_002945	TCGGC	2	10	314786	314795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_002945	CCTGG	2	10	315334	315343	0 %	20 %	40 %	40 %	31791443
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267	NC_002945	GTTGG	2	10	320534	320543	0 %	40 %	60 %	0 %	31791445
268	NC_002945	AGCGC	2	10	328455	328464	20 %	0 %	40 %	40 %	31791451
269	NC_002945	GGGAC	2	10	329360	329369	20 %	0 %	60 %	20 %	31791453
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