MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 1087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002945	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002945	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_002945	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002945	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002945	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002945	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002945	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002945	CTAC	2	8	47203	47210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002945	CTGG	2	8	52700	52707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002945	GCCG	2	8	53554	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002945	CGGT	2	8	79197	79204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002945	CGTG	2	8	82586	82593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002945	CTGG	2	8	87235	87242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002945	CGCA	2	8	89536	89543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002945	CGCT	2	8	97666	97673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002945	CCTG	2	8	97713	97720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002945	GCGA	2	8	97757	97764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002945	ACCG	2	8	99480	99487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002945	ATCC	2	8	125616	125623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002945	GCGA	2	8	130704	130711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002945	CGGG	2	8	130747	130754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002945	GCTC	2	8	131259	131266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002945	CGGG	2	8	133971	133978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002945	TTCT	2	8	139889	139896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002945	ACGC	2	8	139961	139968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002945	GGGC	2	8	140053	140060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002945	AGCA	2	8	141133	141140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002945	GCCG	2	8	143939	143946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002945	GCGT	2	8	148481	148488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002945	GCGG	2	8	149547	149554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002945	GCCG	2	8	152427	152434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002945	CCGG	2	8	155793	155800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002945	GCGT	3	12	155821	155832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002945	GGCT	2	8	157967	157974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002945	CGCA	2	8	157993	158000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002945	TCGT	2	8	161684	161691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002945	CCGG	2	8	161692	161699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002945	CCCG	2	8	161904	161911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_002945	GCTG	2	8	162629	162636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002945	GTGC	2	8	162822	162829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002945	ACTT	2	8	171380	171387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002945	GCCG	2	8	181088	181095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002945	TTGA	2	8	186912	186919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002945	CTGG	2	8	196899	196906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002945	CTGT	2	8	212451	212458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002945	GGCC	2	8	218539	218546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002945	CGGT	2	8	218875	218882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002945	GATG	2	8	219622	219629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002945	AACT	2	8	230819	230826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002945	GGAA	2	8	230994	231001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002945	ACGT	2	8	231746	231753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002945	ACAT	2	8	231813	231820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002945	GTGC	2	8	241526	241533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002945	GAAC	2	8	249212	249219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002945	CGCA	2	8	253821	253828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002945	GACG	2	8	256230	256237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002945	GCGG	2	8	271239	271246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002945	CGGC	2	8	272605	272612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002945	TAGA	2	8	286714	286721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002945	ACTT	2	8	290419	290426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002945	TCGT	2	8	292047	292054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002945	AACT	2	8	294097	294104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002945	AACC	2	8	294105	294112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002945	ATGC	2	8	295095	295102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002945	GACG	2	8	300413	300420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002945	TTGC	2	8	308053	308060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002945	TCGG	2	8	308450	308457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002945	GCGG	2	8	331617	331624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002945	GGTA	2	8	334560	334567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002945	GCCG	2	8	334647	334654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002945	TGGC	2	8	334659	334666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002945	GCCG	2	8	337531	337538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002945	TGGC	2	8	337543	337550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002945	CTGT	2	8	365564	365571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002945	AATC	2	8	376788	376795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002945	GGCC	2	8	387148	387155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002945	AAGG	2	8	388164	388171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002945	TGAC	2	8	397133	397140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002945	GTCA	2	8	397144	397151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002945	ATCG	2	8	418113	418120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_002945	GCCA	2	8	418204	418211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002945	GTCC	2	8	418230	418237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002945	ACGG	2	8	418316	418323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002945	GAGC	2	8	425098	425105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002945	GAGC	2	8	425149	425156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002945	CACG	2	8	455407	455414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002945	TGCG	2	8	456519	456526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002945	GCTC	2	8	456899	456906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002945	GGAT	2	8	469192	469199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002945	CGAG	2	8	469335	469342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002945	GCAC	2	8	477415	477422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002945	CAAC	2	8	481284	481291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002945	AGAA	2	8	491791	491798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002945	GCGG	2	8	504167	504174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002945	ACCG	2	8	506047	506054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002945	CGGG	2	8	506084	506091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002945	GAGG	2	8	508040	508047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002945	GCGT	2	8	508126	508133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002945	ACGG	2	8	511376	511383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002945	GATG	2	8	516350	516357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002945	CTGA	2	8	516974	516981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002945	GCAA	2	8	519610	519617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002945	GCTG	2	8	522483	522490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002945	CCGT	2	8	529528	529535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002945	CGGC	2	8	534840	534847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002945	CGGC	2	8	539583	539590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002945	GACG	2	8	539593	539600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002945	CCGA	2	8	545845	545852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002945	AATC	2	8	546276	546283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002945	GTCT	2	8	546898	546905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002945	CGGC	2	8	560899	560906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002945	CCGG	2	8	561834	561841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002945	AGCA	2	8	565978	565985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002945	CGAC	2	8	566648	566655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002945	CGCC	2	8	578540	578547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_002945	GCAT	2	8	578623	578630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002945	GTTT	2	8	587487	587494	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002945	GCCG	2	8	592501	592508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002945	GCTA	2	8	597803	597810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002945	GCGT	2	8	605689	605696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002945	CCGA	2	8	605714	605721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002945	CCGA	2	8	609717	609724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002945	GTCC	2	8	612271	612278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002945	GCCC	2	8	626781	626788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_002945	CCGG	2	8	636786	636793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002945	TGCC	2	8	641223	641230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002945	CGCC	2	8	642167	642174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_002945	GCCG	2	8	652764	652771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002945	TGGC	2	8	656054	656061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002945	CCAG	2	8	658764	658771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002945	CGGT	2	8	659508	659515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002945	GTGC	2	8	662208	662215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002945	AAGG	2	8	662231	662238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002945	CGGC	2	8	664714	664721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002945	TTGC	2	8	666808	666815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002945	GTCG	2	8	666879	666886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002945	CGGC	2	8	669708	669715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002945	GTGG	2	8	669725	669732	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002945	GCCG	2	8	673215	673222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002945	CGAA	2	8	677318	677325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002945	CGGC	2	8	678343	678350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002945	CCGG	2	8	680349	680356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002945	TTCA	2	8	685635	685642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002945	TCCC	2	8	693225	693232	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_002945	CAAC	3	12	693957	693968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002945	TGCG	2	8	694362	694369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002945	TGAG	2	8	694471	694478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002945	CGGA	2	8	696867	696874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_002945	TCCG	2	8	698239	698246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_002945	CCCG	2	8	744304	744311	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
169	NC_002945	ACCC	2	8	744431	744438	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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172	NC_002945	TCGA	2	8	756282	756289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_002945	CGGC	2	8	757029	757036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_002945	CCGC	2	8	782459	782466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
184	NC_002945	AGCC	2	8	784186	784193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_002945	GCTG	2	8	791378	791385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_002945	CAGC	2	8	791539	791546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_002945	GGCG	2	8	796401	796408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
188	NC_002945	GTGG	2	8	800342	800349	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
189	NC_002945	CAGG	2	8	801341	801348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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194	NC_002945	CGGC	2	8	813068	813075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
195	NC_002945	CTGG	2	8	813146	813153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
196	NC_002945	GGGC	2	8	831527	831534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
197	NC_002945	GGCC	2	8	831674	831681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
198	NC_002945	GTGG	2	8	834199	834206	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_002945	GAGG	2	8	966228	966235	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
232	NC_002945	GCCG	2	8	976489	976496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
233	NC_002945	GGCA	2	8	978927	978934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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235	NC_002945	CTGG	2	8	983118	983125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_002945	CCAG	2	8	1127495	1127502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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292	NC_002945	GAGC	2	8	1179079	1179086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_002945	GCTG	2	8	1179223	1179230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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