MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 76074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
2	NC_002945	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791178
3	NC_002945	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
4	NC_002945	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
5	NC_002945	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791178
6	NC_002945	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
7	NC_002945	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
8	NC_002945	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
9	NC_002945	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
10	NC_002945	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
11	NC_002945	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
12	NC_002945	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791178
13	NC_002945	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
14	NC_002945	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791178
15	NC_002945	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
16	NC_002945	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791178
17	NC_002945	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791178
18	NC_002945	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
19	NC_002945	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
20	NC_002945	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
21	NC_002945	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
22	NC_002945	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791178
23	NC_002945	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
24	NC_002945	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
25	NC_002945	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
26	NC_002945	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
27	NC_002945	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
28	NC_002945	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
29	NC_002945	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
30	NC_002945	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31791179
31	NC_002945	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
32	NC_002945	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
33	NC_002945	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791179
34	NC_002945	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791179
35	NC_002945	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
36	NC_002945	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791179
37	NC_002945	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
38	NC_002945	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791179
39	NC_002945	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791179
40	NC_002945	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791179
41	NC_002945	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
42	NC_002945	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791179
43	NC_002945	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
44	NC_002945	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
45	NC_002945	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
46	NC_002945	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
47	NC_002945	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791180
48	NC_002945	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791180
49	NC_002945	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
50	NC_002945	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
51	NC_002945	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791180
52	NC_002945	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
53	NC_002945	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
54	NC_002945	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791180
55	NC_002945	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
56	NC_002945	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
57	NC_002945	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
58	NC_002945	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
59	NC_002945	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
60	NC_002945	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
61	NC_002945	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
62	NC_002945	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
63	NC_002945	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
64	NC_002945	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791180
65	NC_002945	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791180
66	NC_002945	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
67	NC_002945	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791181
68	NC_002945	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791181
69	NC_002945	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791181
70	NC_002945	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791181
71	NC_002945	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791181
72	NC_002945	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791181
73	NC_002945	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791181
74	NC_002945	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
75	NC_002945	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
76	NC_002945	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
77	NC_002945	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31791182
78	NC_002945	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
79	NC_002945	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
80	NC_002945	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
81	NC_002945	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
82	NC_002945	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
83	NC_002945	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
84	NC_002945	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
85	NC_002945	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
86	NC_002945	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
87	NC_002945	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
88	NC_002945	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791182
89	NC_002945	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
90	NC_002945	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
91	NC_002945	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
92	NC_002945	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
93	NC_002945	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
94	NC_002945	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
95	NC_002945	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
96	NC_002945	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791182
97	NC_002945	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791182
98	NC_002945	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
99	NC_002945	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
100	NC_002945	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
101	NC_002945	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791182
102	NC_002945	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
103	NC_002945	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
104	NC_002945	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791182
105	NC_002945	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791182
106	NC_002945	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
107	NC_002945	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791182
108	NC_002945	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
109	NC_002945	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791183
110	NC_002945	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
111	NC_002945	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
112	NC_002945	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791183
113	NC_002945	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791183
114	NC_002945	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791183
115	NC_002945	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791183
116	NC_002945	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
117	NC_002945	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
118	NC_002945	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791183
119	NC_002945	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791183
120	NC_002945	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791183
121	NC_002945	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
122	NC_002945	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
123	NC_002945	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791183
124	NC_002945	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791183
125	NC_002945	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791183
126	NC_002945	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791183
127	NC_002945	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791183
128	NC_002945	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791183
129	NC_002945	TAA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31791183
130	NC_002945	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791183
131	NC_002945	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791183
132	NC_002945	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791183
133	NC_002945	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791183
134	NC_002945	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791183
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137	NC_002945	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791183
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140	NC_002945	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791183
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259	NC_002945	CGA	2	6	17253	17258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791191
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500	NC_002945	CAC	2	6	32136	32141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791206

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