MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 11751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	CCGC	2	8	153	160	0 %	0 %	25 %	75 %	41406099
2	NC_002944	GCCG	2	8	339	346	0 %	0 %	50 %	50 %	41406099
3	NC_002944	ACGA	2	8	733	740	50 %	0 %	25 %	25 %	41406099
4	NC_002944	AAGG	2	8	841	848	50 %	0 %	50 %	0 %	41406099
5	NC_002944	GTGG	2	8	2180	2187	0 %	25 %	75 %	0 %	41406100
6	NC_002944	GCCG	2	8	2516	2523	0 %	0 %	50 %	50 %	41406100
7	NC_002944	CGGC	2	8	2560	2567	0 %	0 %	50 %	50 %	41406100
8	NC_002944	ACCG	2	8	2640	2647	25 %	0 %	25 %	50 %	41406100
9	NC_002944	GGGC	2	8	2785	2792	0 %	0 %	75 %	25 %	41406100
10	NC_002944	GCCA	2	8	4176	4183	25 %	0 %	25 %	50 %	41406101
11	NC_002944	GCCG	2	8	4562	4569	0 %	0 %	50 %	50 %	41406102
12	NC_002944	GGTC	2	8	4750	4757	0 %	25 %	50 %	25 %	41406102
13	NC_002944	GCGA	2	8	5370	5377	25 %	0 %	50 %	25 %	41406103
14	NC_002944	TCGT	2	8	6407	6414	0 %	50 %	25 %	25 %	41406103
15	NC_002944	GGGC	2	8	6568	6575	0 %	0 %	75 %	25 %	41406103
16	NC_002944	CGGC	2	8	6648	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	41406103
17	NC_002944	GGCC	2	8	7039	7046	0 %	0 %	50 %	50 %	41406103
18	NC_002944	TGAC	2	8	7304	7311	25 %	25 %	25 %	25 %	41406104
19	NC_002944	CGGT	2	8	7528	7535	0 %	25 %	50 %	25 %	41406104
20	NC_002944	GCCG	2	8	7674	7681	0 %	0 %	50 %	50 %	41406104
21	NC_002944	TCGC	2	8	8837	8844	0 %	25 %	25 %	50 %	41406104
22	NC_002944	GACC	2	8	8895	8902	25 %	0 %	25 %	50 %	41406104
23	NC_002944	CCGC	2	8	9074	9081	0 %	0 %	25 %	75 %	41406104
24	NC_002944	CGAC	2	8	9359	9366	25 %	0 %	25 %	50 %	41406104
25	NC_002944	ACCT	2	8	9466	9473	25 %	25 %	0 %	50 %	41406104
26	NC_002944	TCGC	2	8	9749	9756	0 %	25 %	25 %	50 %	41406104
27	NC_002944	GCCG	2	8	10293	10300	0 %	0 %	50 %	50 %	41406105
28	NC_002944	CCCG	2	8	11173	11180	0 %	0 %	25 %	75 %	41406106
29	NC_002944	GCGG	2	8	11506	11513	0 %	0 %	75 %	25 %	41406106
30	NC_002944	ACCA	2	8	11702	11709	50 %	0 %	0 %	50 %	41406106
31	NC_002944	CGGC	2	8	12651	12658	0 %	0 %	50 %	50 %	41406107
32	NC_002944	CCGG	2	8	12706	12713	0 %	0 %	50 %	50 %	41406107
33	NC_002944	CGAC	2	8	13062	13069	25 %	0 %	25 %	50 %	41406107
34	NC_002944	GCCA	2	8	14525	14532	25 %	0 %	25 %	50 %	41406110
35	NC_002944	CTGC	2	8	15263	15270	0 %	25 %	25 %	50 %	41406112
36	NC_002944	CACG	2	8	15293	15300	25 %	0 %	25 %	50 %	41406112
37	NC_002944	GCCC	2	8	15751	15758	0 %	0 %	25 %	75 %	41406112
38	NC_002944	GCCG	2	8	16957	16964	0 %	0 %	50 %	50 %	41406114
39	NC_002944	CGGG	2	8	17364	17371	0 %	0 %	75 %	25 %	41406114
40	NC_002944	CGGG	2	8	18568	18575	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
41	NC_002944	GGCG	2	8	18684	18691	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
42	NC_002944	GGGC	2	8	18846	18853	0 %	0 %	75 %	25 %	41406115
43	NC_002944	GGCC	2	8	18867	18874	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
44	NC_002944	CGCC	2	8	18957	18964	0 %	0 %	25 %	75 %	41406115
45	NC_002944	GCCG	2	8	19495	19502	0 %	0 %	50 %	50 %	41406116
46	NC_002944	CGGG	2	8	20643	20650	0 %	0 %	75 %	25 %	41406117
47	NC_002944	ACGG	2	8	21371	21378	25 %	0 %	50 %	25 %	41406118
48	NC_002944	GTCG	2	8	21684	21691	0 %	25 %	50 %	25 %	41406118
49	NC_002944	CCGA	2	8	22000	22007	25 %	0 %	25 %	50 %	41406118
50	NC_002944	GGCC	2	8	23272	23279	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
51	NC_002944	CGGC	2	8	23336	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
52	NC_002944	GCGG	2	8	24555	24562	0 %	0 %	75 %	25 %	41406120
53	NC_002944	CGGC	2	8	25230	25237	0 %	0 %	50 %	50 %	41406121
54	NC_002944	GTAG	2	8	25330	25337	25 %	25 %	50 %	0 %	41406121
55	NC_002944	CGGG	2	8	25464	25471	0 %	0 %	75 %	25 %	41406121
56	NC_002944	CGGG	2	8	25489	25496	0 %	0 %	75 %	25 %	41406121
57	NC_002944	GGGT	2	8	25864	25871	0 %	25 %	75 %	0 %	41406121
58	NC_002944	GTCA	2	8	26026	26033	25 %	25 %	25 %	25 %	41406121
59	NC_002944	CGGG	2	8	26101	26108	0 %	0 %	75 %	25 %	41406121
60	NC_002944	CGGC	2	8	27556	27563	0 %	0 %	50 %	50 %	41406122
61	NC_002944	GCCG	2	8	28426	28433	0 %	0 %	50 %	50 %	41406124
62	NC_002944	CGAC	2	8	28980	28987	25 %	0 %	25 %	50 %	41406124
63	NC_002944	CGGT	2	8	29137	29144	0 %	25 %	50 %	25 %	41406124
64	NC_002944	GCCG	2	8	29165	29172	0 %	0 %	50 %	50 %	41406124
65	NC_002944	GTGC	2	8	30339	30346	0 %	25 %	50 %	25 %	41406125
66	NC_002944	CGAG	2	8	30826	30833	25 %	0 %	50 %	25 %	41406125
67	NC_002944	GTGC	2	8	30867	30874	0 %	25 %	50 %	25 %	41406125
68	NC_002944	CGAT	2	8	31105	31112	25 %	25 %	25 %	25 %	41406125
69	NC_002944	CGTC	2	8	33296	33303	0 %	25 %	25 %	50 %	41406126
70	NC_002944	CCGA	2	8	33627	33634	25 %	0 %	25 %	50 %	41406126
71	NC_002944	GTTG	2	8	35298	35305	0 %	50 %	50 %	0 %	41406127
72	NC_002944	CACC	2	8	36603	36610	25 %	0 %	0 %	75 %	41406128
73	NC_002944	CTTT	2	8	36934	36941	0 %	75 %	0 %	25 %	41406129
74	NC_002944	TCGG	2	8	36948	36955	0 %	25 %	50 %	25 %	41406129
75	NC_002944	GATC	2	8	37329	37336	25 %	25 %	25 %	25 %	41406129
76	NC_002944	CCAC	2	8	37491	37498	25 %	0 %	0 %	75 %	41406129
77	NC_002944	CTGT	2	8	37653	37660	0 %	50 %	25 %	25 %	41406129
78	NC_002944	GCCC	2	8	37791	37798	0 %	0 %	25 %	75 %	41406129
79	NC_002944	CGGC	2	8	37830	37837	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
80	NC_002944	TACC	2	8	37909	37916	25 %	25 %	0 %	50 %	41406130
81	NC_002944	CACC	2	8	38206	38213	25 %	0 %	0 %	75 %	41406130
82	NC_002944	CGCC	2	8	38325	38332	0 %	0 %	25 %	75 %	41406130
83	NC_002944	CGTG	2	8	39233	39240	0 %	25 %	50 %	25 %	41406130
84	NC_002944	GGGC	2	8	40059	40066	0 %	0 %	75 %	25 %	41406132
85	NC_002944	CGGC	2	8	41408	41415	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
86	NC_002944	ATCG	2	8	41761	41768	25 %	25 %	25 %	25 %	41406133
87	NC_002944	TCTG	2	8	41808	41815	0 %	50 %	25 %	25 %	41406133
88	NC_002944	GTGC	2	8	42106	42113	0 %	25 %	50 %	25 %	41406133
89	NC_002944	GACC	2	8	42395	42402	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
90	NC_002944	GCCG	2	8	42465	42472	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
91	NC_002944	GGCC	2	8	42644	42651	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
92	NC_002944	CCGA	2	8	42992	42999	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
93	NC_002944	GCCG	2	8	43617	43624	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
94	NC_002944	CGAT	2	8	44261	44268	25 %	25 %	25 %	25 %	41406136
95	NC_002944	CGGC	2	8	44956	44963	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
96	NC_002944	GCCG	2	8	45189	45196	0 %	0 %	50 %	50 %	41406137
97	NC_002944	GACG	2	8	45349	45356	25 %	0 %	50 %	25 %	41406137
98	NC_002944	GCAC	2	8	45642	45649	25 %	0 %	25 %	50 %	41406138
99	NC_002944	TCGG	2	8	45928	45935	0 %	25 %	50 %	25 %	41406139
100	NC_002944	CGAC	2	8	46413	46420	25 %	0 %	25 %	50 %	41406139
101	NC_002944	GCCG	2	8	46790	46797	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
102	NC_002944	CGGC	2	8	46814	46821	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
103	NC_002944	GGAT	2	8	47049	47056	25 %	25 %	50 %	0 %	41406139
104	NC_002944	CGGC	2	8	47777	47784	0 %	0 %	50 %	50 %	41406140
105	NC_002944	CGGG	2	8	47983	47990	0 %	0 %	75 %	25 %	41406141
106	NC_002944	CCAG	2	8	48013	48020	25 %	0 %	25 %	50 %	41406141
107	NC_002944	CGGC	2	8	48190	48197	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
108	NC_002944	CGAT	2	8	48253	48260	25 %	25 %	25 %	25 %	41406141
109	NC_002944	CGGT	2	8	48267	48274	0 %	25 %	50 %	25 %	41406141
110	NC_002944	GCCG	2	8	48276	48283	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
111	NC_002944	CGGC	2	8	48397	48404	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
112	NC_002944	GCCG	2	8	48509	48516	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
113	NC_002944	GCCG	2	8	48629	48636	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
114	NC_002944	CAGC	2	8	49382	49389	25 %	0 %	25 %	50 %	41406142
115	NC_002944	CGCC	2	8	49424	49431	0 %	0 %	25 %	75 %	41406142
116	NC_002944	GCGG	2	8	50270	50277	0 %	0 %	75 %	25 %	41406143
117	NC_002944	ACCC	2	8	50793	50800	25 %	0 %	0 %	75 %	41406143
118	NC_002944	TGGG	2	8	51052	51059	0 %	25 %	75 %	0 %	41406144
119	NC_002944	CGGC	2	8	51450	51457	0 %	0 %	50 %	50 %	41406145
120	NC_002944	GGGC	2	8	51462	51469	0 %	0 %	75 %	25 %	41406145
121	NC_002944	CGGT	2	8	51578	51585	0 %	25 %	50 %	25 %	41406145
122	NC_002944	GCGG	2	8	51919	51926	0 %	0 %	75 %	25 %	41406145
123	NC_002944	CCGC	2	8	52238	52245	0 %	0 %	25 %	75 %	41406145
124	NC_002944	CGCC	2	8	52527	52534	0 %	0 %	25 %	75 %	41406146
125	NC_002944	CGGT	2	8	52665	52672	0 %	25 %	50 %	25 %	41406146
126	NC_002944	GACG	2	8	52684	52691	25 %	0 %	50 %	25 %	41406146
127	NC_002944	CACC	2	8	52897	52904	25 %	0 %	0 %	75 %	41406146
128	NC_002944	CGCC	2	8	53583	53590	0 %	0 %	25 %	75 %	41406146
129	NC_002944	GTCG	2	8	53644	53651	0 %	25 %	50 %	25 %	41406146
130	NC_002944	GGAC	2	8	53959	53966	25 %	0 %	50 %	25 %	41406146
131	NC_002944	CGAC	2	8	54240	54247	25 %	0 %	25 %	50 %	41406146
132	NC_002944	GCCG	2	8	54628	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	41406146
133	NC_002944	ACCA	2	8	55046	55053	50 %	0 %	0 %	50 %	41406146
134	NC_002944	CGGG	2	8	55465	55472	0 %	0 %	75 %	25 %	41406147
135	NC_002944	CGGC	3	12	55994	56005	0 %	0 %	50 %	50 %	41406147
136	NC_002944	CCGG	2	8	56179	56186	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
137	NC_002944	GGTC	2	8	56465	56472	0 %	25 %	50 %	25 %	41406148
138	NC_002944	CGGG	2	8	56783	56790	0 %	0 %	75 %	25 %	41406149
139	NC_002944	GCCG	2	8	57040	57047	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
140	NC_002944	ATTG	2	8	57730	57737	25 %	50 %	25 %	0 %	41406150
141	NC_002944	GGCC	2	8	58031	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
142	NC_002944	GGCT	2	8	59073	59080	0 %	25 %	50 %	25 %	41406150
143	NC_002944	GCCG	2	8	59132	59139	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
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