MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 10876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	GC	3	6	234	239	0 %	0 %	50 %	50 %	41406099
2	NC_002944	CG	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002944	GC	3	6	2980	2985	0 %	0 %	50 %	50 %	41406100
4	NC_002944	GC	3	6	3244	3249	0 %	0 %	50 %	50 %	41406100
5	NC_002944	GC	3	6	3635	3640	0 %	0 %	50 %	50 %	41406101
6	NC_002944	GC	3	6	3749	3754	0 %	0 %	50 %	50 %	41406101
7	NC_002944	GC	3	6	4573	4578	0 %	0 %	50 %	50 %	41406102
8	NC_002944	CG	3	6	4980	4985	0 %	0 %	50 %	50 %	41406102
9	NC_002944	GC	3	6	6509	6514	0 %	0 %	50 %	50 %	41406103
10	NC_002944	CG	3	6	6520	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	41406103
11	NC_002944	CG	3	6	7234	7239	0 %	0 %	50 %	50 %	41406103
12	NC_002944	CG	3	6	7420	7425	0 %	0 %	50 %	50 %	41406104
13	NC_002944	CG	3	6	8093	8098	0 %	0 %	50 %	50 %	41406104
14	NC_002944	CG	3	6	8553	8558	0 %	0 %	50 %	50 %	41406104
15	NC_002944	CG	3	6	8781	8786	0 %	0 %	50 %	50 %	41406104
16	NC_002944	CA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002944	CG	3	6	10274	10279	0 %	0 %	50 %	50 %	41406105
18	NC_002944	GC	3	6	11216	11221	0 %	0 %	50 %	50 %	41406106
19	NC_002944	GC	3	6	11635	11640	0 %	0 %	50 %	50 %	41406106
20	NC_002944	TC	3	6	11793	11798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002944	GC	3	6	12162	12167	0 %	0 %	50 %	50 %	41406107
22	NC_002944	CG	3	6	12935	12940	0 %	0 %	50 %	50 %	41406107
23	NC_002944	GC	4	8	13295	13302	0 %	0 %	50 %	50 %	41406108
24	NC_002944	CG	3	6	13303	13308	0 %	0 %	50 %	50 %	41406108
25	NC_002944	CG	3	6	13447	13452	0 %	0 %	50 %	50 %	41406108
26	NC_002944	GC	3	6	13564	13569	0 %	0 %	50 %	50 %	41406108
27	NC_002944	GC	5	10	14474	14483	0 %	0 %	50 %	50 %	41406110
28	NC_002944	GC	3	6	16187	16192	0 %	0 %	50 %	50 %	41406113
29	NC_002944	GC	3	6	16214	16219	0 %	0 %	50 %	50 %	41406113
30	NC_002944	GC	3	6	17741	17746	0 %	0 %	50 %	50 %	41406114
31	NC_002944	GC	3	6	17965	17970	0 %	0 %	50 %	50 %	41406114
32	NC_002944	CG	3	6	18421	18426	0 %	0 %	50 %	50 %	41406114
33	NC_002944	CG	3	6	18735	18740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
34	NC_002944	GC	3	6	18779	18784	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
35	NC_002944	GC	3	6	19006	19011	0 %	0 %	50 %	50 %	41406115
36	NC_002944	GT	3	6	19992	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	41406117
37	NC_002944	CG	3	6	20134	20139	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
38	NC_002944	GC	3	6	20395	20400	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
39	NC_002944	CG	3	6	20916	20921	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
40	NC_002944	GC	3	6	21200	21205	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
41	NC_002944	CG	3	6	22040	22045	0 %	0 %	50 %	50 %	41406118
42	NC_002944	TG	3	6	22702	22707	0 %	50 %	50 %	0 %	41406118
43	NC_002944	GC	3	6	22935	22940	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
44	NC_002944	CG	3	6	23130	23135	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
45	NC_002944	CG	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
46	NC_002944	GC	4	8	23722	23729	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
47	NC_002944	GC	3	6	23982	23987	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
48	NC_002944	GC	3	6	24179	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
49	NC_002944	GC	3	6	24530	24535	0 %	0 %	50 %	50 %	41406120
50	NC_002944	GC	3	6	24709	24714	0 %	0 %	50 %	50 %	41406120
51	NC_002944	CG	4	8	25935	25942	0 %	0 %	50 %	50 %	41406121
52	NC_002944	GC	3	6	26917	26922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002944	CG	4	8	27350	27357	0 %	0 %	50 %	50 %	41406122
54	NC_002944	GC	3	6	27562	27567	0 %	0 %	50 %	50 %	41406122
55	NC_002944	AC	4	8	27587	27594	50 %	0 %	0 %	50 %	41406122
56	NC_002944	GC	3	6	29121	29126	0 %	0 %	50 %	50 %	41406124
57	NC_002944	CG	3	6	29745	29750	0 %	0 %	50 %	50 %	41406125
58	NC_002944	GC	3	6	30220	30225	0 %	0 %	50 %	50 %	41406125
59	NC_002944	CG	3	6	30898	30903	0 %	0 %	50 %	50 %	41406125
60	NC_002944	GA	3	6	31459	31464	50 %	0 %	50 %	0 %	41406125
61	NC_002944	CG	3	6	32257	32262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002944	GA	3	6	32723	32728	50 %	0 %	50 %	0 %	41406126
63	NC_002944	GT	3	6	34326	34331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002944	GC	3	6	34478	34483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002944	CG	3	6	35239	35244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002944	GC	3	6	36291	36296	0 %	0 %	50 %	50 %	41406127
67	NC_002944	GC	3	6	36353	36358	0 %	0 %	50 %	50 %	41406127
68	NC_002944	CG	3	6	37154	37159	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
69	NC_002944	GC	3	6	37193	37198	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
70	NC_002944	GC	3	6	37413	37418	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
71	NC_002944	CG	3	6	37460	37465	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
72	NC_002944	CG	3	6	37809	37814	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
73	NC_002944	GC	3	6	38227	38232	0 %	0 %	50 %	50 %	41406130
74	NC_002944	GC	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	41406131
75	NC_002944	CG	3	6	39714	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	41406131
76	NC_002944	GA	3	6	39955	39960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002944	GC	3	6	40411	40416	0 %	0 %	50 %	50 %	41406132
78	NC_002944	GC	3	6	40504	40509	0 %	0 %	50 %	50 %	41406132
79	NC_002944	GC	3	6	41309	41314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002944	CG	3	6	41425	41430	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
81	NC_002944	GA	3	6	41433	41438	50 %	0 %	50 %	0 %	41406133
82	NC_002944	GC	4	8	41972	41979	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
83	NC_002944	GC	3	6	42412	42417	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
84	NC_002944	CG	3	6	42672	42677	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
85	NC_002944	GC	3	6	43276	43281	0 %	0 %	50 %	50 %	41406135
86	NC_002944	GC	3	6	43984	43989	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
87	NC_002944	CA	3	6	45560	45565	50 %	0 %	0 %	50 %	41406138
88	NC_002944	CG	3	6	45588	45593	0 %	0 %	50 %	50 %	41406138
89	NC_002944	GC	3	6	46151	46156	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
90	NC_002944	GC	3	6	46404	46409	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
91	NC_002944	CG	3	6	46897	46902	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
92	NC_002944	AC	3	6	47161	47166	50 %	0 %	0 %	50 %	41406139
93	NC_002944	GC	3	6	47282	47287	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
94	NC_002944	CG	3	6	47628	47633	0 %	0 %	50 %	50 %	41406140
95	NC_002944	CG	3	6	47953	47958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002944	GC	3	6	48055	48060	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
97	NC_002944	CG	3	6	48339	48344	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
98	NC_002944	GC	3	6	48441	48446	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
99	NC_002944	GC	3	6	48705	48710	0 %	0 %	50 %	50 %	41406141
100	NC_002944	GC	3	6	49126	49131	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
101	NC_002944	CG	3	6	49642	49647	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
102	NC_002944	GC	3	6	49714	49719	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
103	NC_002944	GC	3	6	49840	49845	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
104	NC_002944	GC	4	8	49893	49900	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
105	NC_002944	CG	3	6	50027	50032	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
106	NC_002944	GC	3	6	51067	51072	0 %	0 %	50 %	50 %	41406144
107	NC_002944	CG	3	6	51208	51213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002944	GC	4	8	53118	53125	0 %	0 %	50 %	50 %	41406146
109	NC_002944	GC	3	6	54027	54032	0 %	0 %	50 %	50 %	41406146
110	NC_002944	CG	3	6	54612	54617	0 %	0 %	50 %	50 %	41406146
111	NC_002944	CG	3	6	55085	55090	0 %	0 %	50 %	50 %	41406146
112	NC_002944	GC	3	6	55650	55655	0 %	0 %	50 %	50 %	41406147
113	NC_002944	CG	3	6	56292	56297	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
114	NC_002944	CG	3	6	56333	56338	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
115	NC_002944	GC	3	6	56359	56364	0 %	0 %	50 %	50 %	41406148
116	NC_002944	CG	3	6	56994	56999	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
117	NC_002944	CG	3	6	57444	57449	0 %	0 %	50 %	50 %	41406149
118	NC_002944	GC	4	8	57814	57821	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
119	NC_002944	CG	3	6	58901	58906	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
120	NC_002944	GC	3	6	59140	59145	0 %	0 %	50 %	50 %	41406150
121	NC_002944	CG	4	8	59488	59495	0 %	0 %	50 %	50 %	41406151
122	NC_002944	CG	4	8	59692	59699	0 %	0 %	50 %	50 %	41406151
123	NC_002944	GC	3	6	60553	60558	0 %	0 %	50 %	50 %	41406152
124	NC_002944	GC	3	6	60683	60688	0 %	0 %	50 %	50 %	41406152
125	NC_002944	GC	3	6	60736	60741	0 %	0 %	50 %	50 %	41406152
126	NC_002944	GC	3	6	60802	60807	0 %	0 %	50 %	50 %	41406152
127	NC_002944	GT	3	6	60915	60920	0 %	50 %	50 %	0 %	41406152
128	NC_002944	GC	3	6	60981	60986	0 %	0 %	50 %	50 %	41406153
129	NC_002944	GC	4	8	61016	61023	0 %	0 %	50 %	50 %	41406153
130	NC_002944	CG	3	6	61602	61607	0 %	0 %	50 %	50 %	41406153
131	NC_002944	GC	3	6	61968	61973	0 %	0 %	50 %	50 %	41406154
132	NC_002944	GT	3	6	62197	62202	0 %	50 %	50 %	0 %	41406154
133	NC_002944	CG	3	6	63074	63079	0 %	0 %	50 %	50 %	41406154
134	NC_002944	GC	3	6	63197	63202	0 %	0 %	50 %	50 %	41406155
135	NC_002944	GC	3	6	63348	63353	0 %	0 %	50 %	50 %	41406155
136	NC_002944	GC	3	6	63678	63683	0 %	0 %	50 %	50 %	41406155
137	NC_002944	GC	3	6	63903	63908	0 %	0 %	50 %	50 %	41406155
138	NC_002944	TG	3	6	63942	63947	0 %	50 %	50 %	0 %	41406155
139	NC_002944	CG	3	6	64806	64811	0 %	0 %	50 %	50 %	41406156
140	NC_002944	AC	3	6	64961	64966	50 %	0 %	0 %	50 %	41406156
141	NC_002944	GC	3	6	65486	65491	0 %	0 %	50 %	50 %	41406157
142	NC_002944	GA	3	6	66254	66259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002944	GC	3	6	66417	66422	0 %	0 %	50 %	50 %	41406158
144	NC_002944	AT	3	6	68168	68173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002944	GC	3	6	68334	68339	0 %	0 %	50 %	50 %	41406160
146	NC_002944	GC	3	6	68421	68426	0 %	0 %	50 %	50 %	41406160
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