MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 1070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	CG	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002944	CA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002944	TC	3	6	11793	11798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002944	GC	3	6	26917	26922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002944	CG	3	6	32257	32262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002944	GT	3	6	34326	34331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002944	GC	3	6	34478	34483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002944	CG	3	6	35239	35244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002944	GA	3	6	39955	39960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002944	GC	3	6	41309	41314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002944	CG	3	6	47953	47958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002944	CG	3	6	51208	51213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002944	GA	3	6	66254	66259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002944	AT	3	6	68168	68173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002944	CG	3	6	74599	74604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002944	CA	3	6	76768	76773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002944	TG	3	6	79693	79698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002944	GC	3	6	82317	82322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002944	CG	3	6	83094	83099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002944	GT	3	6	83250	83255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002944	TG	3	6	83436	83441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002944	GC	3	6	83547	83552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002944	GC	4	8	87087	87094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002944	TG	3	6	91843	91848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002944	GC	3	6	92126	92131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002944	GC	3	6	96325	96330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002944	GT	3	6	101505	101510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002944	TG	4	8	101866	101873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002944	AC	3	6	103666	103671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002944	GC	3	6	106813	106818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002944	AC	3	6	108255	108260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002944	GC	3	6	109084	109089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002944	CA	3	6	109837	109842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002944	GT	3	6	110118	110123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002944	CA	3	6	110159	110164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002944	AC	3	6	112204	112209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002944	CG	3	6	112320	112325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002944	GC	3	6	113008	113013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002944	GT	3	6	117261	117266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002944	GC	3	6	127859	127864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002944	CG	3	6	132799	132804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002944	AT	3	6	133532	133537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002944	AT	3	6	133551	133556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002944	GC	3	6	139884	139889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002944	CG	4	8	142179	142186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002944	CG	4	8	144475	144482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002944	GC	3	6	144490	144495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002944	CG	3	6	147871	147876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002944	CG	3	6	147886	147891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002944	AC	3	6	149135	149140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002944	CG	4	8	154338	154345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002944	GC	3	6	156288	156293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002944	TA	3	6	157774	157779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002944	CG	3	6	159609	159614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002944	AC	3	6	161428	161433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002944	TC	3	6	162787	162792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002944	CG	3	6	163678	163683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002944	CG	3	6	175880	175885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002944	GT	3	6	182740	182745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002944	CG	3	6	184123	184128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002944	CG	3	6	184179	184184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002944	CG	3	6	192355	192360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002944	CG	3	6	192951	192956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002944	GC	3	6	193067	193072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002944	CG	3	6	193760	193765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002944	CG	3	6	193810	193815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002944	CG	4	8	197523	197530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002944	GC	3	6	205311	205316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002944	GC	3	6	209578	209583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002944	GC	3	6	212957	212962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002944	GC	3	6	214666	214671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002944	GC	3	6	215864	215869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002944	CA	4	8	215895	215902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002944	GC	3	6	217292	217297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002944	GC	3	6	220696	220701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002944	GC	3	6	224126	224131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002944	GC	4	8	226492	226499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002944	CG	3	6	248153	248158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002944	TC	3	6	250135	250140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002944	GT	3	6	265439	265444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002944	GA	3	6	267751	267756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002944	CG	3	6	267798	267803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002944	GC	3	6	273779	273784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002944	TG	3	6	273810	273815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002944	TG	3	6	273835	273840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002944	GC	3	6	275151	275156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002944	CG	3	6	290538	290543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002944	GC	3	6	295941	295946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002944	GT	3	6	301002	301007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002944	GC	3	6	304607	304612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002944	GC	3	6	320201	320206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002944	CG	3	6	328012	328017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002944	CG	4	8	329348	329355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002944	CG	3	6	331202	331207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002944	CG	3	6	339902	339907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002944	GC	3	6	356641	356646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002944	GT	3	6	373650	373655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002944	GC	3	6	374916	374921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002944	AT	3	6	379758	379763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002944	AC	3	6	379896	379901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002944	CG	3	6	381216	381221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002944	GC	3	6	390983	390988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002944	GC	3	6	397650	397655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002944	GC	3	6	401000	401005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002944	GC	3	6	401035	401040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002944	TC	3	6	410741	410746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002944	GC	3	6	413073	413078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002944	CG	3	6	415317	415322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002944	AC	3	6	418009	418014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002944	CA	3	6	418039	418044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002944	GC	3	6	422373	422378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002944	GC	5	10	429639	429648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002944	AG	3	6	431638	431643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002944	CG	3	6	432296	432301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002944	GC	3	6	439835	439840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002944	GT	3	6	439983	439988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002944	GC	3	6	448575	448580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002944	GC	4	8	468510	468517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002944	AT	3	6	468533	468538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002944	CG	3	6	502514	502519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002944	CG	3	6	504261	504266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002944	CG	3	6	509060	509065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002944	GC	3	6	519322	519327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002944	CG	3	6	540375	540380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002944	GC	3	6	560480	560485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002944	CG	3	6	560807	560812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002944	CG	3	6	560826	560831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002944	CG	3	6	574227	574232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002944	GC	3	6	579876	579881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002944	GT	3	6	586253	586258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002944	CG	4	8	599287	599294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002944	CG	4	8	599370	599377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002944	AC	3	6	600911	600916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002944	GC	3	6	605954	605959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002944	CG	3	6	606074	606079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002944	CG	5	10	607783	607792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002944	CG	3	6	612129	612134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002944	CG	3	6	612170	612175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002944	GC	3	6	612841	612846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002944	GC	3	6	612920	612925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002944	CA	3	6	616260	616265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002944	CA	3	6	617219	617224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002944	GC	4	8	617988	617995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002944	CG	4	8	647459	647466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002944	CG	4	8	665056	665063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002944	GA	3	6	668787	668792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002944	CG	3	6	679321	679326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002944	AT	3	6	681532	681537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002944	GT	3	6	683511	683516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002944	GT	4	8	683529	683536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002944	CG	3	6	684693	684698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002944	CA	3	6	686863	686868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_002944	CA	3	6	686888	686893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_002944	GC	3	6	687241	687246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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475	NC_002944	TG	3	6	2178622	2178627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_002944	GC	3	6	2227799	2227804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_002944	TC	3	6	2243149	2243154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_002944	CG	3	6	2247516	2247521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_002944	CG	3	6	2253288	2253293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_002944	GT	3	6	2254485	2254490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_002944	CG	3	6	2255616	2255621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_002944	CG	3	6	2259614	2259619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_002944	GA	3	6	2334000	2334005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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