MICAS: Microsatellite Analysis Server

Mono-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	C	6	6	1000	1005	0 %	0 %	0 %	100 %	41406099
2	NC_002944	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002944	T	6	6	1593	1598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002944	G	6	6	2048	2053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002944	G	6	6	7839	7844	0 %	0 %	100 %	0 %	41406104
6	NC_002944	C	6	6	10222	10227	0 %	0 %	0 %	100 %	41406105
7	NC_002944	C	6	6	19038	19043	0 %	0 %	0 %	100 %	41406115
8	NC_002944	C	6	6	19889	19894	0 %	0 %	0 %	100 %	41406117
9	NC_002944	G	6	6	25565	25570	0 %	0 %	100 %	0 %	41406121
10	NC_002944	A	6	6	34526	34531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002944	G	6	6	42074	42079	0 %	0 %	100 %	0 %	41406133
12	NC_002944	G	6	6	42727	42732	0 %	0 %	100 %	0 %	41406134
13	NC_002944	C	6	6	47235	47240	0 %	0 %	0 %	100 %	41406139
14	NC_002944	C	7	7	57024	57030	0 %	0 %	0 %	100 %	41406149
15	NC_002944	G	6	6	58292	58297	0 %	0 %	100 %	0 %	41406150
16	NC_002944	G	6	6	72222	72227	0 %	0 %	100 %	0 %	41406162
17	NC_002944	G	6	6	76544	76549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002944	A	6	6	82972	82977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002944	A	6	6	106690	106695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002944	C	6	6	109969	109974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_002944	T	6	6	112547	112552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002944	G	6	6	113349	113354	0 %	0 %	100 %	0 %	41406203
23	NC_002944	C	6	6	117163	117168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_002944	C	6	6	124754	124759	0 %	0 %	0 %	100 %	41406211
25	NC_002944	C	6	6	124891	124896	0 %	0 %	0 %	100 %	41406211
26	NC_002944	G	7	7	130667	130673	0 %	0 %	100 %	0 %	41406219
27	NC_002944	C	6	6	132373	132378	0 %	0 %	0 %	100 %	41406222
28	NC_002944	G	6	6	135034	135039	0 %	0 %	100 %	0 %	41406225
29	NC_002944	C	6	6	155352	155357	0 %	0 %	0 %	100 %	41406248
30	NC_002944	G	6	6	161465	161470	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002944	G	6	6	164710	164715	0 %	0 %	100 %	0 %	41406261
32	NC_002944	C	6	6	167287	167292	0 %	0 %	0 %	100 %	41406263
33	NC_002944	C	8	8	169357	169364	0 %	0 %	0 %	100 %	41406264
34	NC_002944	G	6	6	175529	175534	0 %	0 %	100 %	0 %	41406269
35	NC_002944	G	6	6	182517	182522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002944	G	6	6	192642	192647	0 %	0 %	100 %	0 %	41406284
37	NC_002944	C	6	6	194705	194710	0 %	0 %	0 %	100 %	41406287
38	NC_002944	G	6	6	197474	197479	0 %	0 %	100 %	0 %	41406289
39	NC_002944	C	6	6	199356	199361	0 %	0 %	0 %	100 %	41406291
40	NC_002944	G	6	6	200321	200326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002944	G	6	6	202104	202109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002944	G	6	6	203439	203444	0 %	0 %	100 %	0 %	41406296
43	NC_002944	G	6	6	209525	209530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002944	G	6	6	224799	224804	0 %	0 %	100 %	0 %	41406315
45	NC_002944	A	6	6	231572	231577	100 %	0 %	0 %	0 %	41406318
46	NC_002944	C	6	6	251693	251698	0 %	0 %	0 %	100 %	41406330
47	NC_002944	G	6	6	270620	270625	0 %	0 %	100 %	0 %	41406347
48	NC_002944	T	6	6	271930	271935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002944	C	6	6	275596	275601	0 %	0 %	0 %	100 %	41406352
50	NC_002944	C	6	6	282624	282629	0 %	0 %	0 %	100 %	41406360
51	NC_002944	G	6	6	293645	293650	0 %	0 %	100 %	0 %	41406372
52	NC_002944	G	6	6	300874	300879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002944	G	6	6	304053	304058	0 %	0 %	100 %	0 %	41406383
54	NC_002944	G	6	6	321565	321570	0 %	0 %	100 %	0 %	41406398
55	NC_002944	C	6	6	324730	324735	0 %	0 %	0 %	100 %	41406402
56	NC_002944	C	6	6	326574	326579	0 %	0 %	0 %	100 %	41406404
57	NC_002944	G	6	6	328922	328927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002944	G	6	6	340024	340029	0 %	0 %	100 %	0 %	41406416
59	NC_002944	C	6	6	351838	351843	0 %	0 %	0 %	100 %	41406426
60	NC_002944	T	6	6	361354	361359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002944	C	6	6	368540	368545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_002944	G	6	6	374251	374256	0 %	0 %	100 %	0 %	41406447
63	NC_002944	G	6	6	377953	377958	0 %	0 %	100 %	0 %	41406451
64	NC_002944	G	6	6	379677	379682	0 %	0 %	100 %	0 %	41406452
65	NC_002944	G	6	6	387354	387359	0 %	0 %	100 %	0 %	41406460
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68	NC_002944	G	6	6	403985	403990	0 %	0 %	100 %	0 %	41406475
69	NC_002944	C	6	6	413350	413355	0 %	0 %	0 %	100 %	41406488
70	NC_002944	G	6	6	417746	417751	0 %	0 %	100 %	0 %	41406490
71	NC_002944	G	6	6	417830	417835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002944	A	7	7	417956	417962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002944	T	6	6	439590	439595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002944	C	6	6	439680	439685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_002944	C	7	7	439716	439722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_002944	G	6	6	443122	443127	0 %	0 %	100 %	0 %	41406516
77	NC_002944	C	6	6	448472	448477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_002944	G	6	6	448505	448510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002944	C	6	6	448674	448679	0 %	0 %	0 %	100 %	41406522
80	NC_002944	G	6	6	449399	449404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002944	T	6	6	450821	450826	0 %	100 %	0 %	0 %	41406523
82	NC_002944	G	6	6	455860	455865	0 %	0 %	100 %	0 %	41406526
83	NC_002944	C	6	6	456012	456017	0 %	0 %	0 %	100 %	41406526
84	NC_002944	C	6	6	461637	461642	0 %	0 %	0 %	100 %	41406531
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88	NC_002944	C	6	6	491546	491551	0 %	0 %	0 %	100 %	41406561
89	NC_002944	C	6	6	491628	491633	0 %	0 %	0 %	100 %	41406561
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91	NC_002944	C	6	6	498556	498561	0 %	0 %	0 %	100 %	41406569
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94	NC_002944	G	6	6	520932	520937	0 %	0 %	100 %	0 %	41406590
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97	NC_002944	A	7	7	542559	542565	100 %	0 %	0 %	0 %	41406613
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102	NC_002944	C	6	6	565873	565878	0 %	0 %	0 %	100 %	41406638
103	NC_002944	T	6	6	575036	575041	0 %	100 %	0 %	0 %	41406647
104	NC_002944	C	6	6	580038	580043	0 %	0 %	0 %	100 %	41406652
105	NC_002944	C	6	6	580115	580120	0 %	0 %	0 %	100 %	41406652
106	NC_002944	G	6	6	581540	581545	0 %	0 %	100 %	0 %	41406654
107	NC_002944	G	6	6	586230	586235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002944	G	6	6	586433	586438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002944	G	6	6	591739	591744	0 %	0 %	100 %	0 %	41406665
110	NC_002944	C	6	6	595377	595382	0 %	0 %	0 %	100 %	41406667
111	NC_002944	C	6	6	610069	610074	0 %	0 %	0 %	100 %	41406683
112	NC_002944	G	6	6	615581	615586	0 %	0 %	100 %	0 %	41406687
113	NC_002944	C	6	6	615733	615738	0 %	0 %	0 %	100 %	41406687
114	NC_002944	C	6	6	623505	623510	0 %	0 %	0 %	100 %	41406696
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117	NC_002944	G	6	6	648671	648676	0 %	0 %	100 %	0 %	41406719
118	NC_002944	G	6	6	655266	655271	0 %	0 %	100 %	0 %	41406729
119	NC_002944	G	6	6	658270	658275	0 %	0 %	100 %	0 %	41406733
120	NC_002944	C	6	6	660213	660218	0 %	0 %	0 %	100 %	41406734
121	NC_002944	C	6	6	663910	663915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_002944	A	6	6	670271	670276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002944	T	7	7	694337	694343	0 %	100 %	0 %	0 %	41406771
124	NC_002944	G	6	6	698077	698082	0 %	0 %	100 %	0 %	41406774
125	NC_002944	G	6	6	701222	701227	0 %	0 %	100 %	0 %	41406778
126	NC_002944	C	6	6	735739	735744	0 %	0 %	0 %	100 %	41406808
127	NC_002944	T	6	6	748044	748049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_002944	G	6	6	759765	759770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002944	G	6	6	761636	761641	0 %	0 %	100 %	0 %	41406836
132	NC_002944	C	6	6	774201	774206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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138	NC_002944	C	6	6	852965	852970	0 %	0 %	0 %	100 %	41406933
139	NC_002944	G	6	6	855818	855823	0 %	0 %	100 %	0 %	41406935
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142	NC_002944	C	6	6	872755	872760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_002944	G	6	6	873362	873367	0 %	0 %	100 %	0 %	41406948
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