MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002944	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002944	T	6	6	1593	1598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002944	G	6	6	2048	2053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002944	A	6	6	34526	34531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002944	G	6	6	76544	76549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002944	A	6	6	82972	82977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002944	A	6	6	106690	106695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002944	C	6	6	109969	109974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_002944	T	6	6	112547	112552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002944	C	6	6	117163	117168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_002944	G	6	6	161465	161470	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002944	G	6	6	182517	182522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002944	G	6	6	200321	200326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002944	G	6	6	202104	202109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002944	G	6	6	209525	209530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002944	T	6	6	271930	271935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002944	G	6	6	300874	300879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002944	G	6	6	328922	328927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002944	T	6	6	361354	361359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002944	C	6	6	368540	368545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_002944	G	6	6	417830	417835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002944	A	7	7	417956	417962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002944	T	6	6	439590	439595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002944	C	6	6	439680	439685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_002944	C	7	7	439716	439722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_002944	C	6	6	448472	448477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_002944	G	6	6	448505	448510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002944	G	6	6	449399	449404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002944	C	6	6	509067	509072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_002944	G	6	6	586230	586235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002944	G	6	6	586433	586438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002944	C	6	6	663910	663915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_002944	A	6	6	670271	670276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002944	T	6	6	748044	748049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002944	G	6	6	759765	759770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002944	C	6	6	774201	774206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_002944	C	6	6	872755	872760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_002944	G	6	6	883795	883800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002944	A	6	6	919393	919398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002944	C	6	6	949130	949135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_002944	C	6	6	1038459	1038464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_002944	T	6	6	1059348	1059353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002944	G	6	6	1064777	1064782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002944	T	6	6	1065740	1065745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002944	G	6	6	1116222	1116227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002944	G	7	7	1116680	1116686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002944	G	6	6	1144569	1144574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002944	C	6	6	1176048	1176053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_002944	G	6	6	1176092	1176097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002944	G	6	6	1193837	1193842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002944	G	6	6	1193906	1193911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002944	G	6	6	1211677	1211682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002944	C	6	6	1218046	1218051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_002944	C	6	6	1278863	1278868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_002944	G	6	6	1335746	1335751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002944	G	6	6	1339893	1339898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002944	T	6	6	1360235	1360240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002944	C	6	6	1429778	1429783	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_002944	G	6	6	1443177	1443182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002944	G	7	7	1561643	1561649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002944	G	6	6	1651495	1651500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002944	G	7	7	1655209	1655215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002944	G	6	6	1664440	1664445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002944	C	6	6	1771204	1771209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_002944	C	6	6	1812147	1812152	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_002944	G	6	6	1886629	1886634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002944	T	7	7	1890662	1890668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002944	C	6	6	1895016	1895021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_002944	G	6	6	2019899	2019904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002944	G	7	7	2054974	2054980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002944	C	6	6	2084553	2084558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_002944	G	6	6	2209703	2209708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002944	G	6	6	2328370	2328375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002944	A	6	6	2381073	2381078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002944	T	6	6	2383652	2383657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002944	C	6	6	2452093	2452098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_002944	C	6	6	2454795	2454800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_002944	C	6	6	2574556	2574561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_002944	G	6	6	2578654	2578659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002944	G	6	6	2649542	2649547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002944	T	6	6	2714236	2714241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002944	G	6	6	2747823	2747828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002944	G	6	6	2747975	2747980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002944	C	6	6	2749085	2749090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_002944	A	6	6	2751016	2751021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002944	C	6	6	2763598	2763603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_002944	T	6	6	2790897	2790902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002944	A	6	6	2811483	2811488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002944	C	6	6	2811589	2811594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_002944	C	6	6	2811597	2811602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_002944	C	6	6	2876699	2876704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_002944	A	6	6	2886783	2886788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002944	T	6	6	3011947	3011952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002944	A	6	6	3062568	3062573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002944	C	6	6	3091542	3091547	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_002944	T	6	6	3091596	3091601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002944	A	6	6	3091616	3091621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002944	C	6	6	3095551	3095556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_002944	G	6	6	3095560	3095565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002944	C	6	6	3098139	3098144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_002944	C	6	6	3136986	3136991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_002944	C	6	6	3225726	3225731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_002944	T	6	6	3225765	3225770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002944	C	6	6	3284852	3284857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_002944	C	6	6	3303724	3303729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_002944	A	6	6	3380944	3380949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002944	G	6	6	3450971	3450976	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002944	G	6	6	3457208	3457213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002944	A	7	7	3457335	3457341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002944	G	6	6	3464653	3464658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002944	G	6	6	3480693	3480698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002944	C	6	6	3498390	3498395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_002944	C	6	6	3583660	3583665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_002944	G	6	6	3584858	3584863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002944	G	6	6	3594300	3594305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002944	G	6	6	3596065	3596070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002944	G	6	6	3651349	3651354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002944	T	6	6	3700988	3700993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002944	T	6	6	3727660	3727665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002944	G	6	6	3759456	3759461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002944	C	6	6	3784050	3784055	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_002944	T	6	6	3852006	3852011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002944	A	6	6	3863967	3863972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002944	G	6	6	3931040	3931045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002944	C	6	6	3970116	3970121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_002944	C	7	7	3970188	3970194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_002944	C	7	7	3994448	3994454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_002944	C	6	6	4024408	4024413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_002944	G	6	6	4054678	4054683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002944	G	6	6	4067379	4067384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002944	C	7	7	4079432	4079438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_002944	C	6	6	4108907	4108912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_002944	C	6	6	4116715	4116720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_002944	G	7	7	4116727	4116733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002944	G	6	6	4134519	4134524	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002944	G	6	6	4163426	4163431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002944	G	6	6	4258275	4258280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002944	C	7	7	4264360	4264366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_002944	T	6	6	4269400	4269405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002944	C	6	6	4274539	4274544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_002944	T	6	6	4398797	4398802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002944	G	6	6	4405979	4405984	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002944	G	6	6	4440536	4440541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002944	C	6	6	4447922	4447927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_002944	C	6	6	4456739	4456744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_002944	C	6	6	4494757	4494762	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_002944	C	6	6	4500935	4500940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_002944	G	6	6	4535085	4535090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002944	C	6	6	4537464	4537469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.