MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002942	ATTTT	2	10	246	255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002942	ATTTA	2	10	364	373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002942	ACTTA	2	10	6985	6994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002942	CTTTC	2	10	11314	11323	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_002942	CCTAT	2	10	27054	27063	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002942	ATAAA	2	10	30375	30384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002942	GTTAA	2	10	44716	44725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002942	TGATT	2	10	51253	51262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002942	CTTTT	2	10	59910	59919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_002942	ATCTT	2	10	71404	71413	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002942	ATATA	2	10	78853	78862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002942	ATTAG	2	10	119278	119287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002942	TTGTA	2	10	119979	119988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002942	TCAAC	2	10	123442	123451	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002942	GATTT	2	10	123663	123672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002942	GATAA	2	10	123832	123841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002942	ATATA	2	10	136952	136961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002942	GTTTA	2	10	138298	138307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002942	GATTA	2	10	138401	138410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002942	TTGAT	2	10	146902	146911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002942	CAAAT	2	10	155727	155736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002942	CAAGA	2	10	178062	178071	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002942	TGACC	2	10	179720	179729	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_002942	AATCT	2	10	179746	179755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002942	AATTA	2	10	184358	184367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002942	TGAAA	2	10	194385	194394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002942	ATTGA	2	10	194714	194723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002942	TTAAT	2	10	197184	197193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002942	GTTTG	2	10	200336	200345	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002942	AGTAA	2	10	209928	209937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002942	ATTAA	2	10	214277	214286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002942	TTAAT	2	10	225776	225785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002942	TTAAA	2	10	228341	228350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002942	CTGAT	2	10	228461	228470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002942	AGTAT	2	10	264854	264863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002942	TAAAA	2	10	270598	270607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002942	TAAAT	2	10	277309	277318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002942	AGATG	2	10	280066	280075	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002942	GCGTT	2	10	280273	280282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002942	AAAAT	2	10	284980	284989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002942	TATCG	2	10	298664	298673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002942	CCAAA	2	10	341973	341982	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_002942	TTTCA	2	10	345784	345793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002942	TCGTG	2	10	360931	360940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_002942	TTTTA	2	10	364840	364849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002942	TAAAT	2	10	364906	364915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002942	ATTTT	2	10	393466	393475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002942	ACAGC	2	10	398466	398475	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002942	TAAGT	2	10	404498	404507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002942	AATAT	2	10	407427	407436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002942	TTCTT	2	10	408525	408534	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_002942	ATTAT	2	10	411871	411880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002942	TAAGA	2	10	413235	413244	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002942	TCAAT	2	10	423419	423428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002942	TTAAA	2	10	433023	433032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002942	CTTTT	2	10	434668	434677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002942	TGAAA	2	10	444929	444938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002942	CTTTG	2	10	447723	447732	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002942	AAATA	2	10	448947	448956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002942	CATTT	2	10	453509	453518	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_002942	GTAGA	2	10	460871	460880	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002942	ATTCT	2	10	462389	462398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002942	TTTTG	2	10	466466	466475	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002942	TTTAT	2	10	472870	472879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002942	CTTCT	2	10	476978	476987	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_002942	ATTTC	2	10	480089	480098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002942	AATTT	2	10	492460	492469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002942	ATTAA	2	10	517489	517498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002942	AAGTT	2	10	527222	527231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002942	CATGG	2	10	542768	542777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002942	AAATA	2	10	542801	542810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002942	ACCAT	2	10	556374	556383	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_002942	AAATT	2	10	557598	557607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002942	AATAT	2	10	575256	575265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002942	TAATG	2	10	580758	580767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002942	TTTTG	2	10	581474	581483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002942	TTTTG	2	10	581649	581658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002942	ATTTT	2	10	591992	592001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002942	TTATG	2	10	594298	594307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002942	AATGA	2	10	597788	597797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002942	CGTTT	2	10	602028	602037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_002942	AGATA	2	10	602128	602137	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002942	TCGTG	2	10	609291	609300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_002942	AAAAT	2	10	615303	615312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002942	ATTAA	2	10	620469	620478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002942	GCGAT	2	10	626097	626106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002942	TGTAT	2	10	630896	630905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002942	GCAAA	2	10	643742	643751	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002942	GAAAG	2	10	647234	647243	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002942	TACAT	2	10	650110	650119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002942	ATTTG	2	10	658259	658268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002942	TAAAC	2	10	671954	671963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_002942	CTTGG	2	10	672033	672042	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002942	CAAAT	2	10	683593	683602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002942	CTTTA	2	10	703017	703026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_002942	TTTAA	2	10	736372	736381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002942	TTTAA	2	10	739710	739719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002942	GTCAC	2	10	744875	744884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_002942	TGGTA	2	10	746832	746841	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002942	GTTTA	2	10	755225	755234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002942	TAAAA	2	10	774638	774647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002942	AATTG	2	10	792054	792063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002942	TCCTT	2	10	792605	792614	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_002942	TTGCA	2	10	795353	795362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002942	GTGAT	2	10	796756	796765	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002942	ATTAG	2	10	807332	807341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002942	ATCTT	2	10	814470	814479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002942	AATTG	2	10	815967	815976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002942	TAATA	2	10	816181	816190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002942	TAATA	2	10	816339	816348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002942	TAATA	2	10	816497	816506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002942	TAATA	2	10	816655	816664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002942	AAACT	2	10	831262	831271	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002942	TAATT	2	10	850158	850167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002942	ATGGT	2	10	884453	884462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002942	CTACT	2	10	895355	895364	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_002942	GTACG	2	10	898352	898361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002942	CGTAC	2	10	899962	899971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_002942	ATCAA	2	10	905441	905450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002942	TAAAT	2	10	929432	929441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002942	ATTGG	2	10	938994	939003	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002942	TTGTT	2	10	939116	939125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002942	TTTAA	2	10	946314	946323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002942	ATATA	2	10	952641	952650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002942	TTTAA	2	10	953060	953069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002942	TCAAT	2	10	958212	958221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002942	ATTAT	2	10	958223	958232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002942	CAGGT	2	10	971724	971733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_002942	TGAGA	2	10	976868	976877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002942	TTGGG	2	10	984679	984688	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002942	TGAGT	2	10	995632	995641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002942	TGATT	2	10	1002439	1002448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002942	TTAAT	2	10	1007637	1007646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002942	TTGGG	2	10	1015729	1015738	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002942	TTATA	2	10	1019394	1019403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002942	ATCAT	2	10	1019450	1019459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002942	TTTAA	2	10	1022848	1022857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002942	CTTTT	2	10	1025860	1025869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002942	TAAAG	2	10	1027005	1027014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002942	ACCAG	2	10	1030845	1030854	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002942	TTTTG	2	10	1031784	1031793	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002942	TTAGT	2	10	1068387	1068396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002942	AAGAT	2	10	1072189	1072198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002942	GACAA	2	10	1074647	1074656	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_002942	TGTTT	2	10	1075156	1075165	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002942	TAAAG	2	10	1102696	1102705	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002942	TATTT	2	10	1102858	1102867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_002942	TATTG	2	10	1124031	1124040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002942	CAATT	2	10	1134123	1134132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_002942	CTAAA	2	10	1148701	1148710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_002942	ATTAG	2	10	1153361	1153370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_002942	AATTG	2	10	1167192	1167201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_002942	TACCA	2	10	1171427	1171436	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_002942	TGTTT	2	10	1205385	1205394	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_002942	ATCTT	2	10	1206425	1206434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_002942	TGGTT	2	10	1223254	1223263	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_002942	AAATT	2	10	1306411	1306420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_002942	TTCAT	2	10	2104758	2104767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_002942	ATTGA	2	10	2106782	2106791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_002942	ATAAA	2	10	2131906	2131915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_002942	GATTC	2	10	3023909	3023918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_002942	ACCCA	2	10	3282841	3282850	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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482	NC_002942	ATTTT	2	10	3370796	3370805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.